Ploche ONE: Sérum apolipoproteínu C-I a C-III sú redukované v žalúdku pacientok s karcinómom: Výsledky MALDI-Based peptidomu a immuno-Based klinickej Testy

Abstraktné

Nájdenie nových peptidov biomarkery pre rakovinu žalúdka v ľudskom sére, ktoré môžu byť implementovaná do klinicky použiteľnú metódu predikcie pre sledovanie rakoviny žalúdka. Študovali sme sérového peptidomu z dvoch rôznych biorepositories. Najprv sme zamestnali chromatografie prístup C8 reverznej fáze kvapalina pre čistenie vzorky, nasledované analýzou hmotnostnej spektrometrie. Tie boli použité na vzorkách séra s rakovinou bez kontrol a pacientov s rakovinou žalúdka v rôznych štádiách. Potom sme vytvorili analýzu bioinformatiky potrubia sa a identifikoval peptidové podpis diskrimináciu pacientov žalúdok adenokarcinóm z rakovinových bez kontrol. Matrix Assisted Laser desorpcia /ionizácia-Time of Flight (MALDI-TOF) vyplýva hlavne zo 103 vzoriek odhalené 9 podpis peptidy; s predikcie presnosťou 89% v tréningovom sete a 88% v sade validácie. Tri z týchto peptidov diskriminujúce objavených boli fragmenty apolipoproteíny C-I a C-III (apoC-I a C-III); sme ďalej kvantifikované ich hladiny v sére, ako aj CA19-9 a CRP, za použitia kvantitatívne komerčné-klinické testy vo 142 vzorkách. Apoc-I a Apoc-III kvantitatívne výsledky korelujú s výsledkami MS. Potom sme použili apoB-100 normalizovanej Apoc-I a Apoc-III, CA19-9 a hladinu CRP pre generovanie pravidlá stanovené pre predikciu rakoviny žalúdka. Pre školenia, sme použili séra z jedného úložiska, a pre overenie, sme použili séra z druhej úložiska. Predikčný presnosť 88,4% a 74,4% boli získané v školiacich a overovacích sád, resp. sérové ​​hladiny apoC-I a apoC-III v kombinácii s ďalšími klinickými parametrami, môžu slúžiť ako základ pre formulovanie diagnostické skóre u pacientov s rakovinou žalúdka

Citácia :. Cohen M, Yossef R, Erez T, Kugel A, M Welt, Karpasas MM, et al. (2011) Sérum apolipoproteínu C-I a C-III sú redukované na rakovinu žalúdka u pacientov: Výsledky MALDI-Based peptidomu a immuno-Based Klinické testy. PLoS ONE 6 (1): e14540. doi: 10,1371 /journal.pone.0014540

Strih: Hana algul, Technische Universität München, Nemecko

• Ploche ONE: Kvantifikácia chitinasy mRNA hladiny u človeka a myši tkanív real-time PCR: Druhovo špecifická expresia kyslé cicavcov chitinázy v žalúdku Tissues
• Ploche ONE: Molekulárna Genetická analýza obsahu žalúdka odhaľuje Wild Treska kŕmenie na Piscine reovirus (PRV) Infected atlantického lososa pochádzajúce z obchodného Fish Farm