Le chercheur principal et le directeur administratif principal de la subvention, qui s'intitule "Une enquête basée sur la génomique des déterminants des résultats des maladies infectieuses polymicrobiennes, " est David Rasko, Doctorat, Professeur de microbiologie et d'immunologie et scientifique à l'IGS. Les enquêteurs de l'équipe comprendront :Claire M. Fraser, Doctorat, le professeur de médecine doté du doyen, Microbiologie et immunologie, et directeur de l'IGS, et Owen R. White, Doctorat, Professeur d'épidémiologie et de santé publique, Directeur de la bioinformatique et directeur associé de l'IGS.,
Le GCID utilise des approches génomiques et bioinformatiques à grande échelle pour étudier la biologie des pathogènes, virulence, évasion immunitaire, interactions microbe-microbe ainsi que les interactions hôte-microbiome. Les projets de recherche scientifique se concentrent sur les interrelations hôte/microbe de diverses bactéries, champignons, et parasites. L'équipe interdisciplinaire participera à la recherche GCID, y compris des professeurs de renommée internationale de l'Institute for Genome Sciences, le Département de microbiologie et d'immunologie et le Centre UMSOM pour le développement de vaccins et la santé mondiale (CVD) et leurs collaborateurs de longue date.
"L'équipe GCID a été à l'avant-garde de l'application de techniques génomiques pour faire progresser la compréhension scientifique des agents de maladies infectieuses au cours des 15 dernières années, et ce renouvellement de subvention du NIAID nous permettra de déployer davantage d'approches génomiques dans l'étude des interactions hôte-pathogène-microbiome, " a déclaré le Dr Fraser.
La subvention du NIAID soutiendra des programmes de recherche axés sur trois domaines. Un domaine de recherche consiste à étudier les interactions de plusieurs bactéries entre elles ainsi que l'hôte et le microbiome associé, qui est dirigé par le Dr Rasko, Dr Fraser, et Hervé S.G. Tettelin, Doctorat, Professeur agrégé de microbiologie et d'immunologie et scientifique à l'IGS. Le deuxième domaine comprend la recherche sur l'analyse génomique et transcriptomique des agents pathogènes fongiques en interaction avec l'hôte, qui sera dirigée par Vincent M. Bruno, Doctorat, Professeur agrégé de microbiologie et d'immunologie et scientifique à l'IGS. Le troisième domaine de recherche comprend un projet de recherche intégrée en génomique dans les maladies tropicales parasitaires qui sera dirigé par Julie C. Dunning Hotopp, Doctorat, Professeur agrégé de microbiologie et d'immunologie et scientifique à l'IGS, David Serre, Doctorat, Professeur agrégé de microbiologie et d'immunologie et scientifique à l'IGS ; et Joana C. Silva, Doctorat, Professeur agrégé de microbiologie et d'immunologie et scientifique à l'IGS
"Cette subvention nous permet d'intégrer l'étude de plusieurs agents pathogènes dans des systèmes modèles et avec des échantillons humains d'une manière plus représentative des processus naturels d'infection, qui permettra de mieux comprendre et d'approfondir ces interactions, " a déclaré le Dr Rasko.
Le centre soutient également un noyau technologique, un noyau de gestion des données et un noyau administratif. Les projets comprennent le séquençage du génome entier et ciblé du génome, profilage du transcriptome par RNA-seq, profilage de la communauté ARNr, et la métagénomique et le séquençage métatranscriptomique en mettant l'accent sur les interactions des microbes entre eux, l'hôte et le microbiome résident. Le séquençage sera effectué à l'aide de plusieurs plateformes, y compris l'Illumina MiSeq et HiSeq, Oxford Nanopore Technology et les systèmes Pacific Biosciences.
« L'intégration de la génomique à la médecine diagnostique et clinique a fait progresser notre compréhension biologique des maladies et de la santé, " dit E. Albert Reece, MARYLAND, Doctorat, MBA, Vice-président des affaires médicales à l'Université du Maryland, et John Z. et Akiko K. Bowers, professeur émérite et doyen de la faculté de médecine de l'Université du Maryland. "Cette subvention du NIAID favorisera de nouvelles collaborations entre disciplines au sein des centres cliniques et de recherche de la Faculté de médecine, ainsi qu'avec les communautés internationales de maladies infectieuses."
En plus des projets de recherche, L'IGS mettra en place des ateliers et poursuivra des initiatives éducatives pour élargir la compréhension de la façon d'appliquer la génomique aux questions de recherche hautement prioritaires qui ont un impact sur la santé mondiale.
IGS a déjà reçu des subventions en tant que Centre du génome pour les maladies infectieuses (GCID), une subvention de cinq ans financée par le NIAID (2014-2019); un Centre de séquençage du génome pour les maladies infectieuses (GSCID) ; un contrat de cinq ans financé par le NIAID (2009-2014), et les chercheurs principaux ont également eu des rôles de chercheur principal avec le Centre de séquençage microbien (MSC) financé par le NIAID, un contrat de cinq ans (2004-2009). Cette bourse U19 portant le numéro U19 AI110820 durera cinq ans jusqu'en 2024, représentant vingt ans de recherche de pointe en sciences génomiques.
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