Az NIH tudósai új mintaelőkészítési módszert dolgoznak ki a SARS-CoV-2 kimutatására

A Nemzeti Egészségügyi Intézet (NIH) tudósai új mintaelőkészítési módszert dolgoztak ki a SARS-CoV-2 kimutatására, a COVID-19-t okozó vírus. A módszer megkerüli a vírus genetikai RNS -anyagának kinyerését, egyszerűsíti a minta tisztítását, és potenciálisan csökkenti a vizsgálati időt és költségeket. A módszer a National Eye Institute (NEI) kutatói együttműködésének eredménye, az NIH Klinikai Központ (CC), valamint az Országos Fogászati ​​és Koponya -arc -kutató Intézet (NIDCR).

A diagnosztikai vizsgálatok továbbra is kulcsfontosságú eszközök a COVID-19 világjárvány elleni küzdelemben. A SARS-CoV-2 kimutatására szolgáló standard tesztek a vírus RNS-nek a kimutatható szintre történő felerősítését foglalják magukban, kvantitatív reverz transzkripciós PCR (RT-qPCR) nevű technikával. De először, az RNS -t ki kell vonni a mintából. Az RNS-kivonó készletek gyártói nehezen tudtak lépést tartani a kereslettel a COVID-19 járvány idején, akadályozza a tesztelési kapacitást világszerte. Új vírusváltozatok megjelenésével, szükség van a jobbra, a gyorsabb tesztek nagyobbak, mint valaha.

Robert B. Hufnagel vezette csapat, M.D., Ph.D., a NEI Orvosi Genetikai és Szemészeti Genomikai Egység vezetője, és Bin Guan, Ph.D., munkatárs a NEI Szemészeti Genomikai Laboratóriumában, a Bio-Rad laboratóriumi ellátó cég Chelex 100 gyantának nevezett kelátképző szert használta a SARS-CoV-2 RNS megőrzésére a mintákban RT-qPCR segítségével.

"Különböző virionkoncentrációjú nasopharyngealis és nyálmintákat használtunk annak értékelésére, hogy használhatók -e közvetlen RNS -kimutatásra, - mondta Guan, a technikáról szóló jelentés vezető szerzője, amely ezen a héten jelent meg az iScience -ben. "A válasz igen volt, kifejezetten nagy érzékenységgel. Is, ez a készítmény inaktiválta a vírust, biztonságosabbá téve a laboratóriumi személyzet számára a pozitív minták kezelését. "

Hufnagel csapata felfedezése során számos vegyi anyagot tesztelt szintetikus és emberi minták segítségével, hogy azonosítsa azokat, amelyek minimális lebomlással képesek megőrizni az RNS-t a mintákban, miközben lehetővé teszik a vírus közvetlen kimutatását az RT-qPCR segítségével.

A teszt érvényesítéséhez, Blake M. Warner, a NIDCR D.D.S., Ph.D., M.P.H., és csapata betegmintákat gyűjtött (az NIH IRB 20-D-0094 kutatási protokoll alapján), és azokat akár vírusos szállítóközegben tárolta, vagy az újonnan kifejlesztett kelátképző gyanta-puffert az NIH Tüneti Vizsgáló Létesítményében.

A vírusszállító közegekben lévő mintákat az NIH Klinikai Központ COVID-19 tesztelő csoportja tesztelte, Karen M. Frank vezetésével, M.D., Ph.D., hagyományos RNS extrakció és RT-qPCR tesztelés alkalmazásával. A kelátképző gyanta pufferben lévő mintákat felmelegítettük, és a vírus RNS-t azután, RT-qPCR tesztelte. Az új készítmény jelentősen megnövelte a tesztelésre rendelkezésre álló RNS -hozamot, a standard módszerhez képest.

Úgy gondoljuk, hogy ennek az új módszertannak egyértelmű előnyei vannak az érzékenység növelésében, költség- és időmegtakarítás a teszteléshez. A módszer stabilizálja az RNS -t szobahőmérsékleten a könnyebb szállítás érdekében, tárolás, és kezelés klinikai körülmények között. "

Robert B. Hufnagel, M.D., Ph.D., Az NEI Orvosi Genetikai és Szemészeti Genomikai Egység vezetője

A NEI védte a szellemi tulajdont e technológia körül, és partnereket keres a közös fejlesztéshez/engedélyezéshez. További információért lépjen kapcsolatba az [email protected] szolgáltatással.

• Új bizonyítékokon alapuló megközelítés a kiváló minőségű szénhidráttartalmú élelmiszerek meghatározásához
• A tudósok dokumentálják az antimikrobiális rezisztens tüdőpestis emberről emberre terjedését