PLoS ONE: MDM2 SNP309 rs2279744 Polimorfizam i rak želuca rizika: Meta-Analysis

Sažetak pregled

Pozadina pregled

MDM2 je glavni negativni regulator p53, i polimorfizam jednog nukleotida (SNP) u MDM2 pregled promotorska regija SNP309 je pokazao da je povezan s povećanim MDM2 pregled izražavanja i znatno ranijoj dobi od pojave nekih tumora, uključujući rak želuca. Nekoliko studija objavljeni su procijeniti povezanost između SNP309 i želučane rizik od raka. Međutim, rezultati ostaju u konfliktu nego uvjerljivi. Pregled

Cilj pregled

Cilj ovog istraživanja bio je utvrditi povezanost između MDM2 pregled SNP309 polimorfizam i želuca rizika.

Metode

Izvršili smo meta-analizu da istraži taj odnos. Tečajevi omjera (OR) i 95% intervali pouzdanosti (CIS) korišteni su za procjenu snagu udruge. Sakupljene ORS je provedena za kodominantni model dominantnog modela i recesivnim modelom, respektivno. Pregled

Rezultati pregled

identificirano je pet objavljenih case-control studije, uključujući 1,621 slučajeva rak želuca i 2,639 kontrola. Otkrili smo da je MDM2 pregled SNP309 polimorfizma je povezan sa značajno povećanim rizikom od rizika od raka želuca, kada sve studije su sakupljene u meta-analizi (GG u odnosu na TT, OR = 1,54; 95% CI = 1.04-2.29 i GG u odnosu na GT /TT, OR = 1,49, 95% CI = 1,30-1,72). Nadalje, Egger test nije pokazao nikakve dokaze objave pristranosti ( P pregled = 0,799 za GG u odnosu na TT). Pregled

Zaključak

Naši rezultati sugeriraju da je MDM2 pregled SNP309 polimorfizam može biti niska penetrirati faktor rizika za razvoj karcinoma želuca pregled

Izvor:. Ma Y, Bian J, Cao H (2013) MDM2 pregled SNP309 rs2279744 polimorfizam i Rak želuca rizika: meta-analiza. PLoS ONE 8 (2): e56918. doi: 10,1371 /journal.pone.0056918 pregled

Urednik: Hiromu Suzuki, Sapporo Medicinski fakultet, Japan pregled

Primljeno: 14. studenog 2012; Prihvaćeno: 15. siječnja 2013. godine; Objavljeno: 25 veljača 2013 pregled

Copyright: © 2013 Ma et al. Ovo je otvorenog pristupa članak distribuirati pod uvjetima Creative Commons Imenovanje License, koja omogućuje neograničeno korištenje, distribuciju i reprodukciju u bilo kojem mediju, pod uvjetom da je izvorni autor i izvor su zaslužan

financiranja. Autori nemaju sredstava ili potporu izvješću pregled

suprotstavljenih interesa.. autori su izjavili da ne postoje suprotstavljeni interesi pregled

Uvod pregled

rak želuca je četvrti najčešće dijagnosticiran rak i drugi vodeći uzrok smrti od raka u svijetu [1]. Kao drugih složenih bolesti, raka želuca je složeno svojstvo uzrokovane obje genetičkih i okolišnih čimbenika [2]. Veliki broj epidemioloških studija potvrdili su efekti niske potrošnje svježeg voća i povrća, i visoku potrošnju slane hrane, pušenje i Helicobacter pylori pregled ( H. Pylori pregled) infekcija na razvoj karcinoma želuca. [3] Osim gore navedenih vanjskih faktora, genetski polimorfizmi u procesima kancerogen detoksikacija, antioksidans za zaštitu, popravka DNA i proliferaciju stanica su također ključni u razvoju raka želuca [4], [5]. Tumor supresor p53 je glavni posrednik mnoge stanične funkcije, uključujući staničnog ciklusa, apoptozu, inhibicije angiogeneze i staničnu starenjem [6]. Somatske mutacije koje deaktiviraju gen p53 su pronađeni u najmanje polovice svih ljudskih solidnih tumora, naglašavajući ključnu ulogu p53 proteina u procesu karcinogeneze [7]. MDM2 je ključni negativni regulator p53 kroz nekoliko mehanizama. MDM2 izravno veže na p53, što rezultira inhibicijom p53 transaktivacijskog djelovanja. [8] MDM2 također djeluje kao ubikvitina proteina ligaze i kontrola p53 ga ciljanje za razgradnju putem proteasoma [9] pregled

polimorfizma jednostrukog nukleotida u MDM2 pregled, promotora, SNP309 T >. G (rs2279744), identificiran [10], a pokazalo se da rezultirati pojačanom ekspresijom MDM2 pregled, RNA i proteina. Također se pokazalo da je povećana razina MDM2 pregled je posredovana i ovisna o faktora transkripcije SP1. Zanimljivo je da je pojačanje MDM2 pregled jedino može poboljšati tumorigenezi [11], što otvara mogućnost da se G alel SNP309 mogu predstavljati rak predisponirajući alel u svojem vlastitom pravu. Pregled

Nedavno, jedan broj studije su izvijestili o ulozi MDM2 pregled polimorfizma SNP309 rizika od raka želuca, ali rezultati su neuvjerljivi, djelomično zbog mogućeg mali učinak polimorfizma na rak želuca i relativno male veličine u svakom od objavljenih studija , Dakle, proveli smo meta-analizu po svim studijama case-control koji ispunjavaju uvjete za procjenu ukupne želučane rizik od raka MDM2 pregled SNP309 polimorfizma kao i kvantificirati između-studija heterogenost i potencijalnu pristranost. Pregled

Materijali i metode pregled

Identifikacija i prihvatljivosti relevantnih studija pregled

tražili smo elektroničku književnost PubMed i EMBASE za sve relevantne članke (zadnje tražili nadogradnja je 10. kolovoz 2012, koristeći pretragu izrazi " MDM
2", "polimorfizam" i "rak želuca"). Potraga je bila ograničena na engleskom jeziku radova. Dodatne studije su identificirali pretraživanje ruka referenci originalnih studija. Od studija s istim ili preklapanja podataka objavljenih od strane istih istražiteljima, odabrali smo najnovije one s najvećim brojem predmeta. Studije uključeni u našoj meta-analize moraju ispunjavati sljedeće uvjete: (a) procjena MDM2 pregled SNP309 polimorfizam i želuca smanjuje rizik od raka, (b) koristiti case-control dizajn, i (c) imati na raspolaganju genotip frekvencije za pacijente i za kontrolu populacije. pregled

Podaci za ekstrakciju pregled

Dva istraživača neovisno ekstrahira podatke i postiglo konsenzus o svim stavkama. Za svakog istraživanja, smatra se sljedeći podaci: ime i prezime autora, godinu izdanja, zemlja studija, etničke pripadnosti, a broj genotipiziran slučajevima i kontrole. Različite etničke nizbrdica su kategorizirani kao europske i azijske. Pregled

Statistička analiza pregled

Sirove omjeri vjerojatnosti (OR) s 95% intervala pouzdanosti (CI) korišteni su za procjenu snagu povezanosti između MDM2 pregled SNP309 polimorfizma i želučane rizik od raka. Sakupljene ORS je provedena za kodominantni modela (GG u odnosu na TT, GT naspram TT), dominantnog modela (GG /GT naspram TT) i recesivnog modela (GG vs GT /TT), respektivno. S obzirom na mogućnost heterogenosti preko studija, statistički test za heterogenosti provedena je na temelju statističkih Q [12]. Ako je P izvoznici > 0,05 Q-testa koji ukazuje na manjak heterogenosti među studijama, sažetak ili procjena svake studije je izračunata modelu fiksne efekte (Mantel-Haenszel metoda). Inače, korišten je model slučajnih učinaka (The DerSimonian i Laird metoda). Analize osjetljivosti provedena su za procjenu stabilnosti rezultata, naime, jedna studija u meta-analize je izbrisan svaki put odražavaju utjecaj pojedinih skup podataka na skupljeni OR. Tokovima parcele i Egger je linearna regresija ispitivanje su korišteni kako bi dijagnozu potencijalne pristranosti objave. Sve analize su učinili s Stata softvera (verzija 8.2; StataCorp LP, College Station, TX), koristeći dvostrani P
vrijednosti pregled

Rezultati

Karakteristike studija <. br>

bilo je 47 objavljenih radova relevantne uvjete za pretraživanje (sl. 1). Kroz koraku screening naslov, 37 od tih spisa bili su isključeni (7 nisu bili na karcinoma želuca, 2 su mišljenja, a 28 nisu bili polimorfizam). Sažetak iz 10 radova su pregledani i bili su isključeni tri dodatna istraživanja, ostavljajući sedam studija za punu objave pregled. Od tih, dva članka su isključeni (jedan je bio pregled, a jedan nije bio case-control studija). Ukupno pet prihvatljivih studijama koje uključuju 1,621 slučajeva i 2,639 kontrole su uključene u Sakupljene analize [13], [14], [15], [16], [17]. Karakteristike prihvatljivih studije su prikazani u tablici 1. Ti pet studije bili su azijske potomstvo. Želučani karcinom je potvrđeno histološki ili patološki u većini studija. Klasični polimeraza lančanoj polimorfizam duljine restrikcijskih odsječaka Reakcijska-test je izveden u svim studijama. Raspodjela genotipova u kontrolama svakog istraživanja bio u dogovoru s Hardy-Weinberg ravnoteže, osim jednoj studiji [13]. Pregled

Glavni rezultati

Kao što je prikazano u tablici 2, varijanta homozigot GG bio je povezan sa značajno povećanim rizikom od raka želuca, u usporedbi s divljim tipom homozigot TT (OR = 1,54; 95% CI = 1,04-2,29, sl. 2). Nadalje, MDM2 pregled SNP309 polimorfizma je povezan sa značajno povećanim rizikom od raka želuca u recesivnim modelom (GG u odnosu na GT /TT, OR = 1,49, 95% CI = 1.30-1.72), ali ne u prevladavajući model (GG /GT u odnosu na TT, OR = 1,18, 95% CI = 0.84-1.65). pregled

heterogenost i analize osjetljivosti pregled

Značajna heterogenost između studija uočen je u cjelokupnoj usporedbi osim recesivno modela ( P pregled _{heterogenost = 0,073 za GG u odnosu na GT /TT). Analiza Utjecaj izvršena je procijeniti utjecaj svake pojedine studije na skupna ili sekvencijalnom uklanjanje pojedinih studija. Rezultati su pokazali da nijedan pojedinac studija značajno utječu na udružuje ORS (Sl. 3). Pregled}

pristranost Objava pregled

Begg je dimnjak zemljište i Egger-a test je procijeniti pristranost objavljivanja književnosti. Oblici lijevka parcela nije otkrila nikakve dokaze očitog asimetrije u svim modelima usporedbu. Zatim, Egger-ov test je korišten za pružanje statističke dokaze lijevak zemljište simetrije. Rezultati još uvijek nisu pokazali nikakav dokaz objave pristranosti (t = -0,28, P pregled = 0,799 za GG u odnosu na TT, sl. 4). Pregled

Rasprava pregled

prethodna studija ima proturječne rezultate o povezanosti između MDM
2 SNP309 polimorfizma i rizik od raka želuca, koji bi mogli biti pod utjecajem relativno male veličine uzorka i različitog genetskog podrijetla. Ohmiya et al. [13] i Yang et al. [14] izvijestili da su osobe s varijantom G alela u MDM2 pregled SNP309 polimorfizma imali povećani rizik od raka želuca. S obzirom na važnu ulogu MDM2 u regulaciji p53, to je biološki moguće da MDM2 pregled polimorfizam može modulirati rizik od raka želuca. MDM2 pregled SNP309 polimorfizma povećava afinitet SP1 za MDM2 pregled, promotor i uzrokuje izražajnost MDM2 Netlogu. U skladu s tim, stanične linije s SNP309 GG i TG genotipova izrazio višu razinu MDM2 Netlogu od onih s TT genotipova [10]. Međutim, Cho i sur. pokazala je da nema povezanosti između MDM2 pregled SNP309 polimorfizam i rak želuca rizik [15]. Meta-analiza je snažan način za rješavanje nije u skladu nalaz s relativno velikim brojem predmeta. Kako bi se riješio taj sukob, meta-analiza pet studija koje uključuju 1,621 slučajeva i 2,639 kontrola je provedena izvesti precizniju procjenu udruge. Naši rezultati pokazuju da je MDM2 pregled SNP309 polimorfizam povezan sa znatno povećanim rizikom od raka želuca. Pregled

Malo ograničenja ove meta-analize treba rješavati. Prvo, misclassifications o statusu bolesti i genotipova mogu utjecati na rezultate, jer su slučajevi u nekoliko studija nije potvrdila patologije ili drugog zlata standardnom metodom, a kontrola kvalitete genotipa također nije dobro dokumentirana u nekim studijama. Drugo, selekcijske pristranosti mogao imati igrao ulogu jer je distribucija genotipova ovog polimorfizma među kontrolnih ispitanika odstupilo od Hardy-Weinberg ravnoteže u jednoj studiji [13], a sve kontrole su iz bolnice koje ne može biti predstavnik u općoj populaciji , Treće, naši rezultati su na temelju neusklađeni procjenama, dok je preciznija analiza treba biti provedena ako pojedinačni podaci bili dostupni, što bi omogućilo podešavanje od strane drugih co-varijanti, uključujući i okolišnih čimbenika i drugih načina života. Pregled

unatoč tim, naša meta-analiza je također imao neke prednosti. Prvo, iako je broj studija uključenih u meta-analize je relativno mali broj od ukupnog broja slučajeva i kontrola bila znatna, što značajno povećava statističku snagu analize. Drugo, kvaliteta case-control studija uključenih u trenutnoj meta-analize bio je zadovoljavajući i susreo se naš kriterij uključivanja. Treće, nismo otkrili nikakav objavljivanje pristranost naznačeno da se cijela skupna rezultat bi trebao biti nepristran. Pregled

Ukratko, ova meta-analiza pruža dokaze o povezanosti MDM2 pregled SNP309 polimorfizma i raka želuca rizika, podupire hipotezu da polimorfizam SNP309 može biti niske pojavnosti osjetljivost biljeg karcinoma želuca. Međutim, velike studije uzorak se opravdano mogli potvrditi svoje nalaze. Štoviše, sve više gena gena i gena okoliš interakcije također treba uzeti u obzir buduće analize, što bi trebalo dovesti do bolje, sveobuhvatno razumijevanje povezanosti između MDM2 pregled SNP309 polimorfizma i želuca rizik od raka. Pregled