Stomach Health > Желудок Здоровье >  > Gastric Cancer > Рак желудка

PLoS ONE: Новый полиморфизм биомаркеров rs629367 ассоциируется с повышенным риском и бедных выживание рака желудка в китайском повышающей регуляции микроРНК-пусть-7а Expression

Абстрактный

Фон
<р> Вариант в ПОИ -miRNA может влиять на экспрессию микроРНК и зрелый процесс или эффективность сплайсинга, изменяя таким образом наследственную предрасположенность и прогноз рака. Нашей целью было оценить микроРНК-LET-7 одиночных нуклеотидных полиморфизмов (SNP), связанные с риском и прогноза рака желудка (GC), как предсказывают биомаркеров, и, кроме того, его возможные механизмы.

Методы
<р> исследование случай-контроль двухступенчатая был разработан для скрининга четыре микроРНК ОНП (ИРП-пусть-7а-2 rs629367 и rs1143770, ИРП-пусть-7а-1 rs10739971, ИРП-пусть-7F-2 rs17276588) в 107 больных GC , 107 атрофический гастрит (АГ), и соответствует 124 управления с помощью ПЦР-ПДРФ. Два перспективных ОНП были подтверждены в другом независимом 1949 образцов (в том числе 579 больных раком желудка, атрофический гастрит 649 и 721 управления) с использованием платформы Sequenom MassARRAY и последовательности.

Результаты
<р> Мы обнаружили, что при-пусть -7a-2 rs629367 CC вариант генотип был связан с повышенным риском развития рака желудка и атрофический гастрит на 1,83 раза и 1,86 раза, соответственно. Для желудка прогноза рака, у пациентов с rs629367 CC генотипом имели значительно более низкий уровень выживания, чем у пациентов с генотипом АА (лог-ранговый P
= 0,004). Кроме того, мы исследовали уровни экспрессии LET-7а в сыворотке крови и обнаружили, что выражение пусть-7а повышен постепенно для rs629367 AA, CA, CC генотипом в группе атрофический гастрит ( P
= 0,043). Кроме того, мы подтвердили эти данные в пробирке исследования с помощью гиперэкспрессией Let-7a проведение Pri-пусть-7а-2 дикого типа А или С аллель полиморфный типа ( P
&лт; 0,001).

Выводы
<р> ИРП-пусть-7а-2 rs629367 CC генотип может увеличить риск развития рака желудка, а также атрофический гастрит и был также связан с плохой выживаемостью рака желудка, который, возможно, воздействуя на зрелую LET-7а выражение, и может служить в качестве прогнозирующего биомаркером высокого риска и плохого прогноза рака желудка
<р> Образец цитирования:. Сюй Q, Q Dong, он C, Лю W, L ВС, Лю Дж, и др. (2014) Новый полиморфизм биомаркеров rs629367 ассоциируется с повышенным риском и бедных выживания рака желудка по-китайски повышающей регуляции микроРНК-пусть-7а Expression. PLoS ONE 9 (4): e95249. DOI: 10.1371 /journal.pone.0095249
<р> Редактор: Цин-Yi Вэй, герцог институт рака, Соединенные Штаты Америки
<р> Поступило: 26 января, 2014 года; Принято: 24 марта 2014; Опубликовано: 23 апреля 2014
<р> Copyright: © 2014 Xu и др. Это статья с открытым доступом распространяется в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution, которая позволяет неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе, при условии, что оригинальный автор и источник кредитуются

Финансирование:. Эта работа не поддерживается за счет субсидий из программы фундаментальных исследований ключевых национальных Китая (973 Программа исх нет. 2010CB529304), Национальный фонд естественных наук Китая (ссылка N 31200968), а также научно-технических проектов технологии в провинции Ляонин (ссылка N 2011225002) , Доноры не играет никакой роли в дизайн исследования, сбора и анализа данных, решение о публикации или подготовки рукописи
<р> Конкурирующие интересы:.. Авторы заявили, что не существует никаких конкурирующих интересов

Введение
<р> MicroRNAs (микроРНК) являются 18-25 лет нуклеотид (нуклеотиды) -длинный, одноцепочечной РНК некодирующей [1]. Любое изменение в Pri-микроРНК, предварительно микроРНК или зрелой микроРНК могут повлиять на зрелый процесс и функции микроРНК, которые могут в дальнейшем влиять на экспрессию сотен белков в пути взаимодействия [2]. В какой-то степени, вариант микроРНК сыграли свою роль в качестве "онкоген" или "опухолевого гена-супрессора" косвенно [3].
<Р> пусть-7 является второй идентифицированный микроРНК после открытия первого микроРНК, LIN -4 [4] - [6]. Выпускаемое-7 семья имеет 10 членов, включая пусть-7а-7g пусть, пусть-7i, MIR-98 и MIR-202. Выпускаемое-7 семья играет решающую роль в поддержании нормального физиологические функции человека. Например, ИРП-микроРНК выпускаемой-7 семейства может сочетать с Lin28 и подавлять процедуру сплайсинга Drosha и Dicer, два важных ферментов рестрикции с участием в зрелом процесса для всех микроРНК [7]. Кроме того, сбивая фермент Drosha, чтобы подавить все зрелый процесс микроРНК всесторонне, Кумар в Аль обнаружил, что основной причиной для активизации и продвижения злокачественной трансформации клетки была понижающая регуляция экспрессии пусть-7 семейства [8]. Хотя многие предыдущие исследования способствовали широко, чтобы проиллюстрировать биологические функции LET-7 семьи, немногие исследования были сосредоточены на генетических вариаций членов семьи. На самом деле, если два человека были выбраны случайным образом, их геномы могут демонстрировать около 0,1% разнообразие, из которых наиболее распространенным разнообразие было ОНП [9]. Из-за существования этих различий, тот же ген может привести к различным продуктам экспрессии генов, которые могут привести к различной восприимчивости заболевания, наследственной фенотипа и прогноза заболевания [10].
<Р> Предыдущие исследования показали, что ИРП-микроРНК ОНП могут быть использованы в качестве генетических маркеров для прогнозирования риска развития рака. Например, ИРП-микроРНК-185 rs2008591 был связан с риском развития рака молочной железы [11]; ИРП-Mir-34B /C rs4938723 был связан с риском гепатоцеллюлярной рака [12]. В настоящем исследовании, с использованием данных баз данных биоинформатики NCBI, мы провели скрининг всех ОНП в основной зоне предшественника LET-7 семейства (± 600 б.п.), и обнаружили, что только 4 SNPs (ИРП-пусть-7а-1 rs10739971, ча -Давай-7а-2 rs629367 и rs1143770, ИРП-пусть-7F-2 rs17276588) имели минорного аллеля Частота (МАФ) > 5% населения Китая, и все они были tagSNPs в HapMap базе данных. До сих пор мало исследований, которые упомянули о взаимосвязи между четырьмя tagSNPs и прогнозирования заболевания риска для шизофрении [13], немелкоклеточного рака легкого [14] и диабетической нефропатией [15], за исключением. Их потенциальная роль в прогнозировании риска развития рака остается в значительной степени неизвестны
<р> Рак желудка является второй ведущей причиной смерти от рака во всем мире и один из наиболее частых видов рака в Восточной Азии и Китая населения [16] - [18].. Исследования показали, что некоторые микроРНК ОНП были связаны с риском развития рака желудка [19] - [22]. Тем не менее, является ли вышеупомянутая четыре tagSNPs в Pri-микроРНК генов давайте-7 были связаны с риском развития рака желудка и атрофический гастрит в китайской популяции, может ли он быть использован в качестве прогностического генетического биомаркера для рака желудка, а также конкретные механизм, как они регулируют риск заболевания, по-прежнему нуждаются в уточнении.
<р> в этом исследовании мы впервые оценили связь между этими четырьмя кандидатами в tagSNPs Pri-LET-7а и восприимчивости рака желудка и его предшественника путем проведения исследование случай-контроль двухступенчатая на китайском языке. В то же время, мы исследовали, влияет ли риск-связанный полиморфизм на выживание больных раком желудка. Кроме того, мы исследовали влияние риска ассоциированного полиморфизма по регулированию своей зрелой экспрессии микроРНК в сыворотке крови и желудочной ткани, а также изучить его возможный механизм регулирования в модуляции риск заболевания и выживаемость. Проводя настоящего исследования, мы надеемся предложить приложение потенциальную перспективу изучаемого SNP в качестве предварительного предупреждения биомаркером для лиц с высоким риском развития рака желудка и его предраковые заболевания (атрофический гастрит).

методы

Пациенты и дизайн исследования
<р> Этот исследовательский проект был одобрен Комитетом по этике первой филиал больницы Китайского медицинского университета им и исследование было разделено на три независимых, но взаимосвязанных частей, включая риск, прогноз и механизмы исследований , Часть риска было два этапа, разработанные, один заслон этап, а другой проверяется этап. Для выяснения связи кандидатов полиморфизмов с раком желудка и атрофических рисков гастрит, этап скрининга ретроспективно набранных образцов в том числе 338 случаев, состоящий из 107 больных раком желудка, 107 атрофических случаев гастрит и 124 контрольных группах из Первой филиал больницы Китайского медицинского университета между 2005 и 2010. в проверенного этапе мы исследовали в общей сложности 1949 случаев заболевания, включая рак желудка 579, 649 атрофический гастрит и 721 здоровых лиц из проверки здоровья программы скрининга рака желудка в Zhuanghe провинции Ляонин, Китай или от пациентов в Первый филиал больницы Китайского медицинского университета, между 2002 и 2013 г. Все субъекты в этом исследовании были эндоскопически и гистологически подтверждены. Классификация рака желудка была разделена на кишечную типа и диффузного типа для анализа подгрупп которая была основана на классификации Лорен [23], [24]. Классификация и классификация гастрита была основана на обновленном Сиднейской системе [25], [26]. Субъекты, которые были эндоскопически и гистологически подтвержденные нормальной слизистой или только минимальной гастрита без других системных заболеваний или других заболеваний желудка служили в качестве контроля. Письменное информированное согласие были собраны от пациентов, а также истории болезни (в том числе возраст, пол, курение и употребление алкоголя), полученные анкеты и записи были компьютеризированные, как предыдущая описано [24].
<Р> Для дальнейшего исследования ассоциации от риска, связанный с полиморфизмом клиникопатологическими параметрами и выживания в больных раком желудка, мы использовали данные 150 случаев рака желудка, чья информация о смерти или выживания была доступна. Опухоль гистологическое оценка оценивали по Всемирной критериям организации здравоохранения и опухоли были организованы с использованием 7-е издание TNM постановка системы Международного союза против рака (UICC) /Американский Объединенный комитет по вопросам рака (AJCC) (2010) на основе послеоперационной патологической экспертизы , Пациенты (I) с отдаленными метастазами найдены дооперационно, (II), которые подверглись предоперационной лучевой терапии или химиотерапии, или (III) с неполным патологическими записи данных были исключены из анализа выживаемости. Последующая была завершена в августе 2013 г. И, наконец, 150 пациентов были включены в анализ выживаемости.
<Р> Для оценки корреляции между риском ассоциированного полиморфизма и его экспрессии микроРНК в сыворотке крови, 364 случаев, в том числе 164 рака желудка, 100 атрофический гастрит и 100 здоровых лиц были рассмотрены. Характеристики включенных испытуемых были приведены в дополнительном таблице S1. Кроме того, для оценки корреляции между риском ассоциированного полиморфизма и его экспрессии микроРНК в желудочном ткани, 97 не-canceous образцов и 94 желудочные раковые образцы были получены из 97 пациентов, перенесших гастрэктомию на Первой Affilicated больницы Китайского медицинского университета в период с 2009 и 2013 г.

субъекта генотипирование
<р> геномную ДНК экстрагировали, как описано выше, с некоторыми изменениями [27]. Анализ генотипирование проводили CapitalBio (Пекин, Китай) с использованием платформы Sequenom MassARRAY (Sequenom, Сан-Диего, Калифорния, США), как описано ранее [24]. 5% от всего объема образцов неоднократно генотипирование, а скорость конкордантность составила 100%, что свидетельствует о том, что генотипирование было правильным. Подробные материалы были показаны в Методике Дополнительными.

Обнаружение в сыворотке H.pylori IgG-титр

В соответствии с методом, описанным в литературе [28], в сыворотке крови <ЕМ> Н. Pylori
-IgG титр был обнаружен иммуноферментный анализ (ИФА, хеликобактер пилори IgG; комплект Biohit, Хельсинки, Финляндия). Подробные материалы были показаны на дополнительные методы.

Выделение РНК и в режиме реального времени реакции ПЦР для экспрессии микроРНК естественных условиях
<р> был использован Извлеченный метод микроРНК из сыворотки и ткани, обозначенная литература [29] с некоторыми изменениями. Реакцию обратной транскрипции использовали один шаг Prime Script микроРНК кДНК (Perfect Real Time) Kit (Takara Biotechnology Co., Ltd, Далянь, Китай) и в режиме реального времени реакции ПЦР использовали набор обнаружения miRcute микроРНК КПЦР (SYBR) (TIANGEN Biotech Co ., Ltd, Пекин, Китай). Подробные материалы были показаны на дополнительные методы.

Переходная трансфекция и в режиме реального времени реакции ПЦР для экспрессии микроРНК в пробирке
<р> плазмидной коммерческая выражение PCMV-MIR-пусть-7а-2 rs629367- C был приобретен у компании Origene (Origene Biotech Co., Ltd, Шанхай, Китай). Эту плазмиду проводили сайт-специфического мутагенеза при -216 от С до А (PCMV-пусть-7а-2 rs629367-А) Sainuo Company (Sainuo Biotech Co., Ltd, Пекин, Китай) и подтверждены с помощью секвенирования. И линии клеток-кандидаты были секвенированы к генотипу ИРП-пусть-7а-2 rs629367 сайт, чтобы исследовать, есть ли какой-нибудь вариант этого rs629367 полиморфизма сайта. Затем клеточные линии дикого типа, а также самый низкий два выражения пусть-7а, SGC-7901 и AGS, были выбраны для трансфекции (Подробнее см и дополнительные методы Дополнительный рисунок S2). Желудка человека клеточная линия карциномы, AGS был приобретен у АТСС, American Type Culture Collection, США и SGC-7901 был приобретен у банка клеток Китайской академии наук, Шанхай, Китай. Через 72 часа, экстрагируют тотальную РНК из клеток и ПЦР в реальном времени использовали для обнаруженного выражения LET-7а после того, как обратной транскрипции, чтобы сравнить зрелую LET-7а произведенный PCMV-пусть-7а-2 rs629367-A vs. PCMV-пусть-7а-2 rs629367-C.

Статистика
<р> изученные четыре микроРНК полиморфизмы были протестированы на Харди-Вайнберга (HWE) между контрольной группой. Непрерывные переменные были показаны в виде среднего значения ± стандартное отклонение (SD) и по сравнению с помощью дисперсионного анализа, в то время как дискретные переменные были представлены в виде частот и процентах, а по сравнению с тестом х2 [24]. Многомерная логистической регрессии с поправкой на возраст, пол и H. Pylori
инфекция была использована для оценки связи между микроРНК полиморфизмов и рисков заболеваний. Потому что курение и потребление алкоголя было почти треть недостающие данные не были пригодны в качестве поправочных коэффициентов, только в качестве стратифицированных факторов для анализа ассоциации между полиморфизмом микроРНК и рисков заболеваний. Одномерный и многомерный анализ выживаемости проводили с помощью теста лог-ранга и модели пропорциональных рисков Кокса. Кривые выживаемости были нанесены на карту с помощью метода Каплана-Мейера. Многофакторный анализ выживаемости проводили путем добавления SNP ко всем параметрам с клинико-патологическими P
&л; 0,05. Кроме того, копии микроРНК были использованы значения Lg для нормального распределения, а также влияние микроРНК полиморфизмов на его уровни экспрессии были протестированы с помощью дисперсионного анализа (ANOVA) испытания. Корреляция экспрессии LET-7а в сыворотке крови и ткани было показано, как коэффициент корреляции с помощью корреляционного анализа. Статистический анализ проводился с использованием SPSS версии 16.0 программного обеспечения (SPSS, Чикаго, Иллинойс, США) и на этапе скрининга, величины р &ЛТ; 0,10 считается значительным, а все остальные анализы были рассмотрены значения р &лт;. 0,05 как значимые

Результаты

Основной эффект микроРНК полиморфизма на рак желудка и атрофический гастрит риска
<р> генотип частоты исследуемого SNP на стадии скрининга были представлены в таблице 1 и электрофореграмма и секвенирование фигура эти четыре микроРНК полиморфизмы генотипы были показаны в дополнительном рисунке S1. ИРП-пусть-7F-2 rs17276588 был исключен из дальнейшего анализа, поскольку она отклонилась от HWE. Два ОНП считались многообещающе быть связаны с риском заболевания: вариант частоты генотипов Pri-LET-7а-1 rs10739971 между атрофический гастрит и контрольной группы показали статистически достоверное отличие (27,1% против 13,7%, P =
0,018, таблица 1), а также вариант генотипа частоты ИРП-пусть-7а-2 rs629367 между раком желудка и контрольной группы также показали, разница (1,9% vs.6.5%, P
= 0,094, таблица 1) , Мы рассмотрели значение р &л; 0,10 в качестве значимой и выбран этот два перспективных участков SNP в текущем проверенного этапе
<р> Чтобы подтвердить ассоциацию Pri-LET-7а-1 rs10739971 и Pri-пусть-7а-2 rs629367 полиморфизмов. с раком желудка и /или атрофических гастритах рисков, мы вновь оценивали эти два ОНП в другом 1949 случаев в расширенном составе утвержденной стадии. Частоты полиморфизмов во всех образцах были показаны в таблице Дополнительной S2. Здоровые управления были согласованы с частотой рака желудка и атрофических случаев гастрита по возрасту (± 5 лет) и пола (1:1). После согласования частоты, только 501 рак желудка и 501 управления для анализа желудочного риска рака и 612 атрофический гастрит и 612 управления для анализа атрофический гастрит риска были окончательно включены. В расширенном составе одобренного стадии, вариант частоты генотипов Pri-LET-7а-2 rs629367 между раком желудка и контрольной группы были статистически различными (6,4% против 4,0%, таблица 1). По сравнению с общим генотипом АА, вариант CC генотип был связан с 1,83-кратным увеличением риска развития рака желудка ( P
= 0,048, 95% ДИ = 1.01-3.32, таблица 1), а также связано с 1,86-кратным увеличением риска атрофического гастрита ( P
= 0,032, 95% ДИ = 1.06-3.28, таблица 1). Кроме того, вариант CC генотип был связан с 1,93-кратным увеличением риска атрофического гастрита по сравнению с генотипами (AC АА +) ( P
= 0,021, 95% ДИ = 1.11-3.36, таблица 1) , Тем не менее, мы не наблюдали статистически значимую связь между Pri-пусть-7а-1 rs10739971 и болезненных рисков в одобренную стадии.

Стратифицированная анализ и анализ Интерактивного
<р> Для дальнейшего исследования потенциального влияния от возраста, пола и экологических факторов, как статус h.pylori
инфекция, курение и потребление алкоголя на генетический эффект, мы провели анализ стратифицированной для Pri-пусть-7а-1 rs10739971 и ИРП-пусть-7а-2 rs629367 полиморфизмы на основе этих факторов (таблица 2). Мы наблюдали различные эффекты Pri-LET-7A-2 rs629367 на риск заболевания в разных подгруппах. Статистическая связь между генотипом CC и повышенным риском атрофический гастрит были обнаружены у женщин ( P
= 0.025, или [95% ДИ] = 2.59 [1.13-5.92]) H. Pylori
серологические-отрицательной подгруппы ( P
= 0,036, или [95% ДИ] = 1,97 [1.05-3.73]), а также в непьющих подгруппе ( P = 0,023
ИЛИ [95% ДИ] = 2,44 [1.13-5.26]). Кроме того, CC генотип было установлено, что связано с повышенным риском развития рака желудка у больных с возрастом ≦ 50 лет ( P
= 0,026, OR [95% ДИ] = 6,02 [1.24-29.10]) и H. Pylori
серологические-отрицательных субпопуляции ( P
= 0,036, OR [95% ДИ] = 2,02 [1.05-3.90]). Однако, когда мы провели анализ взаимодействия между rs629367 SNP и H. Pylori
инфекции, курение и употребление алкоголя, никакого статистического эффекта взаимодействия обнаружено не было ( P
<суб> взаимодействие = 0,786 и 0,382 соответственно, смотрите дополнительную таблицу S3). Ни одна значимая связь не была обнаружена между ИРП-пусть-7а-1 rs10739971 и рака желудка или атрофических гастритах риски в любом стратифицированном анализе.

Корреляция между ИРП-пусть-7а-2 rs629367 полиморфизм и клиникопатологическими параметры и продолжительность выживания из больных раком желудка
<р> из-за наблюдения статистически значимой связи между rs629367 и раком желудка и атрофический гастрит риска в основной эффект анализирует и многослойный анализ, мы дополнительно исследовали, коррелирует ли риск-ассоциированный rs629367 с клиникопатологическими фенотипа и прогностическое выживание рака желудка. Результаты показали, что значительной корреляции этого SNP не было найдено с клинико-патологическими параметрами, включая размер опухоли, локализации опухоли, типа борманновской, гистологический тип, тип Lauren, TNM стадии, характер роста, глубина инвазии, лимфатический метастаз, H.pylori
статус инфекции, курение, алкоголь, и история семьи ( P &
GТ; 0,05, смотрите дополнительную таблицу S4), но этот SNP был найден связанный с желудочным выживания рака. Генотип носители CC показали неблагоприятное выживание (CC против АА: 22,2 месяцев против 32,0 месяцев) и увеличение ГКР для больных раком желудка в однофакторного анализа (CC vs. AA: P
= 0,011, HR [95% CI] = 3,39 [1.33-8.65]; CC vs. AA + AC: P
= 0,005, HR [95% ДИ] = 3,51 [1.45-8.49]; Таблица 3 и Рисунок 1-A и - Б). Регулируя нескольких параметров клинико-патологическими, которые являются потенциальными вмешивающиеся факторы коррелировали с желудочным выживания рака ( P
≤0.0001 для размера опухоли, типа Бормана, TNM стадии, глубина инвазии и лимфатического метастазирования, смотрите дополнительную таблицу S5), статистически увеличение HRs были получены и для CC носителей в многомерном анализе (CC vs. AA: P
= 0,004, HR [95% ДИ] = 4,48 [1.60-12.60]; CC vs. AA + AC: P
= 0,001, HR [95% ДИ] = 4,69 [1.84-11.95], таблица 3).

Корреляция между rs629367 и созревают пусть-7а выражение в сыворотке крови и ткани желудка
<р> для изучения возможного механизма rs629367 полиморфизма, связанного с раком желудка, мы дополнительно исследовали зрелое выражение пусть-7а в естественных условиях и лабораторных условиях. Характеристики пациентов, отобранных для исследования экспрессии в сыворотке крови и ткани были показаны в таблице Дополнительной S6. В сыворотке крови, расслаивается различными заболеваниями, мы обнаружили, что в атрофический гастрит группе, зрелое выражение LET-7а rs629367 AA, CA, CC генотип показал тенденцию к постепенному увеличению, и это различие было статистически значимым (3,30 ± 0,56 Vs . 3,52 ± 0,55 3,76 ± Vs. 0,34, P
= 0,043, таблица 4, рисунок 2-А). В тканевом уровне, мы проанализировали влияние на выпускаемую-7A SNP генотипов на его зрелого выражения пусть-7а в желудочном ткани рака, и обнаружили rs629367 AA, CA, CC генотип также показал тенденцию к постепенному увеличению, хотя эта разница не достигла статистической значение (таблица 4).

зрелый выражение пусть-7а PCMV-MIR-ИРП-пусть-7а-2 rs629367-A и -C
<р> Во-первых, линии клеток-кандидаты были секвенированы генотипу ИРП-пусть-7а-2 rs629367 сайт и обнаружили, что эти клеточные линии кандидатов были все rs629367 дикого типа (см Дополнительный рисунок S3). В пробирке уровне, SGC-7901 и линии AGS клеток transinfected в двух плазмид, PCMV-MIR-ИРП-пусть-7а-2 rs629367-A и PCMV-MIR-ИРП-пусть-7а-2 rs629367-C. Через 72 часа, пожилые пусть-7а выражение имело статистической значимости в линии SGC-7901 клеток ( P
&л; 0,001, рис, 2-Б). Вариант C аллель выразил высокую LET-7а по сравнению с древней аллеля. Клеточная линия AGS не получил статистической значимости и показал тенденцию в соответствии с SGC-7901 (см Дополнительный рисунок S4).

Обсуждение
<р> На основе различных исследований, касающихся зрелых функций микроРНК [30], он был хорошо принят, что микроРНК играют важную роль в развитии рака, как "онкоген" или "опухолевого гена-супрессора" [31]. Тем не менее, отношения между вариантами микроРНК и риском развития рака, а также прогноз по-прежнему нуждается в уточнении [32]. В настоящем исследовании мы сообщали, в первый раз, частоты распределения четырех микроРНК tagSNPs (ИРП-пусть-7а-1 rs10739971, ИРП-пусть-7а-2 rs629367 и rs1143770, ИРП-LET-7F-2 rs17276588) в Северном китайском. Мы также проверил достоверность перспективных участков полиморфизма в независимой и расширили образцы и нашли вариант CC генотип Pri-LET-7а-2 rs629367 повысили риск развития рака желудка и атрофический гастрит до 1,83 и 1,86 раза, а также связанные с плохой выживаемостью от больных раком желудка. Кроме того, мы исследовали влияние Pri-пусть-7а-2 rs629367 по его выражению, и возможные механизмы, и указал, что механизм может в связи с чередованием зрелого выражения LET-7а, который в конечном итоге может привести к изменению восприимчивости и прогноз для желудка рак. Насколько нам известно, это первый доклад о соотношении rs629367 SNP с восприимчивостью и прогноза рака желудка.
<Р> Как мы знаем, генетические вариации, которые возникают в генах микроРНК, включая их част- и пре-микроРНК регионах , будет иметь возможность влиять на несколько биологических путей и частоту влияния заболевания [33]. Таким образом, и полиморфизм В пер- предварительно микроРНК могут быть использованы в качестве генетических маркеров для прогнозирования риска развития рака [32], [34], которые имеют более значительные преимущества и сильные, чем кодирование полиморфизмы генов на прогнозированием потенциала, потому что микроРНК часто находится в рака-ассоциированной геномики регионы [35] и может регулировать практически все гены, кодирующие [36]. В последнее время различные исследования сосредоточены на полиморфизмов предварительно микроРНК, расположенных на стебле контуре, таких как предварительно Mir-196a2 rs11614913 [37], предварительно Mir-146a rs2910164 [38], предварительно Mir-499 rs3746444 [39], [40], предварительно Mir-149 rs2292832 [41], предварительно Mir-27а rs895819 [42]. Из-за сложности РНК пространственной структуры, все большее внимание уделялось SNP на Pri-микроРНК. Представитель ИРП-микроРНК ОНП были ИРП-микроРНК-185 rs2008591, связанная с раком молочной железы [11], Pri-MIR-34b /с rs4938723, связанной с гепатоцеллюлярной рака [12], ИРП-Mir-30C rs928508 [22] и Pri-MIR -938 rs2505901 [43], связанные с раком желудка. пусть-7 семей были наиболее предыдущие были определены микроРНК [4] и играют важную роль в поддержании нормального физиологические функции человека. При использовании NCBI баз данных биоинформатики, мы нашли 4 ОНП в основной зоне предшественника давайте-7 семей (ИРП-пусть-7а-1 rs10739971, ИРП-пусть-7а-2 rs629367 и rs1143770, ИРП-пусть-7F-2 rs17276588) был минорного аллеля Частота (МАФ) > 5% населения Китая, что были все tagSNPs, но их потенциальные роли предсказании были неясны. В настоящем исследовании, путем скрининга и подтверждения двух этапов исследования мы впервые обнаружили, что среди 4 tagSNPs, ИРП-пусть-7а-2 rs629367 полиморфизм был связан с восприимчивостью рака желудка (вариант CC генотипе Pri-пусть-7а-2 rs629367 повысили риск развития рака желудка и атрофический гастрит до 1,83 и 1,86 раза). Это ИРП-пусть-7а-2 rs629367 SNP был расположен в нижнем 3'-UTR, который был ближайшим SNP с зрелых генов микроРНК среди четырех сортировочных ОНП, и это было бы новым биомаркером при прогнозировании риска развития рака желудка.

Кроме того, мы проводили одномерных и многомерных Кокса регрессионный анализ последующих данных для изучения ассоциации Pri-LET-7а-2 rs629367 SNP с общей выживаемости больных раком желудка. Последовательно значительные результаты наблюдались от одномерных и многомерных моделей Кокса (таблица 3). ИРП-пусть-7а-2 rs629367 вариант CC носителей генотипа показали увеличение ЧСС с P
-value 0,011 (HR = 3,39) и 0,005 (HR = 3,51) по сравнению с AA дикого типа и А.А. + AC генотип, соответственно, в одномерном анализе. Поскольку несколько параметров клинико-патологических значительный вклад в общую выживаемость рака желудка ( P
≤0.0001 для размера опухоли, типа Бормана, TNM стадии, глубина инвазии и лимфатического метастазирования), мы провели анализ с поправкой на тех потенциальных искажающих факторов в многомерный анализ. В конце концов, мы обнаружили, что P
-value этого rs629367 SNP было более значительным и статистические ОР были также повышены (CC vs. AA: P
= 0,004, HR = 4,48; CC vs. AA + AC: P
= 0,001, HR = 4,69, соответственно), предполагая, что при-пусть-7а-2 rs628367 может быть независимым фактором риска развития рака желудка прогноза

Несколько исследований. показали, что микроРНК полиморфизмы ухудшают обработку микроРНК и экспрессию зрелых микроРНК и играют роль в канцерогенезе [12], [33]. Для изучения возможного механизма rs629367 полиморфизма, связанного с раком желудка, в данном исследовании мы изучали влияние ИРП-пусть-7а SNP на зрелого выражения LET-7а, как в естественных условиях и лабораторных условиях. Контроль за фактора заболевания, мы обнаружили в сыворотке крови атрофический гастрит группы, зрелый выражение пусть-7а rs629367 AA, CA, CC генотип показал значительное постепенно увеличивать ( P
= 0,043, таблица 3). Это может частично объяснить феномен, что вариант CC генотип rs629367 имели более высокую частоту распределения в атрофический гастрит группе, чем в контрольной группе (6,2% против 3,9%, таблица 1). Отношение rs629367 CC генотипа с повышенным риском атрофический гастрит показал, что этот SNP связан с атрофический гастрит и даже рак желудка, возможно чередование экспрессии зрелого микроРНК, что, таким образом, влияет на восприимчивость к раку желудка. На основании уровня экспрессии в естественных условиях, мы также построили выраженную плазмиду, содержащую ИРП-LET-7a-2 rs629367 дикого типа аллель А и вариант С аллель с целью наблюдения за зрелую выражение пусть-7а двух различных аллеля. Мы обнаружили, что после того, как transinfection, SGC-7901 клетки, содержащие PCMV-MIR-ИРП-пусть-7а-2 rs629367-C аллель продемонстрировали более зрелые выражение пусть-7а, чем у аллеля ( P
&л; 0,001, Рисунок 1). Результат, полученный из экстракорпорального эксперимента созвучны с тем из естественных условиях, которые также показывают, что при-пусть-7а-2 rs629367 полиморфизм может влиять на экспрессию зрелого пусть-7А и изменяют восприимчивость к раку желудка. Несколько исследований сообщили, что пусть-7а-супрессоры [44], [45]. Мы предположили, что отклонение от А до С может Потеря свою первоначальную функцию опухоли, подавлении, которые могли бы изменить желудка восприимчивость рака и приводит к плохой выживаемости для прогноза.
<Р> Рак желудка является многофакторным заболевание, вызываемое генетической предрасположенности а также факторы окружающей среды [46]. Для того, чтобы исследовать потенциальное влияние возраста, пола и экологических факторов, как статус h.pylori
инфекции, курение и алкоголь пить на генетический эффект, мы также проанализировали влияние возможных факторов влияния на эту Pri-пусть-7а -2 rs629367 SNP, и обнаружили, ИРП-пусть-7а-2 rs629367 был связан только с риском заболеваний в H. пилори
серологические-отрицательных пациентов группы и непьющих группы. В H. Pylori
серологические-отрицательных пациентов, ОШ для ассоциации rs629367 SNP и атрофический гастрит и желудка риск развития рака повышенной быть 2,12 и 1,97 раза, что выше, чем в ОШ целых случаях (1,83 и 1,86 раза, соответственно) , Тем не менее, не было никакой статистической значимости в H. Pylori
серологические-положительных пациентов. Кроме того, это явление также наблюдается в стратифицированной анализа при питье: в непьющих группе, ИЛИ для объединения rs629367 SNP и атрофический гастрит риска повышенной быть 2,39 раза, в то время не было никакой статистической значимости в питьевой группе. Это может быть потому, что H.pylori
и питье были связаны с частотой развития рака желудка. Бреннер и др. было высказано предположение, что H.pylori
был необходимой причиной развития рака желудка [47], и Tramacere и др. обнаружили, что существует тесная связь между питьевой и заболеваемости раком желудка [48], [49]. Таким образом, устранение этих двух факторов внешней среды из ОШ выше анализа образцов цельной.

Other Languages