Stomach Health > magen Helse >  > Q and A > magen spørsmålet

UChicago genomics -forsker vinner NIH Directors New Innovator Award

Oni Basu, PhD, en assisterende professor i genetisk medisin ved University of Chicago, har mottatt den prestisjetunge National Institutes of Health (NIH) Director's New Innovator Award.

Disse prisene, del av NIHs høyrisiko, High-Reward Research Program, er gitt til eksepsjonelt kreative forskere som foreslår høyrisiko, forskning med stor innvirkning på alle karrierestadier. The New Innovator Award, finansiert gjennom NIH Common Fund, er fokusert på å støtte forskere i tidlig karriere, støtte uvanlig nyskapende forskning fra etterforskere fra tidlig karriere som er innen 10 år etter at de har fullført sin siste grad. I år, 53 forskere ble anerkjent med prisen.

Bredden av innovativ vitenskap som 2020 -årskullet med tidlige karriere og erfarne etterforskere la frem, er imponerende og inspirerende. Jeg er overbevist om at arbeidet deres vil drive biomedisinsk og atferdsforskning og føre til forbedringer i menneskers helse. "

Francis S. Collins, M.D., Ph.D., NIH -direktør

Siden ankomsten til UChicago i 2016, Basu har jobbet med en rekke forskningsprosjekter. Hun undersøker komplekse biologiske systemer ved hjelp av encellede genomics - isolering av individuelle celler og sekvensering av deres genetiske informasjon for å få et bedre bilde av cellulære forskjeller i en vevsprøve. Dette, i sin tur, gir innsikt i de unike undertyper av celler og deres funksjoner i et gitt vev.

Basu utdannet seg i laboratoriene til Aviv Regev, PhD, og David Weitz, PhD, begge pionerene innen enkeltcellet genomikk og mikrofluidikk. Basu er selv en medoppfinner av de første høy-gjennomstrømning encellede og én-kjerne RNA-seq-teknologiene som muliggjorde deres omfattende adopsjon over hele verden.

Basu-forskningslaboratoriet utvikler og bruker ny teknologi for å gjennomføre encellet epigenomisk og transkriptomisk profilering med høy gjennomstrømning på opptil 100, 000 celler om gangen. Med denne tilnærmingen, teamet hennes jobber med å analysere og klassifisere unike celletyper i en rekke vev, inkludert musens og menneskelige hjerner og mikrobielle cellepopulasjoner.

Forskningen hennes bidrar også til Human Cell Atlas, et globalt prosjekt som involverer genomics-eksperter rundt om i verden som tar sikte på å lage et komplett atlas over alle celletyper i menneskekroppen både i helse og sykdom. Hun jobber med å identifisere og karakterisere celletyper i den menneskelige tarmen for å etablere et cellulært atlas i ileum - endedelen av tynntarmen. Bruk av tarmbiopsiprøver fra pasienter med og uten Crohns sykdom, hun søker å bedre forstå celletype og sykdomsspesifikke uttrykksmønstre knyttet til den svekkende tilstanden.

Med støtte fra New Innovator Award, Basu planlegger å skyve denne encellede teknologien til den mikrobielle verden. Mangfoldet av unike celletyper i flercellede organismer som mennesker har drevet behovet for å studere genomet på enkeltcellet nivå; et lignende mangfold kan også forventes i mikrobielle samfunn. Bedre forståelse av denne heterogeniteten vil hjelpe til med å svare på spørsmål om kompliserte emner som evolusjonær kondisjon og antimikrobiell resistens.

Det er fortsatt utfordrende å produsere verktøy som er i stand til å undersøke forskjellene mellom mikrobielle celler ved encellede oppløsninger. Basu og teamet hennes jobber med å utvikle mikrofluidiske og genomiske verktøy som vil gjøre det mulig for forskere å tyde de komplekse interaksjonene mellom mikrobielle populasjoner, vert-patogen-interaksjon og mikrobiomet.

Høy risiko, High-Reward Research Program katalyserer vitenskapelig oppdagelse ved å støtte forskningsforslag som, på grunn av deres iboende risiko, kan slite i den tradisjonelle fagfellevurderingsprosessen til tross for deres transformative potensial. Programsøkere oppfordres til å tenke "utenfor boksen" og til å forfølge banebrytende ideer innen alle forskningsområder som er relevante for NIHs oppgave å fremme kunnskap og forbedre helse.