La nouvelle initiative sera lancée avec le soutien et la collaboration solides de l'Université du Maryland, Baltimore (UMB) et son président, Bruce Jarrell, MARYLAND, qui soutient le programme depuis sa création. A l'UMSOM, cette initiative sera dirigée par Claire Fraser, Doctorat, le professeur titulaire du doyen et directeur de l'Institut des sciences du génome (IGS) de l'UMSOM, et Sanford Stass, MARYLAND, Professeur et président du département de pathologie et du département de technologie médicale et de recherche de l'UMSOM. Cette initiative de test à grande échelle sera progressivement renforcée pour pouvoir éventuellement en exécuter jusqu'à 20, 000 tests par jour dans les prochains mois. Cela permettra un accès beaucoup plus large aux tests dans le Maryland grâce à la coordination avec la ville de Baltimore et le département de la santé de l'État.
Notre État continue de mobiliser tous les outils de l'arsenal de la santé publique pour lutter contre la propagation de ce virus, y compris l'expertise de notre système universitaire. Augmenter notre capacité de test est essentiel pour aller de l'avant, et je tiens à remercier l'Institut des sciences du génome et le département de pathologie de la faculté de médecine de l'Université du Maryland pour s'être associés à nous dans le but d'étendre considérablement les tests COVID-19 ici dans le Maryland. »
Larry Hogan, Gouverneur du Maryland
Les échantillons de patients seront traités sur des plateformes robotiques dotées de technologies automatisées hébergées dans un laboratoire de l'Institut UMSOM pour les sciences du génome (IGS). Le nouveau financement de l'État permettrait l'achat de plates-formes supplémentaires pour faciliter une augmentation de la capacité de test. L'analyse des échantillons aura lieu à l'Université du Maryland Pathology Associates (UMPA), Accrédité CLIA/CAP, qui est exploité par le service de pathologie de l'UMSOM.
"Un obstacle majeur auquel nous sommes confrontés est de ne pas comprendre l'étendue de la maladie asymptomatique dans la population du Maryland, " a déclaré le Dr Jarrell. " Avoir un large accès aux tests à haut débit nous montrera où se trouve la maladie et comment elle se propage. C'est l'orientation dont nous avons besoin pour contrôler cette pandémie plus efficacement jusqu'à ce qu'un vaccin puisse être développé."
L'État a un besoin urgent d'une augmentation des tests de coronavirus, et l'École de médecine a déjà l'infrastructure initiale en place, en termes de technologie et d'expertise scientifique pour aider à combler l'écart de test. Ce financement qui nous est fourni nous permettra de mieux suivre la propagation du virus et de fournir des diagnostics et des traitements plus rapides à ceux qui en ont besoin. »
Doyen Reece, Vice-président exécutif chargé des affaires médicales, Université du Maryland, et le professeur distingué John Z. et Akiko K. Bowers
Alors que 18 personnels de laboratoire sont actuellement nécessaires pour en traiter au maximum 3, 000 échantillons par jour dans l'installation IGS, passant à 20, 000 échantillons par jour impliqueraient 60 employés de laboratoire travaillant trois quarts de 8 heures sur une période de 24 heures. Cette augmentation de la dotation en personnel et des tests d'échantillons se déroulera sur quelques mois.
« Dans un premier temps, nous ferons appel à des techniciens supplémentaires qui travaillent actuellement à domicile. La montée en puissance jusqu'à un personnel complet se fera au fil du temps, " a déclaré le Dr Fraser. " Je suis sûr que beaucoup de nos employés de laboratoire seraient impatients de retourner sur place pour travailler pour une entreprise aussi utile. "
La plupart des patients de l'État doivent attendre une semaine ou plus pour que les équipements commerciaux renvoient leurs résultats en raison d'un arriéré de tests et d'une capacité et d'un débit limités. L'établissement de l'UMSOM serait en mesure de restituer les résultats aux patients et aux médecins dans un délai de 24 à 48 heures, augmentant considérablement le délai d'exécution.
L'analyse des échantillons de test de patients suspectés d'avoir COVID-19 est un processus complexe en plusieurs étapes qui consiste d'abord à transférer une partie de l'échantillon dans une solution d'inactivation et à extraire son ARN, qui contient le code génétique du virus. L'ARN est ensuite converti en ADN et amplifié à l'aide du dosage recommandé par le CDC. Le laboratoire du site de pratique de la faculté UMSOM détermine finalement si l'échantillon du patient contient le nouveau coronavirus. L'automatisation de ces étapes est essentielle pour augmenter la capacité du laboratoire à tester des milliers d'échantillons par jour.
« Nous avons maintenant mis en œuvre une reconfiguration du laboratoire IGS pour établir cette capacité de test à haut débit, " dit Jacques Ravel, Doctorat, Professeur de microbiologie et d'immunologie et directeur associé de l'Institut des sciences du génome de l'UMSOM. « En étroite collaboration avec la supervision du Département de pathologie, le laboratoire de l'UMPA a pu obtenir l'agrément réglementaire pour nous permettre de traiter des échantillons à tester sous le contrôle de l'UMPA, membre du corps professoral de l'UMSOM."
Le Dr Ravel a noté que Mike Humphrys, Directeur du Microbiome Service Laboratory (MSL) à l'IGS, a mené cet effort, et son expérience passée en tant que scientifique de laboratoire du CDC et son expertise ont été la clé de cet effort. Le MSL, travailler avec son équipe de laboratoire, réaffecté et reprogrammé les plates-formes robotiques pour gérer des tâches spécifiques liées aux tests COVID-19, une tâche qu'ils ont commencée fin février après qu'il est devenu clair que le virus se propageait au-delà de la Chine. Les machines avaient auparavant été utilisées pour des études de recherche visant à caractériser les bactéries qui composent le microbiome humain.
L'installation de test de l'Université du Maryland Pathology Associates a été certifiée par le gouvernement fédéral pour effectuer des tests développés en laboratoire. Ces épreuves, appelés LDT, consistent en un type de test de diagnostic conçu pour être effectué et utilisé dans un seul laboratoire, souvent situé dans un hôpital. Pour les tests COVID-19, le département de pathologie de l'UMSOM prévoit de demander une autorisation d'utilisation d'urgence à la FDA, puis soumettra des données à l'agence pour vérifier les performances du test à la fois pour détecter les vrais résultats positifs pour le virus et les vrais résultats négatifs qui indiquent que le virus n'est pas présent.
« Nous avons déjà la capacité d'effectuer des tests chez les patients admis au centre médical de l'Université du Maryland pour tester le COVID-19, " a déclaré le Dr Stass. " Cette nouvelle initiative de financement, cependant, améliorera considérablement nos capacités à atteindre plus profondément la communauté et contribuera à fournir des tests étendus qui sont désespérément nécessaires pour aider à maîtriser l'épidémie dans l'État du Maryland. La capacité de test améliorée sera également exploitée à plus long terme pour assurer une surveillance soutenue du COVID-19 dans l'État du Maryland. »
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