De abstracte
Achtergrond
MDM2 is een belangrijke negatieve regulator van p53, en een single nucleotide polymorfisme (SNP) in de MDM2 Het doel van dit onderzoek was om de relatie tussen beoordelen van de MDM2 Methods We voerden een meta-analyse om deze relatie te onderzoeken. Odds ratio (OR's) en 95% betrouwbaarheidsintervallen (CI) werden gebruikt om de sterkte van de associatie beoordelen. De gepoolde OR's werden uitgevoerd voor codominant model, dominant model, en recessief model, respectievelijk. Vijf gepubliceerde case-control studies, met inbegrip van 1621 maagkanker gevallen en 2639 controles werden geïdentificeerd. We vonden dat de MDM2 Onze resultaten suggereren dat de MDM2 Visum:. Ma Y, Bian J, Cao H (2013) MDM2 Editor: Hiromu Suzuki, Sapporo Medical University, Japan Ontvangen: 14 november 2012; Aanvaard: 15 januari 2013; Gepubliceerd: 25 februari 2013 Copyright: © 2013 Ma et al. Dit is een open-access artikel gedistribueerd onder de voorwaarden van de Creative Commons Attribution License, die onbeperkt gebruik, distributie en reproductie maakt in elk medium, op voorwaarde dat de oorspronkelijke auteur en de bron worden gecrediteerd Financiering:. De auteurs hebben geen financiering of ondersteuning op het verslag Competing belangen:.. de auteurs hebben verklaard dat er geen tegenstrijdige belangen bestaan Introductie Maagkanker is de vierde meest voorkomende kanker gediagnosticeerd en de tweede belangrijke oorzaak van kanker overlijden wereldwijd [1]. Zoals andere complexe ziekten, maagkanker is complex kenmerk veroorzaakt door zowel genetische en omgevingsfactoren [2]. Een groot aantal epidemiologische studies hebben de effecten van een lage consumptie van verse groenten en fruit, hoge consumptie van zout voedsel, roken bevestigd, en Helicobacter pylori Een single nucleotide polymorfisme in de MDM2 Onlangs heeft een aantal studies hebben de rol van gerapporteerde MDM2 Materialen en methoden Identificatie en in aanmerking komen van relevante studies We zochten de elektronische literatuur PubMed en Embase voor alle relevante artikelen (de laatste zoekopdracht update met 10 augustus 2012, met behulp van de zoekopdracht termen " MDM data-extractie Twee onderzoekers onafhankelijk van elkaar gehaald de gegevens en bereikte consensus op alle punten. Voor elk onderzoek werden de volgende gegevens beschouwd: naam van de auteur, jaar van uitgave, het land van de studie, etniciteit, en het aantal gegenotypeerd gevallen en controles. Verschillende etnische afdalingen werden gecategoriseerd als Europese en Aziatische. Ruwe odds ratio's (OR's) met 95% betrouwbaarheidsintervallen (CI's) werden gebruikt om de sterkte van de associatie tussen de MDM2 Resultaten Kenmerken van Studies <. br> Er waren 47 gepubliceerde artikelen aan de zoektermen (afb. 1) relevant. Door de stap van het screenen van de titel, 37 van deze literatuur werden uitgesloten (7 niet op maagkanker, 2 waren beoordelingen, en 28 waren niet polymorphisms). Samenvattingen van 10 papieren werden beoordeeld en een extra drie studies werden uitgesloten, waardoor er zeven studies voor de volledige publicatie beoordeling. Hiervan werden twee artikelen uitgesloten (was beoordeling, en één was niet case-control studie). Een totaal van vijf in aanmerking komende studies waarbij 1621 gevallen en 2639 controles werden opgenomen in de gepoolde analyses [13], [14], [15], [16], [17]. De kenmerken van in aanmerking komende studies zijn samengevat in Tabel 1. Deze vijf studies waren alle Aziatische nakomelingen. Maagkanker werden histologisch of pathologisch bevestigd in de meeste studies. Een klassieke polymerasekettingreactie-restrictiefragment lengte polymorfisme assay werd uitgevoerd in alle studies. De verdeling van genotypen bij de controles van elk onderzoek was in overeenstemming met Hardy-Weinberg-evenwicht behalve één studie [13]. Zoals getoond in Tabel 2, de variant homozygote GG was geassocieerd met een significant verhoogd risico op maagkanker, vergeleken met wildtype homozygote TT (OR = 1,54, 95% CI = 1,04-2,29, fig. 2). Verder is de MDM2 heterogeniteit en gevoeligheidsanalyses aanzienlijke heterogeniteit tussen studies werd waargenomen in de algehele vergelijkingen met uitzondering van recessieve model ( P Begg's trechter plot en test Egger's werden uitgevoerd om de publicatie vertekening van literatuur te beoordelen. De vormen van de trechter plots geen enkel bewijs van duidelijke asymmetrie in alle opzichte modellen niet onthullen. Vervolgens werd testen van de Egger's gebruikt om statistische gegevens van funnel plot symmetrie te bieden. De resultaten nog steeds geen enkel bewijs van publicatie vooringenomenheid tonen (t = -0,28, P De eerdere studie heeft tegenstrijdige resultaten over de associatie tussen de MDM Een aantal beperkingen van deze meta-analyse moet worden aangepakt. Ten eerste kunnen misclassificaties op ziektestatus genotypes en de resultaten beïnvloeden, omdat gevallen in verschillende studies niet werden bevestigd door pathologie of andere gouden standaard methode en de kwaliteitscontrole van genotypering was niet goed gedocumenteerd in een aantal studies. Ten tweede kan selectiebias een rol spelen omdat het genotype verdeling van dit polymorfisme bij controlepersonen afweek van de Hardy-Weinberg-evenwicht in een studie [13] en alle controles werden uit het ziekenhuis die niet representatief voor de algemene populatie kunnen . Ten derde, waren onze resultaten op basis van niet-gecorrigeerde schattingen, terwijl een meer nauwkeurige analyse moet worden uitgevoerd indien de individuele gegevens beschikbaar waren, die het mogelijk maken voor de aanpassing door andere co-varianten, met inbegrip van omgevingsfactoren en andere leefstijlfactoren. In ondanks deze, meta-analyse hadden ook een aantal voordelen. Ten eerste, hoewel het aantal onderzoeken betrokken bij de meta-analyse relatief klein is, het totale aantal patiënten en controles waren aanzienlijk, waarbij het onderscheidingsvermogen van de analyse aanzienlijk toegenomen. Ten tweede is de kwaliteit van de case-control studies opgenomen in de huidige meta-analyse was bevredigend en voldeed aan onze inclusie criterium. Ten derde, hebben we geen publicatie vooringenomenheid wat aangeeft dat de hele samengevoegde resultaat onpartijdige zou moeten zijn op te sporen. Kortom, deze meta-analyse het bewijs geleverd van de associatie tussen MDM2
promotorgebied SNP309 is aangetoond geassocieerd met een verhoogd MDM2
expressie en een significant vroegere beginleeftijd van verscheidene tumoren, zoals maagkanker. Verschillende studies werden gepubliceerd om de associatie tussen SNP309 en maag risico op kanker te evalueren. Echter, de resultaten blijven tegenstrijdige plaats van sluitend.
Doelstelling
SNP309 polymorfisme en maag risico.
Resultaten
SNP309 polymorfisme geassocieerd met een significant verhoogd risico op maag kankerrisico bij alle onderzoeken in de meta-analyse (GG werden samengevoegd versus TT, OR = 1,54, 95% CI = 1,04-2,29 en GG versus GT /TT, OR = 1,49, 95% CI = 1,30-1,72). Bovendien heeft onderzoek Egger is geen enkel bewijs van publicatie vooringenomenheid tonen ( P
= 0,799 voor GG versus TT).
Conclusie
SNP309 polymorfisme kan een low-penetrant risicofactor voor het ontwikkelen van maagkanker zijn
SNP309 rs2279744 polymorfisme en Gastric Cancer Risk: een meta-analyse. PLoS ONE 8 (2): e56918. doi: 10.1371 /journal.pone.0056918
( H. Pylori
) infectie op de ontwikkeling van maagkanker [3]. In aanvulling op bovenstaande exogene factoren, genetische polymorfismen in het carcinogeen ontgifting, antioxidant bescherming, DNA herstel en celproliferatie processen ook cruciaal voor de ontwikkeling van maagkanker [4], [5]. De tumorsuppressor p53 is een belangrijkste mediator van veel cellulaire functies, waaronder celcyclus, apoptose, remming van angiogenese en cellulaire senescentie [6]. Somatische mutaties die het p53-gen te inactiveren werden gevonden in ten minste de helft van alle menselijke solide tumoren, benadrukt een cruciale rol van het p53 eiwit in carcinogenese [7]. MDM2 is een cruciale negatieve regulator van p53 door middel van verschillende mechanismen. MDM2 direct bindt aan p53, wat resulteert in de remming van p53 transactivatie activiteit [8]. MDM2 fungeert ook als een ubiquitine-eiwit ligase en controles p53 door zich te richten het voor proteasomale degradatie [9]
promotor, SNP309 T >. G (rs2279744), werd geïdentificeerd [10], en te leiden tot overexpressie van MDM2
RNA en eiwitten. Er werd verder aangetoond dat het verhoogde niveau van MDM2
werd gemedieerd door en afhankelijk transcriptiefactor SP1. Interessant amplificatie van MDM2
alleen kan tumorigenese [11] verbeteren, wat de mogelijkheid biedt de G allel van SNP309 kanker predisponerende allel op zich kan voorstellen.
SNP309 polymorfisme in maag kankerrisico, maar de resultaten zijn niet overtuigend zijn, deels vanwege de mogelijke klein effect van het polymorfisme op maagkanker en de betrekkelijk geringe omvang in elk van de gepubliceerde studies . Daarom hebben we een meta-analyse uitgevoerd op alle geschikte case-control studies om het totale risico van maagkanker schatten MDM2
SNP309 polymorfisme en de heterogeniteit tussen studies en mogelijke vertekening te kwantificeren.
2," "polymorfisme" en "maagkanker"). Het onderzoek werd beperkt tot Engels-talige kranten. Aanvullende studies werden geïdentificeerd door een onderzoek met de hand van de referenties van de oorspronkelijke studies. Van de studies met dezelfde of overlappende gegevens die zijn gepubliceerd door dezelfde onderzoekers, hebben we gekozen voor de meest recente met het grootste aantal onderwerpen. Studies in onze meta-analyse aan de volgende criteria voldoen: (a) evaluatie van de MDM2
SNP309 polymorfisme en maag risico op kanker, (b) gebruik maken van een case-control design, en (c) beschikbaar hebben genotype frequenties voor zowel patiënten als controle populaties.
Statistische analyse
SNP309 polymorfisme en maag risico op kanker. De gepoolde OR's werden uitgevoerd voor codominant model (GG versus TT, GT versus TT), dominant model (GG /GT versus TT) en recessief model (GG vs. GT /TT), respectievelijk. Gezien de mogelijke heterogeniteit tussen de onderzoeken, werd een statistische test voor heterogeniteit uitgevoerd op basis van de Q statistiek [12]. Als de P Restaurant > 0,05 van de Q-test die een gebrek aan heterogeniteit onder studies aangeeft, de samenvatting of raming van elk onderzoek werd berekend door de vaste effecten model (de Mantel-Haenszel methode). Anders, de random-effects model (de DerSimonian en Laird werkwijze) toegepast. Nauwkeurige analyses uitgevoerd om de stabiliteit van de resultaten te evalueren, namelijk één onderzoek in de meta-analyse telkens de invloed van de ingesteld op de samengevoegde afzonderlijke gegevens weerspiegelen verwijderd. Trechter percelen en lineaire regressie-test Egger's werden gebruikt om de diagnose van de mogelijke publicatie vertekening te bieden. Alle analyses werden uitgevoerd met Stata software (versie 8.2; StataCorp LP, College Station, TX), met behulp van dubbelzijdig P
waarden
Voornaamste resultaten
SNP309 polymorfisme geassocieerd met een significant verhoogd risico op maagkanker bij recessieve model (GG versus GT /TT, OR = 1,49, 95% CI = 1,30-1,72), maar niet dominant model (GG /GT versus TT, OR = 1,18, 95% CI = 0,84-1,65).
heterogeniteit = 0,073 voor GG versus GT /TT). Invloed analyse werd uitgevoerd om de invloed van elk onderzoek te beoordelen op samengevoegde of door achtereenvolgende verwijdering van afzonderlijke studies. De resultaten suggereren dat er geen individuele studie significante invloed op de gepoolde OR's (afb. 3).
Publication vooringenomenheid
= 0,799 voor GG versus TT, afb. 4).
Discussie
2 SNP309 polymorfisme en het risico op maagkanker, wat kan worden beïnvloed door relatief kleine steekproef en verschillende genetische achtergrond. Ohmiya et al. [13] en Yang et al. [14] gemeld dat patiënten met variante allel G in de MDM2
SNP309 polymorfisme een verhoogd risico op maagkanker. Gezien de belangrijke rol van MDM2 in de regulatie van p53, is biologisch plausibel dat MDM2
polymorfisme kan het risico op maagkanker moduleren. De MDM2
SNP309 polymorfisme verhoogt de affiniteit van SP1 voor de MDM2
promoter en veroorzaakt overexpressie van MDM2
. Dienovereenkomstig, de cellijnen met de SNP309 GG TG en genotypes uitgedrukt hogere MDM2
dan de TT genotypes [10]. Echter, Cho et al. aangegeven dat er geen verband tussen de MDM2
SNP309 polymorfisme en maagkanker het risico [15]. Meta-analyse is een krachtige methode voor het oplossen van inconsistente vinden met een relatief groot aantal onderwerpen. Om dit conflict op te lossen, een meta-analyse van vijf studies waarbij 1621 gevallen en 2639 controles werd uitgevoerd om een nauwkeuriger schatting van de vereniging af te leiden. Onze resultaten suggereren dat de MDM2
SNP309 polymorfisme wordt geassocieerd met een significant verhoogd risico op maagkanker.
SNP309 polymorfisme en maagkanker risico, ondersteunen de hypothese dat de SNP309 polymorfisme een lage penetrantie gevoeligheid marker van maagkanker kan zijn. Er zijn echter grote steekproef studies gerechtvaardigd om onze bevindingen te valideren. Bovendien moet meer gen-gen en gen-omgeving interacties ook worden overwogen in de toekomst analyse, die moet leiden tot beter begrip van het verband tussen de MDM2
SNP309 polymorfisme en maag risico op kanker.
Mannen die twee keer per week yoghurt eten, hebben minder kans op darmkanker
E. coli superbacteriën verspreiden door slechte toilethygiëne,
Ernstige COVID-19-complicaties die verband houden met de afbraak van de darmbarrière
Genetisch tweaken van darmbacteriën vermindert het risico op colorectale kanker bij muizen vindt studie
Spingif-peptide kan helpen pijn bij het prikkelbare darm syndroom te stoppen
Darmmicrobioom verandert bij het koken van plantaardig voedsel,
Nieuw ontdekte grote fagen vervagen de grens tussen leven en niet-leven
Een nieuwe studie gepubliceerd in het tijdschrift Natuur laat zien dat er letterlijk honderden virussen zijn die groot genoeg zijn om bacteriën te consumeren, en met eigenschappen die typisch zijn v
Wat is de deal met hepatitis C?
Hep C. Tegenwoordig, je ziet veel tv-commercials over getest en gescreend worden. Het is gemakkelijk om aan te nemen dat hepatitis een aandoening is die alleen van belang is voor diegenen die mogelijk
Waterstofademhaling komt niet van Bikini-atol
In deze dagen met al dat stomme gepraat over een nucleaire oorlog, als je het woord waterstof ziet, denk je misschien meteen aan dat arme kleine eiland in de Stille Oceaan, Bikini-atol, waar ze al die