Ученые NIH разработали новый метод подготовки проб для обнаружения SARS-CoV-2

Ученые Национального института здоровья (NIH) разработали новый метод подготовки проб для обнаружения SARS-CoV-2, вирус, вызывающий COVID-19. Метод позволяет обойтись без экстракции генетического РНК-материала вируса, упрощая очистку проб и потенциально сокращая время и стоимость испытаний. Этот метод является результатом сотрудничества исследователей из Национального института глаз (NEI), Клинический центр NIH (CC), и Национальный институт стоматологических и черепно-лицевых исследований (NIDCR).

Диагностическое тестирование остается важным инструментом в борьбе с пандемией COVID-19. Стандартные тесты для обнаружения SARS-CoV-2 включают амплификацию вирусной РНК до обнаруживаемых уровней с использованием метода, называемого количественной ПЦР с обратной транскрипцией (RT-qPCR). Но сначала, РНК должна быть извлечена из образца. Производители наборов для экстракции РНК испытывали трудности с удовлетворением спроса во время пандемии COVID-19. препятствует тестированию во всем мире. С появлением новых вариантов вирусов, потребность в лучшем, более быстрых тестов больше, чем когда-либо.

Команда под руководством Роберта Б. Хуфнагеля, Доктор медицины, Кандидат наук., руководитель отдела медицинской генетики и офтальмологической геномики NEI, и Бинь Гуань, Кандидат наук., научный сотрудник лаборатории офтальмологической геномики в NEI, использовали хелатирующий агент, произведенный компанией-поставщиком лабораторий Bio-Rad под названием Chelex 100, для сохранения РНК SARS-CoV-2 в образцах для обнаружения методом RT-qPCR.

«Мы использовали образцы носоглотки и слюны с различными концентрациями вирионов, чтобы оценить, можно ли их использовать для прямого обнаружения РНК, "сказал Гуань, ведущий автор отчета о методике, который был опубликован на этой неделе в iScience. "Ответ был да, с заметно высокой чувствительностью. Также, этот препарат инактивировал вирус, что делает более безопасным работу персонала лаборатории с положительными образцами ».

Команда Хуфнагеля сделала свое открытие, протестировав различные химические вещества с использованием синтетических образцов и образцов человека, чтобы определить те, которые могут сохранять РНК в образцах с минимальной деградацией, позволяя при этом прямое обнаружение вируса с помощью RT-qPCR.

Чтобы проверить тест, Блейк М. Уорнер из NIDCR, D.D.S., Кандидат наук., M.P.H., и его команда собрали образцы пациентов (согласно протоколу исследований NIH IRB 20-D-0094) и хранили их в любой вирусной транспортной среде, или недавно разработанный буфер на основе хелатирующей смолы в Центре симптоматического тестирования NIH.

Образцы в вирусной транспортной среде были протестированы группой тестирования COVID-19 в Клиническом центре NIH, под руководством Карен М. Франк, Доктор медицины, Кандидат наук., с использованием стандартной экстракции РНК и тестирования RT-qPCR. Образцы в буфере хелатной смолы нагревали, и вирусная РНК была тогда, протестировано методом RT-qPCR. Новый препарат значительно увеличил выход РНК, доступной для тестирования, по сравнению со стандартным методом.

<цитата>

Мы думаем, что эта новая методология имеет очевидные преимущества повышения чувствительности, экономия средств и времени на тестирование. Метод стабилизирует РНК при комнатной температуре для облегчения транспортировки, место хранения, и обращение в клинических условиях ».

Роберт Б. Хуфнагель, Доктор медицины, Кандидат наук., Заведующий отделением медицинской генетики и офтальмологической геномики NEI

NEI защитила интеллектуальную собственность, связанную с этой технологией, и ищет партнеров для совместной разработки / лицензирования. Пожалуйста, свяжитесь с [адрес электронной почты защищен] для получения дополнительной информации.

• Новый научно обоснованный подход к определению высококачественных углеводных продуктов
• Ученые зафиксировали передачу от человека к человеку устойчивой к противомикробным препаратам легочной чум…