Mokslininkai žengia dar vieną žingsnį, kad suprastų bakterijas, sukeliančias Salmonella epidemiją

Liverpulio universiteto mokslininkai žengė dar vieną žingsnį į priekį, kad suprastų pražūtingas bakterijas Salmonelės epidemija šiuo metu nusineša apie 400 gyvybių, 000 žmonių kasmet į pietus nuo Sacharos esančioje Afrikoje.

Paskelbta žurnale PLOS biologija ir atstovauja penkerius darbo metus, Integruotos biologijos instituto mokslininkai baigė vieną didžiausių bakterijų lyginamųjų genų ekspresijos tyrimų.

Invazinė netipinė salmoneliozė (iNTS) atsiranda, kai Salmonelės bakterijos, kurie paprastai sukelia virškinimo trakto ligas, patenka į kraują ir plinta per žmogaus kūną. Afrikos iNTS epidemiją sukelia variantas Salmonella Typhimurium (ST313), kuris yra atsparus antibiotikams ir paprastai veikia asmenis, kurių imuninė sistema susilpnėjusi dėl maliarijos ar ŽIV.

„Nors Afrikos ir pasaulio genomai S. Typhimurium yra 95% identiški, likę 5% yra labai skirtingi, "aiškina tyrimo autorius dr. Rocío Canals Alvarez." Dauguma šių skirtumų nesukelia genų ekspresijos pokyčių, bet mes turime nustatyti genetinius pokyčius, kurie turi įtakos genų ekspresijai ir gali turėti įtakos žmonių bakterinės infekcijos rezultatams “.

Norėdami atrasti šiuos pagrindinius genetinius skirtumus, tyrėjai atliko didelio masto lyginamąjį transkriptominį metodą tarp mirtino afrikiečio Salmonelės ir bendra „pasaulinė“ versija, sukelianti gastroenteritą.

Tyrėjai augino kiekvieną Salmonelės štamų 16 skirtingų būdų, kurie atspindėjo skirtingus žmogaus infekcijos proceso etapus. Jie taip pat išskyrė Salmonella iš pelių makrofagų - imuninių ląstelių, kurias bakterijos naudoja užgrobti šeimininką infekcijos metu.

Tiriant Afrikos ir pasaulio transkriptą S. Typhimurium esant šioms skirtingoms sąlygoms, jie atrado, kad 677 genai ir mažos RNR buvo išreikšti skirtingai tarp dviejų padermių.

Lygiagretus proteominis metodas nustatė genų ekspresijos skirtumus, dėl kurių pasikeitė baltymų lygis. Du principo įrodymo eksperimentai atskleidė Afrikos salmonelių metabolinio defekto genetinį pagrindą ir atrado naują bakterijų plazmidės palaikymo sistemą.

Kad viso pasaulio mokslininkai galėtų dirbti su nauja informacija, nauji duomenys pateikiami patogiame internete įrankyje, vadinamame

"Šis tyrimas perkelia transkriptomikos galią į naują bakterijos lygį. Mūsų" funkcinis transkriptominis "metodas yra svarbus plačiai auditorijai ir gali būti taikomas daugeliui kitų organizmų. Analitinis vamzdynas ir bendruomenės duomenų išteklių aspektai yra bendri ir gali įkvėpti kitus naudoti panašų metodą atsakant į savo tyrimo klausimus, “priduria profesorius Jay Hinton, kuris vadovavo tyrimui.

• Tyrimas nustato žarnyno mikrobiomo sutrikimo antibiotikais poveikį skeleto sveikatai
• Tyrimas rodo, kaip herpeso virusai ir navikai išmoko manipuliuoti ta pačia senovės RNR