Genomisk analyse af specifik E. coli -stamme kan hjælpe med at udvikle potentielle vacciner

Fødevarebårne patogener er meget almindelige og normalt godartede, men visse virulente stammer af patogener kan resultere i alvorlig sygdom og endda død. Sondring af specifikke stammer af patogener kan hjælpe forskere med bedre at forstå dem og udvikle biomarkører for at hjælpe med at opdage dem hos patienter, fremskynde diagnose og behandling.

Universitetet i Buffalo forskere har nu afsluttet den genomiske analyse af en specifik stamme af Shiga-toksin E coli (STEC), der kan forårsage alvorlige sygdomsudbrud og er mere og mere almindelig. Forskningen kan spille en rolle i at udvide forståelsen for STEC -infektioner og, potentielt, ved at udvikle vacciner mod dem.

Ifølge Centers for Disease Control and Prevention, STEC anslås at forårsage mere end 265, 000 infektioner om året i USA, og er forbundet med mere end 3, 600 indlæggelser og cirka 30 dødsfald.

Udgivet i BMC Genomics sidste måned, papiret beskriver den genomiske analyse udført på en unik STEC-stamme isoleret fra et ellers sundt 2 ½-årigt barn, der bor i Davidson County, Tennessee.

Patogenet forårsagede alvorlig sygdom, herunder hæmolytisk uræmisk syndrom, en tilstand, der ødelægger røde blodlegemer sænker blodplader og blokerer blodkar i nyrerne, resulterer i anæmi og nyreskade.

Barnet overlevede, men blev indlagt på hospitalet i en måned og fik alvorlige komplikationer, der påvirkede flere organsystemer, herunder hendes lunger, hjerte, nyre, hjerne, kredsløbssystemet og mave -tarmkanalen.

En voksende bekymring for folkesundheden

Shiga-toksinet producerer E coli hun var inficeret med er en ikke-0157 STEC. Selvom patogenerne klassificeret som 0157 STEC -infektioner generelt er mere almindelige og resulterer i mere alvorlig sygdom, antallet af nye, ikke-0157 STEC-patogener har været stigende. Nogle fører til alvorlig sygdom, skabe en voksende bekymring for folkesundheden, ifølge UB -forskerne.

Papiret siger, at der er mere end 400 af disse ikke-0157 STEC-stammer, og mere end en fjerdedel rapporteres at forårsage mave -tarmsygdom, ofte præsenteres først som blodig diarré med hæmolytisk uræmisk syndrom, og hvis det ikke behandles, i sjældne tilfælde, død.

Det specifikke patogen, barnet var inficeret med, var en STEC 0145:H25. "Da genomiske undersøgelser af nye ikke-0157 STEC-begrænsninger er begrænsede, vores undersøgelser er betydningsfulde, fordi de afslører den genetiske sammensætning af nye STEC 0145:H25 i sammenligning med andre STEC -stammer. "

Oscar G. Gómez-Duarte, MD, Ph.d., Undersøg tilsvarende forfatter og lektor, Institut for Pædiatri, Universitetet i Buffalo

Gómez-Duarte er også chef for afdelingen for pædiatriske infektionssygdomme på Jacobs School of Medicine and Biomedical Sciences ved UB og en børnelæge med UBMD Pædiatri.

"Resultaterne afslører, hvordan denne nye STEC forårsager alvorlig sygdom, og at den kan være lige så virulent, eller endnu mere virulent, end mere almindelige STEC -stammer, fører til alvorlig og endda dødelig sygdom hos modtagelige værter, "sagde han." Det giver også oplysninger om, hvordan denne potentielt forebyggelige infektion fortsat påvirker sårbare personer. "

Virulensgener

Et centralt fund af undersøgelsen, han sagde, var, at denne 0145:H25 -serotype fører til særlig alvorlig infektion. I øvrigt, ud over at bære virulensgener til stede i 0157 STEC, den har yderligere gener og nye potentielle virulensgener sammenlignet med andre ikke-0157-stammer, der er blevet undersøgt. "Disse fund fortjener yderligere analyse for at forstå patogenesen af ​​disse nye STEC -infektioner, "sagde Gómez-Duarte.

• Forskere identificerer sammenhæng mellem forstyrret søvn,
• Hunders ældningsmekanisme og hukommelsesydelse forbundet med tarmmikrobiomsammensætning