Stomach Health > Mo. Gesondheet >  > Gastric Cancer > Gastric Cancer

PLOS NËMMEN: Simulatiouns vun Swansons Literatur-Opgrond Discovery: Anandamide Prefabrizéierten bremst Wuesstem vun Gastric Cancer BTS eng kënschtlech an Am Silico

Wat VerfÜgung

Swanson d'Literatur-baséiert Entdeckung konzentréieren op déi virdrun publizéiert erëmbelieft mä Wëssen vernoléissegt. An dëser Etude, proposéieren mir eng zwee-Schrëtt Modell vun der Entdeckung Prozess an enger Hypothes tëscht anandamide an gastric Kriibs generéieren. Weider gouf de Potential Relatioun vun Suivi trotzdeem confirméiert. D'anandamide Behandlung schéinen Zell Zyklus Ëmverdeelung vun gastric Kriibs Zellen. Wichteg, huet de Variant vun Zell Zyklus vun e puer Genen vun der B-Bestëmmunge vun der zougemaach Entdeckung mediated, d'Potential Roll vun der B-Begrëffer ugëtt. Swanson d'Literatur-baséiert Entdeckung net nëmmen collates Daten fir méiglech Interaktiounen, mä stellt och d'Potential dat grousst Hannergrond hannert dësen direkt Linken op fest an ass eng grouss Entdeckung Hëllefsprogramm fir Enquêteuren VerfÜgung

Fro:. Dong W, Liu Y, Zhu W, Mou Q, Wang J, Hu Y (2014) Simulatiouns vun Swanson d'Literatur-Opgrond Discovery: Anandamide Prefabrizéierten bremst Wuesstem vun Gastric Cancer BTS kënschtlech VerfÜgung a an Silico VerfÜgung. PLoS NËMMEN 9 (6): e100436. Doi: 10.1371 /journal.pone.0100436 VerfÜgung

Redakter: Valli De Re, CENTRO di Riferimento Oncologico, IRCCS National Cancer Institut, Italien VerfÜgung

Arnaque: 12. Januar 2014; Akzeptéiert: 25 Mee, 2014; Publizéiert: 20. Juni 2014 VerfÜgung

Copyright: © 2014 Dong et al. Dëst ass eng oppen-Zougang Artikel ënnert de Bedingunge vun der Lizenz BY Creative Commons verdeelt, déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt d'Original Auteur an d'Quell Kaiser sinn VerfÜgung

Funding:. Dës Etude vun der chinesescher Geriatric Zukunft Society finanzéiert gouf (Zukunft Programm, Stipendien CGOS-03-2013-1-1-00600). D'funders hu keng Roll am Etude Design, Daten Kollektioun an Analyse, Décisioun, oder Virbereedung vun der mëttelalterlech Handschrëft ze publizéieren VerfÜgung

Wettsträit Interessen:.. D'Auteuren hunn deklaréiert, datt keng Competitioun Interessen existéieren VerfÜgung

Aféierung VerfÜgung

D'rapid Entwécklung vun der Wëssenschaft huet fir eng exponential Wuesstem vun eisem Wëssen huel gefouert. Demno, ass et ganz Erausfuerderung fir medezinesch Enquêteuren déi relevant, aktualiséiert Informatiounen aus dem Alldag deluge vun publizéiert Literatur Feil a verschaffe. Zum Beispill, d'Gesamtzuel vun de Publikatioune vun der Sich Begrëff "gastric Kriibs" indexéiert fräi méi wéi 4-fantastesch an 2012 am Verglach zu 1980. Oft, déi relevant Informatiounen dierft am aktuelle Studien präsentéieren oder vernoléissegt ze ginn [1]. Ausserdeem, mat Spezialisatioun an de Beräicher vun der Wëssenschaft ëmmer méi an Technologie, existéieren grouss Erausfuerderungen Informatiounen Kräiz-System an sharing, wéi wëssenschaftleche Verständnis ass méi do a manner diversifizéiert réckelt. Allerdéngs muss ee Sënnvolles Relatioun tëscht de verschiddene Fuerschung Beräicher existéieren. Dofir, et ass méi wichteg, de ignoréiert Wëssen iwwer d'Informatiounen Wuesstem selwer [2] ze bestëmmen. VerfÜgung

Swanson (1990) entwéckelt a realiséiert engem Roman Outil déi bestehend Wëssen durstellen fir unreported oder underreported Bezéiungen zu Grouf, an gegrënnt virdru hypotheses publizéiert mä vernoléissegt, e Prozess bekannt als Literatur-baséiert Entdeckung [3]. Dëse Prozess Funktiounen wéi eng Manéier 2 jiddwereen stinn Conclusiounen vun ëmklammen, soss an dëser Form festgehalen: wann "A bis B Zesummenhang ass" a "B ass am Zesummenhang mat C", dann d'Hypothes, datt "A bewierkt C" ass staark ugeholl [4 ]. Obschonn dës Approche déi net eng mer eis Beweis, d'Entdeckung ass, an sech, ganz hëllefräich virdrun onbekannt Bezéiungen zu uncovering [5]. Weider, kann et den Enquêteuren Zougang Kontext an mäin Wëssen hëllefen, dass net eng traditionell Sich réischt kéint benotzen. VerfÜgung

Am Moment studéieren, standing mir eng 2-Schrëtt Approche Swanson d'Literatur-baséiert Entdeckung Methodik an 2 bis virstellen Beräicher vun der biologescher Fuerschung Literatur dat normalerweis net bibliographically verbonne sinn: gastric Kriibs a Psychologie. Gastric Kriibs ass eng vun de meeschte Toast festgestallte Cancers, den zweete Spëtzekandidat Ursaach vum Kriibs-Zesummenhang Doud weltwäit, an engem schlëmmen ëffentlechen Gesondheetsproblem [6]. Virdrun Fuerschung huet hien och, datt eng Rei vu psychesch Faktoren eng bedeitend Effekt op kierperlech Krankheeten hunn kann. Allerdéngs huet d'Relatioun tëscht gastric Kriibs a Psychologie virdrun vernoléissegt ginn. Dofir, dësen 2 Beräicher vun der Fuerschung mat dem Zil vun fannen eng vernoléissegt gemeinsam Verbindung ausgewielt goufen. VerfÜgung

D'2-Schrëtt entsteet Entdeckung Prozess engem Hypothesen iwwer d'Korrelatioun tëscht anandamide an gastric Kriibs an engem méiglech gemeinsam molekulare Reseau gëtt, deen kann d'Auswierkunge Mediate. D'Hypothes war dann experimentally propagéieren. Anandamide war bis inhibit Wuesstem vun 4 gastric Kriibs Zell Linnen fonnt, dorënner BGC823, SGC7901, AGS, an N87. Flow cytometry Donnéeën bewisen, dass d'Präsenz vun anandamide entschlof G2 /M Zell Zyklus verhaft an AGS an N87 Zellen. Ausserdeem, confirméiert mir dat anandamide Akt kann Zell Zyklus verbonne Genen ze regléieren, dorënner CHEK1, CDKN1A, CDKN2A, aus der zougemaach Entdeckung Prozess kritt. Zesummen, weg dës Donnéeën, déi anandamide der Zell Zyklus Verdeelung vun gastric Kriibs Zellen Impakt vun der B-Begrëffer Zell Zyklus Legislateuren Regulatioun, eng Hypothes, datt experimentally an dëser Etude validéiert huet, doduerch Enquêteuren mat eng alternativ Vue iwwer d'Roll vun anandamide ëmzesetzen. Mat Hëllef vun dëser Approche, ware mir kënnen erfollegräich e virdrun verstoppt Relatioun tëscht 2 disparate Felder Stéck zesummen an d'allgemeng Wëssen huel derbäi. VerfÜgung

Method a Material zur VerfÜgung

D'Artikelen am MEDLINE Datebank VerfÜgung

D'National Instituter Gesondheetsminister (NIH) -sponsored MEDLINE /PubMed Datebank Linken op Artikelen enthält zu iwwer 5500 Virwaat Ausbildung publizéiert. Mo. oder Mo. Patient oder Neoplasms;; fir déi komplett Serie vun Artikelen fir "gastric Kriibs," eng inklusiv Serie vun Sich Sieg (Patient kritt Mo oder Neoplasms; Gastric oder Gastric Neoplasms oder Gastric Patient oder Patient; Gastric oder Cancer vun Mo. oder Mo. Cancers oder Mo. Cancer oder Cancer; Mo oder Cancers; Mo oder Cancer vun de Mo. oder Gastric Cancer oder Cancer; Gastric oder Cancers; an Gastric oder Gastric Cancers oder Mo. Neoplasms) war benotzt déi entspriechend Artikelen ze recuperéieren. Dës Sich Sensor 86,536 records (27. Oktober Rampen, 2011), déi all Publikatiounen an dëser Datebank aginn abegraff. Onzouréichend oder psychescher Side Effects oder psychescher Side Effekt oder Side Effekt;; onzouréichend oder psychosozialen fir op oder Factor; psychosozialen oder fir op ervirgestrach, déi komplett Serie vun Artikelen fir "Psychologie," eng inklusiv Serie vun Sich Sieg (Psychologie oder Side Effects ze kréien; psychosozialen oder psychosozialen Factor oder psychescher fir op oder fir op; onzouréichend oder Factor; a psychesch oder onzouréichend Factor oder Psychologen oder Psycholog) Sensor 911.793 Alben. All dës Publikatioune goufen an Medline Format fir Sammelt Medical Betreff Rubriken (ech) Begrëffer. VerfÜgung

Mesh Begrëffer VerfÜgung

Mesh ass d'kontrolléiert Vocabulaire Thésaurus vun der Nationalbibliothéik vun Medezin gerett. Mesh besteet aus besot vu Begrëffer Descripteure genannt datt an zwee alphabétësch an Hierarchie Strukturen arrangéiert ginn, also, ech Konditiounen kann d'Primärschoul Schwéierpunkt vun der Publikatioun identifizeieren, a vläicht fir Index Medline records benotzt ginn. An dëser Etude, goufen dës Descripteure mat engem Mesh stoplist vun 5.569 Descripteure spezifesch fir de Sujet Beräicher vun dëser Etude Filter. VerfÜgung

Stoplists VerfÜgung

ass A stoplist enger Lëscht vu Wierder, déi ausgeschloss ginn, entweder well se ze breet sinn oder Sprooch sinn den Ziler vun enger Sich. Stoplists kann esou vill wéi e puer honnert funktionell Wierder och dass Sujet sinn net konzentréiert. An dëser Etude, war eng laang stoplist vun 5.569 Wierder iwwerlieft de Mesh Begrëffer ze filteren. Benotzen ech Kategorien vun der Medline Datebank an Enquêteur Uerteel, mir Lëschte vun stoppen-Begrëffer iwwerlieft, mat den Top-Niveau Mesh Kategorien gewisen an Table 1. Détailléiert Informatiounen iwwert Mesh Kategorien kann op http fonnt ginn: //www.nlm.nih .gov /ech /2012 /mesh_bro-wser /MeSHtree.Dhtml. VerfÜgung

Open Entdeckung Prozess VerfÜgung

d'Open Entdeckung Prozess mat enger wëssenschaftlecher Problem an der Generatioun vun enger Hypothes fänkt. An dëser Etude, goufen d'Felder vun gastric Kriibs a Psychologie ausgewielt fir verstoppt Bezéiungen ze sichen. Mir Sensor d'Publikatiounen, déi op gastric Kriibs a Psychologie virdru beschriwwen. Next, war d'Mesh Profil fir domat och d'A oder B Sujet gebaut. Mir gebaut Sujet Profiler vun enger relevant Ziel vun charakteristesche Begrëffer aus der Auswiel vun Text identifizéieren. Konditioune sech aus der Dokumenter an évaluéieren fir hir famill Wichtegkeet als Descripteure vun de Sujet ofgebaut. An dëser Etude, eis Profiller ware déifgräifender Kris vectors vun Mesh Begrëffer, wéi hei ënnendrënner fir eng Thema X dës i: VerfÜgung

(1) wou m j engem Mesh Begrëff duerstellt, w i , j stellt hir Gewiicht, mat engem Total vu n Begrëffer an der Mesh Vocabulaire [7]. VerfÜgung

No Sujeten a a B gebaut goufen, d'final geschéckt-en C Profil-gouf eng Java Miniprogramm andeems datt mer entwéckelt. An dëser Prozedur, waren Konditiounen, déi a béid A a B Profiler éliminéiert, zesumme mat Sichbegrëffer, datt nëmmen an d'A Profil goufen. waren d'Mesh Begrëffer endlech, datt an der B Profil nëmmen dobäi waren a wossten seelen am A Profil ausgewielt an der C Profil genannt. D'Begrëffer vun der C Profil zougedréckt enk Verbindungen mat Sujet B a wéineg oder keen Linken op Sujet A. An anere Wierder, blouf dëse Konzepter enk mat verbonne "Psychologie," mä sech dacks mat Allerdéngs virdrun unreported gemellt zesummen "gastric Kriibs." Verbindung kann existéieren, déi de Perquisitiounen Prozedur mat sënnlech kann VerfÜgung

Méindes Entdeckung Prozess VerfÜgung

d'zougemaach Entdeckung Prozess war mat der Web-baséiert Modell Arrowsmith (http gesuergt:. //arrowsmith.psych. uic.edu/arrowsmith_uic/index.html; Universitéit vun Illinois, Chicago, Chiffer vun Psychiatrie), déi mat Verständnis an Unerkennung vun Häerzen Verbindungen ze hëllefen tëscht dem a an C Literatur Komponente [8] konzipéiert ass, [9]. Mir goufen d'zougemaach Entdeckung Prozess mat den éischten 2 Medline Recherchen der Arrowsmith Veraarbechtung benotzt: E Sujet Profil Sich an C Begrëff Literatur Sich. Next, generéiert der Arrowsmith Programm eng Lëscht vu Begrëffer datt am Titel vun zwee A an C Literatur retrievals fonnt ginn hätt. Dës Wierder goufen analyséiert enger B-Lëscht ze generéieren, eng drëtt Filter Schrëtt benotzt, vun: VerfÜgung

  • Dir bestëmmte Gebai Kategorien (Aktivitéiten & Verhaalen; Anatomie; Genen & cuisine Message, an Gene & Protein Benennung; Chemikalien & realiséiert; Physiologie); VerfÜgung
  • Stoppen B-Begrëffer, déi manner wéi 5 Mol an entweder Literatur wossten; VerfÜgung
  • hält nëmmen B-Begrëffer, déi éischt an déi lescht 10 Joer wossten;
  • Stoppen B-Begrëffer manner Literatur Zesummenhalt stin se wéi 0,1.

    Endlech hu mir eis Lëscht vu B-Konzepter generéiert an dann desinfizéieren AB a BC retrievals Literatur gekuckten. VerfÜgung

    Zell Kultur VerfÜgung

    D'Zell Linnen am Moment Etude benotzt all gastric Kriibs huet Zell Linnen. Der N87 an AGS Zell Strecken vum amerikanesche Type Kultur Collection (ATCC, Manassas, VA, USA) kritt. AGS Zell Linn war aus etleche Brochstécker vun engem entholl vun engem Patient resected ofgeleet déi eng 54-Joer-ale Caucasian weiblech war an hu keen Welpen Therapie krut. N87 Zell Linn war aus enger Liewer Metastasen vun engem gutt ënnerscheet Mo. carcinoma vun engem Caucasian männlech geholl éier cytotoxic Therapie ofgeleet. AGS an N87 Zellen sech cultured zu Dulbecco d'geännert Eagle d'mëttel- (DMEM; Invitrogen, Karlsbad CA, USA), mat 10% An et Bovine serum nà (FBS). D'Zell Linnen BGC823 an SGC7901 waren an China etabléiert. D'BGC823 Zell Linn gouf 1984 duerch 60 Passage vun Zell Kultur an der Period vun 2 Joer aus engem chirurgesch specimen vun engem Mo. Kriibs Patient etabléiert déi als niddereg ënnerscheet adenocarcinoma diagnostizéiert gouf. SGC7901 Zell Linn gouf 1979 gegrënnt an aus engem lymphatic Metastasen vun gastric adenocarcinoma vun engem 56-Joer-ale Chinese weiblech ofgeleet. D'BGC823and SGC7901 Zellen sech cultured zu Dulbecco d'geännert Eagle d'mëttel- (DMEM; Invitrogen, Karlsbad CA, USA), ergänzt mat 5% An et Bovine serum (FBS); All Zell Linnen bei 37 ° C haten sech CO zu 5% 2. VerfÜgung

    Flow cytometric Analyse vun Zell Zyklus Status an apoptosis VerfÜgung

    D'AGS an N87 Zellen (1 × 10 5) waren déi trypsin unzereegen der Behandlung mat anandamide (Fläch, A0580), gewäsch mat PBS, an fix zu kal 75% Ethanol bei 4 ° C Iwwernuechtung Zäitche recoltéiert. No staining war vun fluorescence ageschalt Zell zortéieren (FACS) mat propidium Kaliumiodid (PI) Léisung fir 30 min, Zell Zyklus Analyse standing de Prozentsaz an Verdeelung vun Zellen vun de G1, S, an G2 /M Phasen ze bestëmmen. VerfÜgung

    fir ze erkennen phosphatidylserine externalization, trypsinized Zellen sech double-Kierchefënster mat fluorescein isothiocyanate (FITC) -conjugated Annexin V (20 μg /ml) an PI (50 μg /ml) laut den Hiersteller d'Protokoll (Biosea; Nelson, Neuseeland ). Dausend Zellen sech gesammelt an analyséiert vum FACSorter, an der Zell Zyklus Profiler benotzt Zell Quest Software (Becton-Dickinson, Franklin sin, NJ, USA) analyséiert. VerfÜgung

    MTT assay VerfÜgung

    BGC823, SGC7901, AGS, an N87 Zellen sech plated an 96-gutt Kultur Placken a mat anandamide bei verschiddene Konzentratioune incubated, gefollegt vun 3- (4,5-dimethylthiazol-2-yl) -2,5-d-iphenyltetrazolium bromide (MTT) op 24, 48, 72, an 96 h. No 4-h incubation bei 37 ° C an 5% CO 2, 200 μL Police sulfoxide (DMSO) ugebaut der formazan Produit ze solubilize. D'absorbance bei 570 nm huet mat enger microplate Lieser sech. (Bio-Rad schaffen; Hercules, CA, USA) VerfÜgung

    Gene Ausdrock profiling Analyse VerfÜgung

    D'2 verschidden RT2 PROFILER Hinnen alleguer flamenden Ofgrond (SA Biosciences waren, QIAGEN) benotzt den Ausdrock Niveau vun 84 Genen vun Regulatioun vun Zell Zyklus (Human Zell Cycle lackeleg, PAHS-020) zu AGS Zellen behandelt mat anandamide oder Gefier Équipe ze analyséieren. D'Zellen sech um 24h an der anandamide Behandlung gesammelt an total RNS war Extraktioun benotzt RNeasy Plus Kit (QIAGEN). D'syntheteschen cDNA war als Skelett benotzt ze grouss polymerase Kette Reaktioun (Hinnen alleguer) Analyse Leeschtunge. D'RT2 PROFILER Hinnen alleguer Singular Data Analyse Software (v3.5) war fir Hinnen alleguer vill Daten Analyse benotzt. Mir ausgewielt der GAPDH an ACTB als Referenz Genen. Genen mat Ausdrock fantastesch Ännerungen tëscht Echantillon grouss wéi 2 den Ënnerscheed Genen ginn ausgewielt. VerfÜgung

    Western blot Analyse VerfÜgung

    Protein lysates vun 12% Tris-glycine polyacrylamide gelies electrophoresis an transferéiert ze polyvinylidene fluoride getrennt huet ( PVDF) Schläimhait (GE Gesondheetswiesen; Little Chalfont, UK). Schläimhait sech mat der Maus monoclonal antibody géint Mënscherechter Chk1 incubated, p-Chk1 (Abcam; Cambridge, UK), CDC25A, CyclinB1 (Santa Cruz Déi, Santa Cruz, CA, USA), gefollegt vun horseradish peroxidase (HRP) -labeled Geess-anti -mouse IgG (PTGLab; Chicago, IL, USA). β-actin (Fläch Chemesch; St. Louis, MO, USA) war als FAQ Luede Kontroll benotzt. D'HRP conjugate gouf vun engem chemioluminescence ECL Kit (Amersham) an autofluorography fonnt. Protein Intensitéit war mat der LANE 1D Organer Software (Sage Schafen, Peking, China) laachen. VerfÜgung

    statistique Analyse VerfÜgung

    Den T-Test d'Student gouf benotzt d'Bedeitung vun Ënnerscheed tëschent zwou Gruppe vu analyséieren Donnéeën. P &Si besteet;. VerfÜgung 0,05 war den statistesch groussen Deel zur VerfÜgung

    Resultater VerfÜgung

    Acquisition vun Mesh Conditioune fir gastric Kriibs a Psychologie VerfÜgung

    An der Open Entdeckung Prozess, den éischte Schrëtt war d'Mesh Begrëffer aus der Literatur retrievals ofzebauen. Mir generéiert 12.001 Mesh Begrëffer (Profil-A) den Text fir mat "gastric Kriibs." Dës Mesh Begrëffer Aspekter vun gastric Kriibs Équipe datt Diagnos gehéiert, Behandlung, Medikamenter, Survival, Kriibs Etapp, Zell Funktioun, Genen, Proteinen, a verschidde chemesch Substanzen wéi Kris géinge verschlëmmeren. Mir generéiert 9.635 Mesh Begrëffer (Profil B) den Text fir "Psychologie" benotzt, déi bis sozial Ëmwelt enk Zesummenhang sinn, Verhalen, Perséinlechkeet, Gefiller, Arte vu Krankheeten, Therapie, Drogen, chemescher Substanz, etc. D'Top Ten Mesh Begrëffer aus all Thema an Table ugewisen sinn 2. VerfÜgung

    Discovery vun anandamide vun der C Profil (BA) VerfÜgung

    deems der CSSF Java Miniprogramm, verleeft mir Begrëffer am a Profil vun der B Profil optauchen, loosst nëmmen Begrëffer präsent an der B Profil, mä ni an d'a Profil optauchen. Dës nei Formatioun huet den identifizéiert "C Profil." Konditioune vun der C Profil sech gemellt méi wéi 1 Relatioun mat Psychologie ze hunn, mee puer oder nee Publikatiounen gläichzäiteg Referenzéieren souwuel Psychologie an gastric Kriibs. Virdru unreported Verbindung kann awer, existéieren, déi net entdeckt hunn, oder sech ignoréiert. VerfÜgung

    Fir weider d'Potential Relatiounen tëscht deene Felder beschen, klassifizéiert mir d'Konditioune vun der C Profil an 6 Kategorien, dorënner gelooss, Uergel an Otemschwieregkeeten, e Bonus, Krankheeten, Drogen a chemesch Substanzen, an aner. All Wuert haat seng eegen Frequenz; déi Begrëffer déi héich Ofstänn a Representatioun: et sinn an Table ugewisen 3. Endlech, ausgewielt mer 1 Begrëff aus dem Drogen- a chemescher Substanz Kategorie, anandamide, fir weider studéieren. D'Grënn fir eis Selektioun ginn ënnert zesummegefaasst:. VerfÜgung

  • D'Begrëffer am Alkohol- an chemesch Kategorie am einfachsten fir experimentell Testen vum Potential Lien tëscht Psychologie an gastric Kriibs VerfÜgung
  • An der Kategorie bis benotzt goufen seng grouss famill Wichtegkeet vun Drogen- a chemesch, uginn der héijer Frequenz vun anandamide. VerfÜgung
  • aner Begrëffer mat héijer Frequenz, wéi diazepam, sinn all bekannt, iwwerdeems anandamide eng relativ nei Matière ass. VerfÜgung

    Obwuel puer Studien fonnt goufen zesummen souwuel anandamide an gastric Kriibs waat [10], [11], eis Aarbecht vun Sënde axéiert Weeër oder Mechanismen op analyséiert datt bekannt ginn kéint net. VerfÜgung

    Cepheid vun Relatioun tëschent anandamide an gastric Kriibs VerfÜgung

    Eis Hypothesen iwwer anandamide an gastric Kriibs war duerch de zougemaach Entdeckung Prozess getest. Dëse Prozess war mat der Web-baséiert Modell Arrowsmith gesuergt; vun der Krankheet vun gastric Kriibs (A) an der Substanz vun anandamide (C) ugefaange, gesichte mir fir gemeinsam Tëscherapport B-Begrëffer. D'B-Lëscht enthale Titel Wierder an Ausdréck (Konditiounen) dat zu zwee den A an C Literatur wossten. Wéi d'Weeër tëscht A an C fonnt gouf méi heefeg, fräi et der wahrscheinlech Validitéit vun eiser Hypothesen. No der néideg CSSF filter Schrëtt, goufen 446 Begrëffer Moment op déi aktuell B-Lëscht, klasséiert no virausgesot Relevanz. Next, limitéiert mir dëse Conditioune vum Gebai Kategorien vun Genen & Molekulare Message an Gene & Protein Benennung a gesammelt Équipe der Zil- Genen vun verschiddenen sécher Weeër dorënner Zell Zyklus, apoptosis, inflammation an etc (Table 4). Parallel gouf eng Passerelle Reseau gebaut der gemeinsamer molekulare reglementaresche Vernetzung gastric Kriibs an anandamide Aktioun ze affichéieren. Als zu Dorënner 1 gesinn, Schatzkummer dës Genen héich Ofhängegkeet de reglementaresche Relatiounen tëscht hinnen ugëtt. Fir weider d'Validitéit vun deenen Zil- Genen ënnersicht, e puer Proteinen /Genen sech als Beispiller gewielt hir Relatioun zu gastric Kriibs oder anandamide duerch ARROWSMITH SYSTEM z'iwwerpréiwen. A wéi an Table 5, eng Grupp vu kriteschen Genen vun e puer Weeër Équipe gewisen, datt souwuel zu gastric Kriibs an anandamide verbonne sinn. All dës Hiweiser implizit eng potenziell verstoppt Verbindung tëscht anandamide an gastric Kriibs, deen Waasserlaf weider Enquête gouf. VerfÜgung

    Detektioun vun den Effet vun anandamide op gastric Kriibs Zellen VerfÜgung

    Anandamide, als Member vun der endocannabinoid Famill, och bekannt als N VerfÜgung -arachidonoylethanolamine oder AEA, war ze aktivéieren 2 Frae Cannabis kenne FAQ-kräftegen G gewisen, déi Cannabis receptor Typ 1 (CB1) an de Cannabis receptor Typ 2 (CB2) [ ,,,0],12]. Anandamide ass aus N-arachidonoyl phosphatidylethanolamine (NAPE) Wierderbuch a seng ofgeschnidden ass vun der fatty Seier amide hydrolase (FAAH) Aktivitéit, déi och catalyzes der afgerappt Ëmbau vun anandamide an ethanolamine an arachidonic Seier allem catalyzed. D'Struktur vun anandamide ëmfaasst déi funktionell Gruppe vun amides, Kris géinge verschlëmmeren, an ethers vun laang-Ketten polyunsaturated fatty Saieren [13]. Dës awer weise "cannabimimetic Aktivitéit"; an anere Wierder, Funktioun se als "D-9-Firwat (THC) mimetics", déi aktiv Zutate vun Cannabis. D'anandamide Struktur deelt kritescher pharmacophores mat THC [14] (Dorënner 2A). VerfÜgung

    den Effet vun anandamide op d'Prolifératioun vu gastric Kriibs Zellen ze wëssen, BGC823, SGC7901, AGS, an N87 mat waarden Konzentratioune vun behandelt goufen syntheteschen anandamide. Duerno, war d'Verbreedung vun dësen Zell Verse MTT fonnt. Resultater bewisen, dass anandamide staark Verbreedung Taux vun deenen 4 gastric Kriibs Zell Linnen an enger Portioun-ofhängeg Manéier reduzéiert, mat statistesch relevant Kierzungen ( p &Si besteet; 0,01 VerfÜgung) um 100 μM. Desweideren, ugewisen der AGS an N87 Zell Linnen engem méi sensibel an dramatesch erofgoen ( p &Si besteet; 0,01 VerfÜgung) souguer bei 50 μM Konzentratioun (Dorënner 2B). Ausserdeem, iwwerpréift mir den Effet vun anandamide um ënneschten Konzentratioune op Zell Verbreedung zu gastric Kriibs Zellen. Als zu Dorënner 2C gewisen, e wichtegen, Morphium-ofhängeg erofgoen ( p &Si besteet; 0,01 VerfÜgung) zu Prolifératioun vu AGS an N87 Zellen war mat enger inhibition observéiert. Allerdéngs, anandamide um ënneschten Konzentratioune wéineg Effet op BGC823 an SGC7901 Zell Linnen produzéiert (Donnéeën net gewisen). Dofir, AGS an N87 Zell goufe méi sensibel op anandamide wéi BGC823 an SGC7901 Zell Linnen. VerfÜgung

    Anandamide de Wuesstem Fähegkeet vun AGS an N87 Zellen reduzéiert, iwwerdeems et wéineg Effet op apoptosis zu AGS an N87 Zellen haten (Dorënner 2D). Dofir, muss et aner Grënn ginn, datt fir d'Verréngerung Prolifératioun gefouert. VerfÜgung

    Effekt vun anandamide Behandlung op Zell Zyklus Verdeelung vun gastric Kriibs Zellen VerfÜgung

    weider Fir d'Charakteristiken vun Wuesstem inhibition vun anandamide iwwerpréifen, déi Zell Zyklus Phase gouf duerch onkontrolléiert cytometry fonnt. D'AGS an N87 Zellen an der Period Mooss Wuesstem sech mat 10 μM anandamide oder Ethanol fir 24 h Léisungsmëttelbad incubated, dann an der G2 Phase vun Zell Zyklus Glatäis (Dorënner 3A an 3B). Fir d'Wierkung vun anandamide op Zell Zyklus Werdegang zu gréissere Detail, AGS an N87 Zellen sech synchroniséiert an der G1 Phase vun serum Honger ermëttelen. D'Zell Zyklus analyséieren wann Zellen aus dëser Blockade mat komplett mëttel- a Presenz oder Feele vun anandamide lassgelooss huet. Zellen mat Ethanol Léisungsmëttelbad, an Plaz vun anandamide behandelt goufen als Kontrollen agestallt. Als zu Dorënner 3C gesinn, sech mat méi wéi 70% G1 Phase DNA Inhalt AGS Zellen synchroniséiert der se an gratis-serum Kultur ugebaut goufen. Vun 6 h, huet ongeféier 46% vun der Kontroll Zellen an G1 Phas, an déi 12 h, d'Majoritéit (57.45%) waren am S Phase. Tëscht 12 an 24 h, goufen d'Zellen am G2 /M Phas a mécht rapid mitosis, a vun 24 h, koum se d'nächst Zell Zyklus. Allerdéngs, wann d'Zellen mat anandamide der Verëffentlechung vun der G1 Phas, 33,47% vun de behandelt Zellen sech am G2 /M Phase verhaft fir bis 24h behandelt goufen, a weisen eng verspéiten wëll an den nächsten Zell Zyklus. Eng ähnlech Trend war och zu N87 Zellen (Dorënner 3D) observéiert. Geholl zesummen, weg dës Resultater datt anandamide Behandlung der G2 /M verhaft ëmmer an AGS an N87 Zellen observéiert. VerfÜgung

    Effekt vun anandamide op Zell Zyklus Legislateuren VerfÜgung

    Fir de molekulare Mechanismen responsabel fir ze analyséieren fräi Zell Zyklus verhaft vun anandamide verursaacht, déi mir 2 verschidden RT2 PROFILER Hinnen alleguer flamenden Ofgrond (SA Biosciences, QIAGEN) den Ausdrock Niveau vun Genen an d'Regulatioun vun der Zell Zyklus Équipe ze bestëmmen. Genen mat Ausdrock fantastesch Ännerungen tëscht behandelt Zellen mat anandamide an Gefier grouss wéi 2 den Ënnerscheed Genen ausgewielt goufen. D'Resultater weisen, datt AGS mat anandamide behandelt Zellen fir 24 h eng allgemeng Erhéijung vun dem Wëllen vun G2 /M verhaft Zesummenhang Genen och GADD45 an p21 ugewisen waf an eng visuell Ofsenkung G2 Zell Zyklus Legislateuren dorënner CHEK1, CHEK2, CDC25, CCNA2, CCNB1, CDKN1A, CDKN2A, etc. (Dorënner 4A). Fir weider z'ënnersichen ob anandamide vun G2 /M Bomm Kontroll Zell Zyklus verhaft ëmmer, standing mir eng westlech blot Analyse vun AGS Zellen folgenden anandamide Behandlung fir 24h. Zellen mat Ethanol Léisungsmëttelbad, an Plaz vun anandamide behandelt goufen als Kontrollen agestallt. Als zu Dorënner 4B an 4C gewisen, ëmmer anandamide eng Erhéijung vun Chk1 phosphorylation a rofgaang den Ausdrock Niveau vun Cyclin B1 an CDC25A Verglach zu den Observatiounen zu Kontroll Zellen. Dës Donnéeë ugeholl datt anandamide Behandlung ze iwwerdribblen fir Aktivitéiten um G2 /M checkpoints gefouert. VerfÜgung

    Diskussioun VerfÜgung

    Ausschöpfung Swanson d'Literatur-baséiert Entdeckung Methodologie, kann Enquêteuren bestëmmen Roman Relatiounen tëscht jiddwereen stinn Felder, an gegrënnt virdrun publizéiert mä vernoléissegt hypotheses [15]. Am Moment studéieren, surfen mir Swanson d'Literatur-baséiert Entdeckung Methodik an 2 Felder vun medezinesch Fuerschung Literatur déi hunn net bibliographically verbonne ginn: gastric Kriibs a Psychologie. No enger 2-Schrëtt Entdeckung Prozess, war anandamide ausgewielt an dermat ze gastric Kriibs verbonne ginn. Next, war vun Suivi trotzdeem bestätegt d'Potential Relatioun tëscht gastric Kriibs an anandamide. Dofir, mir Literatur-baséiert Entdeckungen well d'hypotheses engem Roman Relatioun generéiert datt bewisen ass gin zouverlässeg. VerfÜgung

    Gastric Kriibs ass eng multifactorial Krankheet, mat villen causative Verännerlechen mussen gemellt ginn, dorënner H erfollegräich surfen . pylori VerfÜgung, héich-Natrium Bierger, drénkt, a fëmmen [16]. Virdrun Studien an eiser Labo hunn zu gastric Kriibs spezialiséiert; also d'Ziel vun dëser Etude war bis neit Wëssen an der gastric Kriibsfuerschung Terrain fannen. Dës Approche, Swanson d'Literatur-baséiert Entdeckung benotzt, Nerve der Identifikatioun vun anandamide, e Member vun der endocannabinoids. Anandamide gouf confirméiert anti-Prolifératioun Eegeschaften ze weise wou verschidden Zorten vun Cancers bestéet, dorënner neuroblastoma, Aarbecht carcinoma an melanoma [17] - [20]. Mayato [21] och Fuerschung op anandamide zu gastric Kriibs gemellt. Si propagéieren der inhibitory Effet vun anandamide op gastric Kriibs Zellen an Souzesoen d'Funktioun vun anandamide der cytotoxic Effet vun paclitaxel ze verbesseren, an hir Conclusiounen iwwert d'Auswierkunge vun anandamide op Zell Wuesstem sinn konsequent mat de Resultater vun dëser Etude. Mä e puer Genen (CHEK1, CDKN1A, CDKN2A, CCNB1, etc.) aus der B-Bestëmmunge vun der enker Entdeckung huet Zell Zyklus Reglementatioun, suggeréiert datt anandamide kéint zu Zell Zyklus vun gastric Kriibs Zesummenhang ginn. Wéi erwaart, nogewise real-Zäit Hinnen alleguer a westlech blot assays datt den Ausdrock vun deenen Zell Zyklus Reglementatioun waren folgenden anandamide Behandlung vill verännert. Flow cytometry assays bestätegt weider dass anandamide entschlof G2 /M Zell Zyklus verhaft an gastric Kriibs Zellen duerch aktiv G2 /M checkpoints. Dëst stellt d'éischte Kéier, datt d'Zell Zyklus Ëmverdeelung vun gastric Kriibs Zellen nogewise gouf no direkt a separat mat anandamide behandelt ginn. Ausserdeem, uginn d'Resultater, déi d'B-Begrëffer kéint eventuell d'effectors tëscht der Krankheet Mediate Funktioun bis an d'Entdeckung Ziler. VerfÜgung

    Fir biologescher Enquêteuren, mat aktuellen publizéiert Recherche weider-ze-Datum hält ass eng kritescher Komponent vun keng Aarbecht Beschreiwung vum Enquêteur, a bal all publizéiert Artikel ass eng Méiglechkeet Roman Linken tëscht Drogen- a Krankheeten ze fannen. Mä, ass déi aktuell Ausgab sinn biologescher Wëssenschaft enorm. An deenen informéiert traditionell Sich, observéieren kann Enquêteuren limitéiert Linken tëscht engem Alkohol- /Protein an enger Krankheet, mä kann dat grousst Ëmwelt duerch déi net unerkennen d'Relatiounen bedreiwen, nach identifizéieren aner potentiell Relatiounen bannent datt Ëmwelt. Dofir, si Informatiounen Wëssenschaft an retrieval ganz nëtzlech Handwierksgeschir fir biologesche Wëssenschaftler. Swanson d'Literatur-baséiert Entdeckung ass do op erëmbelieft virdrun publizéiert mä vernoléissegt hypotheses. Wann eng direkt Verbindung dass vernoléissegt ginn schéngt festgestallt gëtt, da stellt sech d'Aarbecht vun Sënde aus analyséiert Weeër oder Mechanismen ze ginn, dass net bekannt ginn. An anere Wierder, Swanson d'Literatur-baséiert Entdeckung Methodik net nëmmen Minièren Daten fir méiglech Interaktiounen tëschent Krankheet a Krankheet, Krankheet an Alkohol-, oder Krankheet a Protein, mä och mat de Potential liwwert eis der grousser Hannergrond hannert dësen direkt Linken op observéieren, wéi de molekulare Passerelle Netz an eiser Etude engem méigleche Lien tëscht gastric Kriibs an anandamide Aktioun suggeréiert. Vun Daten an dësem Kontext analyséiert, dèi mir Molekülle an d'Mechanismen tëscht jiddwereen stinn Sujeten an hire Krankheete Wichtegkeet a Bedeitung. Dofir, Swanson senger Literatur-baséiert Entdeckung ass eng efficace Outil verbonne bestehend Wëssen aus empiresche Resultater ze sichen déi zum Virschäin Relatiounen bruecht, datt a nach "vernoléissegt" (Marc Weeber, 2001). VerfÜgung

    agebonne sinn mir och begéint puer Erausfuerderunge vun der Entdeckung Prozess. Ee Problem ass mat der Mesh Begrëffer, selwer, an de zousätzleche visuellen Inspektioun néideg war folgenden Extraktioun eiser Produktioun Java Miniprogramm benotzt. An der Open Entdeckung Prozess, si mir dacks knapp Ofkierzungen ze erkennen, dass verschidde Wierder bedeiten kann, an mir ignoréiert se also trotz hirem Potential Wichtegkeet. Zousätzlech gesammelt puer vun de Begrëffer huet Weibëschof Wierder, an Redundanz doraus. Desweideren, goufen et Momenter wou synonyms Ufank getrennt, well hir Schreifweis gezielt huet, an dës duplications hat manuell geléist ze ginn. Trotz dëse Problemer, Kaddoen de Literatur-baséiert Entdeckung Methodik Erhéijung kloer e Virdeel am Prozess vun neie Relatiounen aus verschiddenste Beräicher vun der Fuerschung entdecken. VerfÜgung

    Swanson ursprénglech de Literatur-baséiert Methodik Entdeckung entwéckelt a gouf Ausschaffen dësem Prozess fir 30 Joer mat dem Zil vun hëllefen Enquêteuren onbekannt oder onidentifizéierte Relatiounen tëscht Studien entdecken; engem Problem, datt bis elo nach ganz wéineg verstan huet. Anhand Discovery Methodologie, hunn mir e Potential Interaktioun tëscht anandamide an gastric Kriibs, deen déif an de grousse Quantitéiten vu sinn Donnéeën begruewe gouf, an déi elo schonn vun trotzdeem zouverlässeg confirméiert.

  • Other Languages