Estratto
Obiettivo
Per schermo e caratterizzare varianti linea germinale per E-caderina (CDH1) Metodi 59 CV, 59 parenti di primo grado (FDRS) di GC, 20 autoimmuni metaplastiche gastrite atrofica (AMAGs) e 52 donatori di sangue (BDS) sono stati analizzati per CDH1 Risultati In GC, 4 varianti missenso (p.G274S;. P.A298T; p.T470I; p.A592T), 1 mutazione nel 5'UTR (-71C > G) e 1 mutazione nel IVS12 intronic (c.1937-13T > C) regione sono stati trovati. Primo effetto patogeno di p.A298T mutazione era prevedeva per la modellazione di proteine 3D. Il romanzo p.G274S mutazione ha mostrato un no chiaro significato funzionale. Inoltre, prima, IVS12 intronic (c.1937-13T > C) mutazione è stata dimostrata per portare ad un aberrante CDH1 Nel complesso il nostro studio migliora la caratterizzazione corrente di CDH1 Visto: Garziera M, Canzonieri V, Cannizzaro R, S Geremia, Caggiari L, De Zorzi M, et al. (2013) Identificazione e caratterizzazione di CDH1 Editor: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, Stati Uniti d'America Ricevuto: 29 apr 2013; Accettato: 5 settembre 2013; Pubblicato: 29 Ottobre 2013 Copyright: © 2013 Garziera et al. Questo è un articolo ad accesso libero distribuito sotto i termini della Creative Commons Attribution License, che permette l'uso senza restrizioni, la distribuzione e la riproduzione con qualsiasi mezzo, a condizione che l'autore originale e la fonte sono accreditati Finanziamento:. Associazione Italiana per la Ricerca sul Cancro (AIRC De Re N. 10266 e AIRC Cannizzaro speciale programma Molecular Clinical Oncology 5x1000 N. 12214), e Direzione Centrale del Lavoro, Formazione, Università e Ricerca Della Regione Autonoma Friuli Venezia Giulia, Codice Progetto 200502027001. I finanziatori ha avuto alcun ruolo nel disegno dello studio, la raccolta e l'analisi dei dati, la decisione di pubblicare, o preparazione del manoscritto Competere interessi: Dott. Valli De Re dichiara che si tratta di un co-autore e editoriale membro del Consiglio di PLOS UNO. Ciò non toglie l'aderenza degli autori a tutte le politiche di PLoS ONE sui dati e la condivisione di materiale. cancro gastrico (GC) rimane la quarta neoplasia più comune in tutto il mondo, anche se la sua incidenza e tassi di mortalità associati sono diminuiti negli ultimi decenni. la prognosi GC è strettamente correlata allo stadio della malattia al momento della diagnosi [1]. cancro gastrico esordio precoce (EOGC) è definita come GC presentando all'età di 45 o più giovani [2] ed ha una scarsa sopravvivenza globale [3], [4]. La maggior parte dei GC sono sporadici e spesso si sviluppano in seguito Helicobacter pylori Il GC classificazione istopatologica più ampiamente accettata (classificazione di Lauren) [7] distingue due tipi di GC:. Tipo intestinale e di tipo diffuso. Diffuse GC mostra una maggiore base ereditaria e una prognosi generalmente peggiori rispetto al sottotipo intestinale [8]. CDH1 in questo studio, abbiamo analizzato CDH1 caratterizzazione del paziente e CDH1 le caratteristiche cliniche e istopatologiche di soggetti GC, FDR e AMAG sono riassunti nelle tabelle 1 e 2. Tra i 59 pazienti GC, 2 (3,4%) hanno una storia familiare di GC (S15 è il fratello di S16) senza soddisfare i criteri per ereditaria GC diffusa, come definito dal cancro gastrico Linkage Consortium International (IGCLC), al momento della raccolta del campione. Nella nostra serie GC, 5 sporadici pazienti all'inizio del GC (≤45 anni) erano presenti, ma non CDH1 CDH1 Altre modifiche hanno portato polimorfismi comuni (frequenza di almeno l'1% della popolazione) o mutazioni silenti che codificano per Nessuno un'associazione statistica è stata osservata la stessa aminoacido che il filamento originale. tra i quattro gruppi di pazienti testati per ID 4, 6 o ID ID 19 varianti. RefSNP (RS) numeri per identificare le varianti genetiche precedentemente pubblicate come così come le loro frequenze indicate (NIEHS Genome ambientale del progetto, Seattle, WA (URL: http://evs.gs.washington.edu/niehsExome/Letta agosto 2013); ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/phase1/analysis_results/paper/Accessed dicembre 2012) sono riportati nella Tabella 3. Tutti i CDH1 la frequenza di mutazioni e varianti sono state calcolate in soggetti senza GC o malattia AMAG (52BDs + 59FDRs, n = 111). FDR Sedici erano parenti di primo grado della nostra serie GC; quando uno della variante era presente in GC e il relativo caso FDR, abbiamo escluso l'individuo FDR dal calcolo della frequenza. ID4 per esempio, era presente in 5 FDR relative alla nostra GC della nostra serie; quindi la frequenza di popolazione di controllo passa da 111 a 106 totale individui (+ 7FDRs 8BDs /106; 14,5%). La Figura 1 illustra cromatogrammi sequenziamento del nuove mutazioni che abbiamo trovato. Abbiamo precedentemente riportato il cromatogramma ID 10 in un altro lavoro [26]. I residui missense mutato abbiamo trovato sono tutti localizzati a E -cadherin dominio extracellulare. La posizione codone nel immaturo e maturo (dopo la scissione N-terminale) proteine e dati dal PolyPhen-2 e SIFT in silico Per quanto riguarda i rimanenti due mutazioni di senso, hanno un effetto meno chiara funzionale come riportato anche nella tabella 4. p. T470I (ID 12) sostituzione [28] cambia la superficie AA di EC3 extradomain nella proteina matura (Figura 2C). In entrambi i murino E-caderina e la sequenza N-caderina (codice PDB: 3Q2W) treonina trova solitamente O Per esplorare se mutazioni introniche rilevate nella nostra serie GC (Tabella 3) potrebbero potenzialmente indurre un effetto sulla tranciati, abbiamo eseguito CDH1 per gli ID 5 e l'ID 7 mutazioni introniche, abbiamo amplificato la regione che copre parte dell'esone 1 a parte dell'esone 5, per ID 17 mutazione, esone 10 a 13 (Figura 3). L'esone RT-PCR da 1 a 5 frammenti non ha mostrato differenze quando viene eseguito il 4% gel (Figura 3A), né dopo il sequenziamento bidirezionale (dati non hanno mostrato); per ID Converse 17 variante intronic potrebbe influenzare splicing che porta ad un anomalo più piccolo CDH1 Analisi di CDH1 Un confronto di e-caderina livello di espressione di mRNA è stata eseguita da linfociti EBV immortalato ottenuti dal sangue periferico di S10 e S190 (mutazione ID 17), S97 (ID 9) e S189 (senza CDH1 L'analisi immunoistochimica sul tumore tessuto gastrico di intronic ID 17 casi (codice paziente S10, Figura 5E) mostrava una ridotta espressione di legato alla membrana e-caderina nelle cellule tumorali anello con castone (frecce nere), mentre sia membrana e colorazione citoplasmatica erano presenti nell'epitelio normale. Lo stesso paziente ha mostrato una riduzione β-catenina colorazione nelle cellule ad anello con castone rispetto alla forte espressione di questa proteina nelle cellule adiacenti normali (Figura 5H). La perdita di entrambi E-caderina e β-catenina colorazione era nota anche per il secondo pazienti (S46) con lo stesso ID intronic 17 mutazione e influenzata da GC troppo (Figura 5F e 5I, rispettivamente, per l'E-caderina e β-catenina) . Discussione pazienti CG in genere hanno una prognosi infausta [29]. L'identificazione dei pazienti con un aumentato rischio di sviluppare GC e la diagnosi precoce del GC sono approcci promettenti per ridurre la morbilità e la mortalità del GC. FDR dei pazienti GC sono noti per avere un 2-3 volte aumentato rischio di GC, probabilmente a causa dell'esposizione agli stessi fattori di rischio ambientale e /o di predisposizione ereditaria al cancro [30]. La distruzione delle cellule parietali trovato in AMAG combinato con l'importante ruolo di e-caderina in polarità epiteliale e architettura ghiandolare gastrica, suggerisce che le alterazioni germinali di CDH1 Nel 1998, Guilford e colleghi hanno descritto per la prima volta mutazioni germinali del em> CDH1 Il punto di forza del nostro studio è la raccolta di 59 pazienti caucasici con GC sporadici, 59 FDR e 20 AMAGs che frequentato il nostro servizio di gastroenterologia negli ultimi anni per i sintomi gastrici e una diagnosi o l'esclusione di un GC dopo endoscopica e la valutazione del tessuto istologico. Come riassunto nella tabella 3, vari germinali diverso CDH1 L'ID 10 (p.G274S) è una mutazione missense romanzo che abbiamo trovato in un vecchio maschio con un istotipo misto GC. Questa variante non è stato rilevato in 187 soggetti senza cancro (108BDs + 59FDRs + 20AMAGs) escludendo così un polimorfismo. Un effetto patogeno di ID 10 mutazione non è stata sostenuta dopo funzionale (l'aggregazione e l'invasione) in vitro L'ID 11 (p.A298T) sostituzione in esone 7 di CDH1 L'ID 12 (p.T470I) è stato trovato in un maschio di 57 anni (S39) con una diagnosi di GC . Questa modifica è stata descritta per la prima di una famiglia di etnia maori con EOGC, ma il soggetto che mostra questa mutazione non è stata influenzata dal GC al momento dello studio [28]. Qui, abbiamo scoperto che il cambiamento p.T470I AA è tollerato da SIFT e anche attraverso l'analisi di modellazione. Purtroppo, il tumore campione di tessuto bioptico era insufficiente per eseguire la E-caderina IHC colorazione. L'ID 15 sostituzione (p.A592T) è stato rilevato in ciascun gruppo clinico testato, suggerendo una diffusione polimorfico probabile. Tuttavia, questa variante è stato riportato in precedenza associata a tumori della tiroide e tumori al seno lobulare [41] - [43]. La nostra analisi strutturale e in vitro come raccomandato dalle recenti linee guida di gestione clinica [44], la sorveglianza endoscopica dovrebbe essere eseguita ogni anno in quegli individui con mutazioni di significato indeterminato (ad esempio, missense). A nostro avviso, i soggetti che ospitano ID 15 e anche ID 10, devono essere seguite per un massimo di 10 anni prima di escludere un ruolo, anche se debole, per questa alterazione nella patogenesi del GC. Nel ID 2 abbiamo identificato un C cambio-to-G prima del codone di inizio (-71C > G, CDH1 Intronic ID 17 variante (IVS12 c.1937-13T > C). È stato trovato in 2 femmine con GC (2/59 CV = 3,4%) sia positiva per l'infezione HP, e si è trovato anche in 1 BD (1/52 = 1,9%, Tabella 3). La stessa alterazione è stato precedentemente riportato nel carcinoma mammario lobulare con alta frequenza (12/53 = 23%) [47], in famiglie hdgc (2/27 = 7,4%) [48] e nei pazienti EOGC (7/79 = 8,9% ) [46], ma anche in una popolazione di controllo relativa [46]. Da segnalare, dimostriamo per la prima volta che questa sostituzione porta ad un aberrante CDH1 nel gruppo FDR di soggetti, con l'esclusione di CDH1 il ID 1 (5'near gene-176C > T) variante è stata individuata in una femmina di 32 anni, con uno stato sconosciuto un'infezione HP. Questa variante è stata già presentata in database più diffusi, ma il suo significato è sconosciuto L'ID 3 (5'UTR-54G > C). Variante è stata trovata in un uomo di 72 anni, positivo per infezione da HP. Di particolare interesse, questa mutazione è stata già rilevata in un ambiente sano soggetto giapponese 41 anni, con nessun tumore clinicamente rilevabile al momento dell'iscrizione, e descritto come una variante rara in grado di diminuire l'attività trascrizionale di CDH1 L'ID 9 (intronic IVS4 c.532-18C > T). è stato trovato in un 41-year-old soggetto di sesso maschile negativo per l'infezione da HP. ID9 è stata riportata in due pazienti EOGC da Inghilterra e Portogallo, rispettivamente, [56], in due pazienti tedeschi hdgc e in 1 controllo di soggetti arruolati nello stesso studio [35]. Recentemente, è stato proposto un ruolo non patogeno per questa variante [2]. Non abbiamo notato alcuna influenza sulla CDH1 pazienti AMAG avere un 3 volte maggiore rischio relativo di sviluppare GC e sono stati mai indagati per CDH1 In conclusione, i nostri risultati mostrano che il pozzo noto patogeni ID 11 mutazione (p.A298T) può essere rilevata anche in pazienti CG sporadici senza soddisfare i criteri rigorosi per HDGC. Inoltre, abbiamo dimostrato un effetto deleterio di ID 17 variante (IVS12 c.1937-13T > C) su CDH1 Infine, in un individuo FDR a rischio di GC, abbiamo trovato la variante ID 3 (5'UTR-54G > C). con un potenziale effetto di aumentare lo stato di ipermetilazione CDH1 Nord Est d'Italia presenta incidenza e mortalità elevati tassi di GC, anche se inferiore rispetto alle regioni centrali, come la Toscana e Marche [57] . I nostri risultati mostrano la prevalenza in missense CDH1
nel cancro gastrico non ereditaria (GC) pazienti e nei soggetti a rischio di GC.
da sequenziamento diretto, modellazione strutturale e bioinformatica. impatto funzionale sulla splicing è stato valutato per le mutazioni introniche. E-caderina /β-catenina colorazione immunoistochimica ed E-caderina mRNA quantificazione usando RT-PCR sono state eseguite
trascrizione con esone 11 delezione. Questa mutazione è stata trovata in 2 GC e in 1 BD. In FDR, abbiamo identificato 4 varianti: il polimorfico (p.A592T) e 3 mutazioni in regioni non tradotte con ruolo funzionale non identificato ad eccezione del 5'UTR (-54G > C) che era stato trovato a diminuire CDH1
trascrizione. In AMAGs, abbiamo rilevato 2 alterazioni: 1 missenso (p.A592T) e 1 nuova variante (IVS1 (c.48 + 7C > T)), senza effetto sul CDH1
splicing. Diverse sostituzioni silenziosi e polimorfici sono stati trovati in tutti i gruppi studiati.
Conclusioni
mutazioni e il loro ruolo funzionale in GC e in individui a rischio di GC. Le mutazioni trovate nelle regioni non tradotte e dati sugli effetti di splicing meritano una particolare attenzione come associato con una quantità ridotta E-caderina. L'utilità di CDH1
di screening, oltre alla individuazione di altri fattori di rischio, potrebbe essere utile per la diagnosi precoce del GC in soggetti a rischio (cioè FDR e AMAGs), e garantisce ulteriori studi.
germinale varianti in sporadici cancro gastrico pazienti e in individui a rischio di cancro gastrico. PLoS ONE 8 (10): e77035. doi: 10.1371 /journal.pone.0077035
Introduzione
(HP) -associated gastrite [5], [6]. Tuttavia, gli studi aggregazione familiare sottolineano anche l'importanza di una predisposizione genetica nello sviluppo sporadico di GC. Frequenza di familiare aggregazione gastrico è di circa il 10%
gene che codifica per la E-caderina è stato identificato ad avere un ruolo causale in circa il 30% -50% di ereditaria diffusa GC (HDGC), una sindrome GC e lobulare suscettibilità al cancro al seno autosomica dominante che costituiscono 1-3% di raggruppamento familiare di GC [9], [10] e nel diffuso sottotipo GC [11] . CDH1
mutazioni germinali (tale mutazione è trasmessa ogni cellula nel corpo della prole) sono specificamente associati a HDGC (circa il 30% -40% dei casi); grande CDH1
eliminazioni sono stati trovati in circa il 6,5% dei casi [12]. Familial cancro gastrico intestinale (FIGC), con una storia familiare positiva sono anche stati descritti, ma finora, nessuna linea germinale CDH1
difetti sono stati associati con la FIGC o GC intestinali. Questa mancanza di evidenza di CDH1
mutazioni del sottotipo intestinale ha portato all'ipotesi che famigliare clustering in questi casi è determinata da fattori ambientali condivisi, al contrario di una predisposizione genetica ereditaria. Tuttavia, i dati recenti dimostrano che CDH1
alterazioni somatiche (tali alterazioni si accumulano nelle cellule tumorali del corpo oltre la durata della vita di una persona) sono così frequenti in intestinale come in GC diffusa [13], suggerendo un importante ruolo di CDH1
in entrambe le istotipi. Ciò nonostante, l'esatta prevalenza di CDH1
alterazioni germinali in intestinale GC è ancora sconosciuta. CDH1
ipermetilazione del promotore è il secondo colpo genetica più comune nel GC processo cancerogeno [14], [15]. CDH1
mutazioni sono anche associati con una maggiore suscettibilità alle invasiva e metastatica [16], [17] del colon, della vescica, della prostata, del seno e tumori ginecologici [18] - [20]. E-caderina è una glicoproteina transmembrana che svolge un ruolo nel mantenimento dell'architettura tessuto epiteliale attraverso il coinvolgimento di Ca 2 + interazioni cellula-cellula dipendenti [21], [22]. E-caderina comprende un dominio citoplasmatico, un breve dominio transmembrana e cinque domini extracellulari di ripetizione caderina-like (EC1-5) che si estendono esoni 4-13 e contengono regioni di calcio vincolante altamente conservati [23], [24] e cisteine conservate probabili per formare ponti disolfuro [25]
mutazioni germinali in una serie di casi e gli individui a rischio di GC GC casuale consecutivi.; principalmente di primo grado GC-parenti (FDRS) e gastrite atrofica pazienti autoimmuni metaplastiche (AMAG) diretto al nostro istituto per i sintomi gastrointestinali e valutazione endoscopica. Per esplorare il ruolo di espressione E-caderina, analisi strutturali, funzionali e di immunoistochimica sono stati eseguiti in campioni con un CDH1
mutazione germinale. Lo scopo del presente studio è stato quello di valutare la prevalenza e caratterizzare CDH1
mutazioni germinali in una serie di pazienti CG sporadici consecutivi mancano i criteri di classificazione HDGC, e in una popolazione selezionata a rischio di sviluppo di GC, per testare la sua utilità come marker per migliorare la diagnosi precoce del tumore. I dati ottenuti potrebbero essere utilizzati per sviluppare uno strumento in grado di rilevare rapidamente ed economicamente CDH1
mutazioni prevalentemente presenti nella nostra popolazione.
Risultati
germinale screening genetico
alterazioni sono stati trovati in questi pazienti. L'età mediana dei FDR era di 49 anni (range 28-78 anni) e per AMAGs 56 anni (range: 31-72 anni). Tra i 59 pazienti GC, 16 soggetti avevano un parente di primo grado inclusi nello studio (16/59 FDR). FDR e AMAGs venuti al nostro istituto per una visita gastroenterologia ed esame gastroscopia, hanno manifestato sintomi diversi, ma né il cancro né intestinale metaplasia /displasia era presente in questi soggetti.
genetiche risultati dello screening sono elencati nella tabella 3 con nuove
mutazioni: 1 intronic (ID 5), 1 missense (ID 10), e 2 in silenzio (ID 13 e ID18). Nel complesso abbiamo trovato 4 varianti, che il codice per un aminoacido (AA) sostituzione (1 romanzo (ID10) e 3 riportato in precedenza in altre popolazioni (11 ID, 12 ID, ID 15), 1 nella regione del gene 5'near e 2 mutazioni nel elemento normativo non tradotta (UTR) (ID 1, ID 3, già segnalato) e 6 sostituzioni nelle regioni introniche (tre mutazioni: ID 5, ID 9, ID 17, tre intronic varianti polimorfiche: ID 4, ID 6, ID 8, probabilmente senza alcun effetto sulla GC cancerogenesi). Nessun delezioni o inserzioni sono stati trovati nei confini esone.
varianti erano in stato di eterozigote tranne che per l'ID 4 e ID 19 in cui è stato anche rilevato uno stato omozigote.
bioinformatica ruolo predittivo e modellazione strutturale risultati delle varianti missenso trovato
analisi sono riportati nella Tabella 4. Tutti e quattro le varianti missense sono potenzialmente dannosi per PolyPhen -2, ma solo il p.A298T (ID 11) e p.A592T (ID 15) sostituzioni possono influenzare la funzione delle proteine mediante analisi SIFT (Tabella 4). I p.G274S (ID 10), che abbiamo recentemente descritto [26], tuttavia, non perturbano l'ambiente locale, ma introduce un potenziale residuo per la fosforilazione e glicosilazione che possono avere effetti sulla stabilità e l'integrità di E-caderina come noi ipotizzato [26]. L'effetto patogenetico di ID 11 sostituzione è stato precedentemente stabilito [27], ma è stato prima qui dimostrato da analisi strutturale. Come illustrato in figura 2A, la variazione AA nell'esone 7 del p.A298T (ID 11) è posizionato vicino alla regione interattivo tra protomers EC1 e EC2. Così, la sostituzione di residui polari alanina-treonina può guidare formazione H-bond attraverso il suo gruppo oxydrilic e questo può interferire con la struttura locale della proteina in una regione che è fondamentale per Ca 2+ interazioni. Treonina in posizione 144 è stericamente dimostrata invadente perché interagisce con due residui di acido aspartico (Asp Asp136 e 138) che sono direttamente coinvolti nella Ca 2 + vincolante. Inoltre, le lunghezze di legame sono particolarmente sollecitate, essendo inferiore al 3 Å (Figura 2B).
-glycosylated suggerendo un ruolo importante per questo residuo nella struttura della proteina. Tuttavia, come mostrato nella figura 2D, la modifica isoleucina, una AA non polare con una catena laterale idrofoba che non possono subire modificazioni post-traduzionali, suggerisce nessuna particolare tensione intermolecolare. Ipotizziamo che nel mezzo extracellulare, la presenza di un residuo isoleucina nella stessa posizione di treonina può favorire le interazioni proteina-proteina, e questa mutazione potrebbe così assumere un significato protettivo. L'ultima mutazione riportato, p.A592T (ID 15), è stato trovato in tutti i gruppi esaminati (vedi tabella 3), suggerendo un effetto improbabile su GC patogenesi. In questo caso, alanina sulla CE4 extradomain del maturo E-caderina (Figura 2E) fornisce la libertà conformazionale, anche se in prossimità delle Ca 2 + siti di legame. Una sostituzione treonina qui ha un effetto limitato sulla struttura e torsionali angoli locali della proteina. Tuttavia, non possiamo escludere che la catena laterale oxydrilic potrebbe essere post-traslazionale modificato in particolare situazione e influenzare così la struttura e la funzione del CDH1
(Figura 2F).
analisi Trascrizione intronic mutazioni germinali
analisi di trascrizione. varianti polimorfiche e silenziosi sono stati esclusi da questa analisi dal momento che probabilmente non hanno alcun ruolo patogenetico. cDNA prodotta da sangue periferico dei soggetti GC selezionati che ospitano intronic ID 5, ID 9 o ID 17 mutazioni (Tabella 3) sono stati confrontati a quello da due donatori di sangue sani, uno solo avendo lo stesso ID 17 mutazione come pazienti GC (codice BD S190 ), e un altro (codice BD S189) senza CDH1
mutazione.
trascrizione (Figura 3B). Al momento l'isolamento e il sequenziamento, abbiamo scoperto che il gruppo più piccolo ha provocato una trascrizione saltato mancanti esone 11, con esone 10 direttamente unito alla esone 12. Questa trascrizione aberrante è stata anche rilevata nel BD S190 portando la stessa sostituzione linea germinale (Figura 3B).
livello abbondanza di proteine e di espressione di mRNA nei soggetti che mostra CDH1
mutazioni introniche
mutazioni) soggetti. Soggetto S10 è stata colpita da un cancro gastrico, soggetto S97 è parente di primo grado di un paziente con un cancro gastrico (FDR), mentre la S189 e S190 sono stati entrambi i donatori di sangue. Abbiamo osservato tra il donatore di sangue di controllo (S189) non avendo CDH1
mutazione e pazienti, una forte diminuzione relativa nell'espressione E-caderina (circa il 60%, figura 4) in pazienti S10 avere entrambi ID 17 mutazione e una GC, mentre la riduzione solo a circa 2% nel donatore di sangue S190 avente lo stesso ID 17 mutazione ( p
< 0,05, rispetto al GC S10). Per S97 (ID mutazione 9, FDR soggetto), abbiamo osservato una simile espressione E-caderina, come quella del controllo S189.
potrebbe essere un fattore di rischio aggiuntivo per lo sviluppo GC in AMAG paziente [31].
gene [28] <. Successivamente, i diversi tipi di mutazioni sono state riportate in famiglie di varia etnie con GC diffusa [32], [33]. Il primo CDH1
mutazione germinale è stata descritta in una famiglia italiana nel 2006, in un paziente che ha incontrato i criteri per IGCLC HDGC [34]. Tuttavia, pochi studi riportano CDH1
mutazioni germinali nei casi sporadici GC senza aggregazione familiare o nei soggetti a rischio di sviluppare CG [35], [36]. Inoltre, in questi studi gli effetti funzionali di CDH1
varianti spesso non sono indagato.
varianti hanno stato rilevato. Nella serie 59 GC, escludendo le variazioni polimorfiche e silenziosi che, probabilmente, non hanno alcun ruolo patogenetico, abbiamo trovato 6 sostituzioni diverse in 9 pazienti (9/59 GC = 15,2%): 4 di tipo missense (ID 10, 11 ID, ID 12, ID 15) in 4 pazienti distinti (6,8%) e 2 di tipo non-missense (ID 2 e ID 17) in 5 GC distinti (3,4%).
saggi come abbiamo recentemente riportato [26], tuttavia i dati di in silico
caratterizzazione della mutazione e una riduzione dell'espressione β-catenina trovato nel tessuto tumorale non può escludere completamente il significato di questa mutazione in sviluppo GC. Così, oggi ID 10 rimane un romanzo CDH1
mutazione con una patogenesi di un significato indeterminato.
è già stato descritto in un 36-year-old giovane maschio caucasico in una famiglia HDGC [27]. Nella nostra serie, questa variante è stata rilevata solo in 1 maschio (S47) di 74 anni, con un istotipo misto. Il potenziale effetto patogeno di questa mutazione è stata confermata attraverso in vitro
studi funzionali in laboratori diversi [27], [37], [38]. Ecco i risultati di modellazione prima (Figura 2A-B), analizzando le interazioni di legame proteina-ligando 3D, sostengono fortemente il potenziale per la funzione della proteina alterata e portano alla possibile meccanismo molecolare che sostenere questo processo. Il potenziale funzione della proteina alterata è stata sostenuta anche da analisi SIFT (Tabella 4) con un buon punteggio. Inoltre, un recente studio, utilizzando il in silico
progettazione di proteine FoldX approccio algoritmico [39], riafferma il ruolo patogenetico della ID 11 (p.A298T) sostituzione, sulla base di un calcolo delle variazioni di stabilità native-statali (ΔΔG > 0,08 kcal /mol) [40]. Gli autori caratterizzati pazienti portatori di questa mutazione missenso come avere una più giovane età alla diagnosi e un istotipo diffuso. Il nostro caso ha evidenziato che ID 11 può essere rilevato anche in un paziente anziano con GC mista.
[35] e in silico
studi [38], [40] non supportano un ruolo patogenetico per questa variante in GC.
5'UTR regione), che rappresentava la variante più comune associato con il GC nella nostra serie, che si verificano in tre dei 59 pazienti GC ( 5,1%). Questa variante è stata riportata anche in uno studio finlandese [45] in 1 su 13 (7,7%) pazienti GC e in 2 di 51 controlli (3,9%), e anche in due pazienti EOGC di origine americana del Nord (3,4%) [46] . In generale i dati di questi studi suggeriscono che ID 2 è una mutazione abbastanza comune, ma gli autori non hanno riportato dati relativi ID 2 variante in relazione allo stato di espressione E-caderina. ID 2 è stato trovato nella nostra serie in uno intestinale, una mista e una istotipi GC diffuse. Tutti questi pazienti avevano più di 50 anni al momento della diagnosi e sono risultati negativi per l'infezione HP. Nessuno dei soggetti di controllo (n = 111) sottoposti a prova senza GC, ha mostrato questa mutazione (Tabella 3). Un in situ
valutazione o una correlazione tra ID 2 e l'espressione E-caderina è stato in grado di essere eseguito a causa della mancanza di materiale tumorale. Il potenziale effetto patogeno di questa variante promotore a livello di espressione E-caderina merita ulteriori studi
trascrizione ospitare una delezione del CDH1
dell'esone 11. Exon 11, insieme con sequenze parziali di esoni fiancheggianti , codifica per il dominio CE4 della proteina matura [25]; ID 17 è una delezione out-of-frame e porta alla formazione di un codone di stop prematuro alla posizione 384 del promotore EC4. Di conseguenza, la proteina tradotta da CDH1
ID 17 filone potrebbe mancare il dominio transmembrana e la coda citoplasmatica che è coinvolto in β-catenina vincolante. Entrambi i pazienti GC S10 e S46, avendo l'ID 17 mutazione, ha mostrato una riduzione nell'espressione di E-caderina e β-catenina da IHC analisi (figura 5); il paziente GC S10, con un carcinoma a cellule anello con sigillo, è stato diagnosticato all'età di 61 anni, e il paziente GC S46, con un adenocarcinoma diffuso, è stato diagnosticato all'età di 58 anni. Inoltre, la valutazione dell'espressione E-caderina dal EBV immortalata linfociti B ha mostrato una riduzione forte (60%) in GC S10 ospitare ID 17 mutazione in confronto con il controllo BD (S189) senza CDH1
alterazioni, ma anche rispetto ad un singolo donatore di sangue (S190) portante lo stesso ID 17 variante. Dal momento che tutti i soggetti portatori della mutazione ID 17 sono eterozigoti per la CDH1
gene, i nostri dati indicano che l'individuo S190, ma non le cellule tumorali di pazienti S10 e S46, possono sfruttare un meccanismo di compensazione che contrasta la E-caderina down-regulation. Nei tumori, E-caderina sotto-espressione è legata ad una maggiore β-catenina attività trascrizionale, un effettore principale del pathway Wnt [49]. L'espressione di un gran numero di geni correlati alla progressione del tumore, compresi quelli per ciclina D1, C myc
, fattore di crescita vascolare endoteliale, e survivina è controllato attraverso la via Wnt /β-catenina [50]. legandosi a beta-catenina previene la sua traslocazione al nucleo E-caderina; di conseguenza, una riduzione dell'espressione E-caderina può favorire patogenesi GC attraverso un maggiore accumulo β-catenina nucleare. Poiché i pazienti S10 e S46 con variante ID17 sono due donne che mostrano un Helicobacter pylori (HP) l'infezione, si assume che ID 17 potrebbe essere associato ad un fattore prognostico sesso-specifico (è ben noto che l'incidenza di GC è più alto per gli uomini rispetto alle per le donne) e /o un'infezione HP. Una delezione dell'esone 11 del CDH1
gene è stato anche descritto in un paziente HDGC, ma in questo ultimo caso aberrant splicing è stato associato ad una diversa mutazione intronic (IVS11 c.1711 + 5G > A) [27] . Curiosamente, un splicing alternativo, non funzionale trascrizione E-caderina che manca dell'esone 11 del gene era stata riportata anche in alcune cellule della testa e del collo cancro [51] e casi di leucemia linfatica cronica (LLC) e, anche se a un livello inferiore rispetto a CLL, anche in cellule B normali [52]. In questi casi non sono state osservate alterazioni genetiche in esone 11 o nelle sue regioni introniche d'accompagnamento; la trascrizione non funzionale ha un premature codone di terminazione ed è degradato dal nonsense-mediata RNA degrado [52]. fattori di splicing, vincolante nella regione dell'esone 11 del CDH1
, potrebbero avere livelli alterati di espressione o stati di attivazione nelle cellule CLL rispetto alle normali cellule B come recentemente dimostrato [53].
mutazioni polimorfiche e silenziosi, abbiamo osservato 3 sostituzioni (ID 1, ID3 e ID 9) che non sono stati trovati in GC.
[54]. Noi ipotizziamo che questa mutazione con l'introduzione di un isola CpG nel CDH1
regione del promotore aumenta la probabilità di CDH1
hypermethylation, un evento noto favorendo l'inattivazione trascrizionale, un evento precoce in HP gastrite [ ,,,0],55] e un fattore di rischio chiave associata allo sviluppo GC
splicing.
mutazioni germinali fino ad ora. In serie AMAG abbiamo trovato solo varianti polimorfiche, ad eccezione di ID 5, una nuova mutazione intronic vicino al esone 1 (IVS1 c.48 + 7C > T). ID 5 è stato trovato in una femmina di 51 anni, con ipergastrinemia. Non abbiamo trovato nessun troncamenti o mutazione nella produzione della proteina associata a questa mutazione. Anche se la nostra serie è limitato (n = 20), questi dati sembra non sostenere un ruolo rilevante di CDH1
alterazioni genetiche associate alla malattia AMAG.
splicing e una diminuzione relativa nell'espressione E-caderina e anche per il β-catenina. Lo stesso ID 17 mutazione splicing ed effetto trovato nel 1 donatore di sangue, ma con un effetto limitato a livello di mRNA E-caderina, è intrigante e merita ulteriori studi. Considerando la correlazione tra specifici CDH1
alterazioni germinali e l'istotipo tumorale, abbiamo scoperto che l'8,3% (1 di 12 CV) di misto (ID11) e del 7,7% (2 di 26 CV) di diffusa (ID17) sottotipi , portato un potenziale mutazione patogena
, un evento di rischio ben noto associato con lo sviluppo e la progressione GC.
sostituzioni contro le alterazioni non missense, come riportato in una recente metanalisi per le aree a rischio GC medio-alte, come il Centro Italia [58].
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