L'effet gène-réduction des pertes chromosomiques détectées dans cancers

gastrique L'effet gène-réduction des pertes chromosomiques détectées dans les cancers gastriques
Résumé de l'arrière-plan
Le niveau de perte d'hétérozygotie (LOH) qui réduit une dose de gène et exerce un effet nocif sur les cellules est connue pour être un paramètre pour l'organisation génétique des cancers gastriques. Cette étude a examiné si l'effet cellulaire indésirable induit par la réduction du gène a été un facteur de limitation de vitesse pour les événements LOH dans deux types histologiques distincts de cancers gastriques, les diffuse- et intestinaux-types.
Méthodes
Le anatomopathologique des échantillons obtenus à partir de 145 patients atteints de cancer gastrique ont été examinés pour le niveau de LOH en utilisant 40 marqueurs microsatellites sur huit chromosomes associés au cancer (3p, 4p, 5q, 8p, 9p, 13q, 17p et 18q).: Résultats
plus des chromosomes associés au cancer ont été trouvés appartenir aux chromosomes des gènes pauvres et contenir quelques gènes spécifiques estomac qui ont été fortement exprimés. Un LOH au niveau de la ligne de base comportant une ou aucun chromosome est fréquent dans les cancers gastriques de type diffus. Le chromosome 17 contenant une densité relativement élevée de gènes a été généralement perdue dans les cancers de type intestinal, mais pas dans les cancers de type diffus. Un haut niveau LOH impliquant quatre ou plusieurs chromosomes ont tendance à être fréquentes dans les cancers gastriques avec la différenciation intestinale et mixte. rechute de la maladie était commun pour les cancers gastriques avec LOH de haut niveau grâce à la fois le hématogène (38%) et (36%) des itinéraires non hématogènes, et pour les cas de LOH au niveau de référence par le biais de la route non hématogène (67%).
Conclusions
l'effet cellulaire défavorable de la réduction du gène est plus tolérés dans les cancers gastriques de type intestinal que dans les cancers de type diffus, et la perte de gènes à forte dose est associée à la métastase hématogène.
fond
cancers de l'estomac subissent hypermutations dans des séquences répétitives simples et les pertes chromosomiques déséquilibrés, et que ces altérations génétiques sont détectés comme une instabilité des microsatellites (MSI) et perte d'hétérozygotie (LOH), respectivement, en utilisant des marqueurs microsatellites hautement polymorphes [1-4]. Le comportement pathobiologique et le pronostic des cancers gastriques ont été associés au niveau de la LOH et la présence de MSI [3-6]. La profondeur de l'invasion et métastases ganglionnaires sont considérablement avancé dans les cas de petite taille cancers avec haut niveau LOH, et ces paramètres histologiques a tendance à être liée linéairement avec la taille du cancer pour les cas de LOH de bas niveau [7]. Étant donné qu'un seul génotype de microsatellites est pareillement détectée dans l'ensemble du tissu chirurgical, ainsi que l'échantillon de biopsie endoscopique [3, 7], il est possible de prédire la probabilité de rechute de la maladie et de déterminer la procédure de résection appropriée en fonction de l'analyse de microsatellites d'un prétraitement des tissus de biopsie.
l'hypothèse des deux résultats a proposé que la perte chromosomique et le résultat de la mutation ponctuelle dans l'inactivation biallélique des gènes suppresseurs de tumeur [8]. les pertes chromosomiques qui exercent un effet nuisible sur la croissance des cellules sont beaucoup moins tolérés que les gains chromosomiques et génétiques des deux résultats fournissent un avantage de croissance pourraient protéger les cellules souches cancéreuses d'événements de LOH létales [9, 10]. En outre, des études antérieures ont suggéré que les régions de gène de contrôle méthylés sont de moins en moins méthylée de manière niveau LOH dépendant des cancers gastriques [11, 12] par l'intermédiaire d'un mécanisme de compensation de dose qui maintient une dose de gènes ou la transcription au cours des cycles cellulaires ultérieures [9 ]. En ce qui concerne le mécanisme de compensation de dosage, le gain chromosomique et la déméthylation LOH associées peuvent résulter de réponses génétiques et épigénétiques dose de compensation à une réduction de la dose chromosomique [11-14]. Par conséquent, les événements LOH combinés avec un effet cellulaire indésirable et une réponse à la dose de compensation en plus de gène suppresseur de tumeur inactivation sont susceptibles de déterminer le comportement pathobiologique des cellules souches cancéreuses.
Cancers gastriques ont été classés en deux types histologiques distinctes , à savoir les diffuse- et intestinales types [15, 16]. cancers de type Diffuse sont fréquents chez les patients jeunes d'âge qui manquent une lésion précancéreuse, alors que les cancers de type intestinal sont fréquentes chez les patients âgés d'âge associés à la métaplasie intestinale précancéreuse qui ressemblent à des glandes intestinales [17]. En supposant que les cellules souches dérivées de la moelle s'adaptent à l'estomac tissu-environnement [18], les cellules souches nouvellement fixes, qui sont potentiellement non cohésive et invasive chez les individus jeunes, se développent en de type diffus cancer. les cancers de type intestinal sont fréquentes chez les vieux âge des patients qui ont l'adaptation à long terme des cellules souches nouvellement fixé à l'environnement du tissu gastrique. À cet égard, un événement LOH donné peut affecter des doses distinctes de transcription entre les cancers diffuse- et de type intestinal gastrique qui établissent des profils d'expression des gènes distincts.
Dans cette étude, les corrélations ont été faites entre les événements LOH et le comportement pathobiologique des cancers gastriques en termes d'effets sur les cellules-défavorables de la réduction du gène. Les huit chromosomes associés au cancer que nous avons examinés avaient une faible densité de gènes et pas de gènes spécifiques à l'estomac, ce qui pourrait entraîner un léger effet cellulaire nocif de LOH. Les événements LOH étaient fréquents dans les cancers gastriques de type intestinal, dans lequel la perte d'un chromosome affecterait une faible dose de transcription et exercer un effet cellulaire nocif doux.
Méthodes
sélection de cas
Cent et quarante-cinq patients atteints de cancer gastrique qui ont subi une résection chirurgicale curative entre Février 1996 et Juin 2003 ont été inclus dans cette étude. Les informations clinicopathologique et radiologic a été obtenue par l'examen des dossiers détaillés sur les patients. Cent seize cas ont été préalablement analysées par examen génétique multifocale des sites tumoraux hétérogènes [3]. Les 29 patients restants ont été examinés à l'aide d'un bloc de tissu unique de chaque tumeur.
Les lames microscopiques ont été examinés et un site de tumeur qui était représentative de la fonction histologiques a été choisi. Le type histologique du cancer gastrique a été défini comme intestinal (glandulaire, cohérente ou solide), diffuse et mélangé selon la classification de Lauren [15, 16] et le degré de différenciation a été classé selon la classification de l'OMS. Les localisations tumorales étaient considérés comme le cardia, le corps et l'antre. Le stade de la tumeur clinicopathologique a été déterminée selon les tumeurs-Node-Metastasis (TNM) critères [19]. La plupart des patients atteints de cancer gastrique (140 145, 97%) avaient subi une gastrectomie R0 et D2 ou lymphadénectomie plus étendu. Une moyenne globale de 28,6 (valeur médiane: 33), les ganglions lymphatiques ont été enlevés en même temps que l'échantillon. Aucun des patients ont reçu une chimiothérapie et la radiothérapie pré-opératoire.
Données de suivi sur la récidive et la survie
Une thérapie de combinaison de mitomycine intraveineuse, fluorouracil, et cytarabine (MFC), suivie par fluorouracil par voie orale a été administré en tant que norme traitement adjuvant postopératoire selon le jugement du médecin sur le pronostic global de chaque cas. Pendant la période de suivi, un examen physique, des tests de laboratoire, radiographie thoracique, échographie abdominale ou la tomodensitométrie, et gastrofiberscopy ont été effectuées tous les 3 ou 6 mois et de rechute de la maladie a été histologiquement confirmé, si possible. Lorsque plus d'un site de récurrence a été détecté au premier instant de l'échec, les récurrences individuels ont été comptés séparément. Le site de récurrence a été classé dans la métastase hématogène impliquant le poumon, le foie, ou d'autres organes éloignés, et les métastases non hématogène qui comprenait l'envahissement ganglionnaire et la diffusion péritonéale. cancers gastriques résiduels ont été exclus de l'analyse du motif de récurrence.
La durée de survie globale a été calculée à partir de la date de la résection chirurgicale jusqu'à ce que le jour du dernier contact de suivi ou de décès liés au cancer. Les données sur les patients qui sont morts d'autres causes ont été censurées au moment de la mort. L'analyse statistique a été réalisée en Avril 2007. La période moyenne de suivi de tous les patients survivants était de 40 mois (extrêmes: 5 à 96 mois) et a été complété par 98% des patients inscrits. Lors de l'analyse de survie, 50 patients étaient décédés à la suite de leurs cancers et 12 patients sont morts d'autres causes.
Microdissection tissulaire et amplification de l'ADN
Cinq série 7 sections um d'épaisseur de chaque embarqué paraffine fixés au formol échantillon de tissu ont été déparaffinées et brièvement colorées avec de l'hématoxyline et de l'éosine. Un seul foyer de cellules tumorales riche a été choisi par l'examen au microscope et une zone de tumeur allant de 5 mm à 7 mm de diamètre a été disséqués manuellement sous une loupe binoculaire (grossissement x 40) à l'aide d'un scalpel chirurgical. Les morceaux de tissu ont été examinées au microscope microdissection si le contenu de la cellule tumorale est > 70%, ce qui a été confirmé pour refléter une différence dans le contenu génétique entre les tissus normaux et tumoraux [3, 7].
Cellules tumorales environ 1000 microdissection ont été incubées dans 20 ul de tampon d'extraction d'ADN (0,5% de Tween-20 , EDTA 1 mM à pH 8,0, 50 mM de Tris pH 8,0, 0,5 mg /mL de proteinase K) à 37 ° C pendant 24 heures. Formaline fixe l'ADN des tissus enrobés de paraffine a tendance à être mal amplifié par PCR dans les échantillons plus âgés. La plupart des ADN ont été extraits dans les cinq ans après la préparation des échantillons pathologiques, ce qui assure la qualité de l'ADN pour la PCR. La quantité d'ADN, avec différentes qualités, du lysat de tissu a été déterminée en fonction de l'intensité de la bande de PCR avec 5-10 ng /ul de l'ADN, qui a été amplifié en utilisant un ensemble microsatellite d'amorce, D19S226
(avant: 5 ' - CCA GCA GAT TTT GGT GTT GTC TA - 3 ', à l'inverse: 5' - ACA GAG CCA GAG CCA GTA GGA GT - 3 '; taille de l'amplicon: 164 pb). L'amplification par PCR a été effectuée sous une condition de démarrage à chaud avec l'aide d'un radio-isotope (α- 32P dCTP, PerkinElmer, Boston, MA, USA) comme décrit précédemment [3, 7]. En bref, un total de 10 ul du mélange de PCR a subi 32 cycles d'une étape d'amplification en série qui est composée de 94 ° C pendant 50 secondes, une température d'hybridation spécifique de l'amorce pendant 50 s et 72 ° C pendant 1 min. Les séquences microsatellites radio-isotopes marqués ont été séparés sur un gel de Polyacrylamide à 6% contenant 7 M d'urée, et ils ont été visualisés par des expositions répétées de chaque autoradiogramme et à l'aide d'un scanner radioluminograph (BAS 2500, Fuji Photo Film Co. Ltd., Kanakawa, Japon) .
Analyse des allèles microsatellites
les lignes directrices pour la notation du statut de LOH et MSI ont été détaillées dans des études antérieures qui ont utilisé le même panel de marqueurs microsatellites [7]. Comme type des allèles microsatellites de référence, on a récupéré les marqueurs de répétition dinucléotidique allant de 88 pb à 247 pb en taille de l'amplicon et qui avaient une fréquence hétérozygote > 50%. Les marqueurs microsatellites hautement polymorphes sur 8 chromosomes associés au cancer (3p, 4p, 5q, 8p, 9p, 13q, 17p et 18q), qui souvent souffert de LOH dans cancer gastrique [3, 7, 20], ont été utilisés pour augmenter la nombre d'allèles hétérozygotes sur chaque bras (figure 1A). Les cinq marqueurs microsatellites sur chaque bras chromosomique a montré les bandes de PCR claires des allèles hétérozygotes, et étalonnés sur toute la longueur des huit chromosomes [3, 5]. Afin d'assurer la réduction chromosomique, la perte chromosomique a été attribué lors de l'événement impliqué LOH plus de deux marqueurs microsatellites sur un bras chromosomique [13]. Quarante paires d'amorces microsatellites ont été mélangés dans un total de 22 tubes de réaction et dont chacun contenait un (4 mélanges) ou deux (18 mélanges), des jeux d'amorces qui couvraient les amplicons de taille différente à la même température de recuit. Les bandes de microsatellites sans équivoque qui en résultent ont indiqué la grande spécificité de la condition PCR multiplex, ce qui était utile pour les petites quantités de tissus pathologiques microdissection. Figure 1 L'analyse de microsatellites à base de PCR (A) et la classification génétique des cancers gastriques (B). autoradiographies représentatives des échantillons qui ont été examinés par une analyse par PCR microsatellites (A) et la classification génétique des cancers gastriques intestinaux du type et de type diffus en fonction de la perte d'hétérozygotie (LOH) et l'instabilité des microsatellites (MSI) (B). (A) L'électrophorèse sur gel de gauche montre à haute fréquence MSI à plus de 40% des 15 marqueurs homozygotes. L'électrophorèse sur gel de droite montre de haut niveau LOH impliquant les chromosomes 3p, 4p, 5q, 9p, 13q, 17p et 18q. La normale (N) et de la tumeur correspondante (T) ADN sont indiqués au-dessus de chaque bande allélique. L'astérisque indique MSI et LOH. L'ADN génomique microdissection à partir de tissus de paraffine fixés au formol noyé a été amplifié et marqué par [α-32P] dCTP dans l'état de démarrage à chaud de la PCR multiplex. Un total de 80 amplicons microsatellites de chaque échantillon ont été exécutés simultanément sur deux gels de séquençage. (B) À l'aide d'un panel de 40 marqueurs microsatellites sur huit chromosomes associés au cancer, LOH a été interprété aux marqueurs hétérozygotes si 40% ou moins des marqueurs homozygotes expose MSI. L'ampleur des pertes chromosomiques, comme marqué en fonction du nombre de chromosomes LOH-positifs, a été divisé en haut niveau (LOH-H) et bas niveau (LOH-L) des pertes tant pour l'intestin et diffus types. Dans les cas de cancers gastriques de type diffus, zéro ou un chromosomique perte a été classé dans le niveau de base (LOH-B).
Basé sur la même classification des génotypes microsatellites qui a été appliqué dans l'étude précédente (figure 1B) [ ,,,0],7], les profils alléliques des 40 marqueurs microsatellites ont été analysés pour MSI aux marqueurs homozygotes qui a montré quelques bandes d'ombre ou de bégaiement dans une paire d'ADN normaux et tumoraux. Parce que MSI obscurcit l'état allélique hétérozygote, les profils alléliques des 40 séquences microsatellites ont d'abord été analysés pour MSI aux marqueurs homozygotes. Le statut LOH a été déterminée sur la base de la perte allélique dans le marqueur hétérozygote (figure 1B). L'ampleur des pertes chromosomiques dans chaque cas a été marqué en fonction du nombre des pertes chromosomiques constitutionnelles impliquant plus d'un microsatellite allèle
. Analyse des in-silico
données pour la densité de gènes et la transcription des chromosomes individuels
A total de 17,723 gènes de référence identifiés dans une base de données publique (http:.. //génome UCSC edu /, Mars 2006 assemblage) [21] ont été analysées pour calculer le nombre de gènes par 1 Mb nucléotides segment. analyse sérielle d'expression génique (SAGE) les données de la muqueuse gastrique normale a été obtenue à partir d'une base de données publique (http:.... //www NCBI nlm nih gov /geo /, "SAGE_Stomach_normal_B_antrum"). L'activité de transcription des gènes individuels a été calculée en combinant la carte du gène de référence et les étiquettes de gènes exprimés. Sur la base d'une comparaison entre la puce et les données SAGE évaluant les profils d'expression de gène, le nombre de transcrits comptées dans les données SAGE a été trouvé à estimer avec précision une grande différence dans l'activité des gènes entre les gènes spécifiques de l'estomac et des gènes d'entretien [21].
analyse statistique
test exact de Fisher et χ
2 tests ont été utilisés pour comparer les caractéristiques clinico-pathologiques avec le génotype microsatellite des cancers gastriques. courbes de probabilité ont été calculées selon la méthode de Kaplan-Meier et comparées en utilisant le test du log-rank. L'analyse multivariée a été réalisée par la méthode des risques proportionnels de Cox avec l'aide de procédures pas à pas. Les valeurs de probabilité étaient deux à queue, avec une valeur P
moins de 0,05 étant considérée comme statistiquement significative. Le progiciel statistique SPSS 11.0 (SPSS Inc., Chicago, IL, USA) a été utilisé pour l'analyse des données.: Résultats
Analyse des événements LOH dans les cancers gastriques
La plupart des cancers gastriques (116 sur 145 cas) ont été examinés dans une analyse multifocale précédente sur les sites tumoraux hétérogènes à partir d'un cancer gastrique donnée [3]. Quatre-vingt cinq pour cent des cancers gastriques examinés ont été trouvés à avoir soit un niveau similaire de LOH ou MSI communément partagée par les sites tumoraux hétérogènes et chaque cancer de l'estomac a été divisée en un seul génotype microsatellite, et non un génotype mixte. Les génotypes microsatellites des 27 autres cas ont été notés en fonction du niveau de LOH et la présence de MSI, qui ont été détectés dans une pièce de tissu unique contenant un composant histologique représentatif. Le plus Chaque perte chromosomique a été corrélée avec les paramètres clinico-pathologiques de la les cancers gastriques (voir le tableau 1). La plupart des pertes chromosomiques (4p, 5q, 9p, 13q, 17p et 18q) ont été associés à la maladie d'apparition tardive (P
< 0,05). Deux ou plusieurs pertes chromosomiques ont été en même temps liées à l'emplacement antrale (9p et 18q pertes), l'intestin ou de type mixte histologie (5q, 17p et 18q pertes), et un faible taux de survie (3p, 9p et 13q pertes) (P
< 0,05). La perte de 17p est le plus fréquent dans les cancers de type intestinal (67%). La perte 13q était plus fréquente dans les cancers de type diffus (47%). Tableau 1 Rapports des caractéristiques clinico-pathologiques et seule perte chromosomique
Caractéristiques

3p perte perte
4p
perte de 5q perte
de 8p
9p perte
13q perte
17p perte perte
de 18q
No. de 130
47
47
51
30
50
57
77
55
Age patients
moyenne
60
61
63
63
63
64
63
63
63
± SD
± 12,60
± 10,18
± 10,49
± 9,28 ± 10,24

± 10,28
± 10,43
± 10,94
± 11,20
P
0,290
0,029
0,014
0,102
0,003
0,030
< 0,0001
0,030
Sex
Homme
86
37
34
36
18
37
42
52
36
Femme
44
10
13
15
12
13
15
25
19
P
0,033
0,335
0,450
0,510
0,182
0,136
0,710
1.000
localisation de la tumeur
Cardia
13 4
3
5 1
2
5
8 3
Body
48
16
16
13
10
14
16
24
16
Antrum
69
27
28
33
19
34
36
45
36
P
0,743
0,424
0,078
0,267
0,018
0,119
0,253
0,043
histologiques Type
Intestinal
54
19
19
23
13
22
20
36
27
diffuse
32
9
9
6
5 8
15
11
7
Mixed 44
19
19
22
12
20
22
30
21
P
0,395
0,395
0,018
0,480
0,176
0,404
0,004
0,026
taille de la tumeur
moyenne
5.3
5.8
5.1
4.9
5.1
4.9
5.7
5.2
5.5
± SD
± 3.01 ± 2.86

± 2,64 ± 2,29

± 2,42 ± 2,73

± 3.02 ± 2.86

± 3.13
P
0,129
0,631
0,131
0,705
0,181
0,179
0,564
0,483
Stage
I & II
64
20
21
20
14
22
21
36
24
III & IV
66
27
26
31
16
28
36
41
31
P
0,277
0,469
0,075
0,836
0,372
0,014
0,593
0,292
Récurrence
péritonéale
24
10
9
8
5
10
12
16
11
ganglionnaire
10
4 3
3 2
5 <22
13
11
14 8
11
14
15 de
br> 4
6 3
hématogène 56
27
23
25
15
26
30
37
24
P 10
total

0,422
0,507
0,070
0,428
0,826
0,415
0,899
0,663 statut
Vital
119
42
41
47
29
44
51
68
48
Vivant
70
19
21
26
16
20 <49
23
20
21
13
24
27
32 de
br> 24
36
27
Morte 21
P
0,021
0,152
0.330
0,402
0,019
0,019
0,094
0,389
P
valeurs inférieures 0,05 sont indiquées en caractères gras impression.
une grande partie (52%) des cancers gastriques de type diffus avaient un ou pas de pertes chromosomiques qui ont été classées dans une LOH au niveau de référence (LOH-B), parce que la plupart de l'intestin -et cancers mixtes de type (86%) a eu deux ou plusieurs pertes chromosomiques (figure 2) [7]. Les cas de LOH de haut niveau avec quatre ou plus de pertes chromosomiques étaient plus fréquentes dans les cas de différenciation mixtes avec les deux cancers gastriques intestinal- et de type diffus (44%). Dans l'ensemble, 15 LOH-B (10%), 65 LOH-L (45%), 50 LOH-H (35%), et 15 MSI (10%) cas ont été identifiés dans les 145 échantillons chirurgicaux. Figure 2 Les relations entre le type histologique et non. des pertes chromosomiques dans les cancers gastriques. Le type histologique du cancer gastrique a été défini comme le diffuse- (n = 32, box fermé), intestinal- (n = 54, boîte grise), et mixtes-types (n = 44, boîte ouverte), selon la classification de Lauren.
Analyse de la densité du gène et les gènes fortement exprimés sur les chromosomes associés au cancer
la densité de gènes par 1 Mb segment, les 100 meilleurs gènes actifs qui ont été fortement exprimés dans l'estomac, et la fréquence de la LOH génotypes détectés dans les cancers gastriques ont été analysés sur chaque chromosome (tableau 2). En comparaison des huit chromosomes associés au cancer examinés et les 14 chromosomes restants, la densité des gènes (4,8 gènes contre 6,9 ​​gènes par 1 Mb segments) et le nombre moyen des gènes fortement exprimés (3,3 gènes contre 5,3 gènes) étaient inférieur dans les chromosomes associés au cancer que dans les autres chromosomes. Le nombre moyen de transcriptions estimées dans chaque gène fortement exprimé était également faible dans les chromosomes associés au cancer (54 contre 69 transcriptions par chaque gène). Les autosomes individuels ont été regroupés dans l'ordre des densités de gènes. Les chromosomes 2, 3, 4, 5, 8, 13 et 18 ont été classés dans le groupe à faible gène densité de moins de cinq gènes par segment 1 Mb. Les chromosomes 11, 16, 17, 19, 20 et 22 ont une densité élevée de gènes de plus de huit gènes par segment 1 Mb. Par conséquent, des huit gènes associés au cancer qui ont été examinés, six (chromosomes 3, 4, 5, 8, 13 et 18) appartenaient aux chromosomes des gènes pauvres, et les deux gènes restants appartenaient à la moyenne activité (le chromosome 9 ) et haute (les chromosomes des groupes 17) gène densité. Les chromosomes 17 et 13 contenaient des densités élevées et faibles de gènes (13,4 et 2,7 gènes par segment 1 Mb), respectivement. Chromosome 17 a montré une fréquence élevée de LOH dans le LOH-L (49%), mais pas dans les cas LOH-B (13%). La fréquence du chromosome 13 perte était similaire dans la LOH-L (25%) et le cas LOH-B (27%). Tableau 2, la densité des gènes, des gènes fortement exprimés, et le niveau de LOH sur les chromosomes individuels estimés dans l'estomac cancéreux et les tissus non cancéreux

No. de gènes par un segment de 1 Mb * (n o de transcrits par gène) *
Niveau de LOH (en%) §

Top 100 gènes fortement exprimés de>


(n = 15)
Low
(n = 65)
haut de base
(n = 50)
chromosomes
cancer associés 3
4.9
3 (76)
1 (7)
18 (28)
28 (56) 4
3.6
5 (53)
2 (13)
12 (18)
33 (66)
5
4.4
4 (44)
0 (0)
14 (22)
37 (74) 8
4.1
3 (32)
0 (0)
9 (14)
21 (42)
9
5.2
4 (60)
1 (7)
15 (23)
34 (68)
13
2,7
2 (121)
4 (27)
16 (25)
37 (74)
17
13,4
5 (42)
2 (13)
32 (49)
43 (86)
18
3.2
0 (0)
1 (7)
18 (28)
36 (72)
valeurs moyennes
4,8
3,3 (54)
Autres chromosomes 1
7.7
8 (47) 2
4.7
9 (132)
6
5.8
7 (39)
7
5.2
6 (45)
10
5.0
2 ( 37)
11
8.9
9 (85)
12
7.3
10 (62)
14
5.3
6 (43)
15
5.3
2 (90)
16
8.6
3 (34)
19
19,8
8 (61)
20
8.3
2 (76)
21
5.1
1 (268)
22
8.4
1 (55)
valeurs moyennes
6.9
5.3 (69)
* le nombre de transcriptions des 17,723 gènes a été analysée en utilisant les données publiées précédemment [21].
§Les détails sont décrits dans la section matériel et méthodes.
les relations entre les caractéristiques clinicopathologiques et la génotypes microsatellites
les cancers gastriques 145 ont été analysés pour les relations entre le niveau de LOH et les caractéristiques clinico (tableau 3). Les deux cancers gastriques LOH-H et LOH-B ont été souvent associés à des phénotypes à haut risque tels que l'invasion lymphatique (P
= 0,006), invasion veineuse (P
= 0,005), des stades avancés (P
< 0,0001), récurrence (P = 0,023
) et un faible taux de survie (P
< 0,0001), tandis que la LOH-l et les cancers gastriques MSI ont été corrélés avec le bien et la différenciation modérée (P
= 0,033) et un stade précoce des tumeurs (P
< 0,0001). Les deux génotypes associés à un risque élevé-phénotype étaient dissemblables selon le site anatomique de l'événement et le modèle de récurrence. Les cas LOH-H souvent eu lieu dans la partie antrale (70%) et ils sont réapparus à travers hématogène propagation vers le foie, les poumons et d'autres organes éloignés (38%), ainsi que des métastases non hématogène telles que l'ensemencement péritonéale et envahissement ganglionnaire ( 36%). La plupart des cas LOH-B étaient présents dans la cardiaque et la partie de corps (94%) et ils ont rechuté dans la cavité péritonéale (67%), plutôt que dans des organes distants (13%). L'âge de début de la LOH-B (45 ans) et LOH-H (65 ans) des cas était significativement différent (P
< 0,0001) .Table 3 Les relations entre les génotypes microsatellites et les caractéristiques clinico-pathologiques des cancers gastriques
Caractéristiques

génotypes à haut risque


génotypes à faible risque

P valeur

(%)
LOH -H (%) *
LOH-B (%) *
P
valeur
LOH-L (%) *
MSI (%) *
P
valeur

No. des patients
145
50
15
65
15
Age (année)
< 0,0001
0,038
0,710
Mean
61
65
45
60
67
SD
± 12,5 ± 9,8

± 12,7
± 11,6
± 9,8
Sex
0,118
0,008
0,393
Homme
90 (62)
36 (72)
7 (47)
43 (66)
4 (27)
55 (38) de Femme
14 (28)
8 (53)
22 (34)
11 (73)
taille de la tumeur
0,247
0,502
0,394
Mean
5,34
5.3
6,34
5.0
5.6
SD
± 2,94 ± 2,62

± 3.77 ± 3.10

± 2,33
Différenciation
0,052
0,094
0,033
Eh bien
11 (8)
3 (6)
8 (12)
Modéré
53 (36)
17 (34)
1 (7)
25 (39)
10 81 (56)
30 (60)
14 (93)
32 (49)
5 (33)
emplacement de la tumeur
(67)
pauvres
< 0,0001
0,037
0,791
Cardia
13 (9)
3 (6)
4 (27)
6 (9)
Body
50 ( 35)
12 (24)
10 (67)
26 (40)
2 (13)
Antrum
82 (56)
35 (70)
1 (6)
33 (51)
13 (87)
classification Lauren
< 0,0001
0,016
< 0,0001
Intestinal
58 (40)
19 (38)
0 (0)
35 (54)
4 (27)
Diffuse
32 (22 )
9 (18)
15 (100)
8 (12)
0 (0)
Mixed 55 (38)
22 (44)
0 (0)
22 (34)
11 (73)
modèle de croissance
0.600
< 0,0001
< 0,0001
Expanding
20 (14)
1 (2)
1 (7)
9 (14)
9 (60)
Infiltrative
70 (48 )
32 (64)
10 (67)
28 (43)
mixte 55 (38)
17 (34)
4 (26)
28 (43)
6 (40)
lymphatique invasion
1.000
0,771
0,006
No
44 (30)
9 (18)
3 (20)
34 (52)
5 (33)
Oui
101 (70)
41 (82)
12 (80)
31 (48)
10 (67)
invasion Venous
0,351
0,113
0,005
Non
112 (77)
35 (70)
8 (53)
54 (83)
15 (100)
Oui
33 (23)
15 (30)
7 (47)
11 (17)
stade de la tumeur
0,757
0,763
< 0,0001
Early 75 (52)
16 (32)
6 (40)
42 (65)
11 (73)
avancée
70 (48 )
34 (68)
9 (60)
23 (35)
4 (27)
Récurrence
0,035
0,517
0,023
Non-

• L'effet de lactulose sur la tolérance de l'alimentation gastrique en réanimation à long terme patients
• une expression altérée d'une cellule progénitrice putatif marqueur DCAMKL1 dans la muqueuse gastrique du rat dans la régénération, la métaplasie et la dysplasie