TCGA kutatók azonosítani négy altípusa gyomor cancer

301-496-6641 katalógusa

gyomorrák sorolhatók négy különböző molekuláris altípusok kutatók a Cancer Genome Atlas (TCGA) Hálózati találtak. A tanulmányban megjelent online 23 július 2014, Nature, a tudósok számolnak be, hogy ez a felfedezés megváltoztathatja kutatók hogyan gondol a fejlődő kezelések gyomorrák, más néven gyomorrák vagy gyomor adenocarcinoma. Katalógusa

Ahelyett, hogy a gyomor- rák, mint egy betegség, mint már a múltban, a kutatók most képes felfedezni terápiák meghatározott készlet betegek, akik tumora genom rendellenességek. Gyomorrák egyik fő oka a rák összefüggő halálozás világszerte, ami a becslések szerint 723.000 ember halálát okozza évente. Katalógusa

A korábbi kísérletek, hogy megvizsgálják a klinikai jellemzőit gyomorrák hátráltatta mennyire másképp rákos sejtek nézd mikroszkóp alatt, akkor is, ha az azonos daganat. A kutatók azt remélik, hogy az új osztályozási rendszer szolgál majd egy értékes kiegészítés a jelenlegi patológia osztályozási rendszer, amely két kategóriában: a diffúz és a bél. Katalógusa

"A kulcsfontosságú előre ezzel, hogy az általunk azonosított és fejlesztett egy sokkal hasznosabb osztályozási rendszert találni csoportok gyomorrák, amelyek különböző molekuláris jellemzői, és egyúttal azt is meghatározta a legfontosabb célokat, hogy folytassa a különböző betegcsoportok ", mondta Adam Bass, MD, a Harvard Medical School, DANA- Farber Rákkutató Intézet, a Broad Intézet, Boston, és az egyik vezető kutató a projekt. "Ez lesz az erős alapot kategorizálása a betegség, és ehhez olyan módon, ahol tudjuk fejleszteni a klinikai vizsgálatok alapján néhány kritikus molekuláris változás, hogy a vezetés különböző típusú rákos megbetegedések." A legfrissebb

A kutatók azonosította az új alcsoportok keresztül összetett elemzések molekuláris adatok 295 daganatok. Ezek használt hat molekuláris analízis platformok, beleértve a DNS-szekvenálás, RNS szekvenálást, és a fehérje tömbök.

A tumorokat az első csoport, amely képviseli 9 százaléka a tumorok, pozitív volt az Epstein-Barr vírus (EBV), és több más molekuláris közös vonások. Daganatok egy második alcsoport (22 százalék a tumorok) magas volt a mikroszatellita instabilitás (MSI), amely a tendencia, hogy a mutációk felhalmozódnak ismétlődő szekvenciák DNS-t. A fennmaradó alcsoportok különbözött a szint szomatikus kópiaszámától (SCNAs), amely származhat a párhuzamos vagy törlését szakaszok a genomban. A daganat a harmadik alcsoport, amelyek tartalmazták 20 százaléka a tumorok, úgy tekintettünk, hogy egy alacsony szintű SCNAs és hívták genomically stabil. A maradék 50 százalék a tumorok sorolták kromoszomálisan instabil, a magas szintű SCNAs.

Az EBV-pozitív alcsoport tumorok különösen érdekes volt. EBV legjobban ismert az Egyesült Államokban, mint az oka a fertőző mononukleózis, amelyet az jellemez, láz, torokfájás, és duzzadt nyirokcsomók, különösen a nyak. Az EBV feltehetően okozó rák egyes fajtái, beleértve orr-garat-karcinóma és bizonyos típusú lymphoma. Korábbi kutatások azt mutatták, hogy az EBV lehet kimutatni kisebbségben gyomor adenokarcinómák és hogy az EBV gének expresszálódnak az említett daganatok. Azonban ez a tanulmány megállapította, hogy a jelenléte az EBV a gyomor tumorok társul számos egyéb molekuláris jellemzőit.

Először is, a kutatók megfigyelték, hogy az EBV-pozitív daganatok jelennek nagy gyakorisággal mutációk a PIK3CA gén amely kódolja egy komponense egy fehérje, a PI3-kináz, ami elengedhetetlen a sejtek növekedését és osztódását és sok más olyan sejtes aktivitást, amelyek fontosak a rák. Bár a 80 százaléka EBV-pozitív daganatok hordozott fehérje változó módosulása PIK3CA, PIK3CA mutációkat találtak 3 százalékkal, 42 százaléka a daganatok a többi gyomorrák altípusok. A kutatók azt javasolta, hogy az EBV-pozitív daganatok reagálnak a PI-3-kináz-inhibitorok, amelyek közül néhány a korai szakaszában a vizsgálatok a klinikai vizsgálatok során, de még nem hagyta jóvá az amerikai Food and Drug Administration, általános használatra. Katalógusa

Néhány tumorok az EBV-pozitív alcsoport is kimutatta, több gén másolatok gyártanak egy kromoszómális régió, amely tartalmazza a JAK2 gént. A JAK2 protein megkönnyíti a sejtek növekedését és osztódását, és a megnövekedett expressziója JAK2 lehet helytelenül aktiválja a sejtek növekedését. Az amplifikált régió tartalmazza a géneket két fehérje, a PD-L1 és a PD-L2, amely elnyomja az immunválaszt; megnövekedett expressziója segíthet tumort pusztítás az immunrendszer által. A kutatók azt javasolta, hogy ezek az eredmények értékelését segítő JAK2-inhibitorok és a PD-L1 /2 antagonisták kezelésére EBV-pozitív gyomor rák.

és az EBV-pozitív alcsoport mutatott sokkal nagyobb prevalenciája DNS hipermetiláció mint bármilyen más rákos altípusa által jelentett TCGA kutatók. Metilezést a folyamatot, hozzátéve metil-csoportok a DNS-t, ami csökkenti a génexpressziót. Hipermetilációja történik, ha ez a mechanizmus továbbra abnormálisan, quieting gének aktív legyen. Az EBV-pozitív tumor alcsoport, hipermetiláció leggyakrabban megfigyelhető a promóter régiók gének, amely megakadályozná a gének expressziójának.

" Egyre ezek betekintést közötti kapcsolat EBV és gyomorrák a típusú úttörő kutatás, hogy a NIH örömmel, hogy egy részét. Bízunk benne, hogy a potenciális klinikai jelentősége ennek a felfedezésnek, " mondta NIH igazgatója Francis S. Collins, MD, Ph.D. katalógusa

"Ez a tanulmány megerősíti az érték a megközelítés, mi használ, hogy tanulmányozzák genomi sokszínűség és a hasonlóságot tumorokban számos különböző ráktípus," mondta NCI igazgatója Harold Varmus, MD "Csak egy ilyen szisztematikus elemzés hoztak megfigyeléseket a szövetség között EBV és néhány provokatív molekuláris jellemzőit." a legfrissebb

Fontos betekintést is érkeztek elemzéseket a három másik gyomorrák alcsoportok. A tumor például a genomically stabil altípus tartalmazott gyakori gén mutációja úgynevezett RhoA, melynek termék kölcsönhatásba lép más celluláris fehérjék, hogy segítsen a sejtek megváltoznak, alakja és vándorolnak, amelyek fontosak lehetnek a tumor növekedését. Ez arra utal, a lehetséges célpontok tumorok kezelésére ezen altípus. És daganatai kromoszomális instabil altípus tartalmazott gyakori amplifikáció gének kódolnak receptor fehérjéket a külső a sejt, ami a promóciós aberráns sejtnövekedést. Kábítószer már rendelkezésre állnak, hogy megfékezze a tevékenység néhány ilyen fehérjéket. Katalógusa

"Ez a legutóbbi TCGA tanulmány ismét azt bizonyítja, hogy fontos az átfogó tervezés", mondta NHGRI igazgató Eric Green, M. D., Ph.D. "Ezek az eredmények számunkra fontos új genomikai betekintést oka a halálos formája a rák. &Quot; katalógusa

TCGA közösen vezeti a National Cancer Institute (NCI), valamint a Nemzeti Humán Genom Kutatóintézet (NHGRI) mindkét része a National Institutes of Health (NIH), hogy átfogóan jellemzik a genom több mint 30 típusú rákban. A TCGA Research Network generált adatok és közzétett elemzéseket számos rákban, melyek mindegyike megtalálható a TCGA honlapján, http://www.cancergenome.nih.gov.
### Katalógusa

Referencia: The Cancer Genome Atlas Research Network. Átfogó molekuláris jellemzése gyomor adenokarcinóma. Természet. ONLINE július 23., 2014. doi: 10.1038 /nature13480 katalógusa

TCGA generált adatok szabadon hozzáférhető előre kiadványban a TCGA Data Portal http: //tcga-adatokat. nci.nih.gov/tcga és CGHub, https://cghub.ucsc.edu. A TCGA Research Network több mint 150 kutatók több tucat intézmény az egész nemzet. A résztvevők listája áll rendelkezésre http://cancergenome.nih.gov/abouttcga/overview. További részletek a TCGA, beleértve Tények, Q & A, grafika, szószedet, egy rövid útmutató a genomika és a médiatár a képek találhatók a http://cancergenome.nih.gov. Katalógusa