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Un chercheur en génomique d'UCicago remporte le prix du nouvel innovateur des administrateurs du NIH

Oni Basu, Doctorat, professeur adjoint de médecine génétique à l'Université de Chicago, a reçu le prestigieux prix du nouvel innovateur du directeur des National Institutes of Health (NIH).

Ces récompenses, partie du NIH à haut risque, Programme de recherche à haut rendement, sont donnés à des scientifiques exceptionnellement créatifs proposant des risques élevés, recherche à fort impact à toutes les étapes de la carrière. Le prix du nouvel innovateur, financé par le Fonds commun des NIH, se concentre sur le soutien aux chercheurs en début de carrière, soutenir la recherche inhabituellement innovante de chercheurs en début de carrière qui sont dans les 10 ans suivant l'obtention de leur diplôme final. Cette année, 53 chercheurs ont été récompensés par le prix.

L'étendue de la science innovante mise de l'avant par la cohorte 2020 de chercheurs en début de carrière et de chercheurs chevronnés est impressionnante et inspirante. Je suis convaincu que leurs travaux propulseront la recherche biomédicale et comportementale et conduiront à des améliorations de la santé humaine. »

Francis S. Collins, MARYLAND., Doctorat., Directeur du NIH

Depuis son arrivée à UChicago en 2016, Basu a travaillé sur une variété de projets de recherche. Elle étudie des systèmes biologiques complexes à l'aide de la génomique à cellule unique - en isolant des cellules individuelles et en séquençant leurs informations génétiques pour obtenir une meilleure image des différences cellulaires au sein d'un échantillon de tissu. Cette, à son tour, donne un aperçu des sous-types uniques de cellules et de leurs fonctions dans un tissu donné.

Basu formé dans les laboratoires d'Aviv Regev, Doctorat, et David Weitz, Doctorat, tous deux pionniers dans le domaine de la génomique unicellulaire et de la microfluidique. Basu elle-même est co-inventeur des premières technologies de séquençage d'ARN à cellule unique et à noyau unique à haut débit qui ont permis leur adoption à grande échelle dans le monde entier.

Le laboratoire de recherche de Basu développe et applique de nouvelles technologies pour effectuer un profilage épigénomique et transcriptomique unicellulaire à haut débit allant jusqu'à 100, 000 cellules à la fois. Avec cette approche, son équipe travaille sur l'analyse et la classification de types cellulaires uniques dans une variété de tissus, y compris les cerveaux de souris et humains et les populations de cellules microbiennes.

Ses recherches contribuent également à l'Atlas des cellules humaines, un projet mondial impliquant des experts en génomique du monde entier visant à créer un atlas complet de tous les types de cellules du corps humain, à la fois en bonne santé et en maladie. Elle travaille à l'identification et à la caractérisation des types de cellules dans l'intestin humain afin d'établir un atlas cellulaire de l'iléon, la partie terminale de l'intestin grêle. En utilisant des échantillons de biopsie intestinale de patients avec et sans maladie de Crohn, elle cherche à mieux comprendre les modèles d'expression des types cellulaires et spécifiques à la maladie associés à la maladie débilitante.

Avec le soutien du Prix Nouvel Innovateur, Basu prévoit de pousser cette technologie à cellule unique dans le monde microbien. La variété des types de cellules uniques dans les organismes multicellulaires comme les humains a conduit à la nécessité d'étudier le génome au niveau de la cellule unique; un niveau similaire de diversité peut également être attendu dans les communautés microbiennes. Une meilleure compréhension de cette hétérogénéité aidera à répondre à des questions sur des sujets complexes tels que l'aptitude évolutive et la résistance aux antimicrobiens.

La production d'outils capables d'étudier les différences entre les cellules microbiennes à une résolution unicellulaire reste un défi. Basu et son équipe travaillent au développement d'outils microfluidiques et génomiques qui permettront aux chercheurs de décrypter les interactions complexes entre les populations microbiennes, l'interaction hôte-pathogène et le microbiome.

Le risque élevé, Le programme de recherche à haut rendement catalyse la découverte scientifique en soutenant des propositions de recherche qui, en raison de leur risque inhérent, peuvent avoir des difficultés dans le processus traditionnel d'examen par les pairs malgré leur potentiel de transformation. Les candidats au programme sont encouragés à sortir des sentiers battus et à poursuivre des idées novatrices dans tout domaine de recherche pertinent pour la mission du NIH de faire progresser les connaissances et d'améliorer la santé.