PLoS ONE: MDM2 SNP309 rs2279744 polimorfizmas ir skrandžio vėžio rizika: metaanalizė

Anotacija

Fonas

MDM2 yra pagrindinis neigiamas reguliatorius p53, ir vieną nukleotidų polimorfizmo (SNP) į MDM2
rengėjas regionas SNP309 buvo įrodyta, kad būti susijęs su padidėjusia MDM2
išraiškos ir gerokai jaunesnio amžiaus pasireiškimo kelių navikų, įskaitant skrandžio vėžio. Keletas tyrimų buvo paskelbtas įvertinti ryšį tarp SNP309 ir skrandžio vėžio rizika asociacija. Tačiau rezultatai lieka prieštaringa, o ne galutiniai.

Tikslas

Šios studijos tikslas buvo įvertinti tarp asociaciją MDM2
SNP309 polimorfizmas ir skrandžio pavojus.

metodai

atliko metaanalizę ištirti šį ryšį. Kursai koeficientai (PVA) ir 95% pasikliautinieji intervalai (CIS) buvo naudojamas įvertinti asociacijos stiprumą. Suminė AR buvo atlikti codominant modelis, paplitęs modelis, ir recesyvinis modelį, atitinkamai.

Rezultatai

Buvo nustatyti penki paskelbti teismo kontrolės tyrimus, įskaitant 1,621 skrandžio vėžio atvejų ir 2,639 kontrolės. Mes nustatėme, kad MDM2
SNP309 polimorfizmas buvo susijęs su žymiai padidėjusia skrandžio vėžio rizikos, kai visi tyrimai buvo sujungtos į metaanalizę (GG prieš TT, AR = 1,54; 95% PI = 1.04-2.29 ir GG, palyginti su GT ​​/TT, AR = 1,49, 95% PI = 1,30-1,72). Be to, EGGER testas neparodė jokio paskelbimo šališkumo įrodymų ( P
= 0,799 už GG palyginti TT).

Išvada

Mūsų rezultatai rodo, kad MDM2
SNP309 polimorfizmas gali būti mažai penetrantiška rizikos veiksnys skrandžio vėžio išsivystymo

nurodomoji dalis:. Ma Y Bian J Cao o (2013), MDM2
SNP309 rs2279744 polimorfizmas ir skrandžio vėžio rizika: metaanalizė. PLoS ONE 8 (2): e56918. Doi: 10,1371 /journal.pone.0056918

redaktorius: Hiromu Suzuki, Saporas medicinos universitetas, Japonija

Įstojo: lapkričio 14, 2012; Priėmė: 15 sausio, 2013 m Paskelbta: Vasario 25, 2013

Visos teisės saugomos: © 2013 Ma et al., Tai atviros prieigos straipsnis platinama pagal Creative Commons Attribution licencija, kuri leidžia nevaržomai naudotis, paskirstymo ir dauginimąsi bet kokioje laikmenoje sąlygomis, su sąlyga, kad pirmasis autorius ir šaltinis įskaitomos

Finansavimas:. Autoriai neturi lėšų arba parama pranešti

konkuruojančių interesų.. autoriai pareiškė, kad nėra konkuruojantys interesai egzistuoja

Įvadas

Skrandžio vėžys yra ketvirtas dažniausiai diagnozuojama vėžio ir antra pagrindinė priežastis, dėl vėžio mirties visame pasaulyje [1]. Kaip kitų sudėtingų ligų, skrandžio vėžys yra sudėtingas bruožas sukelia abiejų genetinių ir aplinkos veiksnių [2]. Daug epidemiologinių tyrimų rezultatai patvirtino mažo vartojimo šviežių vaisių ir daržovių, vartoti daug sūraus maisto, rūkymo poveikį ir Helicobacter pylori
( h. Pylori
) infekcija dėl plėtra skrandžio vėžiu [3]. Papildomai šalia aukščiau minėtų išorinių veiksnių, genetinių polimorfizmų kancerogenas detoksikacijos, antioksidantas apsaugos, DNR remonto ir ląstelių proliferacijos procesus yra taip pat labai svarbu į skrandžio vėžio išsivystymo [4], [5]. Navikas slopintuvas p53 yra pagrindinis tarpininkas daugelio mobiliojo ryšio funkcijas, įskaitant ląstelių ciklo, apoptozės, slopindamas angiogenezę ir ląstelių senėjimo [6]. Somatinių mutacijų, kurios inaktyvuoja p53 geną buvo rasta ne mažiau kaip pusė visų žmogaus solidinių navikų, pabrėžiant esminį vaidmenį p53 baltymo kancerogenezėje [7]. MDM2 yra esminis neigiamas reguliatorius p53 per keletą mechanizmų. MDM2 tiesiogiai jungiasi prie p53, todėl p53 transactivation veiklos [8] slopinimui. MDM2 taip pat veikia kaip Ubikvitino baltymų ligaze ir kontroliuoja p53 nukreipiant jį proteasomal degradacijos [9]

vieno nukleotido polimorfizmas į MDM2
promotoriaus, SNP309 T >. G (rs2279744) buvo nustatyta [10], ir įrodyta, kad sukelti padidėjusią MDM2
RNR ir baltymų. Be to, buvo įrodyta, kad padidėjęs lygis MDM2
buvo sąlygotas ir priklauso nuo transkripcijos faktorius SP1. Įdomu tai, stiprinimas vien MDM2
gali sustiprinti tumorigenezei [11], didinant galimybę, kad G alelis SNP309 gali kelti vėžį lemiantį alelį savo teisę.

Neseniai skaičių tyrimai pranešė apie vaidmenį, MDM2
SNP309 polimorfizmas skrandžio vėžio rizika, tačiau rezultatai yra abejotini, iš dalies dėl galimo mažo efekto polimorfizmo skrandžio vėžio ir santykinai mažo dydžio kiekvienoje iš paskelbtų tyrimų , Todėl mes atliko metaanalizę visų tinkamų atvejo-kontrolės tyrimuose įvertinti bendrą skrandžio vėžio riziką, MDM2
SNP309 polimorfizmas, taip pat apskaičiuoti skirtumą tarp-studijos heterogeniškumas ir galimo šališkumo.

medžiagos ir metodai

identifikavimas ir tinkamumas atitinkamų tyrimų

ieškoma elektroninę literatūrą PubMed ir EMBASE visų atitinkamų straipsnių (paskutinis paieška atnaujinimas buvo Rgp 10, 2012 naudojant paiešką terminai ", MDM
2", "polimorfizmas" ir "skrandžio vėžio). Krata buvo tik anglų kalba dokumentus. Papildomi tyrimai buvo identifikuojama rankų ieškodamas originalių tyrimų nuorodomis. Iš tyrimų su tų pačių ar sutampančių duomenų paskelbtais tų pačių tyrėjų, mes išrinkome pačius naujausius tuos su didžiausia tiriamųjų skaičiaus. Tyrimuose dalyvavo mūsų metaanalizę turi atitikti šiuos kriterijus: (a) MDM2
SNP309 polimorfizmas ir skrandžio vėžio rizika (B) naudoti atvejo-kontrolės dizainas, ir (C) Įvertinimas turėti likvidaus genotipą dažniai ir pacientams, ir kontrolės populiacijose.

duomenų gavybos

du tyrėjai nepriklausomai išgauti duomenis ir pasiekė sutarimą dėl visų elementų. Kiekvienam tyrime buvo laikomi šie duomenys: autoriaus vardas, publikavimo metus, šalies studijų, etniškumo ir numeriai genotipo atvejais ir kontrolės. Skirtingų etninių tautybių buvo priskirti Europos ir Azijos.

Statistinė analizė

Neapdorotos šansai koeficientai (PVA), kurių 95% patikimumo intervaluose (CIS) buvo naudojami siekiant įvertinti ryšį tarp MDM2
SNP309 polimorfizmo ir skrandžio vėžio riziką. Suminė AR buvo atlikti codominant Modelis (GG, palyginti su TT, GT, lyginant su TT), dominuojanti modelis (GG /GT palyginti TT) ir recesyvinis modelio (GG vs GT /TT), atitinkamai. Atsižvelgiant į šio heterogeniškumas visoje tyrimų galimybę, statistinis tyrimas heterogenišku buvo atliktas remiantis Q statistikos [12]. Jei P
> 0,05, kad Q-testas kuris rodo heterogeniškumo tarp tyrimų stoka, santrauka arba įvertinti kiekvieno tyrimo buvo apskaičiuojamas fiksuotojo poveikių modelio (židinio-Haenzel metodas). Priešingu atveju, buvo naudojamas atsitiktinių poveikių modelis (toliau DerSimonian ir Laird metodas). Jautrumo analizė buvo atlikta siekiant įvertinti rezultatų stabilumą, ty, vieno tyrimo į metaanalizę buvo ištrintas kiekvieną kartą, siekiant atspindėti nustatytas jungtinės ar asmens duomenų įtaką. Piltuvas sklypus ir EGGER anketa tiesinės regresijos testus buvo naudojami siekiant suteikti diagnozę galimą paskelbimo šališkumo. Visi tyrimai buvo atlikti su Stata programinės įrangos (versija 8.2; StataCorp LP College Station, TX), naudojant dvipusio P
vertybes

Rezultatai

Charakteristikos studijų <. Br>

buvo 47 paskelbtus dokumentus, susijusius su paieškos terminus (1 pav.). Per atrankos titulą, 37 šių literatūrų buvo pašalinta po žingsnio (7 nebuvo skrandžio vėžio, 2 buvo apžvalgos ir 28 buvo ne polimorfizmas). Santraukos iš 10 kortelių buvo peržiūrimi ir buvo atmesti papildomai trys tyrimai, paliekant septynis studijas pilną leidinio peržiūrą. Iš jų du straipsniai buvo atmesti (vienas buvo peržiūrą, ir vienas nebuvo atvejo-kontrolės tyrimas). Penkių tinkamų tyrimų, kuriuose dalyvavo 1621 atvejai ir 2,639 kontrolę iš viso buvo įtrauktas į bendrojo fondo analize [13], [14], [15], [16], [17]. Reikalavimus atitinkančių studijų charakteristikos yra apibendrinti 1 lentelėje Šie penki tyrimai buvo visi Azijos palikuonys. Skrandžio vėžio buvo patvirtinta histologiškai arba patologiškai daugeliu tyrimų. Klasikinis polimerazės grandininės reakcijos apribojimas fragmentas ilgio polimorfizmo tyrimas buvo atliktas visų tyrimų. Iš genotipų pasiskirstymas kiekvieno tyrimo kontrolės buvo susitarusi su Hardy-Weinberg pusiausvyros, išskyrus vieną tyrimą [13].

Pagrindiniai rezultatai

Kaip parodyta 2 lentelėje, variantas homozigotos VS buvo susijęs su žymiai padidėjusia skrandžio vėžio, palyginti su laukinio tipo homozigotos TT (OR = 1,54,; 95% PI = 1,04-2,29, 2 pav.). Be to, MDM2
SNP309 polimorfizmas buvo susijęs su žymiai padidėjusia skrandžio vėžio recesyvinis modelis (VS palyginti GT /TT, AR = 1,49, 95% PI = 1.30-1.72), bet ne paplitęs modelis (GG /GT prieš TT, AR = 1,18, 95% PI = 0.84-1.65).

heterogeniškumas ir jautrumo analizę

Reikšmingas heterogeniškumas tarp tyrimų buvo pastebėtas bendras palyginimų išskyrus recesyvinis modelis ( P
_{heterogeniškumas = 0,073 už GG palyginti GT /TT). Įtaka analizė buvo atliekamas siekiant įvertinti kiekvieno atskiro tyrimo įtaką bendrus arba nuosekliam pašalinus atskirų tyrimų. Rezultatai parodė, kad jokia atskira studija reikšmingos įtakos bendrus PVA (3 pav.).}

Leidinys šališkumo

Begg anketa piltuvėlis sklypas ir EGGER testas buvo atliktas siekiant įvertinti paskelbimo šališkumo literatūras. Piltuvo sklypų figūros neatskleidė jokios akivaizdžios asimetrijos įrodymus visų palyginimo modelių. Tada EGGER testas buvo naudojamas teikti statistinę įrodymų piltuvėlis sklypo simetrijos. Rezultatai dar neparodė jokio paskelbimo šališkumo įrodymų (t = -0,28 P
= 0,799 už GG, palyginti su TT, 4 pav.).

Diskusijos

Ankstesnis tyrimas turi prieštaringus rezultatus apie tarp MDM pervežimas 2 SNP309 polimorfizmo ir skrandžio vėžio riziką asociacijos, kuri gali turėti įtakos santykinai mažos imties ir skirtingų genetinių fone. Ohmiya ir kt. [13] ir Yang et al. [14] pranešė, kad dalykai, kurių variantas G alelio MDM2
SNP309 polimorfizmas turėjo didesnę riziką skrandžio vėžio. Atsižvelgiant į svarbius vaidmenis MDM2 į p53 reguliavimas, tai biologiškai tikėtina, kad MDM2
polimorfizmas gali moduliuoti skrandžio vėžio riziką. MDM2
SNP309 polimorfizmas padidina SP1 afinitetas MDM2
promotoriaus ir sukelia padidėjusią MDM2
. Taigi, ląstelių linijas su SNP309 VS ir TG genotipų išreiškė didesnį MDM2
nei su TT genotipų [10]. Tačiau, CHO ir kt. nurodė, kad nebuvo jokio ryšio tarp MDM2
SNP309 polimorfizmas ir skrandžio vėžio rizika [15]. Meta-analizė yra galingas metodas sprendžiant nenuosekli išvadą su gana daug dalykų. Siekiant išspręsti šį konfliktą, meta-analizė penkiuose tyrimuose dalyvavo 1621 atvejai ir 2,639 kontrolę buvo atliktas siekiant gauti tikslesnę įvertinti asociacijos. Mūsų rezultatai rodo, kad MDM2
SNP309 polimorfizmas yra susijęs su žymiai padidėjusia skrandžio vėžio.

turėtų būti sprendžiami Kai ši metaanalizė apribojimus. Pirma, neteisingo klasifikavimo Ligos statusą ir genotipų gali turėti įtakos rezultatams, nes atvejų keliuose tyrimuose nebuvo patvirtinta patologijos ar kitų aukso standartinį metodą, o kokybės kontrolė genotipas taip pat nebuvo gerai dokumentuoti kai kurių tyrimų. Antra, atrankos paklaida galėjo suvaidino tam tikrą vaidmenį, nes genotipas platinimas šio polimorfizmo tarp kontrolinės grupės tiriamųjų nukrypo nuo Hardy-Weinberg pusiausvyros viename tyrime [13], ir visi kontrolės buvo iš ligoninės, kurie gali ir neatspindėti bendro gyventojų , Trečia, mūsų rezultatai buvo grindžiami nekoreguotų skaičiavimais, o tiksliau analizė turėtų būti atliekama, jei atskiri duomenys buvo prieinami, kuri leistų už kitais bendradarbiais variantų, įskaitant aplinkos veiksnius ir kitas gyvenimo būdo koregavimas.

nepaisant šių, mūsų metaanalizė taip pat turėjo tam tikrų privalumų. Pirma, nors studijų dalyvaujančių metaanalizę buvo palyginti mažas, iš visų atvejų ir kontrolės skaičius buvo didelis, kuris gerokai padidino statistinę galią analizė. Antra, atvejo-kontrolės tyrimų, įtrauktų į dabartinę meta-analizės kokybė buvo patenkinama ir susitiko mūsų įtraukties kriterijų. Trečia, mes neaptiko jokio paskelbimo šališkumo, nurodantį, kad visas jungtinis rezultatas turėtų būti nešališka.

Apibendrinant, ši metaanalizė pateikė įrodymų, kad tarp MDM2
SNP309 polimorfizmo ir skrandžio vėžio asociacijos rizika, remti hipotezę, kad SNP309 polimorfizmas gali būti mažai Pralaidumą jautrumas žymeklis skrandžio vėžio. Tačiau dideli mėginių tyrimai yra tikslingas siekiant patvirtinti mūsų išvadas. Be to, vis daugiau genų genų ir genų-aplinkos sąveika, taip pat turėtų būti atsižvelgta į būsimos analizės, kuri leistų geriau, išsamų supratimą tarp MDM2
SNP309 polimorfizmas, ir skrandžio vėžio rizika asociacijos.

• PLoS ONE: Geresnis priešvėžiniai veikla nanodalelių albuminu sujungto Paklitakselis eksperimentinėmis Skrandžio Cancer
• PLoS ONE: Scenos Stratifikuotas analizė prognozinių Reikšmė naviko dydis pacientams, sergantiems Skrandžio Cancer