Stomach Health > elodec Zdravje >  > Stomach Knowledges > želodec člen

Plos ONE: društev genetskih variant v PSCA, BRCA1 in PLCE1 Geni z rak želodca Dovzetnost v kitajski Prebivalstvo

Povzetek

Ozadje

Več genetske variante, vključno z PSCA
rs2294008 C > T in rs2976392 G > A, MUC1
rs4072037 T > C, in PLCE1
rs2274223 A > G so pokazale pomembno povezavo z rakom na želodcu v prejšnjih pridružitvenih raziskav genoma vsej (GWASs)

metode

Za oceno združenja teh. SNP v Han Kitajci, je neodvisna študija bolnišnice na osnovi primerov in kontrol izvaja genotipizacija te štiri polimorfizmov v skupno 692 primerov raka želodca in 774 zdravih kontrol s pomočjo frekvenčnega ujemanja za starost in spol pridobili. Lažno pozitivno poročilo verjetnost analiza (FPRP) je bila izvedena tudi potrditev vseh statistično pomembne ugotovitve.

Rezultati

V sedanji študiji so ugotovili pomembno povezanost z dovzetnostjo za raka želodca za vse štiri polimorfizmov na interesov. Natančneje, je pomembno povečano tveganje za nastanek raka želodca, povezanih z PSCA
rs2294008 (CT v primerjavi CC: prilagojen OR = 1,37, 95% CI = 1,07-1,74 in CT /TT vs.CC: prilagojen OR = 1,30 95% IZ = 1,03-1,63), PSCA
rs2976392 (AG proti GG: prilagojen OR = 1,30, 95% CI = 1,02-1,65, in AG /AA vs GG: prilagojen OR = 1,26, 95% IZ = 1,00-1,59), ali PLCE1
rs2274223 (AG vs. AA: prilagojen OR = 1,48, 95% IZ = 1.15-1.90 in AG /GG v primerjavi z AA: prilagojen OR = 1,45, 95% IZ = 1,14-1,84), oz. V nasprotju s tem, MUC1
rs4072037 bilo dokazano, da zmanjša tveganje za raka (CT vs TT: prilagojen OR = 0,77, 95% CI = 0,60-0,98). Bolniki z več kot enim genotipom tveganja imeli bistveno povečano tveganje za nastanek raka na želodcu (prilagojena ali = 1,30, 95% CI = 1,03-1,64), v primerjavi s tistimi, ki imajo 0-1 genotipov tveganja. Stratificiran analiza je pokazala, da je povečano tveganje bolj izrazit pri mlajših osebah, moški, kdaj kadilci, kadilci z leti paket ≤ 27, bolniki z visokim ITM, ali ne-Cardia raka na želodcu.

Sklepi

Ta študija utemeljili povezavo med prejšnjih štirih prijavljenih genskih variant in občutljivost raka želodca v samostojni Han kitajskega prebivalstva. Nadaljnje študije z večjo velikost vzorca in različnih narodnosti, so upravičena za potrditev naše ugotovitve

Navedba. Ne H, Wu X, Wu F, Li Y, Yu Z, Chen X, et al. (2015) Združenja genetske različice v PSCA
, MUC1
in PLCE1
Geni z rak želodca Dovzetnost v kitajskega prebivalstva. PLoS ONE 10 (2): e0117576. doi: 10,1371 /journal.pone.0117576

Akademska Urednik: Balraj Mittal, Sanjay Gandhi Medical Institute, INDIJA

Prejeto: 30. junij 2014; Sprejeto: 27. december 2014; Objavljeno: 6. februar 2015

Copyright: © 2015 Sun et al. To je prost dostop članek razširja pod pogoji Creative Commons Attribution License, ki omogoča neomejeno uporabo, distribucijo in razmnoževanje v katerem koli mediju, pod pogojem, da prvotni avtor in vir knjižijo

Razpoložljivost podatkov: Vsi pomembni podatki so v papir in njene dodatne informacije datotek

Financiranje:. študija je bila podprta z China National Natural Science Foundation (št 81370563) nepovratnih sredstev in programa deželnega Zhejiang za gojenje na visoki ravni inovativna zdravje talentov in A pokrajinska uprava tradicionalne kitajske medicine v provinci Zhejiang, Kitajska (No.2011ZA072) in projekta, ki ga ministrstvo za zdravje-China večjih medicine znanosti in tehnologije projekt v provinci Zhejiang (št WKJ2012-2-033) in uporabe javnega dobrega počutja tehnološko podprtega raziskovalni projekt podpira znanstveno tehnološkega oddelka v provinci Zhejiang (No.2012C23108) in odlične Youth Foundation Zhejiang Provincial naravoslovje (No.LR14H030001) in projekt znanost in tehnologijo Wencheng občine. Med financerji imel nobene vloge pri oblikovanju študije, zbiranje in analizo podatkov, sklep, da se objavi, ali pripravi rokopisa

nasprotujočimi si interesi.. Avtorji so izjavili, da ne obstajajo konkurenčni interesi

Uvod

želodec raka je četrta najpogosteje diagnosticiran rak in drugi najpogostejši vzrok smrti zaradi raka na svetu, s približno 738.000 smrti zaradi raka v letu 2008. na splošno je bilo več kot 70% novih primerov in smrti zaradi raka želodca pojavljajo v državah v razvoju, z najvišjo stopnjo pojavnosti v vzhodni Aziji. Še posebej so se pojavile približno 40% primerov raka želodca svetu na Kitajskem [1,2]. Helicobacter pylori
( H
. pylori
) okužba je dobro uveljavljena etiološke faktor za raka na želodcu po vsem svetu, saj je stopnja okužb v razponu od 40% do 80% pri ljudeh. Poleg H
. pylori
okužba, soljeno in poraba nitro hrana in kajenje cigaret, so poročali tudi, da je povezana s povečanim tveganjem za raka na želodcu, ker so sveže sadje in zelenjava odprtine priznana kot varovalni dejavniki [3]. indeks mase visoke telo (ITM) je bilo predlagano tudi kot dejavnik tveganja za raka na želodcu v zahodnih državah [4], ne pa tudi na Kitajskem [5]. Kljub temu, le majhen delež posameznikov izpostavljen tveganju dejavniki sčasoma razvijejo raka želodca v življenju [6], kar kaže, da lahko genetski faktorji igrajo pomembno vlogo v patogenezi raka na želodcu. Do danes, genetska etiologija raka na želodcu, kot genov-gen in gen-okoljskih interakcij, ostaja nejasno.

V zadnjih letih, genom za celotno združenje študije (GWASs), visoke tehnologije genotipizacijio prepustnost, imajo je robustno orodje za odkritje nove občutljivosti raka loci ali genov v celotnem genomu [7]. Doslej so GWASs uspešno identificirane stotine genetskih markerjev, ki so povezane z dovzetnostjo za bolezni, vključno z rakom na želodcu [8]. Naš namen je, da razišče single-nukleotidnih polimorfizmov (SNP) v PSCA
, MUC1
in PLCE1
genov v tej študiji. PSCA
gen (ki se nahaja na kromosomu 8q24) kodira antigena prostate matičnih celic (PSCA), protein, sestavljen iz 123 aminokislinskih ostankov. PSCA pripada družini LY-6 /Thy-1 celične površinske antigene. Je zelo izražena v normalnem prostati in nadalje navzgor regulirano pri raku prostate [9], kot tudi malignih sprememb brez prostate, vključno z rakom želodca [10]. PSCA igra ključno vlogo v celični adhezijo, proliferacijo in preživetje [11]. vitro
poskusi so pokazali, da lahko nekateri PSCA
variante (npr rs2294008T) zmanjšajo transkripcijo gena gostiteljice z moduliranjem svojo gorvodno fragment [10]. Dvostopenjski GWAS za raka na želodcu, opravljena med japonskimi in korejskimi populacije je pokazala, da PSCA
rs2976392 G > A in rs2294008 C > T SNP znatno povečano tveganje raka na želodcu [10]. Združenja PSCA
SNP z rakom želodca je bila potrjena tudi v kitajskih prebivalstva [12-18]. Poleg tega je dvostopenjski GWAS med kitajskega prebivalstva po Abnet et al. [19] nedavno ugotovili dve grozdov SNP na 1q22 ( MUC1
rs4072037 T > C) in 10q23 ( PLCE1
rs2274223 A > G) in njihovih združenj z občutljivostjo za rakom želodca [19]. Hkrati pa tri faze GWAS v drugi kitajskega prebivalstva po Wang et al. [20] upoštevati tudi povezavo z rs2274223 A > G SNP. Mucin 1 (MUC1) je membransko vezan protein, ki se lahko zasidra na apical površine gastrointestinalnega epitelij preko transmembranske domene [21]. MUC1 igra pomembno vlogo v sluznice mazanje, zaščito pred patogeni, signalov in interakcije celica-celica [22,23]. Zaščitna funkcija MUC1 pred okužbo v normalnih epitelijskih celic, so potrdili tako in vitro
in vivo
poskusov [24]. Poleg tega, PLCE1
kodira fosfolipaze C. To proteinski produkt lahko katalizirajo hidrolizo polyphatidylinositol 4,5-bisfosfata (PIP2) v dveh kritičnih drugi sli: inozitol 1,4,5-trisphosphate (Insl, 4, 5P3) in 4,5-diacilglicerolno (DAG) [25], in s tem uravnavajo celično gibljivost, gnojenje, in senzorično transdukcijo [26]. Združenja MUC1
rs4072037 T > C in PLCE1
rs2274223 A > G s tveganjem za nastanek raka želodca so ponovili tudi v različnih narodnosti [27-31]. Kljub temu pa niso bile preiskane skupnih učinkov vseh teh štirih polimorfizmov na tveganje za raka želodca.

V sedanji raziskavi smo genotipizacijo te štiri GWAS-razpoznavna SNP in oceniti njihovo povezavo z rakom na želodcu, v bolnišnici na podlagi primera -nadzorovalnik študija, ki vsebuje 692 primerov in 774 kontrol rakave bolezni.

Metode

populacijski študiji
študija

Ta sodna upravljalnik 692 gensko nepovezanih etnične Han kitajskih bolnikov in 774 nadzor rak brez. Vsi primeri so bili na novo diagnosticiranih in histopathologically potrdili bolnikov primarnim rakom želodca, zaposleni na oddelku za gastroenterologijo, prve odvisnimi bolnišnici Wenzhou medicinske univerze v obdobju od januarja 2010 do septembra 2013. Bolniki z interstitialoma, metastaze raka od drugih organov in ponavljajočih se tumorji so bili izključeni. Vse kontrole so bile naključno izbrane iz bolnišničnih obiskovalcev, ki spremljajo bolnike v bolnišnico, vendar ne želijo za zdravstveno oskrbo v istem časovnem obdobju, genetsko ni povezana z vpisanih primerov predmetov. Bili so frekvenca ujema v primerih, ki jih dobi (± roku 5 let) in spolu. Pri zaposlovanju udeležencev raziskave je bil vsak udeleženec predvidena za intervju z usposobljenih popisovalcev, ko je bila podpisana pisna privolitev. Demografski podatki in zgodovino izpostavljenosti okolja so bili zbrani, kot so starost, spol, etnično pripadnost, zgodovine kajenje, uživanje alkohola in družinsko anamnezo raka. Vsak udeleženec podaril približno 5 ml krvi, od katerih je 2 ml, uporabljeno za ekstrakcijo genomske DNA. Odgovor je bil približno 95% za rak želodca predmetov in 92% za nadzor. Ta študija je bila odobrena s raziskovalni Odbor za etiko Kliničnem Wenzhou Medical University, in vsi udeleženci zagotovili informirano soglasje pisno za darovanje svojih bioloških vzorcev. Nikoli kadilci iz manj kot 100 cigaret vse življenja. Tisti, ki vsaj enkrat pil alkoholnih pijač na teden za eno leto ali več, ali redno so bili opredeljeni kot pivce.

genotipizacijo

genomske DNA smo ekstrahirali in obravnavajo kot je opisano prej [32]. Sprejeli smo TaqMan v realnem času metode PCR za genotipizacijo izbranih štiri SNP v primerih in kontrolah, ki uporabljajo 7900 HT sistem zaporedje detektor (Applied Biosystems). Osem pozitivne kontrole in osem negativne kontrole so bile vključene v vsako 384 vdolbinicami, da se zagotovi točnost rezultatov genotipizacije. Prav tako smo večkrat genotipizacijo 10% vzorcev, in rezultati so bili 100% skladnih.

Statistična analiza

χ 2 testu je bila izračunana za oceno razlike v distribuciji alele in genotipov, kakor tudi demografske med primerov in kontrol. Dobrota-of-fit χ 2 testu smo uporabili za testiranje Hardy-Weinberg ravnovesje (HWE) pri kontroli. razmerja Surovi in ​​prilagojeni obetov (OR) in njihove ustrezne 95% intervali zaupanja (CIS) smo izračunali z univariatne in multivariatne logistične regresijskih modelov, oz. Dodatno smo izvedli razčlenjenost analize glede na starost, spol, kajenje /pitni statusa, pakiranja leto, BMI, mestu tumorja in stopnji TNM. Prav tako smo izvedli analizo lažno pozitivno poročilo verjetnost (FPRP) za vse statistično pomembnih ugotovitev [33]. Na kratko smo nastavil prag FPRP 0,2 in predhodno verjetnost 0,1 za določeno povezavo med izbrane SNP in tveganje za nastanek raka želodca. Statistični moč je bila izračunana za detekcijo ali 1,50 /0,67 za alelov z oceno tveganja /zaščitni učinek. Povezovanje s FPRP vrednosti < 0.2 je bila razglašena kot pomembnem [34]. Vse statistike so bile izvedene s pomočjo SAS programske opreme (različica 9.1; SAS Institute, Cary, NC). Vsi statistični testi so bili dvostranski in P
< 0,05 je štela kot statistično pomembne

Rezultati

Študijski predmeti

Demografske značilnosti. primerov rakave 692 želodec in 774 kontrol so povzeti v tabeli 1. ni bilo pomembno spol razlikuje med primeri in kontrol ( P
= 0,944). Vendar pa so bile kontrole bolj verjetno, da bodo kadilci ( P
< 0,0001) in pivci ( P
= 0,0006), v primerjavi z bolniki. Primeri so bili bolj verjetno, da imajo pomanjkljivosti hranil in zniža ITM ( P
< 0,0001). Zato so kajenje, pakiranj let, status in ITM pitne prilagojen v analizah naknadno multivariatno logistično regresijo. Med vsemi primeri, 199 (28,76%) je Cardia raka in 493 (71,24%) je imela raka, ki niso Cardia. Poleg tega so bile v želodcu raka uprizorjena v skladu s sistemom TNM počivališču v 7 th izdaja AJCC [35]. Kot rezultat, je bilo 274 primerov (39,60%) označi kot odrsko TNM I ali bolezni II, medtem ko je 418 (60,40%) predstavil s stopnjo TNM III ali IV bolezni.

zveza med izbrane SNP in dovzetnost za raka želodca

Razporejenost genotip štirih izbranih SNP pri vseh predmetih so prikazani v tabeli 2. Vsi opazovani genotip distribucije pri nadzoru so bili v dogovoru z HWE ( P
= 0,105 za rs2294008, P
= 0,130 za rs2976392, P
= 0,155 za rs2274223 in P
= 0,735 za rs4072037).

Kot je navedeno v tabeli 2, vse to štirih izbranih polimorfizmov so bile povezane z dovzetnostjo raka želodca. Ko je PSCA
rs2294008 CC genotip je bila uporabljena kot referenca, genotipom CT in kombinacije CT in TT genotipa bili povezani s povečanim tveganjem za raka na želodcu (popravljeni OR = 1,37, 95% CI = 1.07-1.74 za CT in prilagodi OR = 1,30, 95% IZ = 1,03-1,63 za CT /TT). Ugotovljeno je bilo tudi Podobna povezava z rakom na želodcu za PSCA
rs2976392 G > polimorfizma (AG proti GG: prilagojen ALI = 1,30, 95% CI = 1.02-1.65 in AG /AA vs GG : prilagojen OR = 1,26, 95% IZ = 1,00-1,59). Poleg tega PLCE1
rs2274223 A > G polimorfizem je bilo ugotovljeno, da znatno poveča tveganje za nastanek raka želodca pod homozigotno modela (AG proti AA: popravljeni ali = 1,48, 95% CI = 1.15-1.90), in prevladujočega modela (AG /GG vs AA: prilagojen OR = 1,45, 95% CI = 1,14-1,84). V nasprotju s tem, MUC1
rs4072037 T > C polimorfizem dokazano znatno zmanjšala želodec občutljivost raka pod homozigotno modela (CT vs TT: prilagojen ALI = 0,77, 95% IZ = 0.60-0.98). Poleg tega smo ugotovili, da osebe z 2-4 genotipov tveganja (genotipa tveganja iz CT /TT za rs2294008 C > T, AG /AA za rs2976392 G > A, AG /GG za rs2274223 A > G, in TT za rs4072037 T >C polimorfizem) je imela bistveno povečano tveganje (prilagojena ali = 1,30, 95% IZ = 1.03-1.64) v primerjavi s tistimi, ki samo 0-1 genotipov tveganja

Stratifikacija analiza

Združenja. med variantnih genotipov in tveganjem za nastanek raka želodca se je še ocenili v analizi stratifikacije glede na starost, spol, kadilski status, pakiranja leto, pitno statusa, in ITM pod prevladujočim genetskega modela (tabela 3). Ugotovili smo, da je PSCA
rs2294008 CT /TT genotipi so povezana s povečanim tveganjem za raka želodca pri mlajših osebah, lahka kadilci, in osebah z rakom, ki niso Cardia, v primerjavi z zadevnimi referenčnimi skupinami. V zvezi s PLCE1
rs2274223 A > G polimorfizem, stratifikacija analize ugotovili povečano tveganje za nastanek raka želodca z AG /GG genotipov pri mlajših udeležencev, ženske, nikoli za kadilce, nikoli pivci, udeleženci z visokim ITM, in predmete z Cardia raka ali faza TNM III + IV bolezni. Medtem ko so bile združene genotipi tveganja, smo ugotovili, da so predmeti z 2-4 genotipov tveganja večja verjetnost za razvoj raka na želodcu med mlajšo podskupine, moški, kdaj za kadilce, ali podskupine z visokim ITM in bolniki z rakom, ki niso Cardia, od vsakokratnega podskupini kolegi z genotipom 0-1 tveganja. V nadaljnji preskusi heterogenosti za slojevito analize ni zaznati nobene razlike med podskupinami po različnih sodelavcev različna glede na, kot so starost, spol, in kajenja. Poleg tega ni bilo statistično dokazov o interakciji med temi izbranimi SNP in sodelavcev različna glede (starost, spol, indeks telesne mase, itd), bodisi.

Vrednosti FPRP za vse statistično pomemben rezultat so prikazani v tabeli 4. False -positive verjetnost vrednosti poročilo za združenja med tveganjem za nastanek raka želodca in pogostnosti genotipov izbranih genov. 4, s prednastavljenim predhodnim verjetnostjo 0,1 in prag FPRP 0,2. FPRP analiza je pokazala, da je pomembna povezava med PSCA
rs2294008 C > je T in raka želodca tveganja omeniti pod homozigotno modelu. Poleg tega je združenje tudi zaslužijo pozornost pri mlajših osebah in tistih, ki imajo ne-Kardije. Prav tako je pomembna povezava z PLCE1
rs2274223 G > je Pomembna za vse osebe, kakor tudi za mlajše osebe, nikoli kadilcev, nikoli pivcev, tiste, ki imajo ITM > 24,0, Cardia raka ali stopnja TNM III + IV bolezni. FPRP potrdili tudi pomembno povezavo z PSCA
rs2976392 G > A pod homozigotno in prevladujočih modelov in pomembna povezava z MUC1
rs4072037 T > C pod homozigotno modelu. Kar kombiniranih genotipov smo potrdili pomembno združenje za osebah z zasipanjem leto ≤27 ali raka ne Cardia. Relativno je bilo do konca pomembnih povezav med izbranimi polimorfizmov in tveganjem za nastanek raka želodca, ki se lahko pripisati relativni majhnosti vzorca te študije kot tudi zmernimi učinki izbranih SNP ugotovljeno večje vrednosti FPRP. Te ugotovitve je treba dodatno potrditev v preiskavah v velikosti vzorca.

Pogovor

V sedanji študiji primerov in kontrol, ki temelji bolnišnici, smo raziskovali potencialne združenja PSCA
rs2294008 C >T in rs2976392 G > a, PLCE1
rs2274223 a > G in MUC1
rs4072037 T > C polimorfizmov z občutljivostjo raka želodca med kitajskim prebivalstvom. Ugotovili smo, da je PSCA
rs2294008 CT /TT, PSCA
rs2976392 AG /AA in PLCE1
rs2274223 AG /GG genotipi so bile povezane z znatno povečano tveganje za nastanek raka želodca v kitajsko prebivalstvo, medtem ko je MUC1
rs4072037 T > C so bile povezane z zmanjšano občutljivostjo za raka želodca. Prav tako smo ugotovili, da imajo subjekti, ki opravljajo 2-4 genotipov tveganja z izrazito povečano tveganje za nastanek raka želodca, v primerjavi s tistimi, ki opravljajo 0-1 genotip tveganja. Učinek kombiniranih genotipov tveganja na tveganje za nastanek raka je bolj očitna pri mlajših osebah, moških in kdaj za kadilce, osebah z visokim ITM in non-Cardia raka na želodcu. Te ugotovitve kažejo, da so izbrani SNP iz GWASs prispevajo k želodčne rakotvornost.

Doslej so štiri GWASs raziskovali tveganje za nastanek raka želodca [10,16,19,20], kot je omenjeno v uvodu, ki je privedla do ugotovitev štirih SNP interesa. PSCA
rs2294008 C > rezultati T v Met /THR zamenjavo, in PSCA
rs2976392 G > A, lahko spremeni transkripcijski faktor zavezujoč stran aktivnost gena [10]. Poleg tega MUC1
rs4072037 T > C, lahko privede do spajanja sprememb, ker PLCE1
rs2274223 A >G lahko povzroči, da Arg do njegove spremembe, ki so znatno povezano s tveganjem za raka na želodcu v začetni fazi skeniranja [19]. Medtem ko so bile združene skeniranje in validacijske faze, so opazili genom za celotno združenje le za gt PLCE1
rs2274223 A &G polimorfizem, ne pa MUC1
rs4072037 T > C polimorfizem [19]. Istočasno, Wang et al. tudi ugotovila, je bila rs2274223 polimorfizem povezana z želodčno Cardia adenokarcinom ( P
= 1,74 × 10 -39) [20]. Nedavno GWAS Shi et al. [16], je potrdila že poročali združenja niso Cardia želodca dovzetnosti za raka z ne le PSCA
rs2294008 in rs2976392, ampak tudi MUC1
rs4072037.

Ugotovitve iz prejšnje GWASs so se pogosto potrjeni med različnimi etničnimi prebivalstva v zadnjih letih (S1 tabela). Na primer, Wu et al. [18] je pokazala, da je bila povezava med PSCA
rs2294008 in raka na želodcu bolj izrazit pri bolnikih z ne-Cardia želodcu raka kot tisti z rakom Cardia želodcu. Pomemben združenje je bila potrjena tudi študije, izvedene med različnimi etničnimi skupinami po vsem svetu [14-17,19,36-40]. Vendar pa je povezava med rs2294008 C > T in želodčnega raka ni bila potrjena z drugimi [12,41]. Za razrešitev nesoglasja, je bilo šest meta-analize za ovrednotenje razmerja med PSCA
polimorfizmov in občutljivost želodčnega raka [42-47]. Qiao sod. [42], vključenih osem študije primerov in kontrol iz sedmih člankov in ugotovili, da alel T rs2294008 in rs2976392 A alel so bile precej povezano s povečanim tveganjem za raka želodca. Te ugotovitve so bile potrjene tudi z drugimi meta-analizo [43-46]. V zadnjem času, za dostop do prispevke teh dveh široko raziskanih PSCA
SNP na občutljivost raka želodca, Gu et al. [47] opravili meta analizo 16 študij s skupno 18,820 primerov in 35,756 kontrol. Je zbrana ali je bila 1,46 (95% IZ = 1,30-1,69) za PSCA
rs2294008 in 1,49 (95% IZ = 1,22-1,82) za rs2976392 polimorfizmov. Poleg tega, ko je ugotovil Abnet et al. [19] Wang et al. [23], PLCE1
rs2274223 polimorfizem so temeljito raziskan med različnimi etničnimi skupinami v različnih vrst raka, kot so rak želodca, rak požiralnika, raka glave in vratu, in žolčnika raka [48-60]. Vendar pa sklepi o pridružitvi med gt PLCE1
rs2274223 A &G polimorfizem in tveganja raka so sporna. Pomemben združenje je bilo opaziti v nekaterih študijah [49-52,56,58], v drugih pa ne [48,53-55,57,59,60]. Štiri meta-analize so bile izvedene, da ponovno oceni združenja [27-30]. Hao sod. [27] je bilo vključenih skupno 13 študij primerov in kontrol, od katerih je pet študij s 5127 primerov in 5791 kontrol preučiti vlogo tega SNP v tveganje za nastanek raka želodca. Ugotovili so statistično pomembne zveze med rs2274223 polimorfizma in povečanim tveganjem za raka na želodcu po homozigotno model in heterozigotnem modelu. Ti rezultati so skladni s tistimi iz drugih treh meta-analize, ki so vključevale manj pridružitvene študije o raku želodca. Kot je na MUC1
rs4072037 T > C polimorfizem, je povezava med tem polimorfizem in rakom želodca potrjena med različnimi etničnimi skupinami [49,53,61]. Saeki sod. [61] in Zhang et al. [49] je pokazala, da je bila ta polimorfizem povezana z zmanjšanim želodčnega raka med Azijci, medtem ko ni bilo pomembno združenje je med belci [53] .There bila samo ena meta-analize za MUC1
rs4072037 T > C polimorfizma [31 ], v kateri je bilo vključenih skupno 10 študij z 6580 želodca primerov raka in 10324 kontrol. Ugotovljeno je bilo, da je MUC1
alel rs4072037 G je značilno povezani z manjšim želodčne tveganje za nastanek raka (OR = 0,72, 95% CI = 0,68-0,77), v primerjavi z A alel.

Številne študije so bile izvedene za potrditev ugotovitve GWAS za raka na želodcu. Kljub temu pa nobena od študij pokriva vse štiri SNP, kot smo tu, razen ene študije, ki jo Palmer et al poteka. med belci, ki preiskujejo PLCE1
rs2274223, C20orf54
rs13042395 in MUC1
rs4072037 polimorfizmi [53]. Ugotovili so, da je MUC1
rs4072037 polimorfizem je bila povezana z manjšim tveganjem za raka na debelem črevesu tipa želodca (OR = 0,4, 95% IZ = 0,2-0,9); Vendar pa ni bilo združenja našel tako s PLCE1
rs2274223 in C20orf54
rs13042395. V trenutni študiji smo ugotovili vse štiri SNP so individualno povezan z dovzetnostjo raka želodca med Kitajcih. Prav tako smo ugotovili, da je imel 2-4 genotip tveganja prevozniki veliko večje tveganje za raka na želodcu, kot na 0-1 prevoznikov. Ta pojav je bolj izrazit pri mlajših osebah, moških in kdaj kadilec, tiste z visokim ITM, in osebah z non-Cardia raka na želodcu. Cigaretni dim vsebuje približno 55 rakotvorne snovi, ki lahko povzročajo reaktivne kisikove spojine, da sproži različne odškodnine DNK. Moški kdaj kadilci stalno izpostavljena cigarete dimu morda pristana DNK škodo, ki lahko pridejo v stik z genetskimi razlike vodijo do razvoja raka. Z drugimi besedami, lahko gen interakcije z okoljem, igrajo pomembno vlogo pri uvajanju in spodbujanju rakotvornost [62]. Visoka ITM je bil priznan kot dejavnik tveganja za raka na želodcu v zahodnih državah [4]. Cardia raka na želodcu je lokaliziran na gastroezofagealnem prehodu in se lahko razlikujejo od raka niso Cardia o epidemioloških značilnostih in klinične značilnosti [16] .Zato je povezava z ne-Cardia raka na želodcu je zdelo, da je biologija verjetna.

povzetek, smo potrdili povezavo med štirimi prejšnjih GWAS-razpoznavna SNP in občutljivost raka želodca v tej študiji primerov in kontrol temelji bolnišnici. Vendar pa je treba obravnavati nekaj omejitev v tej študiji. Prvič, neločljivo izbor pristranskosti in informacije pristranskosti lahko pripeti v tej bolnišnici temelji sodni nadzor namenjen študijo. Drugič, smo vključili le štiri SNP v trenutne študije, namesto da zajema vse obetavne GWAS-razpoznavna SNP. Na splošno lahko študije, ki obsegajo več SNP potencialno povezan z rakom na želodcu bolj lahko osvetljuje natančno vlogo genetskih variant v želodcu rakotvornost. Poleg tega je zaradi narave retrospektivne načrta študije, nismo imeli zanesljivih in zadostnih informacij za posameznike na druge vplive iz okolja, kot so H
. pylori
okužba, izpostavljenost s prehrano, poklic, kot tudi želodec razvrstitev in podtipe, kot so črevesne in razpršeni podtipa raka. Pomanjkanje vse dragocene informacije, nas ovira za nadaljnji preiskavi etiološki pomen teh dejavnikov v želodcu rakotvornost. Kljub tem omejitvam, so ugotovitve iz naše raziskave informativne raziskovalcev in zdravnikov na tem področju. Dodatne dobro zasnovan prihodnje študije, ki temeljijo na prebivalstvu so potrebni, da še dodatno potrjujejo naše ugotovitve, zlasti tiste s podrobnimi informacijami o dejavnikih tveganja za raka na želodcu in velikosti vzorca, vključno z različnimi etničnimi skupinami.

Podpora Informacije
S1 podatkov. Original Data
doi:. 10,1371 /journal.pone.0117576.s001
(XLS)
S1 tabeli. Značilnosti predhodnih študijah, osredotočenih na teh štirih SNP
doi:. 10,1371 /journal.pone.0117576.s002
(DOC)

Other Languages