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Un estudio destaca una nueva forma de identificar genes de resistencia a los antibióticos

Los simios en los zoológicos de EE. UU. Albergan comunidades bacterianas en sus tractos intestinales que son más similares a las de las personas que consumen una dieta no occidental que a la composición intestinal de sus primos simios salvajes. según un nuevo estudio de la Universidad de Washington en St. Louis.

Más lejos, incluso los simios salvajes que nunca han encontrado antibióticos albergan microbios con genes de resistencia a los antibióticos.

Los hallazgos sugieren que el contacto con las personas da forma a las comunidades microbianas intestinales, o microbiomas, de gorilas y chimpancés, y que los microbiomas intestinales de los simios salvajes proporcionan pistas sobre las interacciones entre humanos y simios que podrían informar los esfuerzos para proteger a las especies en peligro de extinción.

El estudio también destaca una forma de identificar nuevos genes de resistencia a los antibióticos antes de que se establezcan ampliamente en bacterias y personas. dando a los investigadores tiempo para desarrollar herramientas para contrarrestar dichos genes antes de que amenacen la salud humana.

El estudio está disponible en línea en The ISME Journal.

El microbioma intestinal nos aporta vitaminas, ayuda a digerir los alimentos, regula la inflamación y mantiene bajo control a los microbios que causan enfermedades. Los antibióticos pueden cambiar la composición del microbioma intestinal de manera duradera.

"Es difícil averiguar exactamente cómo afectan los antibióticos al microbioma intestinal humano cuando casi todo el mundo nace con insectos que ya tienen genes de resistencia a los antibióticos". "dijo el autor principal Gautam Dantas, Doctor, profesor de patología e inmunología, de microbiología molecular, y de ingeniería biomédica en la Facultad de Medicina de la Universidad de Washington. "Los simios salvajes son lo más parecido que tenemos a los humanos antes de los antibióticos. Afortunadamente, tuvimos la oportunidad de trabajar con dos primatólogos muy respetados ".

Coautores Crickette Sanz, Doctor, profesor asociado de antropología biológica en Artes y Ciencias en la Universidad de Washington, y David Morgan, Doctor, investigador del Centro Lester E. Fisher para el estudio y la conservación de los simios en el zoológico de Lincoln Park en Chicago y científico investigador honorario de la Universidad de Washington, estudie chimpancés y gorilas salvajes en un área remota del Parque Nacional Nouabalé-Ndoki en la República del Congo.

El parque está gestionado por la Wildlife Conservation Society y el gobierno congoleño. Para aprender sobre los microbiomas intestinales de los simios, Sanz, Morgan y sus equipos de campo siguieron a los simios en grupos conocidos y recolectaron discretamente muestras fecales de 18 chimpancés salvajes y 28 gorilas salvajes.

El método de muestreo no invasivo permitió a los investigadores recopilar datos sobre los simios sin molestarlos.

Las muestras se almacenaron en nitrógeno líquido, llevado a la sede del parque, y transportado en canoa por el río Sangha y luego en camión a Brazzaville, la capital de la República del Congo, donde se mantuvieron en un congelador hasta que pudieran ser enviados al laboratorio de Dantas.

Los investigadores también recolectaron y enviaron muestras fecales de 81 personas que vivían en las afueras del parque.

Mientras tanto, Dantas y el primer autor Tayte Campbell, PhD, entonces un estudiante de posgrado en el laboratorio de Dantas, organizó la obtención de muestras fecales de 18 chimpancés y 15 gorilas que vivían en el zoológico de Saint Louis o en el zoológico de Lincoln Park.

Los investigadores identificaron los tipos de bacterias y los genes antibióticos presentes en el gorila, muestras de chimpancés y humanos, y comparó los resultados con los datos disponibles públicamente sobre personas que viven en los EE. UU., Perú, El Salvador, Malawi, Tanzania, o Venezuela y sigue al cazador-recolector, agricultor rural, o estilos de vida urbanos.

Los microbiomas intestinales de las personas cuyos datos se incluyeron en el estudio se dividieron en dos grupos. En uno estaban los cazadores-recolectores y agricultores rurales que típicamente comen una dieta rica en vegetales y liviana en carne y grasa; este grupo incluía a personas de las afueras del parque nacional de la República del Congo.

En el segundo grupo estaban las personas urbanas que comen una dieta occidental rica en carne. Los gorilas y chimpancés salvajes formaron un tercer grupo distinto de ambos grupos humanos. Pero los simios cautivos entraron en el primer grupo; eran más similares a las personas que consumían dietas no occidentales.

"Los chimpancés están en peligro, y los gorilas de las tierras bajas occidentales están en peligro crítico de extinción; sus principales amenazas son la destrucción del hábitat, caza furtiva y enfermedades, "Dijo Sanz." Medir el microbioma intestinal podría ser una forma de monitorear la exposición de los simios a las amenazas antropogénicas para que podamos identificar áreas de preocupación y desarrollar de manera efectiva, estrategias de mitigación basadas en evidencias ".

Los investigadores también identificaron varios genes de resistencia a antibióticos previamente desconocidos en los simios salvajes y en personas de la República del Congo. incluyendo uno que confiere resistencia a la colistina, un antibiótico de último recurso. Por ahora, los genes residen en bacterias inofensivas para los humanos.

Pero las bacterias tienen la capacidad de compartir genes, por lo que cualquier gen de resistencia a los antibióticos podría convertirse en una especie de bacteria más peligrosa.

"Las raras oportunidades de muestreo de simios salvajes como en este estudio nos dan una mirada al futuro, ", Dijo Campbell." Cuando encontramos estos nuevos genes de resistencia a los antibióticos en el medio ambiente, podemos estudiarlos y posiblemente encontrar formas de inhibirlos antes de que aparezcan en patógenos humanos y dificulten mucho el tratamiento de las infecciones ".

"Sería muy interesante ampliar esta investigación a una gama más amplia de contextos de conservación, como zonas de tala comercial y operaciones turísticas, "Agregó Morgan.

"Con la llegada de las actividades humanas y las perturbaciones antropogénicas asociadas, Los simios salvajes pueden estar expuestos a genes de resistencia a antibióticos. No sabemos mucho sobre cómo se propaga la resistencia a los antibióticos a través de entornos naturales, por lo que podría tener implicaciones para la salud pública humana que aún no comprendemos. Eso es algo que nos gustaría investigar ".

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