Stomach Health > želudac Zdravlje >  > Q and A > želudac pitanje

Sastav i struktura nazofaringealnog mikrobioma povezani su s težinom bolesti COVID-19

Virusne infekcije povezane su s promjenama u mikrobiomu gornjih dišnih putova/nazofarinksa (NP). U Dodatku, mnoge studije pretpostavljaju mogućnosti 'super infekcija' zbog potisnutog imuniteta tijekom virusnog napada.

Virulentni patogeni mogu se promovirati mikrobiotom, ali komenzalna mikrobiota također može suzbiti širenje virusa. Pokazalo se da te interakcije utječu na kliničke ishode.

Kako se ponaša trenutna pandemija COVID-19 (koronavirusna bolest 2019), uzrokovana teškim akutnim respiratornim sindromom koronavirusa 2 (SARS-CoV-2), utječu na bakterijski mikrobiom?

U nedavnoj studiji koju je vodila dr. Amy K Feehan, istraživači su pretpostavili da bi status COVID-19 bio povezan s promjenom mikrobioma NP, osobito kod hospitaliziranih pacijenata. Rezultati ovog istraživanja podržavaju dinamične i značajne promjene mikrobioma u NP prostoru, osobito kada pacijenti koriste uređaj za pomoć pri disanju.

Hospitaliziranim pacijentima s COVID-19 pružaju se tretmani disanja. U ovoj studiji, istraživači su ispitali sastav zajednice u odnosu na tri atributa - status COVID -19, pomoć pri disanju, i korištenje antibiotika. Ova studija objavljena je u časopisu, Primijenjena mikrobiologija.

„Razlike u presjeku mikrobioma bile su očite kod infekcije SARS-CoV-2, ali su potrebne longitudinalne studije kako bi se razumjela dinamika modulacije mikroba u liječenju virusa i disanja. "

Studija

Istraživači su koristili plitko sekvenciranje sačmarica poprečnog presjeka uzoraka medicinskog otpada iz Louisiane, SAD, koji su potvrđeni PCR pozitivnim na SARS-CoV-2 u različitim stupnjevima ozbiljnosti (asimptomatski, hospitalizacija, i smrt). Ovo istraživanje obuhvatilo je 79 pozitivnih uzoraka SARS-CoV-2 i 20 negativnih uzoraka (kontrola).

Znanstvenici su predstavili demografiju povezanu s uzorcima. Na primjer, informacije poput stacionara, korištenje uređaja za pomoć pri disanju, Ozbiljnost COVID-19, status pušenja, dob, spol, i trka.

Koristeći metagenomski niz i klasifikaciju, procijenili su sastav mikrobioma briseva nazofarinksa ovih pozitivnih i negativnih pojedinaca na SARS-CoV-2.

Trakasti grafikon postotka pacijenata unutar svake skupine za tri atributa kod kojih je gen otkriven. Svaki od stupova predstavlja jedan od 21 roda (os x). Testirana su tri svojstva:status infekcije COVID-19

Sastav zajednice i različito obilje

Pronašli su ukupno 202 jedinstvena roda u svim uzorcima, od kojih, identificirali su ukupno 27 jedinstvenih rodova. U Dodatku, Pozitivnost na COVID-19 povezana je s povećanom zastupljenošću Serratia , sveprisutni mikroorganizam. Posebno, Serratia marcescens priznati je uzročnik ljudskih bolesti, uključujući upalu pluća.

Istraživači su otkrili Serratia , Streptococcus , Enterobacter , Veillonella , Prevotella , i Rothia često u pacijenata s COVID-19 koji su koristili pomagala za disanje.

Također, izvijestili su da postoje dva roda: Finegoldia , oportunistički ljudski patogen, i Peptoniphilus , tipično povezan s crijevnom i vaginalnom mikrobiotom, bili su potpuno odsutni kod pacijenata s COVID-19 koji su trebali pomoć pri disanju; dok je prisutan kod pacijenata kojima nije bila potrebna pomoć pri disanju.

Uočili su da je pojedinačno relativno brojnost Veillonella bilo je slično među grupama, i relativno obilje Finegoldia bio je očito veći u skupini koja je uzimala antibiotike.

Raznolikost vrsta

Izračunali su alfa raznolikost (raznolikost unutar određenog područja ili ekosustava; bogatstvo vrsta) i beta raznolikost (razlika u raznolikosti vrsta među ekosustavima; promet vrsta).

Za razliku od statusa COVID-19, istraživači su otkrili da je alfa raznolikost različita za dobni status i za pojedince koji su pušili. Dobro je poznato da starost i pušenje utječu na mikrobiom crijeva, koža, i gornjih dišnih putova.

Iako su otkrili da je beta raznolikost mikrobioma značajno različita za one koji su imali COVID-19, koristili pomagala za disanje, imao stacionarni bolnički boravak, i, također, oni koji su umrli. Iznenađujuče, istraživači su uočili rasne razlike u beta-raznolikosti NP prostora i naglasili potrebu za studijom velikog uzorka koja bi to dodatno procijenila.

„Međudjelovanje infekcije SARS-CoV-2, liječenje disanja, boravak u bolnici, i respiratorni mikrobiomi su složeni, a za utvrđivanje uzročno -posljedičnih veza potrebna je detaljna vremenska linija i/ili uzdužno uzorkovanje pacijenata. "

Sažetak

Iako ova studija ne razmatra upotrebu posebnih lijekova koje su pojedinci uzimali zbog ograničenja u vrijeme prikupljanja podataka, snažno naglašava vezu između infekcije COVID-19 i promjena u mikrobnoj zajednici. Očigledno je da COVID -19 mijenja mikrobiom NP - u raznolikosti, frekvencija, i obilje. Dodatno, liječenje disanjem utječe na vrstu i brojnost mikrobnih svojti koje čine NP mikrobiom.

Razlike u populaciji pacijenata, geografija, i klimu, ili čak količina ili genomska raznolikost virusa SARS-CoV-2 zajedno igraju određenu ulogu u mikrobiomu NP.

Other Languages