Genomisk analyse av spesifikk E. coli -stamme kan bidra til å utvikle potensielle vaksiner

Matbårne patogener er svært vanlige og vanligvis godartede, men visse virulente stammer av patogener kan resultere i alvorlig sykdom og til og med død. Å skille mellom spesifikke stammer av patogener kan hjelpe forskere til bedre å forstå dem og utvikle biomarkører for å oppdage dem hos pasienter, fremskynde diagnose og behandling.

Universitetet i Buffalo forskere har nå fullført den genomiske analysen av en bestemt stamme av Shiga-toksin E coli (STEC) som kan forårsake alvorlige sykdomsutbrudd og er stadig mer vanlig. Forskningen kan spille en rolle i å utvide forståelsen av STEC -infeksjoner og, potensielt, i å utvikle vaksiner mot dem.

Ifølge Centers for Disease Control and Prevention, STEC anslås å forårsake mer enn 265, 000 infeksjoner per år i USA, og er assosiert med mer enn 3, 600 sykehusinnleggelser og omtrent 30 dødsfall.

Publisert i BMC Genomics forrige måned, papiret beskriver den genomiske analysen fullført på en unik STEC-stamme isolert fra et ellers sunt 2 ½ år gammelt barn som bor i Davidson County, Tennessee.

Patogenet forårsaket alvorlig sykdom, inkludert hemolytisk uremisk syndrom, en tilstand som ødelegger røde blodlegemer, senker blodplater og blokkerer blodårer i nyrene, resulterer i anemi og nyreskade.

Barnet overlevde, men ble innlagt på sykehus i en måned og fikk alvorlige komplikasjoner som påvirket flere organsystemer, inkludert lungene hennes, hjerte, nyre, hjerne, sirkulasjonssystemet og mage -tarmkanalen.

Et voksende folkehelseproblem

Shiga-toksinet som produserer E coli hun ble smittet med er en ikke-0157 STEC. Selv om patogenene klassifisert som 0157 STEC -infeksjoner generelt er mer vanlige og resulterer i mer alvorlig sykdom, antall nye, ikke-0157 STEC-patogener har økt. Noen fører til alvorlig sykdom, skape et voksende folkehelseproblem, ifølge UB -forskerne.

Avisen sier at det er mer enn 400 av disse ikke-0157 STEC-stammene, og mer enn en fjerdedel er rapportert å forårsake gastrointestinal sykdom, presenterer ofte først som blodig diaré med hemolytisk uremisk syndrom og hvis det ikke behandles, i sjeldne tilfeller, død.

Det spesifikke patogenet barnet ble smittet med var en STEC 0145:H25. "Siden genomiske studier av fremvoksende ikke-0157 STEC er begrensede, våre studier er viktige fordi de avslører den genetiske sammensetningen av fremvoksende STEC 0145:H25 i sammenligning med andre STEC -stammer. "

Oscar G. Gómez-Duarte, MD, PhD, Studere tilsvarende forfatter og førsteamanuensis, Institutt for pediatri, Universitetet i Buffalo

Gómez-Duarte er også sjef for divisjonen for pediatriske smittsomme sykdommer ved Jacobs School of Medicine and Biomedical Sciences ved UB og barnelege med UBMD Pediatrics.

"Funnene avslører hvordan denne nye STEC forårsaker alvorlig sykdom og at den kan være like virulent, eller enda mer virulent, enn mer vanlige STEC -stammer, som fører til alvorlig og til og med dødelig sykdom hos mottakelige verter, "Den sa også. Den gir også informasjon om hvordan denne potensielt forebyggbare infeksjonen fortsetter å påvirke sårbare individer."

Virulensgener

Et sentralt funn av studien, han sa, var at denne 0145:H25 -serotypen fører til spesielt alvorlig infeksjon. Videre, i tillegg til å bære virulensgener i 0157 STEC, den har flere gener og nye potensielle virulensgener sammenlignet med andre ikke-0157-stammer som har blitt studert. "Disse funnene fortjener ytterligere analyse for å forstå patogenesen til disse fremvoksende STEC -infeksjonene, "sa Gómez-Duarte.

• Forskere identifiserer koblingen mellom forstyrret søvn,
• Hundens aldringsmekanisme og hukommelsesytelse knyttet til tarmmikrobiomsammensetning