Mokslininkai kuria įrankį, kuris pagreitina biomedicinos duomenų analizę ir paskelbimą

Sinajaus kalno Icahno medicinos mokyklos mokslininkai sukūrė įrankį, kuris pagreitina biomedicinos duomenų analizę ir paskelbimą nuo daugelio mėnesių ar metų iki kelių minučių, pakeisti tai, kaip mokslininkai praneša apie savo studijų rezultatus. Iki dabar, pagrindinis metodas, kuriuo galima dalintis biomedicinos tyrimų duomenimis, buvo paskelbtas spaudoje mokslo žurnaluose. Naujas įrankis, BioJupies, remiasi debesų technologijomis analizuodamas ir vizualizuodamas didelius duomenų kiekius, toks, koks buvo įgytas genų sekos nustatymo būdu, kaip aprašyta 2018 m. lapkričio mėn Ląstelių sistemos .

RNR sekos nustatymas yra labiausiai paplitęs eksperimentinis metodas, naudojamas biomedicininių tyrimų ląstelėms apibūdinti. Pastaraisiais metais, sekos technologija sukėlė revoliuciją, kaip mokslininkai tiria genetinius duomenis, ir ši pažanga vaidina lemiamą vaidmenį narkotikų atradime ir kūrime. Tradiciškai, RNR sekos analizė reikalauja didelių kompiuterinio programavimo įgūdžių ir prieigos prie vietinių didelio našumo skaičiavimo įrenginių, sulėtinti greitį, kuriuo galima analizuoti biomedicinos duomenis, bendrino, ir paskelbtas.

Sukūrus „BioJupies“, Dabar vartotojai gali įkelti ir analizuoti savo RNR sekos duomenis per tam tikrą laiko tarpą, kaip tai buvo padaryta anksčiau. Platforma naudoja debesų kompiuterijos vamzdyną, kuris sumažina RNR sekos duomenų apdorojimo išlaidas iki mažiau nei vieno cento vienam mėginiui. „BioJupies“ taip pat gamina pilną, atviro kodo, interaktyvi ataskaita iš apdorotų duomenų, leidžianti 300, Turi būti paimta 000 viešai prieinamų RNR sekos duomenų rinkinių, iš naujo išanalizuotas, ir pakartotinai panaudotas biomedicinos tyrimams stiprinti.

„Kadangi sugeneruotų biomedicinos duomenų kiekis ir toliau auga eksponentiškai, taip pat turėtų būti naudojami įrankiai joms analizuoti ir dalintis, “ - sakė Avi Maayan, Daktaras, Sinajaus kalno bioinformatikos centro direktorius, Profesorius, Farmakologijos mokslų katedra, Icahno duomenų mokslo instituto fakultetas, ir vyresnysis leidinio autorius. „„ BioJupies “ne tik pagreitina duomenų analizės ir aiškinimo būdą, bet tai taip pat suteikia visiškai naują būdą dalintis rezultatais su pasauline mokslinių tyrimų bendruomene “.

Kadangi naujos genominės technologijos leido surinkti didžiulį kiekį biomedicinos informacijos, kurią galima panaudoti tiksliajai medicinai, prieinamumas, sąveika, ir šių duomenų pakartotinis panaudojimas tapo itin svarbus moksliniams tyrimams. „BioJupies“ atveria kelią tyrėjams, neturintiems skaičiavimo žinių, atlikti RNR sekos analizę, nebereikia bendradarbiauti su bioinformatikais, kad mūsų turtingame pasaulyje klestėtų daugiau medicinos ir mokslo laimėjimų.

• Mokslininkai tiria, ar mažai glitimo turinčias dietas galima rekomenduoti alergiškiems žmonėms
• Tyrimas suteikia naujos informacijos apie noroviruso protrūkius,