Genet-reduktion effekt af kromosomale tab påvist i gastrisk cancers

Genet-reduktion effekt af kromosomale tab påvist i gastrisk kræft
Abstract
Baggrund
Niveauet for tab af heterozygositet (LOH), der reducerer et gen dosis og udøver en celle-skadevirkning er kendt for at være en parameter for den genetiske stadieinddeling af gastriske cancere. Dette studie undersøgte hvis cellen-skadelig virkning induceret med reduktionen genet var en hastighedsbegrænsende faktor for de LOH begivenheder i to forskellige histologiske typer af gastriske cancere, de diffus og tarm-typer. Salg Metoder
patologiske prøver taget fra 145 mavecancerpatienter blev undersøgt for niveauet af LOH hjælp 40 mikrosatellitmarkører på otte cancer-associerede kromosomer (3p, 4p, 5q, 8 p, 9p, 13q, 17p og 18q).
Resultater
Most af cancer-associerede kromosomer viste sig at tilhøre de gen-fattig kromosomer og til at indeholde et par mave-specifikke gener, der var stærkt udtrykt. En baseline-niveau LOH involverer en eller ingen kromosom var hyppige i diffust-gastriske kræftformer. Af kromosom 17, der indeholder en relativt høj tæthed af gener var almindeligt tabt i tarm-typen cancere, men ikke i diffust-type kræftformer. Et højt niveau LOH involverer fire eller flere kromosomer tendens til at være hyppige i mavens kræft med tarm og blandet differentiering. Sygdomstilbagefald var almindeligt for gastriske cancere med højt niveau LOH gennem både hematogene (38%) og ikke-hæmatogene (36%) ruter, og for baseline-niveau LOH tilfælde gennem den ikke-hæmatogen rute (67%).
konklusioner
celle-negative virkning af reduktion genet mere tolereres i intestinal gastriske cancere end i diffust-type kræft, og tabet af højdosis-gener er associeret med hæmatogen metastase.
Baggrund
Gastric cancere undergår hypermutationer i enkle gentagelsessekvenser og ubalancerede kromosomale tab, og disse genetiske ændringer detekteres som en mikrosatellit instabilitet (MSI) og tab af heterozygositet (LOH), henholdsvis ved hjælp af meget polymorfe mikrosatellitmarkører [1-4]. Den patobiologiske opførsel og prognose af gastriske cancere har været forbundet med niveauet af LOH og tilstedeværelsen af ​​MSI [3-6]. Dybden af ​​invasion og lymfeknude metastaser er betydeligt frem i tilfælde af små kræftformer med højt niveau LOH, og disse histologiske parametre har tendens til at være lineært relateret med kræft størrelse for de lavt niveau LOH sager [7]. Fordi en enkelt mikrosatellit-genotype er ligeledes påvist i hele kirurgiske væv samt den endoskopiske biopsiprøve [3, 7], er det muligt at forudsige sandsynligheden for sygdomstilbagefald og afgøre den passende resektion procedure baseret på mikrosatellit-analyse af en forbehandling biopsi væv.
to-hits hypotese har foreslået, at kromosomal tab og punktmutation resultat i den biallele inaktivering af tumorsuppressorgener [8]. Kromosomale tab, der udøver en skadelig virkning på cellevækst er meget mindre tolereret end kromosomale gevinster, og de to genetiske hits giver en vækstfordel kunne beskytte kræft progenitorceller fra letale LOH hændelser [9, 10]. Derudover har tidligere undersøgelser foreslået, at den methylerede regioner gen-kontrol er mindre og mindre methyleret i et LOH-niveau-afhængig måde i gastriske cancere [11, 12] via en dosering udligningsmekanisme, som opretholder et gen eller transkription dosis under efterfølgende cellecykler [9 ]. Med hensyn til dosering udligningsordning, kan kromosomal gain og LOH-associeret demethylering skyldes dosis-kompenserende genetiske og epigenetiske svar på en reduktion i den kromosomale dosis [11-14]. Derfor LOH begivenheder kombineret med en celle-negativ virkning, og en dosis-respons kompenserende foruden tumorsuppressorgen inaktivering sandsynligvis bestemme patobiologiske opførsel af cancer progenitorceller.
Gastriske cancere er blevet kategoriseret i to forskellige histologiske typer , det vil sige de diffus og tarm-typer [15, 16]. Diffus-type kræft er almindelige hos unge-alderen patienter, der mangler en præcancerøse læsion, mens tarm-type kræft er almindelige i gamle-alderen patienter forbundet med præcancer tarm metaplasi, der ligner tarm kirtler [17]. Antages det, at marv-afledte stamceller tilpasser til maven væv-miljø [18], de nyligt faste stamceller, som er potentielt usammenhængende og invasive i unge individer, udvikle sig til diffus-typen cancer. Intestinal-type kræft er hyppige blandt de gamle-aged patienter, der har den langsigtede tilpasning af nyligt faste stamceller til det gastriske væv miljø. I denne henseende kan en given LOH begivenhed påvirker forskellige doser af transkription mellem diffus og tarm-typen gastriske cancere, der etablerer særskilte genekspressionsmønstre.
I denne undersøgelse blev korrelationer mellem de LOH begivenheder og patobiologiske opførsel af gastriske cancere i form af de celle-skadelige virkninger af reduktion gen. De otte cancerassocierede kromosomer vi undersøgte havde en lav densitet af gener og ingen mave-specifikke gener, hvilket kan resultere i en mild celle-negative virkning af LOH. De LOH begivenheder var hyppige i tarm-gastriske kræftformer, hvor tabet af et kromosom ville påvirke en lav dosis af transskription og udøver en mild celle-negativ effekt.
Metoder
Udvælgelse af sager
Et hundrede og femogfyrre patienter med mavekræft, som gennemgik en helbredende kirurgisk resektion fra februar 1996 og juni 2003, blev indrulleret i denne undersøgelse. Den clinicopathologic og radiologiske oplysninger blev opnået ved at gennemgå de detaljerede optegnelser over patienterne. Et hundrede og seksten sager blev tidligere analyseret af multifokal genetisk undersøgelse af de heterogene tumor sites [3]. De resterende 29 patienter blev undersøgt under anvendelse af et enkelt væv blok af hver tumor.
Den mikroskopiske objektglas blev gennemgået og derefter et tumorsted, der var repræsentativ for den histologiske træk blev valgt. Den histologiske type mavekræft blev defineret som tarm (kirtel, sammenhængende eller fast), diffus, og blandes i henhold til Lauren klassifikationen [15, 16], og graden af ​​differentiering blev gradueret ifølge WHO klassifikationen. Tumoren steder betragtes var Cardia, krop og antrum. Den clinicopathologic tumor fase blev bestemt i henhold til de Tumor-Node-Metastase (TNM) kriterier [19]. De fleste gastrisk kræftpatienter (140 af 145, 97%) havde gennemgået R0 gastrektomi og D2 eller mere udvidet lymphadenectomy. En samlet gennemsnit på 28,6 (median: 33) lymfeknuder blev fjernet sammen med prøven. Ingen af ​​patienterne fik præoperativ kemoterapi og strålebehandling.
Opfølgende data om tilbagefald og overlevelse
En kombinationsbehandling med intravenøs mitomycin, fluorouracil, og cytarabin (MFC) efterfulgt af oral fluorouracil blev administreret som en standard postoperativ adjuverende behandling efter lægens dom over den overordnede prognose af den enkelte sag. Under opfølgningsperioden, en fysisk undersøgelse, laboratorieundersøgelser, bryst radiografi, abdominal ultralyd eller computertomografi, og gastrofiberscopy blev udført hver 3 eller 6 måneder og sygdom tilbagefald blev histologisk bekræftet, hvis det er muligt. Når mere end én gentagelse site blev opdaget på det første gang for fiasko, blev de individuelle gentagelser optalt hver for sig. Den gentagelse site blev kategoriseret i hæmatogen metastasering involverer lunge, lever eller andre fjerntliggende organer, og ikke-hæmatogen metastasering, der omfattede lymfeknudeinvolvering og peritoneal formidling. Gastric rest kræftformer blev udelukket fra gentagelse mønster analyse.
Samlede overlevelse tid blev beregnet fra datoen for kirurgisk resektion indtil enten dag i den sidste opfølgning kontakt eller cancer-relaterede dødsfald. De data om patienter, der døde af andre årsager blev censureret på tidspunktet for dødsfaldet. Statistisk analyse blev udført i april 2007. Den gennemsnitlige opfølgningsperiode af alle de overlevende patienter var 40 måneder (interval: 5 til 96 måneder) og blev afsluttet med 98% af de inkluderede patienter. Under overlevelsesanalyse, var 50 patienter døde som følge af deres kræft og 12 patienter var døde af andre årsager.
Tissue mikrodissektion og DNA-amplifikation
Fem serielle 7 um-tykke sektioner fra hver formalin-fikseret paraffinindlejret vævsprøve blev afparaffiniseret og kortvarigt farvet med hematoxylin og eosin. En enkelt tumor-celle-rige fokus blev valgt ved mikroskopisk undersøgelse og en tumor område der spænder fra 5 mm til 7 mm i diameter blev manuelt dissekeret under et stereomikroskop (forstørrelse, × 40) ved anvendelse af en kirurgisk skalpel. De Mikrodissekterede vævsstykker blev undersøgt mikroskopisk hvis tumorcelle indholdet var > 70%, som var blevet bekræftet at afspejle en forskel i den genetiske indhold mellem de normale og tumorvæv [3, 7].
Ca. 1.000 Mikrodissekterede tumorceller blev inkuberet i 20 pi DNA ekstraktionsbuffer (0,5% Tween-20 , 1 mM EDTA, pH 8,0, 50 mM Tris pH 8,0, 0,5 mg /ml proteinase K) ved 37 ° C i 24 timer. Formalinfikseret paraffinindlejret væv DNA tendens til at blive dårligt amplificeret ved PCR i ældre præparater. De fleste DNA blev udvundet inden for fem år efter udarbejdelsen af ​​de patologiske prøver, som sikrer DNA kvalitet til PCR. Mængden af ​​DNA, med varierende egenskaber, af vævet lysat blev bestemt på basis af PCR båndintensitet med 5-10 ng /pl af DNA'et, der blev amplificeret under anvendelse af en mikrosatellit primersæt, D19S226
(fremad: 5 ' - CCA GCA GAT TTT GGT GTT GTC TA - 3 '; omvendt: 5' - ACA GAG CCA GAG CCA GTA GGA GT - 3 '; amplikonstørrelse: 164 bp). PCR-amplifikation blev udført under en varm start tilstand med anvendelse af en radioisotop (α- 32P dCTP, PerkinElmer, Boston, MA, USA) som beskrevet tidligere [3, 7]. Kort fortalt, i alt 10 pi PCR-blandingen undergik 32 cykler af en seriel amplifikationstrin, der bestod af 94 ° C i 50 sek, en primer-specifik annealing temperatur i 50 sek og 72 ° C i 1 min. Radioisotopen-mærkede mikrosatellit sekvenser blev separeret på en 6% polyacrylamidgel, der indeholdt 7 M urinstof, og de blev visualiseret ved gentagne eksponeringer af hver autoradiografi og anvendelse af en radioluminograph scanner (BAS 2500, Fuji Photo Film Co. Ltd., Kanakawa, Japan) .
Analyse af mikrosatellit-alleler
retningslinjerne for at lave status LOH og MSI er blevet beskrevet i tidligere undersøgelser, der bruges det samme panel af mikrosatellitmarkører [7]. Som reference typen af ​​mikrosatellit-alleler, vi hentet dinukleotid gentage markører, der lå fra 88 bp til 247 bp i amplikonstørrelse og der havde en heterozygot frekvens > 50%. De stærkt polymorfe mikrosatellitmarkører på 8 cancerassocierede kromosomer (3p, 4p, 5q, 8 p, 9p, 13q, 17p og 18q), som hyppigt blev LOH i gastrisk cancer [3, 7, 20], blev anvendt til at øge antal heterozygote alleler på hver arm (figur 1A). De fem mikrosatellitmarkører på hver kromosomale arm viste klare PCR bands i heterozygote alleler og kalibreres hele længden af ​​de otte kromosomer [3, 5]. For at sikre reduktion kromosomale blev det kromosomale tab tildelt, da LOH begivenhed er involveret mere end to mikrosatellitmarkører på en kromosomal arm [13]. Fyrre par af mikrosatellit-primere blev blandet i i alt 22 reaktionsrør og som hver indeholdt én (4 blandinger) eller to (18 blandinger) primersæt, der strakte forskellige størrelser amplikoner ved de samme udglødningstemperaturer. De resulterende utvetydige mikrosatellit bands angivet den høje specificitet multiplex PCR tilstand, som var nyttigt for små mængder af mikrodissekeres patologiske væv. Figur 1 PCR-baserede mikrosatellit-analyse (A) og den genetiske klassifikation af gastriske cancere (B). Repræsentative autoradiogrammer af de prøver, der blev undersøgt ved PCR-baserede mikrosatellit-analyse (A) og den genetiske klassificeringen af ​​intestinale-type og diffus gastriske cancere på grund af tab af heterozygositet (LOH) og mikrosatellit instabilitet (MSI) (B). (A) Den venstre gelelektroforese viser højfrekvente MSI på mere end 40% af de 15 homozygotiske markører. Den rigtige gelelektroforese viser højt niveau LOH involverer kromosomer 3p, 4p, 5q, 9p, 13q, 17p og 18q. Normal (N) og tilsvarende tumor (T) DNA'er er angivet over hver allel bånd. Stjernen angiver MSI og LOH. Den genomiske DNA mikrodissekeres fra formalin-indlejret paraffin-fikseret væv blev forstærket og er mærket med [α-32P] dCTP i varm start tilstand multiplex PCR. I alt 80 mikrosatellit amplikoner fra hver prøve blev kørt samtidigt på to sekventeringsgeler. (B) anvendelse af et panel af 40 mikrosatellitmarkører på otte cancerassocierede kromosomer, blev LOH fortolket på heterozygote markører, hvis 40% eller mindre af de homozygote markører udviste MSI. Omfanget af tabene kromosomale, som scorede efter antallet af LOH-positive kromosomer, var opdelt i højt niveau (LOH-H) og lav-niveau (LOH-L) tab for både den intestinale-og diffusfeltrespons typer. I tilfælde af diffuse gastriske kræft, blev nul eller en kromosomal tab klassificeret i baseline-niveau (LOH-B).
Baseret på den samme klassificering af mikrosatellitmarkørerne genotyper, der blev anvendt i den tidligere undersøgelse (figur 1B) [ ,,,0],7] blev allele profiler af de 40 mikrosatellitmarkører analyseret for MSI hos homozygote markører, der viste et par skygge eller stutter bands i et par normale og tumor DNA'er. Fordi MSI tilslører heterozygote allele status blev de allele profiler af de 40 mikrosatellit sekvenser oprindeligt analyseret for MSI hos homozygote markører. Den LOH status blev bestemt på basis af allele tab i den heterozygote markør (figur 1B). Omfanget af kromosomale tab i hvert tilfælde blev scoret efter antallet af forfatningsmæssige tab kromosomale involverer mere end en mikrosatellit allel.
Analyse af i-silico
data for genet tæthed og transskription af individuelle kromosomer
A alt 17,723 reference- gener identificeret i en offentlig database (http:.. //genom UCSC edu /marts 2006 samling) [21] blev analyseret for at beregne antallet af gener pr 1-Mb nukleotider segment. Seriel analyse af genekspression (SAGE) data med normal maveslimhinden blev opnået fra en offentlig database (http:.... //Www NCBI NLM NIH gov /geo /, "SAGE_Stomach_normal_B_antrum"). Den transkriptionelle aktivitet af individuelle gener blev beregnet ved at kombinere henvisningen genet kort og de udtrykte gen tags. Baseret på en sammenligning af microarray og SAGE data evaluerer genekspressionsprofilerne blev antallet af transkripter talt i SAGE data fundet til præcist estimere en stor forskel i geners aktivitet mellem mavesækken-specifikke gener og husholdningsgener [21].
Statistisk analyse
Fishers eksakte test og χ
2 tests blev anvendt til at sammenligne de clinicopathologic features med mikrosatellit-genotype i mavens cancere. Probability kurver blev beregnet efter den Kaplan-Meier-metoden og sammenlignet under anvendelse af log-rank test. Multivariat analyse blev udført ved Cox proportional hazards metode med anvendelse af trinvise procedurer. Sandsynlighedsværdier var to-sidede, med en P Drømmeholdet værdi mindre end 0,05 betragtes som statistisk signifikant. Den statistiske programpakke SPSS 11.0 (SPSS Inc., Chicago, IL, USA) blev anvendt til dataanalyse.
Resultater
Analyse af LOH begivenheder i gastrisk kræft
fleste af mavens kræft (116 ud af 145 tilfælde) blev undersøgt i en tidligere multifokal analyse af de heterogene tumor websteder fra en given mavekræft [3]. Femoghalvfems procent af de gastriske cancere undersøgte fandtes at have enten et tilsvarende LOH eller MSI almindeligvis deles af heterogene tumorsteder og derefter hver mavekræft blev kategoriseret i en enkelt mikrosatellit-genotype, og ikke en blandet genotype. De mikrosatellit genotyper i de 27 ekstra tilfælde blev bedømt i henhold til niveauet af LOH og tilstedeværelsen af ​​MSI, som blev påvist i et enkelt væv stykke indeholdende en repræsentativ histologisk komponent.
Hver kromosomale tab var korreleret med de clinicopathologic parametre gastriske cancere (tabel 1). De fleste kromosomale tab (4p, 5q, 9p, 13q, 17p og 18q) var forbundet med sent debuterende sygdom (P
< 0,05). To eller flere kromosomale tab blev samtidig relateret til antral placering (9P og 18q tab), den intestinale-eller blandet type histologi (5q, 17p og 18q tab), og en dårlig overlevelse (3p, 9P og 13q tab) (P
< 0,05). Den 17p tab var hyppigst i de kræftformer tarm-type (67%). Den 13q tab var hyppigst i diffust-type kræft (47%). Tabel 1 Forhold til de clinicopathologic egenskaber og enkelt tab kromosomal
Karakteristik

3p tab
4p tab
5q tab
8p tab
9P tab
13q tab
17p tab
18q tab
No. af patienterne
130
47
47
51
30
50
57
77
55
Alder
Mean
60
61
63
63
63
64
63
63
63
± SD
± 12,60
± 10,18
± 10,49
± 9,28
± 10,24
± 10,28
± 10,43
± 10,94
± 11.20
P
0.290
0,029
0,014
0,102
0.003
0,030
< 0,0001
0,030
Sex
Mand
86
37
34
36
18
37
42
52
36
Female
44
10
13
15
12
13
15
25
19
P
0,033
0,335
0.450
0,510
0,182
0,136
0.710
1,000
Tumor placering
Cardia
13
4
3
5
1
2
5
8
3
Krop
48
16
16
13
10
14
16
24
16
antrum
69
27
28
33
19
34
36
45
36
P
0,743
0,424
0,078
0,267
0,018
0,119
0,253
0,043
histologiske type
Intestinal
54
19
19
23
13
22
20
36
27
Diffus
32
9
9
6
5
8
15
11
7
Blandet
44
19
19
22
12
20
22
30
21
P
0,395
0,395
0,018
0.480
0,176
0,404
0,004
0,026
Tumor størrelse
Mean
5,3
5,8
5,1
4,9
5,1
4,9
5,7
5.2
5.5
± SD
± 3,01
± 2,86
± 2,64
± 2,29
± 2,42
± 2,73
± 3,02
± 2,86
± 3.13
P
0,129
0,631
0,131
0,705
0,181
0,179
0,564
0,483
Stage
I & II
64
20
21
20
14
22
21
36
24
III & IV
66
27
26
31
16
28
36
41
31
P
0,277
0,469
0,075
0,836
0,372
0,014
0,593
0,292
Gentagelse
peritoneal
24
10
9
8
5
10
12
16
11
Lymfeknude
10
4
3
3
2
5
4
6
3
hæmatogen
22
13
11
14
8
11
14
15
10
Total
56
27
23
25
15
26
30
37
24
P

0,422
0,507
0,070
0,428
0,826
0,415
0,899
0,663
Vital status
119
42
41
47
29
44
51
68
48
Alive
70
19
21
26
16
20
24
36
27
Dead
49
23
20
21
13
24
27
32
21
P
0,021
0,152
0,330
0,402
0,019
0,019
0,094
0,389
P
værdier mindre end 0.05 er angivet med fed skrift.
en stor del (52%) af diffus-gastriske kræftformer havde en eller ingen kromosomale tab, som blev klassificeret i en baseline-niveau LOH (LOH-B), fordi de fleste af tarm -og blandet typen cancere (86%) havde to eller flere kromosomale tab (figur 2) [7]. De LOH sager på højt niveau med fire eller flere kromosomale tab var mest hyppige i de blandede differentiering tilfælde med både tarm- og diffus-type gastrisk kræft (44%). Samlet set 15 LOH-B (10%), 65 LOH-L (45%), 50 LOH-H (35%), og 15 MSI (10%) tilfælde blev identificeret i de 145 kirurgiske prøver. Figur 2 Forbindelserne mellem den histologiske type og nej. af kromosomale tab i mavens cancere. Den histologiske type af mavekræft blev defineret som diffus (n = 32, lukket kasse), tarm- (n = 54, grå kasse), og blandede typer (n = 44, åben kasse), ifølge Lauren klassifikation.
Analyse af genet tæthed og de højt udtrykte gener på cancer-associerede kromosomer
tætheden af ​​gener pr 1-Mb segment, de 100 aktive gener, der var stærkt udtrykt i maven, og hyppigheden af ​​LOH genotyper påvist i gastriske cancere blev analyseret på hvert kromosom (tabel 2). I sammenligning af de otte cancerassocierede kromosomer vi undersøgt og de resterende 14 kromosomer, tætheden af ​​gener (4,8 gener versus 6,9 gener pr 1-Mb segment) og det gennemsnitlige antal af de stærkt udtrykte gener (3,3 gener versus 5,3 gener) var lavere i cancerassocierede kromosomer end i de andre kromosomer. Det gennemsnitlige antal udskrifter anslået i hvert stærkt udtrykt gen var også lav i kræft-associerede kromosomer (54 versus 69 udskrifter pr hvert gen). De enkelte autosomer var grupperet i størrelsesordenen gen tætheder. Kromosomerne 2, 3, 4, 5, 8, 13 og 18 blev kategoriseret i lav-genet densitet gruppe på mindre end fem gener per 1 Mb segment. Kromosomerne 11, 16, 17, 19, 20 og 22 havde en høj tæthed af gener af mere end otte gener per 1 Mb segment. Følgelig af de otte cancerassocierede gener, der blev undersøgt, seks (kromosomer 3, 4, 5, 8, 13 og 18) tilhørte genet-fattige kromosomer, og de resterende to gener tilhørte mellem- (kromosomet 9 ) og høj (af kromosom 17) gen-density grupper. Kromosomerne 17 og 13 indeholdt høje og lave tætheder af gener (13,4 og 2,7 gener pr 1-Mb segment), hhv. Kromosom 17 udviste en høj frekvens af LOH i LOH-L (49%), men ikke i tilfælde LOH-B (13%). Hyppigheden af ​​kromosom 13 tab var ens i LOH-L (25%) og LOH-B-sager (27%). Tabel 2 Genet tæthed, stærkt udtrykte gener, og LOH niveau på individuelle kromosomer anslået i maven kræft og noncancerous væv

No. af gener pr en 1-Mb segment *
Top 100 højt udtrykte gener
(Antal udskrifter pr gen) *
Niveau af LOH (%) §




Baseline
(n = 15)
lav
(n = 65)
høj Hotel (n = 50)
Kræft-associerede kromosomer
3 fotos 4,9
3 (76)
1 (7)
18 (28)
28 (56)
4
3.6
5 (53)
2 (13)
12 (18)
33 (66)
5
4.4
4 (44)
0 (0)
14 (22)
37 (74)
8
4,1
3 (32)
0 (0)
9 (14)
21 (42)
9
5,2
4 (60)
1 (7)
15 (23)
34 (68)
13
2,7
2 (121)
4 (27)
16 (25)
37 (74)
17
13,4
5 (42)
2 (13)
32 (49)
43 (86)
18
3,2
0 (0)
1 (7)
18 (28)
36 (72)
Middelværdier
4,8
3.3 (54)
Andre kromosomer
1
7.7
8 (47)
2
4.7
9 (132)
6
5,8
7 (39)
7
5,2
6 (45)
10
5,0
2 ( 37)
11
8,9
9 (85)
12
7,3
10 (62)
14
5,3
6 (43)
15
5,3
2 (90)
16
8,6
3 (34)
19
19,8
8 (61)
20
8.3
2 (76)
21
5,1
1 (268)
22
8,4
1 (55)
Middelværdier
6,9
5.3 (69)
* antallet af udskrifter af 17,723 gener blev analyseret ved hjælp af de tidligere offentliggjorte oplysninger [21].
§The detaljer er beskrevet i materiale og metoder afsnittet.
relationer mellem de clinicopathologic funktioner og microsatellite genotyper
den 145 gastrisk kræft blev analyseret for forholdet mellem niveauet af LOH og clinicopathologic funktioner (tabel 3). Både LOH-H og LOH-B gastrisk kræft blev ofte forbundet med høj risiko fænotyper såsom lymfatisk invasion (P
= 0,006), venøs invasion (P
= 0,005), fremskredne stadier (P
< 0,0001), recidiv (P
= 0,023) og en dårlig overlevelse (P
< 0,0001), mens LOH-L og MSI gastrisk kræft blev korreleret med godt og moderat differentiering (P
= 0,033) og en tidlig tumor stadie (P
< 0,0001). De to genotyper relateret med høj risiko-fænotype var ulig i henhold til den anatomiske sted for forekomst og mønstret for tilbagefald. De LOH-H tilfælde ofte forekom i antrale del (70%) og de gik igen gennem hematogene spredning til leveren, lungerne og andre fjerntliggende organer (38%), såvel som ikke-hæmatogen metastase såsom peritoneal podning og kirtelinvolvering ( 36%). De fleste af LOH-B tilfælde var til stede i hjerte- og kropsdelen (94%), og de fik tilbagefald i den peritoneale kavitet (67%), snarere end i fjerntliggende organer (13%). Starten alder LOH-B (45 år) og LOH-H (65 år) tilfælde var signifikant forskellige (P
< 0,0001) .table 3 Forbindelsen mellem mikrosatellit genotyper og de clinicopathologic træk ved gastriske cancere
Karakteristik

Højrisiko-genotyper


lav risiko genotyper

P Drømmeholdet værdi

(%)
LOH H (%) *
LOH-B (%) *
P Drømmeholdet værdi
LOH-L (%) *
MSI (%) *
P Drømmeholdet værdi

No. af patient
145
50
15
65
15
Alder (år)
< 0,0001
0,038
0.710
Mean
61
65
45
60
67
SD
± 12,5
± 9,8
± 12,7
± 11,6
± 9,8
Sex
0,118
0,008
0,393
Mand
90 (62)
36 (72)
7 (47)
43 (66)
4 (27)
Female
55 (38)
14 (28)
8 (53)
22 (34)
11 (73)
Tumor størrelse
0,247
0,502
0,394
Mean
5,34
5,3
6,34
5,0
5.6
SD
± 2,94
± 2,62
± 3,77
± 3,10
± 2,33
Differentiering
0,052
0,094
0,033
Nå
11 (8)
3 (6)
8 (12)
Moderat
53 (36)
17 (34)
1 (7)
25 (39)
10 (67)
Poor
81 (56)
30 (60)
14 (93)
32 (49)
5 (33)
Tumor placering
< 0,0001
0,037
0,791
Cardia
13 (9)
3 (6)
4 (27)
6 (9)
Krop
50 ( 35)
12 (24)
10 (67)
26 (40)
2 (13)
antrum
82 (56)
35 (70)
1 (6)
33 (51)
13 (87)
Lauren klassifikation
< 0,0001
0,016
< 0,0001
Intestinal
58 (40)
19 (38)
0 (0)
35 (54)
4 (27)
Diffus
32 (22 )
9 (18)
15 (100)
8 (12)
0 (0)
Blandet
55 (38)
22 (44)
0 (0)
22 (34)
11 (73)
vækst mønster
0.600
< 0,0001
< 0,0001
Udvidelse
20 (14)
1 (2)
en (7)
9 (14)
9 (60)
infiltrativ
70 (48 )
32 (64)
10 (67)
28 (43)
Blandet
55 (38)
17 (34)
4 (26)
28 (43)
6 (40)
lymfatisk invasion
1,000
0,771
0,006
Ingen
44 (30)
9 (18)
3 (20)
34 (52)
5 (33)
Ja
101 (70)
41 (82)
12 (80)
31 (48)
10 (67)
Venøs invasion
0,351
0,113
0,005
Ingen
112 (77)
35 (70)
8 (53)
54 (83)
15 (100)
Ja
33 (23)
15 (30)
7 (47)
11 (17)
Tumor fase
0,757
0,763
< 0,0001
Tidlig
75 (52)
16 (32)
6 (40)
42 (65)
11 (73)
Avanceret
70 (48 )
34 (68)
9 (60)
23 (35)
4 (27)
Gentagelse
0,035
0,517
0,023
Ikke-

• Effekten af ​​lactulose på tolerance af gastrisk fodring i langsigtede intensive patienter
• Ændret ekspression af en formodet progenitorcelle markør DCAMKL1 i rotten maveslimhinden i regenerering, metaplasi og dysplasi