Polimorfizmusa TGFB1 és VEGF gén és betegek túlélési gyomor cancer

polimorfizmusa TGFB1 katalógusa és VEGF katalógusa gének és betegek túlélési gyomorrák katalógusa Abstract Background katalógusa katalógusa Néhány TGFB1 katalógusa és VEGF
polimorfizmusok úgy gondolják, hogy a funkcionális. Tekintettel arra, hogy ezek a gének játszanak a daganat növekedéséhez és progressziójához, beleértve az angiogenezist, terjesztés és invazivitását, feltételeztük, hogy ezek a polimorfizmusok lenne társított betegek túlélésének gyomorrákban.
Módszerek
Mi genotipizált TGFB1
-509 C > T, 1869 T > C és 915 G > C és VEGF katalógusa -1498T > C, -634G > C és + 936C > T 167 gyomorrákos betegeknél. A Kaplan-Meier módszerrel, log-rank teszt, és Cox modell értékeltük egyesületek között TGFB1 katalógusa és VEGF katalógusa változatok teljes, 1 éves és 2 éves túlélés. Katalógusa Eredmények
Bár nem volt szignifikáns különbség a teljes túlélés aránya az összes polimorfizmusok vizsgált betegek TGFB1 katalógusa + 915CG és CC genotípus volt rosszabb a 2 éves túlélés (korrigált relatív hazárd (HR) 3,06; 95% -os megbízhatósági intervallum (CI), 1,09-8,62; P katalógusa = 0,034), mint a beteget a GG genotípus volt. Emellett a betegek heterozigóta VEGF katalógusa -634CG is volt rosszabb az 1 éves túlélés (korrigált HR, 2,08; 95% CI, 1,03-4,22; P = 0,042 katalógusa), mint akiknek a -634GG genotípus.
Következtetés katalógusa a tanulmány szerint, TGFB1 katalógusa + 915CG /CC és a VEGF katalógusa -634CG genotípusok társulhat rövid távú túlélés gyomorrákos betegek. Azonban nagyobb vizsgálatok szükségesek annak ellenőrzéséhez ezeket a megállapításokat.
Bevezetés katalógusa A gyomor caner, betegek ugyanolyan klinikai jellemzőkkel és azonos kezelési rendek eltérő klinikai kimenetelt. Bár a szakaszban a legjobb rendelkezésre álló klinikai mércéje tumor agresszió és a prognózis, egyértelműen vannak fontos különbségek még ugyanabban a tumor stádiuma [1, 2]. Ezért hasznos lenne javítani a prognosztikai pontossággal azonosítja könnyen hozzáférhető molekuláris markerek megjósolni néhány variáció a klinikai eredmények. Az elmúlt évtizedekben számos tanulmány kimutatta, hogy genetikai eltérések szerepet játszanak a kialakulásában és fejlődésében gyomorrák [3]. Ezek közül a molekuláris markerek, egyetlen nukleotid polimorfizmusok (SNP) a leggyakrabban vizsgált genetikai variáció, amely hozzájárulhat a betegek klinikai kimenetelt. [4] katalógusa epidemiológiai és klinikai vizsgálatok arra utalnak, hogy mind a TGF-β1 és a VEGF fontos lehet szerepet játszik a onkogenezisben a gyomor [5, 6]. Például TGFB1
és VEGF
variánsok társított megváltozott fehérje termékek, amelyek hozzájárulhatnak a variáció egyéni érzékenység a rák és a klinikai eredmények [4]. Mindkét TGFB1 katalógusa és VEGF katalógusa gének rendkívül polimorf, állítólag miután 168 és 140 változatok, illetve, de csak kevés ilyen variánsok a promoter vagy kódoló régiókban, amelyek potenciálisan működőképes http: //www. NCBI. NLM. NIH. gov /SNP /. Ezen variánsok, több SNP-k írtak le, mint fontos modulálásában gén funkciók [7-9] és a jelentések szerint részt vesz a etiológiájában különféle rákok [10-13].
A TGF-β1 útvonal kritikusan játszanak a daganat fejlődését és a progresszió. A tumor sejttenyészetek, TGF-β1 anti-proliferatív hatást, és képes blokkolni a tumor progresszióját a korai szakaszában, mivel ez is gyorsítja invázió és metasztázis, a későbbi szakaszokban a tumor progresszióját [14, 15]. Egy kísérleti tanulmány számolt be, hogy a TGF-β1-közvetített aktiválását a ALK5-Smad 3 útvonal elengedhetetlen az Shh protein elősegítése motilitás és invazivitását gyomorrákban sejtekben [16]. Egér kísérletek azt is megmutatták, hogy a megváltozott TGF-β1 járt a latens TGF-β1 kötő fehérjék, amelyek gyulladást okozhatnak, és daganatok [17], és hogy a megszakított TGF-β1 útvonal vezethet tumor növekedését azáltal, hogy növeli a tumor angiogenezis által indukált csökkent expressziója thrombospondin-1 [18]. Emberekben, a TGF-β1 volt a nagyobb érzékenység, mint Karcinogén embrionális antigének tumorsejtek gyomorrákos betegek [16]. Továbbá, mind a kísérleti és klinikopatológiai vizsgálatok arra utaltak, szerepe a VEGF család fehérjék metasztázis a nyirokrendszeren keresztül és a klinikai eredmények számos humán szilárd tumorok, beleértve a gyomorrák [19].
Ebben a vizsgálatban, mi úgy döntött, hogy genotípusba kiválasztott közös (azaz, minor allél gyakoriság &0,05) TGFB1
és VEGF
SNP-k, amelyek vagy vezethet nem-szinonim aminosav változásokat [20], vagy már jár alacsonyabb expressziós szintje ezen gének [ ,,,0],8, 21], ami azt jelenti, SNP lehet működőképes. Feltételeztük, hogy a potenciálisan funkcionális polimorfizmusok TGFB1 és VEGF lenne kapcsolatos klinikai eredmények gyomorrákos betegeknél. Konkrétan azt
értékelni a szövetség között a klinikai eredményeket gyomorrák, valamint a teljes túlélést, és az egyes alábbi SNP: három TGFB1 katalógusa SNP, köztük egy promoter SNP (-509 C > T) és két exon 1 SNP (869 T > a C és 915 G > C), és három VEGF
SNP, beleértve egy promotert SNP (-1498T > C), egy 5'-nem transzlatált régió SNP (-634G > C), és egy 3'- transzlálódó régió SNP (936 C > T). katalógusa módszerek katalógusa Study lakosság katalógusa prospektív analízisbe 167 beteg újonnan diagnosztizált és szövettanilag igazolt gyomorrák, akiket a The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, Texas között 2003. április 2008. július a vizsgálati protokollt jóváhagyta az intézményi Review Board (IRB), és minden beteg írásos beleegyezését adta a IRB által jóváhagyott beleegyezési nyilatkozat. A kizárási kritériumok azok, akik nem újonnan diagnosztizált és olyanok, amelyek kezelt máshol mielőtt jön M. D. Anderson. Ezeket a betegeket vontunk be ez az elemzés, mert a tárolt vérminták esetében álltak rendelkezésre DNS extrahálására.
Genotipizálása
Genomiális DNS-t extraháltunk a buffy coat frakció a vérmintát minden egyes beteg segítségével egy Blood Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA) alkalmazásával a gyártó utasításai szerint. DNS tisztaságát és koncentrációját határozzuk meg spektrofotometriás mérésével abszorbancia 260 és 280 nm-nél UV-spektrofotométerrel. A három kiválasztott TGFB1 katalógusa SNP [egy (-509 C > T /rs1800469) a promóter és két (869 T > C /rs1800470 és 915 G > C /rs1800471) az exon 1] és három promoter VEGF
SNP-k [egy (-1498T > C /rs8

• Az érvényesítési egy új módszer kombinálásával egyaránt HER2 immunhisztokémiai HER2 kétszínű ezüst in situ hibridizáció egy csúszda gyomorrák vizsgálata
• Bizonyító érvelés alapú modell diagnosztizálásához nyirokcsomó-metasztázis gyomorrák