La recherche sur le microbiome de la patate douce est une étape majeure pour améliorer le rendement

Cultivé dans le monde entier, les patates douces sont une source importante de nutrition, en particulier dans les régimes alimentaires de l'Afrique subsaharienne et de l'Asie. Les patates douces sont particulièrement importantes pour l'Afrique subsaharienne en tant que source de vitamine A, un nutriment généralement déficient dans la région.

Alors que la Chine produit actuellement le plus de patates douces par pays, l'Afrique subsaharienne a plus de terres consacrées à la patate douce et continue d'accroître sa production. Les agriculteurs d'ailleurs cultivent également de plus en plus de patates douces.

Malgré l'importance de la patate douce, on sait peu de choses sur le microbiome de la patate douce.

Le microbiome d'une plante impacte profondément sa santé et son développement. Nous avons cherché à mieux comprendre le microbiome de la patate douce en le caractérisant au sein et entre les exploitations agricoles réelles. »

Brooke Bissinger, Entomologiste

Bissinger a récemment publié une étude sur les patates douces en Journal des Phytobiomes.

Bissinger et ses collègues travaillent pour AgBiome, qui a été financé par la Fondation Bill &Melinda Gates pour identifier et développer des microbes bénéfiques qui protégeraient les patates douces dans le monde en développement contre les insectes.

Ils ont profité de cette opportunité pour caractériser le microbiome de la patate douce afin d'éclairer leur projet et de fournir des informations à d'autres chercheurs intéressés par des travaux similaires.

Ils ont trouvé que, similaire à des cultures plus couramment étudiées, le microbiome de la patate douce suit le modèle de développement en deux étapes.

« Nous avons démontré une variabilité frappante dans les micro-organismes qui composent le microbiome de la patate douce dans une seule ferme. Malgré cette variabilité, nous avons trouvé des points communs dans la façon dont le microbiome se développe dans les champs d'une seule ferme de patates douces et dans deux fermes de la même région, " dit Charles Pépé-Ranney, scientifique des données en génomique microbienne et auteur principal de l'article.

Il s'agit de la première étude à caractériser le microbiome de la patate douce à l'aide de méthodes modernes, technologie de séquençage de nouvelle génération - une première étape importante vers l'exploitation du microbiome pour améliorer le rendement de la patate douce.

« A noter également, notre étude suggère que la patate douce présente un fort défi écologique pour ses endophytes (microbes qui vivent à l'intérieur d'une plante), " dit Pepe-Ranney. " Si nous voulons développer un endophyte de la patate douce qui protège la patate douce des parasites, par exemple, cet endophyte bénéfique pour la patate douce doit pouvoir résister à la forte pression écologique de la patate douce elle-même."

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