O sequenciamento de RNA é o método experimental mais comum usado para traçar o perfil de células em pesquisas biomédicas. Nos últimos anos, a tecnologia de sequenciamento revolucionou a forma como os cientistas examinam os dados genéticos, e esse avanço desempenha um papel crucial na descoberta e no desenvolvimento de medicamentos. Tradicionalmente, A análise de sequenciamento de RNA requer extensas habilidades de programação de computador e acesso a instalações de computação de alto desempenho locais, diminuindo a velocidade em que os dados biomédicos podem ser analisados, compartilhado, e publicado.
Por meio da criação de BioJupies, os usuários agora podem fazer upload e analisar seus dados de sequenciamento de RNA em uma fração do tempo, como feito anteriormente. A plataforma utiliza um pipeline de computação em nuvem que reduz o custo do processamento de dados de sequenciamento de RNA para menos de um centavo por amostra. BioJupies também produz um completo, Código aberto, relatório interativo dos dados processados permitindo 300, 000 conjuntos de dados de sequenciamento de RNA disponíveis ao público a serem buscados, reanalisado, e reutilizado para apoiar a pesquisa biomédica.
"À medida que a quantidade de dados biomédicos gerados continua a aumentar exponencialmente, o mesmo deve acontecer com as ferramentas usadas para analisá-los e compartilhá-los, "disse Avi Ma'ayan, PhD, Diretor do Centro de Bioinformática Mount Sinai, Professor, Departamento de Ciências Farmacológicas, corpo docente do Icahn Institute for Data Science, e autor sênior da publicação. "Os BioJupies não apenas aceleram a maneira como analisamos e interpretamos os dados, mas também fornece uma maneira completamente nova de compartilhar resultados com a comunidade de pesquisa global. "
Como as novas tecnologias genômicas permitiram a coleta de grandes quantidades de informações biomédicas que podem ser aproveitadas para esforços de medicina de precisão, acessibilidade, interoperabilidade, e a reutilização desses dados tornou-se crucial para a pesquisa científica. A BioJupies abre caminho para que pesquisadores sem experiência computacional realizem análises de sequenciamento de RNA sem a necessidade de colaborar com bioinformáticos, permitindo que mais avanços médicos e científicos floresçam em nosso mundo rico em dados.
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