Det svåra akuta respiratoriska syndromet coronavirus 2 (SARS-CoV-2), orsaken till covid-19-pandemin, sprider sig främst genom luftburen överföring, antingen i andningsdroppar eller aerosoler. Fekal överföring är ytterligare en möjlig väg genom vilken viruset sprids.
En annan spridningsmetod är när människor rör vid virusinnehållande droppar som faller på olika ytor som tabeller, dörrhandtag, och räknare. SARS-CoV-2 har detekterats på en mängd olika ytor, inklusive plast, kartong, stål, och metaller.
Bakteriesammansättning är förutsägande för SARS-CoV-2-status i nares, panna, pall och inre golvprover. Prediktionsprestandan för Random Forest-klassificerare på SARS-CoV-2-status för varje provtyp bedömdes med AUROC (A) och AUPRC (B) för nares (n =76), panna (n =79), pall (n =44), och innergolv (n =107), i en 100-faldig korsvalideringsmetod (se metoder). (C) EMPress-plot av de 100 funktioner som är mest prediktiva för SARS-CoV-2-status i nares, panna, avföring och inre golvprover, där en enda ASV med 100% anpassning till Rothia dentocariosa identifierades för alla provtyper. Topp 100 slumpmässiga skogsvikt och GreenGenes taxonomi från nares, panna, pall, och inre golvprover finns i S2. (D) Andel prover som innehåller den mycket prediktiva Rothia dentocariosa ASV i SARS-CoV-2 positiva och negativa prover från den aktuella studien, och från (30) (ICU 2016 före 263 COVID19) Risken för att drabbas av SARS-CoV-2-viruset är större inomhus än utomhus, särskilt i dåligt ventilerade områden. Ett inomhusmikrobiom kan vara unikt beroende på miljön, domineras mestadels av mänskliga mikroorganismer.
Mikroberna är i allmänhet bakterier, men inomhusområden kan också ha virus när sjuka människor är närvarande. Samspelet mellan virus och bakterier har varit känt och studerat, till exempel, hos djur, interaktionen mellan tarmbakterier och tarmvirus. Tarmbakterier kan påverka gastrointestinal virusinfektion genom att förbättra termostabilitet och miljöstabilitet hos virus. Interaktioner mellan virus och bakterier har också observerats i de övre luftvägarna. Därav, det är möjligt att sådana interaktioner förekommer även i inomhusutrymmen.
Patient (n =16) demografi (A), intag av antibiotika (B), komorbiditet (C). Forskare från University of California, San Diego, IBM, T. J. Watson Research Center och IBM-Almaden undersökte om mikroberna som finns i en inomhusmiljö kan påverka SARS-CoV-2-infektion. De rapporterade sina resultat i en artikel publicerad på medRxiv * förtrycksserver.
Författarna erhöll stickprov från patienter och vårdpersonal vid UCSD Medical Center. De torkade huden, luftvägar, pall, och olika ytor som patienter och vårdpersonal kom i kontakt med för att samla 972 prover från människor och 734 prover av sjukhusytor.
Av ytproven, cirka 13% var positiva för SARS-CoV-2. Golv nära en patients säng hade mest virus. Viss virus hittades också hos patienter som hade testat negativt för viruset och i rum städade efter att ha blivit upptagna av en positiv patient.
Med hjälp av 16S rRNA -testet, de identifierade de olika mikroberna i proverna. De hittade olika kluster av mikrober på golvet, pall, och näsborre/panna prover. Ytor som ofta berörs av vårdpersonal hade mikrobiomer som liknade deras mikrobiomer, och de som berördes av patienterna mer hade mikrobiomer som liknade patienterna.
Den genomsnittliga artdiversiteten var mycket högre i ytproven, speciellt golvet, än i prover från människor, med mångfalden mer i SARS-CoV-2 positiva prover. Analys av mikroberna som finns i positiva prover, författarna hittade Clostridiales att vara en grupp närvarande i hög andel avföringsprover, liknande den som finns i avloppsvattenstudier. Actinomyces, Anaerococcus, Dialister, Gemella, och Schaalia sågs i pannan och näsborren.
De hittade Rothia dentocariosa att vara vanligt i pannan, näsborre, pall, och golvprover och var vanligare i SARS-CoV-2 positiva prover. Rothia finns i allmänhet inte i sjukhusprover, hittade författarna, efter att ha jämfört en tidigare sjukhusmikrobiomstudie, och var specifik för SARS-CoV-2.
Ilis rumsliga kartläggning av standard sjukhusrum (icke-ICU) och intensivvårdsavdelning (ICU). Heatmap visar andelen prover som samlats in på varje plats som var positiva för SARS CoV-2. Även om SARS-CoV-2-viruset detekterades i inomhusmiljön i patientrum, Det är okänt om de upptäckta virusen var livskraftiga. På grund av de höga Ct -värdena för de flesta proverna och bristen på infektion hos vårdpersonal som tar hand om patienterna, författarna drar slutsatsen att positiva ytor var osannolika källor till virusinfektion i sjukhusmiljön som studerades när lämpligt personligt skydd användes. Dock, effektiva rengöringsmetoder bör upprätthållas för att rutinmässigt rengöra ytor för att minska risken för överföring.
Närvaron av Rothia har setts i tidigare studier av SARS-CoV-2, tyder på en stark koppling till viruset, även om mekanismen inte är klar. Rothia arter har setts i det humana orala och gastrointestinala mikrobiomet och föreslår ökad oral-fekal överföring, en egenskap hos COVID-19. Rothia har också setts vara högre hos COVID-19-patienter med hjärt-kärlsjukdom, men det har också observerats hos kardiovaskulära patienter utan COVID-19. Fler studier behövs för att förstå denna förening och om den kan användas i metoder för att minska SARS-CoV-2-överföring.
Bland alla prover, panna, näsborrar, pall, bakterien Rothia dentocariosa var mycket förutsägbar för och associerad med SARS-CoV-2-infektion. Föreningen kan vara ett resultat av bakteriens direkta interaktion med viruset eller indirekt genom effekter på värden, vilket tyder på att det kanske spelar en roll för bakterie-virussynergi vid överföring av COVID-19.
medRxiv publicerar preliminära vetenskapliga rapporter som inte är fackgranskade och, därför, ska inte betraktas som avgörande, vägleda klinisk praxis/hälsorelaterat beteende, eller behandlas som etablerad information.
Typ 1 -diabetes kopplad till tarmmikrobiom och genetiska faktorer
Ulcerös kolit och en saknad mikrob i tarmen
Kvinnor födda med kejsarsnitt har större risk för fetma och diabetes
Fekaltransplantation från vissa givare bättre än andra
Begränsad tarminflammation vid COVID-19
Nyupptäckta stora fager suddar gränsen mellan liv och skada
Växtbaserade dieter förbättrar hjärthälsan via tarmmikrobiomet
En ny studie publicerad i februari 2020 i Journal of the American College of Cardiology rapporterar att ett minskat intag av djurbaserade livsmedel och en kost baserad på växter kan resultera i en l
Kan antivirala läkemedel som härrör från mikroalger bekämpa SARS-CoV-2 och andra virus?
Med framväxten av den pågående coronavirus-pandemin 2019 (COVID-19), orsakad av det allvarliga akuta andningssyndromet coronavirus 2 (SARS-CoV-2), en häftig sökning efter effektiva och säkra antiviral
Rengöringsprodukter kan öka risken för astma i barndomen finner studier
Enligt en ny studie från forskare vid Simon Fraser University:s fakultet för hälsovetenskap (SFU), exponering för hushållsrengöringsprodukter som spädbarn kan öka risken för astma hos barn till 3 år.