NIH mokslininkai sukuria naują mėginių paruošimo metodą SARS-CoV-2 aptikimui

Nacionalinių sveikatos institutų (NIH) mokslininkai sukūrė naują mėginių paruošimo metodą SARS-CoV-2 aptikimui, virusas, sukeliantis COVID-19. Šis metodas apeina viruso genetinės RNR medžiagos išskyrimą, supaprastinti mėginių valymą ir galbūt sumažinti bandymo laiką bei išlaidas. Šis metodas yra Nacionalinio akių instituto (NEI) tyrėjų bendradarbiavimo rezultatas, NIH klinikinis centras (CC), ir Nacionalinis dantų ir kaukolės veido tyrimų institutas (NIDCR).

Diagnostiniai testai išlieka esminė priemonė kovojant su COVID-19 pandemija. Standartiniai SARS-CoV-2 aptikimo bandymai apima viruso RNR amplifikaciją iki nustatomo lygio, naudojant metodą, vadinamą kiekybiniu atvirkštinės transkripcijos PGR (RT-qPCR). Bet pirma, RNR turi būti išgauta iš mėginio. RNR ištraukimo rinkinių gamintojams buvo sunku išlaikyti paklausą COVID-19 pandemijos metu, trukdo bandymams visame pasaulyje. Atsiradus naujiems virusų variantams, geresnio poreikio, greitesni bandymai yra didesni nei bet kada.

Roberto Hufnagelio vadovaujama komanda, M. D., Daktaras, NEI medicinos genetikos ir oftalmologinio genomo skyriaus viršininkas, ir Bin Guanas, Daktaras, NEI oftalmologinės genomikos laboratorijos bendradarbis, naudojo chelatinę medžiagą, kurią pagamino laboratorijos tiekimo įmonė „Bio-Rad“, vadinamą „Chelex 100“ derva, kad išsaugotų SARS-CoV-2 RNR mėginiuose, skirtuose aptikti RT-qPCR.

„Mes naudojome nosiaryklės ir seilių mėginius su įvairiomis virionų koncentracijomis, kad įvertintume, ar jie gali būti naudojami tiesioginiam RNR aptikimui, “, - sakė Guanas, pagrindinis pranešimo apie techniką autorius, kuri šią savaitę buvo paskelbta „iScience“. „Atsakymas buvo taip, su ryškiai dideliu jautrumu. Taip pat, šis preparatas inaktyvavo virusą, todėl laboratorijos darbuotojams saugiau tvarkyti teigiamus mėginius “.

Hufnagelio komanda padarė savo atradimą išbandydama įvairias chemines medžiagas, naudodama sintetinius ir žmogaus mėginius, kad nustatytų tas, kurios galėtų išsaugoti RNR mėginiuose su minimaliu skilimu, tuo pačiu metu leisdamos tiesiogiai aptikti virusą RT-qPCR.

Norėdami patvirtinti testą, NIDCR Blake M. Warner, D.D.S., Daktaras, M.P.H., ir jo komanda surinko pacientų mėginius (pagal tyrimų protokolą NIH IRB 20-D-0094) ir saugojo juos bet kurioje virusinėje transportavimo terpėje, arba naujai sukurtas chelatų dervos buferis NIH simptominio tyrimo įstaigoje.

Mėginius virusinėse transporto priemonėse išbandė COVID-19 tyrimų grupė NIH klinikiniame centre, vadovauja Karen M. Frank, M. D., Daktaras, naudojant įprastą RNR ekstrahavimą ir RT-qPCR testavimą. Chelatų dervos buferio mėginiai buvo kaitinami ir viruso RNR buvo tada, išbandytas RT-qPCR. Naujasis preparatas žymiai padidino RNR išeigą, kurią galima išbandyti, lyginant su standartiniu metodu.

Manome, kad ši nauja metodika turi akivaizdžių pranašumų, nes padidina jautrumą, išlaidos ir laiko taupymas bandymams. Šis metodas stabilizuoja RNR kambario temperatūroje, kad būtų lengviau transportuoti, sandėliavimas, ir gydymas klinikinėje aplinkoje “.

Robertas B. Hufnagelis, M. D., Daktaras, NEI medicinos genetikos ir oftalmologinio genomo skyriaus viršininkas

NEI apsaugojo intelektinę nuosavybę, susijusią su šia technologija, ir ieško partnerių bendram kūrimui/licencijavimui. Norėdami gauti daugiau informacijos, susisiekite su [email protected].

• Naujas įrodymais pagrįstas požiūris į aukštos kokybės angliavandenių maisto produktų apibrėžimą
• Mokslininkai dokumentuoja, kad antimikrobinėms medžiagoms atsparus pneumoninis maras perduodamas asmeniui