Plos ONE: genski polimorfizmi v Micrornas v Helicobacter pylori, povzročena High Risk atrofični gastritis in želodca Cancer

Povzetek

Ozadje in cilji

MicroRNAs (miRNAs) so znani po svoji funkciji translacijskih regulatorji od zaviralnih ali onkogeni. Mononukleotidnih polimorfizmov (SNP) v povezanih miRNAs genov se je izkazalo, da vplivajo na regulativno zmogljivost miRNAs in so bile povezane z rakom želodca (GC) in predrakavih želodca pogoji. Namen te raziskave je bil ugotoviti morebitne povezave med povezanimi-miRNA genskih polimorfizmov ( miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
in miR-608
) in prisotnost PK ali visokim tveganjem atrofični gastritis (HRAG) v evropski populaciji.

Metode

Gene polimorfizmi so bili analizirani v 995 predmetov (nadzor: n = 351; GC: n = 363; HRAG: n = 281), evropskega porekla. MIR-27a
T > C (rs895819), miR-146a
G > C (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492
G > C (rs2289030) in miR-608
C >. G (rs4919510) SNP so genotipizacijo RT-PCR

Rezultati

na splošno, SNP od miRNAs niso povezana s prisotnostjo GC ali HRAG. Ugotovili smo, nagnjenje k miR-196a-2
CT genotip, da je povezana z večjim tveganjem za GC v primerjavi s CC genotip, vendar pa razlika ni dosegla prilagojena P
-vrednost (razmerje obetov (OR) - 1,46, 95% interval zaupanja (CI) 1,03-2,07, P
= 0,032). MIR-608
GG genotip je bolj pogosta v GC primerjavi s kontrolno skupino (ALI -2.34, 95% IZ 1.08-5.04), vendar je pomen ostala obrobna ( P
= 0,029). Podobno je bilo opaziti v recesivna modela za miR-608
, kjer CC + CG vs GG genotipa primerjave so pokazali tendenco za povečano tveganje GC s ali 2,44 (95% CI 1.14-5.22, P
= 0,021). V genotipov in alelov v miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
in MIR-608
SNP imel podobno porazdelitev med histoloških podtipov GC in niso bili povezani s prisotnostjo razpršenega ali črevesnih tipa GC.

Sklepi

genski polimorfizem miR -27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
, miR-492a
in miR-608
niso bile povezane s prisotnostjo HRAG, GC ali različnih histoloških podtipov GC v evropskih temah

Navedba. Kupcinskas J, WEX T, Link, Leja M, Bruzaite I, Steponaitiene R, et al. (2014) genski polimorfizmi v Micrornas v Helicobacter pylori
inducirano High Risk atrofični gastritis in želodca raka. PLoS ONE 9 (1): e87467. doi: 10,1371 /journal.pone.0087467

Urednik: Masaru Katoh, National Cancer Center, Japonska

Prejeto: 14. september 2013; Sprejeto: 26. december 2013; Objavljeno: 27. januar, 2014

Copyright: © 2014 Kupcinskas et al. To je odprtega dostopa članek razširja pod pogoji Creative Commons Attribution License, ki omogoča neomejeno uporabo, distribucijo in razmnoževanje v katerem koli mediju, pod pogojem, da prvotni avtor in vir knjižijo

Financiranje:. To delo je bil podprt s strani Evropskega socialnega sklada (št VP1-3.1-mm-07-K-01-156) in v delu, ki ga donacije iz BMBF (BMBF-0315905D) v okviru projekta ERA-NET PathoGenoMics. Zaposlovanje bolnikov v Latviji je bil podprt delno iz projekta Evropskega sklada za regionalni razvoj (št 2010/0302 /2DP /2.1.1.1.0 /10 /APIA /VIAA /158). Med financerji imel nobene vloge pri oblikovanju študije, zbiranje in analizo podatkov, sklep, da se objavi, ali pripravi rokopisa

nasprotujočimi si interesi.. Avtorji so izjavili, da ne obstajajo konkurenčni interesi

Uvod

Kljub zmanjšuje incidenco raka želodca (GC) v večini razvitih držav, GC predstavljal skupno 989,600 novih primerov in 738,000 smrti v letu 2008 po vsem svetu [1]. Helicobacter pylori
( H. Pylori
) pri želodčne sluznice lahko privede do razvoja atrofični gastritis (AG) in intestinalno metaplazijo (IM) in je dejavnik kardinal tveganja za razvoj GC [2]. Kljub temu, razvoj adenokarcinomom želodca ni mogoče razložiti s prisotnostjo H. pylori
sam. Sinergijski učinki na okolje gostiteljice, prehranske in bakterijskih dejavniki so verjeli, da sproži želodčne rakotvornosti pa so mehanizmi in interakcije so še vedno slabo razumemo [3]. Številne genskih sprememb bili vpleteni v želodčnem karcinogeneze, vendar nobeden od njih še ni bila prenesena vsakodnevno klinično prakso zaradi pomanjkanja pridružitvenega alkohola [4]. Najnovejši podatki kažejo, potencialni vpliv posameznih nukleotidnih polimorfizmov (SNP), povezanih z microRNA genov (miRNAs) za tveganje razvoja raka [5].

MiRNAs le ~22 bp dolgo, in zaradi svoje edinstvene BIOGENESIS v različnih tkivih ali vzorcih zelo stabilen, zaradi česar so privlačen cilj v biomarkerjev raziskovalnem področju [6] [7]. Vedno več funkcionalne študije kažejo, da se miRNAs lahko sodelujejo v različnih fazah rakotvornosti [8] želodca. Ta skladnost se odraža tudi v miRNA profiliranja študije, ki so se pokazale določene spremembe v izraz vzorec v sluznici bolnikov GC. Poleg tega, Mirna izražanje spremembe že zaznati v zgodnjih fazah želodca rakotvornosti, vključno s H. pylori PODJETJA
povzroča AG [8].

Povečanje razumevanje funkcionalne vloge miRNAs je odprl novo Capitel v genski polimorfizem raziskave raka [7], [9]. Enotni miRNA je sposoben ciljanje več genov; Zato se lahko pomen za SNP na Mirni genskega zaporedja, lahko povezana z izjemno sprememb regulacije izražanja genov in spreminjanje tveganja za razvoj nekaterih bolezni ljudi, vključno z GC [8]. Različne študije so pokazale, da nekatere SNP-Mirna-kodirajo geni lahko spremenijo Mirna izraz ali funkcionalno vlogo in na ta način vpliva na tveganje za razvoj ali napredovanje [10] raka, [11]. Večje število študij primera nadzora so pokazale povezavo med polimorfizmi genov, ki kodirajo miRNAs in tveganja različnih malignih bolezni [5]. Gene polimorfizmi petih povezanih z miRNA genov, miR-27a
T > C (rs895819), miR-146a
G > C (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492
G > C (rs2289030) in miR-608
C > G (rs4919510), ki so bili izbrani za to študijo zaradi predhodno predlagana povezava z rakom tveganj [5], [12] - [14]

zgoraj omenjenih miRNAs so bili vpleteni v različne poti, povezanih z rakom.. Liu et al. je pokazala, da miR-27a
je up-urejena v GC in deluje kot onkogen z usmerjanjem prohibitin [15]. SNP za miR-27a
(rs895819) prispeva k GC občutljivost prek vpliva na izražanje miR-27a
in cilji gen cinkov prst in BTB domene, ki vsebuje 10 ( ZBTB10
) [16]. MIR-146a
se je izkazalo, da se spremeni H. pylori PODJETJA
povzročajo vnetni odziv v želodcu epitelnih celic človeških z usmerjanjem IL-1 povezano kinaze 1 ( IRAK1
) in TNF receptor povezan faktor 6 ( TRAF6
) [17]. Poleg tega, miR-146a
SNP (rs2910164) je bila povezana z AG v japonskih predmetov [18]. Prejšnje študije so pokazale, odklonski kot izraz miR-196a-2
in posledično navzdol ureditev P27 (kip1) v GC [16]. Druga študija je pokazala, da genski polimorfizem v miR-196a-2
(rs11614913) je bila povezana s povečanim tveganjem za GC [19], [20], medtem ko je študija Ahn et al. (2012) ni mogel potrditi, to zvezo, vendar je to SNP je bila povezana s preživetjem pri bolnikih GC [21]. MIR-492
je bilo ugotovljeno, da imajo pomembno vlogo pri napredovanju malignih embrionalnih jetrnih tumorjev [22] in deregulacije v kolorektalnega raka v primerjavi z običajnim debelo črevo sluznice [23]. Poročilo iz kitajskega prebivalstva je pokazala, da SNP od miR-608
(rs4919510) lahko vpliva na HER-2 pozitivni tveganje za nastanek raka na dojki in tumorskih [14].

Večina trenutno objavljenih študij genotipizacije povezano da so MIRNA geni v GC izvaja samo v azijskih osebah, so omejene z majhnimi vzorci in poročila, delno nasprotujočih si rezultatov. Poleg tega pa je zelo malo študij predhodno obravnavala vlogo teh povezanih z miRNA SNP v predrakavih želodca pogojih. Na podlagi dokazov zgoraj, ki smo izvedli sistematično analizo genotipizirajoči za miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR- 492
in MIR-608
SNPov pri bolnikih z GC, z visokim tveganjem atrofični gastritis in nadzora s tremi skupinami bolnikov iz Nemčije, Litve in Latvije evropskega porekla.

Metode

Etika izjava

Raziskavo je odobrila odbori za etiko v Otto-von-Guericke University Magdeburg, litovski Univerza za zdravstvene vede in centralne Odbor za etiko medicinsko od Latvije. Vsi bolniki so podpisali informirano obrazec o soglasju za sodelovanje v raziskavi.

populacijski študiji

Predmeti, vključenih v raziskavo prihajajo iz naših prejšnjih raziskovalnih projektov na SNP v GC in predrakavih želodca razmerah [24] [25]. Bolniki in kontrole so bili zaposleni v letih 2005-2012 na treh gastroenterologija centrov v Nemčiji (Oddelek za gastroenterologijo, hepatologijo in infekcijske bolezni, Otto-von-Guericke University, Magdeburg), Litvi (Oddelek za gastroenterologijo, litovskega Univerza za zdravstvene vede, Kaunas) in Latvija (University Hospital Riga vzhod in bolezni prebavil center GASTRO, Riga). Bolniki z HRAG in kontrole je bilo vključenih od zunajbolnišničnih oddelkov, ki so navedene v zgornji endoskopijo zaradi dispeptičnimi simptomov. Merila za vključitev v HRAG in nadzora niso bili anamnezo malignoma, bolezni prebavil ali kirurški poseg. bolniki GC pokazalo histološko preverjanje adenokarcinomom želodca in so bili zaposleni od out-bolnika in stacionarnih oddelkov. Skupaj, 995 posameznikov, je bil za katere material z ustrezno kakovost DNK na voljo (351 kontrol, 281 HRAG in 363 GC), so bili vključeni v raziskavo. Je bilo 310 predmetov iz nemške skupine (63 kontrol, 106 GC in 141 HRAG), 340 predmeti iz latvijske skupine (142 kontrol, 139 GC in 59 HRAG) in 345 predmetov iz litovskega skupini (146 kontrol, 118 GC in 81 HRAG). Vsi bolniki so bili evropskega porekla.

Histološka analiza in H. pylori
stanje

Podrobnejši histološka ocena želodčne sluznice je bila izvedena v okviru nadzora in HRAG skupine glede na spremenjene klasifikacije Sydney [26]. HRAG je bila opredeljena kot pan-gastritis (podobno vnetnih točk v antruma in korpusa), korpus-prevladuje gastritis z ali brez prisotnosti želodčne atrofije in IM bodisi v antruma ali korpusu želodcu [27]. H. pylori
stanje je bilo ugotovljeno s testiranjem za anti H. pylori
protiteles IgG v serumu. Histološki serotipizacija GC je bila izvedena v skladu s klasifikacijo Lauren v črevesnih in difuzne-vrste [28].

ekstrakcijo DNK in genotipizacija

genomske DNK iz nemške skupine je bila vzeta iz mononuklearnih celic iz periferne krvi s pomočjo krvnega komplet QIAamp DNK (Qiagen, Hilden, Nemčija), v skladu z navodili proizvajalca. Genomsko DNA iz vzorcev litovske in latvijske skupine ekstrahiramo s fenol-kloroform ekstrakcijsko metodo iz enojedrnih celicah periferne krvi. DNA vzorci so bili shranjeni pri -20 ° C do analize. SNP za miR-27a
C > G (rs895819), miR-146a
C > G (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913 ), miR-492
C > G (rs2289030) in miR-608
C > G (rs4919510) smo genotipizacijo s pomočjo Predhodno TaqMan® testov s 7500 ™ realnem času ciklerja, v skladu z navodili proizvajalca (Life Technologies, CA, ZDA). Genotip naloge so ročno potrdili z vizualnim pregledom s programsko opremo SDS 2.0.5 združljiv s sistemom TaqMan®.

bile uporabljene za nadzor kakovosti genotipizacijo

postopki kontrole kakovosti v celotnem genotipizacije vzorcev. Po genotipizacije, je bilo izbranih približno 10% vzorcev v vsaki genotipa skupini za večkratno analizo s 100% stopnjo preverjanje skladnosti. Dvomljiva vzorci imeli trojček ponavljajoče analizo. Vse stranke, ki sodelujejo v genotipizacije so zaslepljeni s statusom sodne ali nadzora vzorcev. Vzorci, ki ni genotipa so bile prikazane kot določen

Statistična analiza

Vsi predmeti so bili razvrščeni v tri študijske skupine:. Kontrole (n = 351), HRAG (n = 281), GC (n = 363). Starost je prikazana kot in standardnimi odkloni, in je bil v primerjavi z ANOVA in Neparni t-test. Kategorične podatke (npr spol, H pylori
okužba, histološki GC podtipi, distribucija genotipov in alelov.), Ki so predstavljene kot frekvenc; primerjave so bile izvedene s pomočjo Chi-kvadrat test.

ocene kakovosti in statistične analize podatkov genotipizacije smo izvedli s pomočjo Plink različico programske opreme 1,07 [29]. Posamezniki, ki imajo več kot 10% manjka genotipov in SNP s klicem hitrostjo pod 90% ali odklon od Hardy-Weinberg ravnovesje (HWE) v kontrolah ( P
< 0,05) so bili izključeni iz nadaljnje analize. Povprečna stopnja genotipizacija v vseh vzorcih je bila 99,6%. Razlike v alelov frekvenc med primerov in kontrol je bilo izračunano v kombinirano nemškem, litovski in latvijski študijskega vzorcu s testom Breslow dan za heterogenosti oddaljenih regij. Samo en SNP ( miR-608
C > G rs4919510) je pokazala, heterogenost najbolj oddaljenih regij med tremi študijskimi GC skupinah ( P
_{BD < 0,05) in je zato država rojstvo je bila vključena kot kovariablo v nadaljnjo analizo. Zveza med HRAG in GC s genskih polimorfizmov smo izračunali z uporabo logistične regresijske analize s prilagoditvijo za starost, spol in državo rojstva s 95% intervali zaupanja (CI). Relativne tveganja za mutacije so raziskovali uporabo recesiven in prevladujoč model, ki je privedla do primerjave med heterozigotno vs. homozigotna in divjega tipa vs divji tip +.
Heterozigotno + homozigotno oz. Za prilagoditev za večkratno testiranje smo izračunali popravljen prag pomembnosti α = 0,01 (0,05 /5).}

Rezultati

Značilnosti predmetov

Lastnosti nadzora, GC in HRAG skupine so prikazani v tabeli 1. v skladu z resničnem življenju starosti, teme razlikoval pomembno glede na starost in distribuciji spola med skupinami. Kot je bilo pričakovati, moški predstavljali 63,6% v GC skupini, medtem ko je ta spol v kontrolnih in HRAG skupin predstavljala 26,8% in 37,7%, v tem zaporedju. Kontrolne predmeti so bili precej mlajši od skupine HRAG (3 leta) in GC skupine (5 let). 52,6% bolnikov, ki so bili pozitivni na H. pylori
v GC skupini, vendar pa se v približno 27% posameznikov v GC skupini H. pylori
stanje IgG ni bilo mogoče doseči. Več kot 47% bolnikov v kontrolni skupini in 42,7% v skupini HRAG so H. pylori
pozitiven. Histološka klasifikacija za razpršene in črevesne GC vrste so bile pridobljene pri 62,0% bolnikov, GC (tabela 1).

Združenja miRNA SNP in tveganje za GC in HRAG

distribucija Genotip za vseh pet polimorfizmov v študija so bili podobni tistim, ki se pričakuje Hardy-Weinberg Equilibrium: rs895819 (p = 0,94); rs2910164 (p = 0,44); rs11614913 (p = 0,95); rs2289030 (p = 0,44); rs4919510 (p = 0,39). Genotipov in alelov distribucij za miR-27a
C > G (rs895819), miR-146a
C > G (rs2910164), miR-196a-2
C > T (rs11614913), miR-492
C > G (rs2289030) in miR-608
C > G (rs4919510) genske polimorfizmi v GC in HRAG študijskih skupin so predstavljeni v tabeli 2. za bolezni, ki so študijo po korekciji za večkratnega preskušanja niso opazili pomembnih združenj. Ugotovili smo, nagnjenje k miR-196a-2
CT genotip, da je povezana z večjim tveganjem za GC v primerjavi s CC genotip, vendar pa razlika ni dosegla prilagojene pomembnosti prag (OR - 1,46, 95% CI 1,03-2,07, P
= 0,032). MIR-608
GG genotip je malo povezana z večjim tveganjem za GC v primerjavi s CC genotip (OR - 2,34, 95% CI 1,08-5,04, P
= 0,029). Podobno je bilo opaziti v recesivna model za miR-608
, kjer CC + CG vs GG genotipa primerjavi povzročilo ALI - 2,44 (95% IZ 1,14-5,22), ( P
= 0,021).

Združenja miRNA SNP in tveganje črevesju in difuzno tipa GC

MIR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
in MIR-608
SNP združenja smo testirali z dvema histoloških tipov GC (difuzni ali črevesnih tipa GC). Genotipov in alelov frekvence za študijske skupine so prikazani v tabeli 3. Prevladujoči model za miR-27a
pokazala težnjo po alel T v primerjavi s C povezana z večjim tveganjem za razpršeno tipa GC (OR - 2,07 95% CI 1,13-3,79, P
= 0,018). MIR-196-a2
SNP je pokazala težnjo zmanjšanim tveganjem črevesne tipa GC v recesivno modela (CC + CT vs TT), pa je združenje moč ni dosegla statistične značilnosti (OR - 0,47, 95 % CI 0,20-1,08, P
= 0,077). Podobno opazko prevladujoč model za miR-492
SNP (OR - 1,95, 95% IZ 1,01-3,75), kjer GG vs GC primerjavi privedlo do povečanega tveganja za difuzno tipa GC, vendar je P
vrednost ni dosegla zahtevano stopnjo pomembnosti ( P
= 0,046). Vse druge primerjave med nadzorom in difuzni ali črevesne tipa GC skupin ni razkrila pomembne združenja ali trende pet SNP v miRNAs.

Pogovor

V tej raziskavi smo izvedli analizo genotipizirajoči za miR-27a
(rs895819), miR-146a
(rs2910164), miR-196a-2
(rs11614913), miR-492
(rs2289030) in miR-608
(rs4919510) genske polimorfizmi v študiji kontrolni primera, vključno s 351 nadzorov, 281 HRAG in 363 GC bolnikov iz treh evropskih študijskih skupin. Ta polimorfizem je bila povezana s tveganjem GC ali celotno tveganje raka; pa poročajo podatki so deloma nasprotujoče si ali na podlagi le nekaj študij, povezanih z azijskih skupin. Kljub nekaterim manjšim razlikam, naši rezultati ne podpirajo povezave med miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR- 492
in miR-608
genskih polimorfizmov in prisotnost PK ali HRAG. Poleg tega ni bilo mogoče najti povezavo med SNP v miRNAs in prisotnosti različnih histoloških podtipov GC. Ker so miRNAs pokazale, da ima velik vpliv na želodcu rakotvornost [8], smo pričakovali, da bi ti polimorfizmi spremeni tveganje GC ali njegovih predhodnikih. Po najboljšem znanju, da je to prva študija, ki je preučevala povezav med temi miRNA polimorfizmov in tveganjem GC ali HRAG pri osebah evropskega porekla. Več kot to, SNP od miR-492
(rs2289030) in miR-608
(rs4919510) niso preučevali v zvezi z GC ali predrakavih želodcu razmer pred tem.

Gene polimorfizem miR-27a je trenutno eden izmed najbolj preučevanih SNP v študijah primera za nadzor raka povezana. Pričakovali smo, da nosilci alel C za miR-27a
SNP lahko imajo manjše tveganje za GC, kot je bilo predlagano s strani nekaterih raziskovalnih skupin. Kitajski študiji primerov in kontrol, vključno z 311 GC bolnikov in 425 kontrol rakom brez ugotovila, da
manjši alel C rs895819 v pokoj-27a znatno zmanjša tveganje za GC z OR - 0,77 [30]. Druga študija je pokazala močno povečano tveganje za GC (OR - 1,48) za miR-27a
SNP in še bolj funkcionalne analize pokazale, da je varianta genotipi odgovoren za povišan miR-27a ravni
in zmanjša ZBTB10
ravni mRNA [16]. V nasprotju s tem je študija vključno 2.380 udeležencev z različnih želodčnih poškodb niso našli povečano tveganje za nastanek želodčnega IM ali displazije za rs895819 [12]. Metaanaliza s povzetkom ugotovitev različnih študij primerov in kontrol je pokazala, da je bila rs895819 polimorfizem močno povezano z zmanjšano tveganje za raka v beli barvi, vendar ne v Azijci [31]. Rezultati naše raziskave ne podpirajo morebitni zaščitni učinek alel C za razvoj GC evropskih temah. Naša raziskava je prva, ki je ocenila vlogo , vendar pa so opazili miR-27a
rs895819 v GC in HRAG pri osebah evropskega porekla ni pomembnih združenja.

Glede na obstoječe dokaze o miR-146a
SNP (rs2910164) za razvoj raka smo želeli oceniti morebitna pridružitev v naši skupini bolnikov z GC in HRAG. Pesem sod. ugotovila, da je CC nosilci rs2910164 bistveno povečano tveganje za IM (OR - 1,42) in displazije (ALI - 1,54) v primerjavi z GG prevoznikov [12]. Podobno opažanje je bil vložen v drugi študiji, kjer so opazili skupni učinek miR-146a
(rs2910164) G /G in TLR4 SNP na povečano tveganje za hudo AG med japonskimi predmetov [18]. Dokument, ki ga Okubo et al. [32] so poročali, da je bil prevoz rs2910164 CC genotip povezana z bistveno večjim tveganjem za GC v primerjavi z ne-rakavih predmetov (ALI - 1,30). Meta-analiza, ki jo Wang et al. [33] na miR-146A
rs2910164 vključno 19 študij primera nadzora ugotovi, da je bila rs2910164 povezano s povečano občutljivostjo raka v Azijci s splošno ALI - 1.18, vendar enako meta-analiza zahteva za nadaljnje dobro zasnovan študij z velikim vzorcem za nadaljnjo identifikacijo tveganj. Rezultati naše študije primerov in kontrol ni razkrila pomembno povezavo med rs2910164 in tveganja GC ali HRAG

MIR-196a-2
C >. T SNP (rs11614913) je eden od najbolje študiral miRNA SNP v odnosu do različnih malignih bolezni. Poročilo, ki ga Wang et al. (2013) je pokazala, da je CC genotip povezana z bistveno zmanjšano tveganje za raka želodca (OR - 0,78) v primerjavi z genotipom CT in TT v veliki študiji primerov in kontrol [33]. Meta-analiza, ki jo Wang et al. (2013) je pokazala, bistveno povečano tveganje GC, vendar združenje opazili le v homozigoti primerjavo. Ta meta-analiza je pokazala, da je rs11614913 polimorfizem močno povezana s splošno tveganje za raka prebavil [34]. Okubo sod. [32] niso našli povezavo za ta SNP in GC, vendar pa se v svoji študiji rs11614913 je bila povezana s stopnjo H. pylori
inducirano infiltracijo mononuklearnih celic. Zanimivo je, da drugi meta-analiza na istem SNP ne določa razmerja med rs11614913 in razvoj GC [35]. Rezultati naše raziskave so v skladu s sklepom o slednjem meta-analizi nismo upoštevali pomembno povezavo med SNP v miR-196a-2
in GC tveganja.

polimorfizma miR-492
(rs2289030) je postavil hipotezo, da posreduje tveganje za nastanek raka, vendar podatki o morebitnih združenja za ta SNP in tveganje za nastanek raka, so še vedno primanjkuje. Študija, ki jo Yoon et al. (2012) niso našli povezavo med SNP v miR-492
in tveganja ali preživetja pri bolnikih z nedrobnoceličnim pljučnim rakom [36]. Druga študija o raku debelega črevesa je pokazal, da je bilo preživetje brez napredovanja bolezni bolnikov s kombinirano miR-492
CG in GG genotipa bistveno slabši, kot je bolnikov z miR-492
CC genotip [13]. Naši rezultati kažejo, da rs2289030 za miR-492
ni bil povezan s prisotnostjo GC ali HRAG. Po najboljšem znanju je to prva študija, ki raziskuje odnos med miR-492
SNP in predrakavih želodca pogojev ali GC, in zato ne more primerjava naših podatkih napredku.

SNP od miR-608
(rs4919510) ni bila raziskana v zvezi z GC tveganja prej. Naša študija je prvi poročal ničelno povezavo med tem polimorfizma in tveganja GC ali predrakavih želodca pogoji. Pri bolnikih z rakom debelega črevesa in danke je rs4919510 bistveno povezan s ponovitvijo raka in smrti [37]. Druga študija primerov in kontrol na bolnike z rakom debelega črevesa in danke niso našli povezavo z tveganje za nastanek raka, vendar pa njihovi rezultati so pokazali, da je bil GG genotip povezana s povečanim tveganjem za smrt v belem prebivalstva in zmanjšati tveganje za smrt v afriških Američanov [38]. Dodatne večjih študijah razširitve lahko določajo vlogo miR-608
rs4919510 SNP v želodcu in drugih malignih bolezni.

Črevesna in razporedijo-vrste GC so dokazali, da imajo različne patogenetske poti [3]. Nekatere študije so pokazale, da ima lahko Mirna polimorfizmi različne učinke za histoloških podvrstami GC. Po stratifikacije bolnikov prebavil ter difuzna tipa GC skupin, miR-499
rs3746444 bilo dokazano, da vplivajo na tveganje razpršeno tipa GC v korejskem prebivalstva [21]. Čeprav se je število posameznikov v črevesju in GC skupin difuzna tipa ni bilo v naši raziskavi zelo visoka, je bila opravljena analiza primerjamo ti dve različni histološke vrste GC. Na splošno, miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
in miR-608
SNP niso bili povezani s prisotnostjo različnih histoloških podtipov GC. Čeprav so bili med histološko podskupina GC, razlik v genotipov in alelov frekvenc niso dosegle potrebne ravni pomena upoštevati nekatere tendence, ki so opisani v poglavju rezultati.

Rezultati naše raziskave jasno podpirajo pomen skrbni presoji genski polimorfizmi v različnih etničnih skupin. Prej predlagane povezane z miRNA SNP niso pokazali bistveno povezana GC razlike v našem evropskega prebivalstva. Kljub temu priznavajo, da obstaja nekaj omejitev v zvezi z načrtovanjem naše študije. So bile razlike distribucijo med spoloma med GC, HRAG in kontrolnih skupinah; Vendar pri izvajanju statistične analize smo vključili spol kot sospremenljivko, kar zmanjšuje potencialni vpliv spola za rezultat naših rezultatov. Tu v tej študiji smo se osredotočili na histoloških sprememb, ne pa prisotnost H. pylori
; Zato, dodatni testi poleg serumskih IgG protiteles za detekcijo niso uporabljali ta bakterija. Poleg tega je dobro vedeti, da je kronični atrofični gastritis povzroča H. pylori
okužbe. Nismo prilagoditi ali za H. pylori
IgG protitelesa, CagA
ali Váca
stanje, ker ti podatki niso bili na voljo za vse predmete. Nismo mogli izvesti združenje analizo za SNP v miRNAs glede na preživetje bolnikov GC, saj so bili podatki na voljo le za majhen delež predmetov. Zaradi istega razloga prav tako ni opravila analize glede na anatomsko lokacijo v želodcu (proksimalno vs. distalno). V tej študiji smo opravili le genov analizo polimorfizma brez obravnavanju ekspresijskih razlike Mirne v rakastih in ne-rakavih tkiv in zato ne moremo domnevajo, če bi ti polimorfizmi imajo funkcionalno vlogo. Nadaljnje raziskave naj bi ocenili vlogo SNP za raven miRNA v GC tkiva in ocenjevanje morebitnih ciljnih genov v funkcionalnih študij. Število posameznikov znotraj podskupin v naši raziskavi črevesnih in difuzno tipa GC skupin je relativno majhna in morda underpowered za odkrivanje specifičnih združenja. Našli smo nekaj razlik za pokoj-196a-2 in MIR-608 SNP med skupinami z P
< 0,05; Vendar pa menimo, da ne moremo poročati pomembno združenje, saj ni dosegla naše prilagojena P
vrednost. Več primerjave za genetske pridružitvenih testih so bili uporabljeni v tem dokumentu, in menimo, da bi morali uporabiti prilagojeno P
vrednost za pripravo sklepov.

Zaključki

Naša študija kaže da genski polimorfizem miR-27a
, miR-146a
, miR-196a-2
, miR-492
in miR -608
niso povezani s tveganjem za GC in HRAG pri osebah evropskega porekla. Ti SNP ne izkazujejo kot potencialnih biomarkerjev za identifikacijo posameznikov s povečanim tveganjem za GC.

Priznanja

Radi bi se zahvalil Lina Baldauskiene za odlično pomoč pri genotipizacije poskuse v laboratoriju.

• Plos ONE: MicroRNA-10a Je Dol urejeno s DNA metilacije in funkcije kot zaviralnih v želodcu raka celic
• Plos ONE: Zveza med polimorfizmov v obstaja iz XRCC1 Gene in čistilne izidov bolnikov z napredovalim želodca raka: sistematični pregled in metaanaliza