Roman razpršeno želodčne dovzetnosti rak varianto v E-kadherina (CDH1) intron 2: Študija primerov in kontrol v italijanskem population

Roman razpršeno želodčne dovzetnosti rak varianto v E-kadherina (CDH1
) intron 2: študija Kontrolni primer italijansko prebivalstvo
Abstract
Ozadje PODJETJA
Podedovano genetskih dejavnikov, kot so E-kadherina (CDH1
) promotor variante so verjeli, da vplivajo na tveganje proti sporadične razpršeni raka želodca (DGC). V zadnjem času je bila nova regulatorna regija bistvenega pomena za CDH1
transkripcijo opredeljena v CDH1
intron 2.
Metode
smo genotipizacijo vseh znanih polimorfizmov, ki se nahajajo v ohranjenih zaporedij CDH1
intron 2 (rs10673765, rs9932686, rs1125557, rs9282650, rs9931853) v italijanskega prebivalstva, ki sestoji iz 134 primerov DGC in 100 zdravih kontrolah (55 sorodniki bolnikov in 45 nepovezanih, ujema posameznikov). Vpliv posameznih variant na DGC tveganju je bila ocenjena s pomočjo χ 2-testi in logistično regresijo. Relativni prispevek alelov smo ocenili z analizo haplotip
Rezultati
smo opazili precejšnje. (P < 0,0004) Društvo CDH1
163 + 37235G > Varianta (rs1125557) z DGC tveganjem. razmerja obetov je bilo 4,55 (95% IZ = 2,09-9,93) in 1,38 (95% IZ = 0,75-2,55) za AA in GA prevoznikov oz. Ko je prilagojena za starost, spol, kajenja, uživanja alkohola in H. pylori
okužbe, ocene tveganja ostala večinoma značilna za AA prevoznikov. Analiza haplotip predlagali 163 + 37235A-alel prispeva k tveganja za nastanek bolezni neodvisno od drugih variant študiral
Zaključek
CDH1
163 + 37235G >. polimorfizma lahko predstavlja nov dovzetnost varianto za sporadične DGC, če potrjena druge populacije. Glede na širok izraz E-kadherina v epitela, to raziskovalno študijo spodbuja nadaljnje ocenjevanje za 163 + 37235A-alel kot občutljivosti variante v drugih karcinomov.
Ozadje
raka želodca, je glavni vzrok za umrljivost, povezano z rakom in se običajno razvrščene v dve histoloških tipov, črevesne in difuzno obliko (klasifikacija Lauren [1]). Splošne stopnje pojavnosti raka na želodcu so stalno upada, predvsem zaradi zmanjševanja stopnje črevesnega raka tipa. Ta pada frekvenca je verjel, da je posledica izboljšane prehrane in sanitarnih pogojev. V nasprotju s tem, samo zdi pojavnost razpršenega raka želodca (DGC) bolj stabilne v zadnjih nekaj desetletjih [1, 2]. Taka stalna stopnja kaže večji prispevek podedovanega genetskega tveganja namesto okoljskih dejavnikov na difuzno obliko raka na želodcu.
Zaradi njegovega zgodnjega razvoja pod želodčne sluznice površini [3], je DGC običajno diagnosticirana v zaključni fazi in zato povezana s slabšim izidom [1]. Zato lahko genetski DGC označevalci lažjo identifikacijo posameznikov, ogroženih in s tem prispevati k izboljšanju DGC diagnostiko in terapijo.
Na molekularnem nivoju, DGC, se razlikujejo od črevesne tipa na podlagi svoje nenormalno ekspresijo celice pojavljajo pri adhezijska molekula E-kadherina [4]. E-kadherina je ključni element epitelijskih adherens križišča in kot taka je potrebna za funkcionalno medceličnem oprijema v epitelnih listov [5]. V nasprotju s številnimi drugimi epitelijskih raka, je E-kadherina navzdol reguliranih zelo zgodaj v razvoju DGC, kar kaže na vlogo pri začetku te bolezni [3]. Mutacija in promotor hypermethylation genskega-E kadherina (CDH1
) so najbolj doslednih genetske spremembe, opažene v sporadični DGC [6, 7]. Poleg tega CDH1
zarodne mutacije nagnjenost k dedne DGC [8], v skladu z sprožitvi funkcijo pomanjkanjem E-kadherina v DGC. CDH1
zarodne mutacije običajno sodeluje ločiti s prevladujočim vzorcem bolezni med prizadetim družinam, in včasih je mogoče najti v posameznih primerih DGC diagnosticiranih v mladosti (< 45 y) [9]. Vendar pa predstavljajo le približno 1% vseh primerov DGC [9], in zato ne more pojasniti genetsko etiologijo domneva, da prispevajo k navideznim sporadični primeri DGC. razen CDH1
reproduktivnih mutacij genetske spremembe so zato lahko še dodatno tveganje za razvoj DGC v odsotnosti jasne družinske anamneze ali mladosti ob diagnozi.
skupnih alelov variante z blagim funkcionalnim učinkom lahko vpliva na tveganje za sporadične bolezni. Dejansko je polimorfizma posameznih nukleotidov (SNP) v CDH1
promotorja (-160C > A) je bila povezana z bistveno povečanim tveganjem sporadične DGC v nekaterih populacijah visoko pojavnostjo [10-13]. Obravnavanega CDH1
SNP, alela -160A promotor je doslej edina varianta vpletena v DGC tveganjem, vendar se zdi, da deluje v kombinaciji z drugimi CDH1
polimorfizmov [10, 13].
Zadnjem času, nov CDH1
regulatorna regija je bila opisana [14]. Ta regija je vsebovana v CDH1
intronu 2, največji nekodiranih CDH1
segment (66% celotnega zaporedja) in je bilo dokazano, da je zahteva za začetek in vzdrževanje transkripcijske CDH1
dejavnosti v diferencirano povrhnjice. Pomembno je, da intron 2 sekvence so potrebni tudi za normalno CDH1
prepisu med odraslo življenje, ki zagotavlja možnost, da variant v tej regiji lahko vplivajo na razpršeno želodca rakotvornost.
V tej študiji smo genotipizacijo vse znane variante, ki se nahajajo v ohranjenih zaporedij od CDH1
introna 2 in določi svoje alelov frekvence v skupinah italijanskih sporadični primeri DGC in zdravih posameznikov, da razvozlati možne asociacije z boleznijo.
metod
so pacientov
DNK vzorcev, pridobljenih od 134 bolnikov, DGC, ki so bili domačini okrožja Pesaro-Urbino, regije Marche, srednji Italiji. Po operaciji smo DGC diagnoza neodvisno potrjena z dvema patologi. Bolniki so bili klinično ovrednoteni na lokalni Onkološkem enote Medical (Hospital d'Urbino), kjer so tudi zaključil demografske stanja, vključno z njihovo osebno in družinsko zgodovino raka. Podatki so bili preverjeni med razgovori s svojimi onkoloških zdravnikov in njihovo družinsko zgodovino je izslediti za ≥ 3 generacije in bočno do 2 nd in 3 rd stopinj sorodniki. Na podlagi te ocene, nobeden od bolnikov izpolnjuje klinična merila za znano družinsko sindromov raka. Merila vključitev za upravičene bolnikov je bilo: Bela etničnost, doma iz obravnavanega geografskega območja in pomanjkanja družinsko anamnezo raka. so bili sprejeti enaka merila plus pomanjkanje osebne zgodovine raka za nadzor. Vzorce kontrolni DNA smo pridobili od 55 zdravih sorodniki, ki so bodisi v neprizadetih starši (n = 15), sorojenci (22) ali otrok (18) proučevanih bolnikih DGC. Kot zdravi sorodniki niso bili na voljo za vsak DGC bolnika, so bili vključeni vzorci DNK iz skupine nepovezanih zdravih posameznikih (n = 45), opredeljenih z bazenom nekdanjih in sedanjih krvodajalcev iz bolnišnice d'Urbinu dobimo skupaj 100 kontrol. Nepovezani kontrole so bile naključno izbrane frekvence ujemanje na primere, po starosti in spolu. Povprečna starost bolnikov DGC brez sorodnikov bila 54,6 y ± 11.41SD, medtem ko njihovih ustreznimi kontrolnimi bila 52,2 y ± 10.21SD. Vsi predmeti so bili pogovori o njihovih kajenja in pivske navade. H. pylori
stanje je bilo ugotovljeno s patološkim pregledom želodca vzorcev za primere, ter s krvnimi preiskavami ali izdihanega zraka za nadzor. Etične zahteve, so bili preverjeni in notranjega etičnega odbora (Hospital d'Urbino) in vseh udeležencev raziskave odobril dali pisno privolitev.
CDH1 intronov 2 ohranja regije in polimorfizmi PODJETJA
ohranjenim CDH1
intron 2 (GenBank NC_000016) so bile ugotovljene s pridobivanjem ustreznih ljudi, Šimpanz, podgan in miši sekvenc iz baze NCBI (NCBI, Entrez nukleotidov), ki mu sledi uskladitev z uporabo strežnika NCBI (NCBI, Basic Local Alignment Search Tool) in Invitrogen Vector NTI Advance ™ 9.0 Programska oprema (Accelrys Software Inc, San Diego, ZDA). Ohranjeni regije so bile opredeljene kot ob variacije manj kot 5% zaporedja med različnimi vrstami. Konzerviranih regij bili PCR pomnožili v prekrivajočih fragmentov okoli 200 velikosti bp. Ustrezne primerji (glej tabelo 1 za zaporedij in pogoji), so bili oblikovani s pomočjo spletnega orodja GeneFisher [15] in s Sigma-Proligo (Sigma-Aldrich Corporation, St. Louis, ZDA) izdelan. so bili uporabljeni FastStart Taq DNA polimerazo (Roche, Basel, Švica) in PTC-200 PCR stroji (MJ Research, Waltham, ZDA). Naslednji polimorfizmi se nahajajo (Ensemble GenomeBrowser [16]) v pomnoženih regijah: 163 + 14184ΔAGGG (rs10673765, ki se nahajajo v PCR fragmentov C2F1), 163 + 14384C > T (rs9932686, C2F2), 163 + 37235G > A (rs1125557, C3F2 ), 163 + 37276T > A (rs9282650, C3F2) in 163 + 49526C > G (rs9931853, C4F1). TESS spletno orodje [17] je bila uporabljena za iskanje domnevni prepisu vezavo faktorjev območij, ki bi lahko vplivale na zgoraj variants.Table 1 PCR in pogoji

Forward temeljni premaz
Povratne temeljni premaz
TA *
Mg ++ †
DMSO ‡
C1F1
ccgccttaaagaaactcttg
accggtggcaaatactag
65 ° C
1.5 -
C1F2
tagaagggttgaacctgttc
tcttagtccacgagaagaag
65 ° C
1.5
-
C1F3
taggagagcttgtaacaagc
cactcggttctaccgaag
65 ° C
1,5 -
C2F1
tgtattagccacagagaag
ctaaaactagaccacgaag
65 ° C
1,5
-
C2F2
gtcacaaaacagcttg
ccttccttgagcaaggc
65 ° C
1.5 -
C3F1
ttgcctaaggccccctttttgttc
gaatctgcgaagtctacatc
65 ° C
1,5
-
C3F2
acactagccacacatgggactcaag
tgctggtgtggattcaaatgtg
65 ° C
1.5 -
C4F1
acctccgcctcctgggttcaagc
ttcctcccgcttagtg
60 ° C
1.5 -
C4F2
tggccaggcctgtcttaaactc
ttcttaggtccgtgggtttttacg
65 ° C
1.5 -
C4F3
aaagtgctgggattacaggtgtgag
tcgataatcccgagaactc
55 ° C
1,0
+
C4F4
gaaccataggactttgactgatgg
actgatggttatccgggttcccttg
65 ° C
1.5 -
C4F5
agctgttgagctgtcatcacaatcc
gaatttcctacccgtctatggtagg
65 ° C
1.5 -
C5F1
tagtggggagtggggtcttagcttc
tcgttcaccctcctttcttcttacc
58 ° C
1.5 -
C5F2
gggcatgttgaaatatacccagtc
tctgagtaatagaggggtacgttgg
65 ° C
1.5 -
C5F3
cttgccagcgtgacagtg
cgaaaccccgtggagtag
65 ° C
1.5 -
C5F4
caggttggggctcctcgtcatactg
cttccgacgtgacttaaggaaagag
65 ° C
1.5 -
C5F5
gcttgtctcaactttcactgtc
gaatttcctacccgtctatggtagg
65 ° C
1.5 -
C6F1
tggtattcaggaggatgcag
acctacgatcgtaaaaagt
65 ° C
1.5 -
C6F2
cccatcaatgcttatttgttctt
gcctgggagacggagact
65 ° C
1.5 -
C6F3
tgggctgtttgagttttgttc
cggtgtaaaaggttcgtgac
65 ° C
1,5 -
* TA temperaturo žarjenje; † Mg ++ - koncentracija je podana v mm; ‡ DMSO dodamo pri 5% fc
Single-sklop mesnatosti polimorfizma
je Single-sklop mesnatosti polimorfizem (SSCP), ki se uporablja za skeniranje ohranjena intron 2 regiji v 19 italijanskih bolnikih DGC prisotnosti dodatno splošno, ampak populacijske posebni polimorfizmi. SSCP smo izvedli, kot je opisano [18], z izjemo, da je bila ULS ™ 495 fluorofor (Kreatech Biotechnology, Amsterdam, Nizozemska), ki se uporabljajo namesto radioaktivnosti označiti fragmente. Na kratko smo 1 ul produkt PCR inkubiramo z 0,2 ul barvilom v reakciji 20 ul. . Geli so skenirane z uporabo FX molekularno tipala (BioRad, Hercules, ZDA) pri 488 nm
genotipizacijo
naslednja omejitev encimi se uporabljajo za genotipizacijo DNK različice: 0.06 U /ul BsaXI za 163 + 14184ΔAGGG, 1 U /ul BanII
za 163 + 14384C > T, 0,2 U /ul MaeIII
za 163 + 37276T > A in 0,4 U /ul HpaII
za 163 + 49526C > G. Vse encimi so bili od New England BioLabs (Ipswich, ZDA), z izjemo MaeIII
Roche (Basel, Švica). Reakcije so inkubirali preko noči in fragmente ločili na 4% (w /v) agarozni geli
polimorfizmov 163 + 37235G >. A in 163 + 37276T > A so genotipizacijo na ABI Prism 7900 (Applied Biosystems, Foster City, ZDA) z uporabo PCR v realnem času, ki temelji na alelov teste diskriminacije iz Applied Biosystems v skladu z navodili.
zaporedja PODJETJA
Zaznane variante so bili preverjeni z neposrednim sekvenciranja uporabo USB thermosequencing kit (USB, Cleveland, ZDA) in licor 4000L je DNA sekvencer (licor, Lincoln, Nebraska ZDA).
Statistična analiza
razlika razdelitve med primerov in kontrol so ocenili, ki jih je χ 2-testa (z df = 2 za genotipov in df = 1 za alelov) . Nevarnost je bila ocenjena s univariantne analizo in multiple logistične regresije (programska oprema stata, StataCorp LP, College Station, ZDA). Χ 2-preizkus (df = 2) je bil tudi, naj preuči odstopanja od Hardy-Weinberg ravnovesju. Starost razlike med bolniki, ki imajo različne genotipe smo izračunali z uporabo 2-tailed t-testa.
Haplotip frekvence so rekonstruirali od unphased genotipov in genetsko neravnostežje (LD) med SNP je bila ocenjena s pomočjo platforme SHEsis programske opreme [19, 20]. Samo haplotipov z relativno frekvenco > 0,03 v obeh primerih ali nadzora so bile vključene v analizo. Globalno združenje haplotipov z boleznijo je bila izračunana z χ 2-testa (df = 7). 163 + 14184ΔAGGG in 163 + 14384C > variant T niso bili vključeni v končni fazi, saj niso bili informativni. Združenje posameznih haplotipov z boleznijo, je temeljila na 2 x 2 nepredvidljivih tabel v primerjavi z haplotipom A-A-C. LD je bila izražena kot r 2, z r 2 = 1 kaže na popolno LD, r 2 = 0 odsotnost LD, in r 2 < so bile ugotovljene 0,33 kaže na minimalno LD.
Rezultati
Šest ohranjena regije v skupni velikosti 3,2 kbp v CDH1
intron 2. Poleg petih znanih polimorfizmov (CDH1
163 + 14184ΔAGGG (rs10673765), 163 + 14384C > T (rs9932686), 163 + 37235G > A (rs1125557), 163 + 37276T > A (rs9282650) in 163 + 49526C > G (rs9931853)), nobenih dodatnih skupnih polimorfizmi specifični za italijanskega prebivalstva v raziskavi s SSCP odkrili v šestih regijah.
Uporaba polimorfizmom dolžin restrikcijskih fragmentov in alelov teste diskriminaciji, so relativne frekvence genotipov, ki izhajajo iz petih variant določi v primerih DGC in kontrole. Zaporedja naključnih vzorcev potrdili ustreznih genotipov. Vse polimorfizmi so bile v Hardy-Weinberg ravnovesje za obeh primerih in kontrol (p > 0,19). Preglednica 2 povzema distribucij genotipa in njihove razlike med primeri in controls.Table 2 CDH1
intron 2 genotip razdelitve med primerov in kontrol
DGC + 14184ΔAGGG primerov (n = 134)
+ 14184ΔAGGG nadzor (n = 100)
χ2-preizkus
OR (95% CI) *, †
OR (95% CI) *, †
+ /+
+ /Δ
Δ /Δ
+ /+
+ /Δ
Δ /Δ
p
Δ /Δ vs + /+
+ /Δ vs + /+
128
4
2
96
3
1
0.947
1,50 (0,13-16,78)
1,00 (0,21-4,57)
95,5%
3%
1,5%
97%
1,5%
1,5%
14,2%
2,5%
+ 14384C > primeri T (n = 134)
+ 14384C > nadzor T (n = 100)
χ 2 -test
OR (95% CI)
OR (95% CI)
CC
CT
TT
CC
CT
TT
p
TT vs CC
CT vs CC
130
2
2
98
1
1
0,895
1,51 (0,13-16,87)
1,51 (0,13-16,87)
97,0%
1,5%
1,5%
98,0%
1,0%
1,0%
12,3%
12,3%
+ 37235G > A primerov (n = 134)
+ 37235G > A kontrole (n = 100)
χ 2 -test
OR (95% CI)
OR (95% CI)
GG
GA
AA
GG
GA
AA
p
AA vs GG
GA vs GG
30
56
48
37
50
13
0,0003
4,55 (2,09-9,93)
1.38 (0.75-2.55)
22,4%
41,8%
35,8%
37,0%
50,0%
13,0%
100%
40,6%
+ 37276T > A primerov (n = 134)
+ 37276T > A kontrole (n = 100)
χ 2 -test
OR (95% CI)
OR (95% CI)
TT
TA
AA
TT
TA
AA
p
AA vs TT
TA vs TT
65
65
4
46
51
3
0,929
0,94 (0,20-4,42 )
0,90 (0,53-1,53)
48,5%
48,5%
3,0%
46,0%
51,0%
3,0%
1,9%
1,6%
49526C > G primerov (n = 134)
+ 49526C > nadzor G (n = 100)
χ 2 -test
OR (95% CI)
OR (95% CI)
CC
CG
GG
CC
CG
GG
p
GG vs CC
CG vs GG
34
82
18
30
58
12
0,727
1.32 (0.55-3.19)
1.25 (0.69-2.26)
25,4%
61,2%
13.4 %
30,0%
58,0%
12,0%
32,2%
22,5%
* ALI vrednosti so neprilagojeni.
† odstotek pod ALI vrednot ocenjuje moč združevanja za vsako varianto na ustrezen ALI ravni in ob predpostavki, raven pomembnosti 5%
od preiskovanih različic, le 163 + 37235G >. SNP je bila značilno povezana z boleznijo zaradi overrepresentation v A-alel med DGC primerov (56,7% v primerjavi z 38% v kontrolni skupini, χ 2 = 16,1, p < 0,0001; glej tabelo 2). 163 + 37235AA genotip je bil 2,8-krat bolj pogosta v primerih, v primerjavi s kontrolno skupino. Razmerje ustrezne kvote (OR) je predlagal bistveno povečano tveganje za razvoj DGC za AA prevoznike glede na GG prevoznikov (OR = 4,55, 95% CI = 2.09-9.93, p = 0,0002, moč pridružitvenega 100%; tabela 2). Ne znatno povečanje tveganja je razvidno iz nosi GA-genotip (OR = 1,38, 95% CI = 0,75-2,55, p = 0,3, moč pridružitvenega 41%; tabela 2). Tveganje DGC za AA prevozniki še vedno znatna, ko so najbolj oddaljene regije prilagojena glede na starost, spol, uživanja alkohola in H. pylori
okužbo (tabela 3). Pri kadilcih pa je povezano tveganje le mejno pomembna (p = 0,089, preglednica 3). Tveganja, povezana z drugimi variant proučevanih ostala nepomembne po prilagoditvi (podatki niso prikazani). opazili nobene povezave med 163 + 37235G > SNP in starost ob diagnozi (p > 0,16) .table 3 Prilagojeni najbolj oddaljenih regij, povezane s CDH1
intron 2 163 + 37235G > Varianta
Variable

163+37235

Cases

Controls

OR (95% CI)



n
%
n
%

Age
≤ Mediana
GG
17
20
20
34
1
GA
37
45
30
52
1,45 (0,65-3,25)
AA
29.
35
8
14
4,26 (1.55-11.77 )
> Mediana
GG
13
25
17
40
1
GA
19
37
20
48
1,24 ( 0,48-3,24)
AA
19
37
5
12
4,97 (1,47-16,86)
seks
Moški
GG
13
20
20
34
1
GA
28
44
30
51
1.44 (0.60-3.42)
AA
23
36
9
15
3,93 (1,39-11,12)
Moški
GG
17
24
17
41
1
GA
28
40
20
49
1.40 (0.58-3.39)
AA
25.
36
4
10
6.25 (1,79-21,84)
Kajenje
Nikoli
GG
17
24
25
42
1
GA
30
42
30
50
1,47 (0,66-3,26)
AA
25
35
5
8
7,35 (2.34-23.01)
Ever
GG
13
21
12
30
1
GA
26
42
20
50
1,20 (0,45-3,19)
AA
23
37
8
20
2,65 (0.86-8.16))
alkoholu
≤ 20 g /dan
GG
24
26
26
40
1
GA
35
38
31
48
1,22 (0,59-2,55 )
AA
34
37
8
12
4.60 (1.78-11.90)
> 20 g /dan
GG
6
15
11
31
1
GA
21
51
19
54
2,01 (0,63-6,55)
AA
14
34
5
15
5.13 (1,23-21,36)
H. pylori
Negative
GG
2
11
16
37
1
GA
22
48
22
51
3.2 (1.00-10.26)
AA
19
41
5
12
12.16 (2,98-49,64)
Pozitivni
GG
25
28
21
37
1
GA
34
39
28
49
1,02 (0,472 -. 19)
AA
29
33
8
14
3,045 (1,15-8,07)
ugotoviti, ali CDH1
163 + 37235A-alel daje DGC tveganje, samostojno ali v kombinaciji z drugimi introna 2 variante, haplotipov, ki izhaja iz pet polimorfizmi so rekonstruirali in njihove frekvence so bile ocenjene v primerih in kontrole. Dva 5'-variante niso bili informativni in tako so bili izključeni. Intron 2 haplotipov pokazala globalno združenje z boleznijo (df = 7, χ 2 = 24.09, p < 0,002). Na splošno so bile haplotipov, ki vsebujejo 163 + 37235A-alel pogostejše v primerih, v primerjavi s kontrolami, medtem ko so bili trije od štirih haplotipov z G-alel pogostejše med kontrolami (tabela 4). se je najbolj združenje z boleznijo v AAG in haplotipov zračnega prometa (z 163 + 37235A na položaju 1). Nasprotno pa GAG in GTC haplotipov pokazala najmočnejšo zaščito. Analiza vezavno neravnotežje je navedeno v veliki meri odsotne LD med preiskovanih variant (r 2 < 0,03, Tabela 5), ​​kar kaže, da je CDH1
163 + 37235G > SNP lahko dajejo večjo nagnjenost k DGC neodvisno od drugih variant investigated.Table 4 CDH1
frekvence haplotiski intron 2 med DGA primerov in kontrol

zadevi (freq) †

Control (frekvenca) †
Fisherjev p
Pearsonov p
OR (95% CI)
AAC *
16.04 (0.060)
5.31 (0.027)
0,088
0,088
2,33 (0,86-6,34)
AAG
17.49 (0.065)
5.34 (0.027 )
0,056
0,056
2,55 (0,95-6,83)
ATC
73.09 (0,273)
35.43 (0,177)
0,015
0,015
1,74 (1,11 -2,74)
ATG
45.38 (0,169)
29.91 (0.150)
0.565
0,565
1.16 (0.70-1.92)
GAC
21.73 (0,081)
24.18 (0,121)
0,152
0,152
0.64 (0.35-1.18)
GAG
17.75 (0,066)
22.17 (0,111)
0,087
0,087
0,57 (0,30-1,09)
GTC
39.15 (0.146)
53.07 (0.265)
0.001
0.001
0,47 (0,30-0,75)
GTG
37.37 (0,139)
24.85 (0.123)
0,602
0,602
1,16 (0,67-1,99)
* haplotip naročilo: 163 + 37235G > A, 163 + 37276T > A, 163 + 49526C >G. Dva 5'variante niso bili vključeni, ker ni dodatno razdeljena na haplotipov.
† Številke se nanašajo na rekonstruiranih številke haplotip med primeri (257) in nadzor (192), pri vsakem posamezniku, ki nosi dva kromosoma. Relativne frekvence so podane v odstotkih. Niso vsi podatki genotip je bila vključena v analizo, saj so padle nizke frekvence haplotipov.
Tabela 5 vezavno neravnotežje med CDH1
intron 2 polimorfizmi
r2 vezavno neravnotežje

163 + 14384C > T
163 + 37235G >
163 + 37276T >
163 + 49526C >G
163 + 14184ΔAGGG
0.001
0.000
0.001
0.001
163 + 14384C > T -
0,002
0.000
0.000
163 + 37235G >
- -
0.028
0.000
163 + 37276T > -
- -
0,003 <

• Odnos žilnih endotelijskih rastnih faktorjev genskih polimorfizmov in kliničnim izidom pri bolnikih z napredovalo želodca z rakom, zdravljenih s FOLFOX: VEGF polimorfizem pri raku želodca
• Predoperativno kemoradioterapija za lokalno napredovalega raka želodca