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El estudio proporciona nuevos conocimientos sobre los microbiomas de las poblaciones agrícolas preindustriales.

Un nuevo estudio publicado esta semana demuestra un primer intento de utilizar los métodos de detección de bacterias antiguas, pionero en estudios de epidemias pasadas, caracterizar la diversidad microbiana del contenido intestinal antiguo de dos letrinas medievales.

Los hallazgos brindan información sobre los microbiomas de las poblaciones agrícolas preindustriales, lo que puede proporcionar un contexto muy necesario para interpretar la salud de los microbiomas modernos.

A través de los años, Los científicos han notado que quienes viven en sociedades industrializadas tienen un microbioma notablemente diferente en comparación con las comunidades de cazadores-recolectores de todo el mundo. De esto, un creciente cuerpo de evidencia ha relacionado los cambios en nuestro microbioma con muchas de las enfermedades del mundo industrializado moderno, como la enfermedad inflamatoria intestinal, alergias y obesidad.

El estudio actual ayuda a caracterizar el cambio en los microbiomas intestinales y destaca el valor de las letrinas antiguas como fuentes de información biomolecular.

Microbiomas intestinales antiguos:explorando las entrañas de la historia

Piers Mitchell, de la Universidad de Cambridge, se especializa en los contenidos intestinales de personas del pasado mediante el análisis de sustratos inusuales. Al observar el contenido de las letrinas arqueológicas y las heces desecadas bajo el microscopio, él y su equipo han aprendido mucho sobre los parásitos intestinales que asolaron a nuestros antepasados.

"El análisis microscópico puede mostrar los huevos de gusanos parásitos que vivían en los intestinos, pero muchos microbios en el intestino son simplemente demasiado pequeños para verlos, ", comenta Mitchell." Si vamos a determinar qué constituye un microbioma saludable para la gente moderna, deberíamos empezar a mirar los microbiomas de nuestros antepasados ​​que vivieron antes del uso de antibióticos, Comida rápida, y las demás trampas de la industrialización ".

Kirsten Bos, un especialista en ADN bacteriano antiguo del Instituto Max Planck para la Ciencia de la Historia Humana y codirector del estudio, Primero se mostró escéptico sobre la viabilidad de investigar el contenido de las letrinas que habían estado fuera de servicio durante mucho tiempo.

"Al principio no estábamos seguros de si las firmas moleculares del contenido intestinal sobrevivirían en las letrinas durante cientos de años. Muchos de nuestros éxitos en la recuperación de bacterias antiguas hasta ahora provienen de tejidos calcificados como huesos y cálculos dentales. que ofrecen condiciones de conservación muy diferentes. Sin embargo, "dice Bos, "Realmente esperaba que los datos aquí cambiaran mi perspectiva".

El equipo analizó sedimentos de letrinas medievales en Jerusalén y Riga, Letonia que data del siglo XIV al XV d.C. El primer desafío fue distinguir las bacterias que alguna vez formaron el intestino antiguo de las que fueron introducidas por el medio ambiente. una consecuencia ineludible de trabajar con material arqueológico.

Los investigadores identificaron una amplia gama de bacterias, arqueas protozoos, gusanos parasitos, hongos y otros organismos, incluyendo muchos taxones que se sabe que habitan en los intestinos de los humanos modernos.

"Parece que las letrinas son fuentes valiosas de información tanto microscópica como molecular, "concluye Bos.

No hay coincidencias modernas para microbiomas antiguos

Susanna Sabin, una alumna de doctorado del MPI-SHH que codirigió el estudio, comparó el ADN de la letrina con el de otras fuentes, incluyendo microbiomas de poblaciones industriales y forrajeras, así como aguas residuales y suelo.

"Descubrimos que el microbioma de Jerusalén y Riga tenía algunas características comunes:mostraban similitudes con los microbiomas modernos de cazadores recolectores y los microbiomas industriales modernos". pero eran lo suficientemente diferentes como para formar su propio grupo único. No conocemos una fuente moderna que albergue el contenido microbiano que vemos aquí ".

El uso de letrinas, donde las heces de muchas personas se mezclan, permitió a los investigadores una visión sin precedentes de los microbiomas de comunidades enteras.

Estas letrinas nos proporcionaron información mucho más representativa sobre la población preindustrial más amplia de estas regiones que la que tendría una muestra fecal individual. La combinación de evidencia de microscopía óptica y análisis de ADN antiguo nos permite identificar la asombrosa variedad de organismos presentes en los intestinos de nuestros antepasados ​​que vivieron hace siglos ".

Piers Mitchell, Universidad de Cambridge

A pesar de la promesa de este nuevo enfoque para investigar el microbioma, Sigue habiendo desafíos.

"Necesitaremos muchos más estudios en otros sitios arqueológicos y períodos de tiempo para comprender completamente cómo cambió el microbioma en los grupos humanos a lo largo del tiempo". "dice Bos". Sin embargo, hemos dado un paso clave al demostrar que la recuperación del ADN de los antiguos contenidos intestinales de letrinas pasadas puede funcionar ".

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