PLOS ONE: Analyse de l'estomac et de l'intestin microbiomes de l'huître (Crassostrea de virginica) à partir du littoral de la Louisiane, Etats-Unis

Résumé

Nous avons utilisé un débit élevé pyroséquençage pour caractériser l'estomac et le contenu de l'intestin microbiomes de Crassostrea virginica
, l'huître de Pâques, obtenu à partir de deux sites, l'un dans la baie de Barataria (Hackberry Bay) et l'autre à Terrebonne Bay (lac Caillou), Louisiane, États-Unis. microbiomes de l'estomac dans les huîtres de Hackberry Bay ont été majoritairement dominées par Mollicutes plus étroitement liées à Mycoplasma
; une communauté plus riche dominé par des Planctomyctes a eu lieu dans le lac Caillou estomacs d'huîtres. communautés Gut pour les huîtres de deux sites différents de communautés d'estomac, et abritaient un assemblage relativement diversifié de phylotypes. Phylotypes les plus étroitement liés à Shewanella
et une souche Chloroflexi dominé le microbiote intestinal Lac Caillou et Hackberry Bay, respectivement. Alors que de nombreux membres de l'estomac et de l'intestin microbiomes semblaient être transitoires ou opportunistes, un noyau microbiome putative a été identifié sur la base de phylotypes qui ont eu lieu dans tous les échantillons d'estomac ou de l'intestin seulement. Le putative microbiome noyau de l'estomac comprend 5 OTU dans 3 embranchements, tandis que le noyau putatif gut microbiome contenait 44 OTU dans 12 embranchements. Ces résultats ont révélé collectivement les communautés microbiennes nouvelles dans le système digestif des huîtres, les fonctions du microbiome d'huîtres sont largement inconnues. Une comparaison des microbiomes de huîtres de Louisiane avec les communautés bactériennes rapportées pour les autres invertébrés marins et les poissons a indiqué que microbiomes mollusques étaient plus semblables les uns aux autres que de microbiomes de polychètes, décapodes et poissons

Citation:. Roi GM, Judd C , Kuske CR, Smith C (2012) Analyse de l'estomac et de l'intestin microbiomes de l'huître ( Crassostrea virginica
) de Coastal Louisiana, USA. PLoS ONE 7 (12): e51475. doi: 10.1371 /journal.pone.0051475

Editeur: Josh Neufeld, Université de Waterloo, Canada

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