Stomach Health > gyomor egészség >  > Gastric Cancer > gyomorrák

PLoS One: MDM2 SNP309 rs2279744 polimorfizmusa és a gyomorrák kockázata: meta-analízis

absztrakt katalógusa

Háttér katalógusa

MDM2 jelentős negatív szabályozója p53, és egyetlen nukleotid polimorfizmus (SNP) a MDM2 katalógusa promoter régió SNP309 Kimutatták, hogy társulhat megnövekedett MDM2
kifejezés és szignifikánsan korábbi életkorban alakul több tumorok, beleértve a gyomorrák. Számos tanulmány jelent, hogy értékelje az egyesület között SNP309 és a gyomorrák kockázatát. Az eredmények azonban továbbra is ellentmondásos, nem pedig meggyőző. Katalógusa

Cél katalógusa

A vizsgálat célja az volt, hogy értékelje az egyesület a MDM2 katalógusa SNP309 polimorfizmus és a gyomor kockázatot.

módszerek

végeztünk meta-analízis, hogy vizsgálja meg ezt a kapcsolatot. Esélyhányadosok (OR) és a 95% -os megbízhatósági intervallumok (CI) használtuk, hogy értékelje az erejét a szövetség. Az egyesített legkülső végeztük kodomináns modell domináns modell, és recesszív modell. Katalógusa

Eredmények katalógusa

Öt publikált eset-kontroll vizsgálatok, beleértve 1621 gyomorrák esetek és kontrollok 2639 azonosítottunk. Azt találtuk, hogy a MDM2 katalógusa SNP309 polimorfizmus esetén jelentősen megnövekedett kockázata gyomorrák kockázatát, ha minden vizsgálat egyesítjük a meta-analízis (GG versus TT, OR = 1,54; 95% CI = 1,04-2,29 és GG versus GT /TT, OR = 1,49, 95% CI = 1,30-1,72). Továbbá, Egger-teszt nem mutatta semmilyen jelét publikációs torzítás ( P katalógusa = 0,799 GG versus TT). Katalógusa

Következtetés

Eredményeink azt sugallják, hogy a MDM2
SNP309 polimorfizmus lehet alacsony penetrációs kockázati tényezője a gyomorrák kialakulásával. katalógusa

Citation: Ma Y, Bian J, Cao H (2013) MDM2 katalógusa SNP309 rs2279744 polimorfizmus és A gyomor rák kockázatát: meta-analízis. PLoS ONE 8 (2): e56918. doi: 10,1371 /journal.pone.0056918 katalógusa

Szerkesztő: Hiromu Suzuki, Sapporo Medical University, Japán katalógusa

Beérkezett: november 14, 2012; Elfogadva: január 15, 2013; Megjelent: február 25, 2013 katalógusa

Copyright: © 2013 Ma és mtsai. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Forrás: A szerzők nincs támogatás vagy támogatás jelentést. katalógusa

Érdekütközés: a szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. katalógusa

Bevezető katalógusa

a gyomorrák a negyedik leggyakrabban diagnosztizált rák és a második vezető daganatos halálok világszerte. [1] Mint más komplex betegségek, a gyomorrák egy komplex tulajdonság által okozott mind a genetikai és környezeti tényezők [2]. Számos epidemiológiai vizsgálatok megerősítették a hatásai az alacsony fogyasztás a friss gyümölcsök és zöldségek, a magas fogyasztás sós ételek, a dohányzás, és a Helicobacter pylori katalógusa ( H. Pylori katalógusa) fertőzés a gyomorrák kialakulásával [3]. Amellett, hogy a fenti exogén faktorok, a genetikai polimorfizmusok a rákkeltő méregtelenítés, antioxidáns védelem, a DNS-javítás és a sejt proliferációs folyamatok is kulcsfontosságú a fejlesztés a gyomorrák [4], [5]. A tumor szuppresszor p53 egy fő mediátora számos celluláris funkciókat, beleértve a sejtciklus, apoptózis, gátolják az angiogenezist és a sejtöregedés [6]. Szomatikus mutációk, amelyek inaktiválják a p53-gén találtak legalább a fele az összes humán szolid tumorok, kiemelve döntő szerepet a p53 fehérje karcinogenezis [7]. MDM2 döntő negatív szabályozója p53 számos mechanizmuson keresztül. MDM2 közvetlenül kötődik a p53-hoz, ami a gátlás p53 transzaktivációs aktivitást [8]. MDM2 is működik, mint egy ubiquitin protein ligáz és ellenőrzések p53 megcélozva azt proteaszómális degradáció [9]. Katalógusa

Az egyedi nukleotid polimorfizmus MDM2 katalógusa promoter, SNP309 T > G (rs2279744) azonosították [10], és kimutatták, hogy eredményez túlzott mértékű expressziója MDM2
RNS és fehérje. Azt is demonstrálták, hogy a fokozott szintje MDM2
közvetítik, és függ az Sp1 transzkripciós faktor. Érdekes, erősítés a MDM2 katalógusa önmagában fokozza tumorogenezisben [11], ami felveti annak lehetőségét, hogy a G allélja SNP309 jelenthet a rák hajlamosító allél önmagában. Katalógusa

Az utóbbi időben számos tanulmány arról számolt be a szerepe a MDM2
SNP309 polimorfizmus gyomor rák kockázatát, de az eredmények nem meggyőzőek, részben azért, mert a lehetséges kis hatása polimorfizmus gyomorrák és a viszonylag kis mérete az egyes közzétett tanulmányok . Ezért végzett meta-analízis szerint minden jogosult eset-kontroll vizsgálatok becslései szerint az összes gyomorrák kockázata MDM2 katalógusa SNP309 polimorfizmus valamint számszerűsíteni egyes vizsgálatok heterogenitása és a potenciális torzítás. Katalógusa

anyagok és módszerek katalógusa

azonosítása és a jogosultság a vonatkozó tanulmányok katalógusa

kerestük az elektronikus irodalom PubMed és EMBASE minden releváns cikkeket (az utolsó keresés frissítés volt augusztus 10, 2012, a keresési szempontjából " MDM katalógusa 2", "polimorfizmus", és "a gyomorrák"). A keresés korlátozódott angol nyelvű papírokat. További vizsgálatok azonosítottak egy kézi keresést hivatkozásainak eredeti tanulmányokat. A vizsgálatok az azonos vagy egymást átfedő által közzétett adatok ugyanabban a nyomozók, azt választotta ki a legújabb is a legnagyobb számú alany. Tanulmányok szerepel a meta-analízis meg kell felelniük az alábbi kritériumoknak: (a) értékelése MDM2 katalógusa SNP309 polimorfizmus és a gyomorrák kockázatát, (b) használ eset-kontroll kialakítása, és (c) rendelkeznek genotípus frekvenciák a betegek és kontroll populációban. katalógusa

Adatgyűjtés katalógusa

Két kutató egymástól függetlenül ki az adatokat, és megegyeztek az összes elem. Minden egyes vizsgálat során a következő adatokat vették figyelembe: a szerző neve, a megjelenés éve, ország a tanulmány, etnikai, és a számok a genotípus-esetek és kontrollok. Különböző etnikai ereszkedés kategorizáljuk európai és ázsiai. Katalógusa

Statisztikai elemzés katalógusa

A nyers esélyhányados (OR) 95% -os konfidencia intervallum (CI) használtuk, hogy értékelje az ereje közötti összefüggés MDM2 katalógusa SNP309 polimorfizmus és a gyomorrák kockázatát. Az egyesített legkülső végeztük kodomináns modell (GG versus TT, GT versus TT), domináns modell (GG /GT versus TT), és recesszív modell (GG vs. GT /TT), ill. Figyelembe véve annak lehetőségét, hogy a heterogenitás, a vizsgálatba a statisztikai teszt heterogenitás alapján történt a Q statisztika [12]. Ha a P katalógusa > 0.05 A Q-teszt, amely azt jelzi, hogy hiányzik a heterogenitás között tanulmányok, összefoglaló vagy becslés alapján az egyes vizsgálatok számítottuk ki a fix hatások modellje (a Mantel-Haenszel módszer). Ellenkező esetben a random-hatás modell (a DerSimonian és Laird módszer) használtuk. Érzékenységi elemzést végeztünk, hogy megállapítsuk a stabilitást az eredmények, vagyis egy tanulmány meta-analízis törölve minden alkalommal hatását tükrözik az egyes adatállomány az összevont OR. Tölcsér parcellák és Egger lineáris regressziós tesztet használják fel, hogy a diagnózis a potenciális publikációs torzítás. Minden elemzést végeztünk Stata szoftver (8.2 verzió; StataCorp LP, College Station, TX), a kétoldalas P katalógusa értékeket.

Eredmények katalógusa

Jellemzői Studies

a 47 publikációt relevánsak a keresési feltételeket (1.). Keresztül a lépést a szűrés a cím, 37 ilyen irodalmak kizárták (7 nem voltak gyomorrák, 2 pedig véleménye, és 28 nem polimorfizmusok). Abstracts 10 papírokat felül, és három további vizsgálatok kizárták, így a hét tanulmány teljes kiadvány felülvizsgálatát. Ezek közül két cikk kizárták (egy volt felülvizsgálat, és az egyik nem volt eset-kontroll vizsgálat). Összesen öt támogatható bevonásával végzett 1621 esetekben és 2639 kontrollokat az összegzett analízise [13], [14], [15], [16], [17]. A jellemzők támogatható vizsgálatok 1. táblázat foglalja össze az öt vizsgálatban mind ázsiai leszármazottai. Gyomorrák megerősítette szövettanilag vagy kórosan a legtöbb vizsgálatban. A klasszikus polimeráz láncreakció-restrikciós fragmens hossz polimorfizmus assay-t az összes vizsgálatban. A genotípusok eloszlását az ellenőrzés minden tanulmány egyetért Hardy-Weinberg kivéve egy vizsgálatban [13]. Katalógusa

Főbb eredmények katalógusa

Mivel a 2. táblázatban látható, a variáns homozigóta GG társult egy jelentősen megnövekedett kockázata a gyomorrák, összehasonlítva a vad típusú homozigóta TT (OR = 1,54; 95% CI = 1,04-2,29, Fig. 2). Továbbá, a MDM2 katalógusa SNP309 polimorfizmus esetén jelentősen megnövekedett kockázata gyomorrák recesszív modellben (GG versus GT /TT, OR = 1,49, 95% CI = 1,30-1,72), de nem domináns modell (GG /GT vs. TT, OR = 1,18, 95% CI = 0,84-1,65). katalógusa

a heterogenitás és érzékenységi vizsgálatok katalógusa

jelentős vizsgálatok közötti heterogenitást figyeltek átfogó összehasonlítást kivéve recesszív modell ( P katalógusa heterogenitás = 0,073 GG versus GT /TT). Influence analízist végeztünk, hogy értékelje a befolyása a minden egyes tanulmány az egyesített, vagy egymás utáni eltávolítására egyes vizsgálatokban. Az eredmények arra utalnak, hogy nem egyéni tanulmányi jelentősen befolyásolja az összevont legkülső régiók (3.). Katalógusa

Publikációs torzítás katalógusa

Begg tölcsér telek és Egger tesztet végeztünk, hogy megállapítsuk a publikációs torzítás az irodalmak. Az alakzatok a tölcsér parcellák nem merült fel olyan bizonyíték nyilvánvaló aránytalanság az összes összehasonlító modellek. Ezután a Egger tesztet használtuk, hogy olyan statisztikai bizonyítékot tölcsérgörbe szimmetria. Az eredmény még mindig nem mutatott semmilyen bizonyítékot a publikációs torzítás (t = -0,28, P katalógusa = 0,799 GG versus TT, Fig. 4). Katalógusa

Vita katalógusa

A korábbi tanulmány ellentmondó eredményeket a szövetség között a MDM katalógusa 2 SNP309 polimorfizmus és a kockázat a gyomorrák, ami befolyásolhatja a viszonylag kis minta és a különböző genetikai háttérrel. Ohmiya et al. [13] és Yang és mtsai. [14] számolt be, hogy az alanyok variáns G allél MDM2 katalógusa SNP309 polimorfizmus kockázata nagyobb volt a gyomorrák. Tekintettel a fontos szerepet az MDM2 szabályozásában p53, ez biológiailag kézenfekvő, hogy a MDM2
polimorfizmus modulálhatja a kockázatát gyomorrák. A MDM2 katalógusa SNP309 polimorfizmus növeli az affinitása Sp1 a MDM2 katalógusa promoter és fokozott expresszióját eredményezi MDM2 katalógusa. Ennek megfelelően a sejtvonalak a SNP309 GG és a TG genotípusok kifejezve magasabb MDM2 katalógusa, mint azok a TT genotípusú [10]. Azonban Cho és mtsai. jelezte, hogy nincs összefüggés a MDM2 katalógusa SNP309 polimorfizmus és a gyomorrák kockázatát [15]. Meta-analízis hatékony módszer megoldásának ellentétes megállapítás viszonylag nagyszámú alany. Annak érdekében, hogy megoldja ezt a konfliktust, a meta-analízis öt bevonásával végzett 1621 esetek és kontrollok 2639-ben végzett, hogy ebből a pontosabb becslést az egyesület. Eredményeink arra utalnak, hogy a MDM2 katalógusa SNP309 polimorfizmus esetén jelentősen megnövekedett kockázata gyomorrák. Katalógusa

Egyes korlátozások metaanalízis foglalkozni kell. Először is, a téves besorolások a betegség állapota és genotípusok befolyásolhatják az eredményeket, mert esetek több tanulmány nem támasztja alá patológiai vagy más gold standard módszer, és a minőség-ellenőrzés genotípus szintén nem volt jól dokumentált az egyes tanulmányok. Másodszor, szelekciós torzítás is szerepet játszott, mivel a genotípus eloszlása ​​ezen polimorfizmus kontroll személyekben eltért a Hardy-Weinberg egy vizsgálatban [13], és az összes kontrollok a kórházból, amelyek esetleg nem reprezentatív a lakosság . Harmadszor, az eredmények alapozták korrigálatlan becslések, míg a pontosabb elemzést kell elvégezni, ha az egyéni adatok álltak rendelkezésre, amely lehetővé tenné, hogy a kiigazítási más társ-változatokat, beleértve a környezeti tényezők és egyéb életmód. Katalógusa

Mindezek ellenére, a meta-analízis is volt némi előnye. Először is, bár a tanulmányok száma vesz részt a meta-analízis viszonylag kicsi volt, a teljes száma az esetek és kontrollok jelentős volt, ami jelentősen megnövelte a statisztikai ereje az elemzés. Másodszor, a minősége eset-kontroll vizsgálatok szerepelnek a jelenlegi meta-analízis volt kielégítő, és találkozott a befogadás kritériumnak. Harmadszor, nem tapasztaltunk semmilyen publikációs torzítás azt jelzi, hogy az egész egyesített eredmény kell elfogulatlan. Katalógusa

Összefoglalva, ez a metaanalízis bizonyította az egyesület között MDM2 katalógusa SNP309 polimorfizmus és gyomorrák kockázat, támogatva azt a hipotézist, hogy a SNP309 polimorfizmus lehet egy alacsony penetranciájú fogékonyság markere gyomorrák. Azonban nagy minta vizsgálatok szükségesek, hogy eredmények validálása. Sőt, több gén-gén és gén-környezet interakció is figyelembe kell venni a jövőbeli elemzés, amelynek lehetővé kell tennie, hogy jobb, átfogó megértése az összefüggés az MDM2 katalógusa SNP309 polimorfizmus és a gyomorrák kockázatát. Katalógusa

Other Languages