Alpha Tauri 3D grafika | Shutterstock
A tanulmány azt is javasolta, hogy hasonló megközelítés alkalmazható étrendünk állati és gombás összetevőinek meghatározására.
A DNS -vonalkód egy olyan technika, amely rövid DNS -szekvenciákat használ a szervezet fajának gyors azonosítására. A föld körül, a tudósok együttműködtek annak érdekében, hogy minden élőlény DNS -vonalkódját lekérjék.
A DNS metabarcoding egy speciális vonalkód, amely több szervezetet tartalmazó mintákra is alkalmazható. Ugyanazokat a referencia -adatbázisokat használja, mint a vonalkód, de lehetővé teszi a vegyes mintákból származó taxonok azonosítását nagy teljesítményű szekvenálási módszerekkel. A technika lehetőségei kiterjedtek, ezzel gyakorlatilag bármely mintában meghatározható a fajösszetétel.
A jelenlegi tanulmány, amely nemrég jelent meg a folyóiratban mSystems , kimutatták, hogy az emberi székletmintákban lévő étrendi növényi DNS -t amplifikálni és szekvenálni lehet a vadon élő állatok vizsgálatában általánosan alkalmazott technikákkal.
"A DNS -szekvenálás nagy mennyiségű új adatot adott nekünk olyan dolgokról, mint a bél mikrobiológiája és a személyes genetika. Ez a tanulmány azt sugallja, hogy ugyanez az erőteljes technológia mesélhet arról is, hogy mit eszünk, amit gyakran nehéz mérni.
Vezető szerző Lawrence David, a Duke Genomikai és Számítási Biológiai Központból
Sok technikát már használnak a táplálékbevitel felmérésére, de legtöbbjük attól függ, hogy az emberek önállóan számolnak be arról, hogy mit ettek. Ez az adatgyűjtési módszer a memória hibáitól és a jelentések elfogultságától függ, valamint attól függ, hogy egy személy kognitív képességgel válaszol-e a felmérésekre.
A DNS metakódolásával, a tudósok felerősíthetik a székletmintában lévő DNS -t, és referencia -adatbázis segítségével leképezhetik a szekvenciákat az élelmiszerekre.
"Úgy gondolok a DNS metabarkódolására, mint egy szupermarket vonalkódjára. Egy adott DNS -szekvenciát úgy tekinthetünk, mint egy egyedi azonosítót egy adott élelmiszerfajra, " mondja Brianna Petrone társszerző, szintén a Duke Egyetemről.
David és társszerzője, Aspen Reese a Harvard Egyetemről, felkérték a vizsgálat megkezdésére, miután találkoztak Rob Pringle ökológusokkal a Princetoni Egyetemről és Tyler Kartzinellel a Brown Egyetemen. Ezek a kutatók DNS metabarkódolással elemezték az afrikai szavanna növényevőinek összetett táplálékhálóit.
David és Reese azon tűnődött, vajon a módszer felhasználható -e az emberek tanulmányozására is.
Egyre több munka folyik a mikrobiom területén, ami azt jelzi, hogy bizonyos élelmiszerek valószínűleg megváltoztatják vagy alakítják a bélben lévő specifikus baktériumok szintjét, de gyakran nincsenek kísérő táplálkozási adataink a mikrobiológiai vizsgálatokhoz. "
Lawrence David
A tanulmányhoz, a kutatók kivették a DNS -t a hűtőházból, amelyet az egyik korábbi tanulmányukban használt székletből vontak ki.
"Pár éve történt egy tanulmányunk, amelyben élelmiszereket készítettünk a mikrobiom diéta beavatkozás résztvevői számára, és pontosan tudtuk, mit esznek egy adott héten, amikor összegyűjtötték a székletüket, " - mondja David.
Vonalkód -régiót szekvenáltak a kloroplasztisz DNS -ből 11 emberből vett mintákban, akik mind szabadon választott, mind ellenőrzött étrendet követtek.
Sikeresen amplifikálták a növényi DNS -t a minták körülbelül felében, amely 70% -ra nőtt, amikor kontrollált fogyasztó emberek mintáit vették, növényekben gazdag étrendet alkalmaztak.
A szekvenált DNS legtöbbje megfelel az emberek által széles körben fogyasztott emberi tápláléknak, beleértve a szemeket is, zöldségek és gyümölcsök.
"Átfogó, jó egyetértés volt a tanulmány résztvevői által vezetett naplókban szereplő élelmiszerek és a székletből szekvenált élelmiszerek között, " - mondja David. "Ha egy ételt beírtak az étrendbe, az idő mintegy 80% -ában, ezt a metabarkódolási megközelítést is megtaláltuk. "
A PCR -kudarc viszonylag magas aránya és az egyes növények szekvenciaszintű megkülönböztetésének képtelensége a jövőben javítanivalót hagy maga után.
Például, Fejes káposzta, brokkoli, A karalábé és a Brüsszel -csíra mind ugyanazon faj növényfajtái, és a kutatók nem tudtak különbséget tenni közöttük a kloroplasztisz DNS -szekvenciák használatával.
Az étrendben az egyetlen nem észlelhető élelmiszer volt a kávé, valószínűleg annak köszönhető, hogy a DNS megsérült vagy felhígult a pörkölés és a főzés során.
David arra számít, hogy a DNS -metabarkódolást a jövőbeni tanulmányokban fogják használni, valamint a korábbi tanulmányok étrend elemzéséhez.
Ehhez a tanulmányhoz hasonlóan El tudnám képzelni, hogy ezt az archivált DNS -hez szokták, hogy lássák, vannak -e mögöttes táplálkozási különbségek, amelyek megmagyarázhatják a vizsgálat során megfigyelhető mikrobiológiai mintákat. Előre menni, azt is el tudjuk képzelni, hogy ezt használják új mikrobiológiai vizsgálatok során, hogy azonosítsák a kapcsolatot bizonyos élelmiszerek és a bélbaktériumok között, valamint a tágabb táplálkozási tanulmányokban, a hagyományos étrend -értékelési technikák kiegészítéseként. "
Lawrence David
3 módszer a szervezet természetes méregtelenítési folyamatának támogatására
Nem szteroid gyulladásgátló szerek (NSAID) és fekélyek
Takayasu-kór (Takayasu arteritis)
A ciklikus hányás szindróma (CVS) tünetei és okai
Hogyan lehet enyhíteni a székrekedést természetes mozgással
Az antibiotikumok gyakran elegendőek a gyermekek vakbélgyulladására
Miben különbözik a szerves betegség a funkcionális rendellenességtől
Szerves betegség minden olyan egészségi állapot leírására használatos, amelyben megfigyelhető és mérhető betegségi folyamat van, például gyulladás vagy szövetkárosodás. Az organikus betegség olyan bet
A hepatitis fertőző? Tünetek, átvitel, gyógyulás
Mi az a hepatitis? A hepatitis egy olyan betegség, amelyet a májgyulladás jellemez. A „hepatitis” egy általános kifejezés, amely a máj bármely gyulladására utal. Számos betegség és állapot, amelyek
Székletkultúrák:mikor és miért?
Egyes emésztési problémák, például a hasmenés, maguktól is elmúlhatnak, de ha nem, akkor célszerű az egészségügyi szolgáltatóhoz fordulni. Az egészségügyi szolgáltatónak el kell végeznie néhány vizsgá