Naujų difuzinis skrandžio vėžys jautrumo variantą E-cad (CDH1) intronui 2: atvejis kontrolės tyrimą Italijos gyventojams

Naujų difuzinis skrandžio vėžys jautrumo variantą E-cad (CDH1 pervežimas) intronui 2: atvejis kontrolės tyrimas ir Italijos gyventojų pervežimas tezės
Background
Paveldimos genetinius veiksnius, kaip antai E-cad (CDH1
) promotorinės variantai yra manoma, kad įtakos rizikos link atsitiktinio difuzinio skrandžio vėžiu (DGC). Neseniai naują reguliavimo regionas būtinas CDH1
transkripcija buvo nustatyta CDH1
intronui 2.
metodai
Mes genotipą visų žinomų polimorfizmas, esančias užkonservuotas sekų CDH1 pervežimas intronui 2 (rs10673765, rs9932686, rs1125557, rs9282650, rs9931853) ir Italijos gyventojų sudaro 134 DGC atvejais ir 100 sveikų (55 pacientų artimiesiems ir 45 nesusijusių, suderintų individų). Atskirų variantų įtaka DGC rizika buvo vertinama naudojant χ 2-testai ir logistinė regresija. Santykinė alelių buvo įvertintas haplotipas analizės
rezultatai
Mes nustatėme reikšmingą. (P < 0,0004) asociacija CDH1
163 + 37235G > variantas (rs1125557) su DGC rizika. Kursai santykis buvo 4,55 (95% PI = 2,09-9,93) ir 1,38 (95% PI = 0,75-2,55) už AA ir GA vežėjų, atitinkamai. Kai reguliuojamas pagal amžių, lytį, rūkymą, alkoholio vartojimo ir H. pylori
infekcijos rizikos vertinimai liko beveik reikšmingas AA vežėjams. Haplotipas analizė pasiūlė 163 + 37235A-alelių, prisideda prie ligų rizikos nepriklausomai nuo kitų variantų studijavo
Išvada
The CDH1
163 + 37235G > a. Polimorfizmas gali atstovauti romaną jautrumo variantą pavienių DGC, jei patvirtinta kitos populiacijos. Atsižvelgiant į platų išraišką E-cad į epitelyje, tai tiriamoji studija skatina tolesnį vertinimo 163 + 37235A-alelio kaip jautrumo variantu kituose karcinoma.
Faktai
Skrandžio vėžys yra pagrindinė priežastis, dėl vėžio susijusio mirtingumo ir paprastai skirstomi į dvi histologinių tipų, žarnyno ir difuzinis formą (Lauren klasifikacija [1]). Bendrieji dažnis dėl skrandžio vėžio yra stabiliai mažėja, daugiausia dėl mažėjančio tarifus žarnyno vėžio tipo. Tai kritimo dažnis yra manoma, kad būti geresnė mityba ir sanitarinių sąlygų rezultatas. Priešingai, pasklidosios skrandžio vėžiu (DGC) dažnis vien atrodo labiau stabili per pastaruosius kelis dešimtmečius [1, 2]. Toks pastovus lygis rodo didesnį indėlį paveldėtos genetinės rizikos, o ne aplinkos veiksnių į difuzinio formos skrandžio vėžio.
Dėl savo ankstyvoje kūrimo po skrandžio gleivinės paviršiaus [3], DGC yra dažniausiai diagnozuojama vėlyvos stadijos ir todėl susijęs su blogesne rezultatų [1]. Todėl genetinių DGC žymekliai gali palengvinti asmenų, kuriems gresia pavojus identifikuoti ir taip prisidėti prie į DGC diagnozės ir gydymo.
Molekuliniu lygiu gerinimo, DGC skiriasi nuo žarnyno tipą dėl jos neįprasto išraiška ląstelių pagrindu -cell sukibimas molekulė El cad [4]. El cad yra esminė epitelio adherens sankryžos ir kaip toks yra reikalingas funkcinis tarpląstelinės adhezijos per epitelio lapų [5]. Skirtingai nuo daugelio kitų epitelio vėžio E-cad yra downregulated labai anksti metu DGC plėtros, siūlant vaidmenį šios ligos pradžios [3]. Mutacijos ir propaguotojas hypermethylation iš E-cad genų (CDH1
) yra labiausiai atitinka genetiniai pakitimai pastebėti atsitiktinio DGC [6, 7]. Be to, CDH1
germinacinės mutacijos sąlygoti paveldimos DGC [8] atitinka su inicijavimo funkcija E-cad trūkumas DGC. CDH1
germinacinės mutacijos paprastai bendrai atskirti su dominuojančia ligos modelis tarp nukentėjusių šeimų, o kartais galima rasti izoliuotų DGC atvejais diagnozuota nuo mažens (< 45 m) [9]. Tačiau jie sudaro tik apie 1% visų DGC [9] atvejais ir todėl negali paaiškinti genetine etiologija postuluojama prisidėti prie akivaizdžių atsitiktinis DGC atvejais. išskyrus CDH1
gemalo mutacijų genetiniai pakitimai Todėl tikėtina, kad įtraukti į besivystančių DGC į aiškią šeimos istoriją ar jaunas amžius diagnozę nesant rizikos.
Bendrąsias alelių variantus su švelniu funkcinis poveikis gali daryti įtaką rizikos pavienių ligos. Iš tiesų, viena nukleotidų polimorfizmo (SNP) per CDH1
promotoriaus (-160C > A), buvo susijęs su labai padidėjusia rizika, atsitiktinio DGC tam tikrų aukštos sergamumo gyventojų [10-13]. Studijuojamos CDH1
VNP-ai, The -160A rengėjas alelis yra kol kas vienintelis variantas susijęs DGC rizikos, tačiau, atrodo, veikia kartu su kitais CDH1
polimorfizmas [10, 13].
Neseniai naują CDH1
reguliavimo regionas buvo aprašytas [14]. Šis regionas yra pateiktas per CDH1
intronas 2, didžiausia ne kodavimo CDH1
segmentas (66% visos sekos) ir buvo įrodyta, kad būti reikalaujama ir inicijavimo ir priežiūra transkripcijos CDH1
veiklos į diferencijuotą epitelyje. Svarbu tai, kad intronui 2 sekas taip pat yra būtinos normaliam CDH1
transkripcijos metu suaugusiųjų gyvenimą, suteikiant galimybę, kad variantų šiame regione gali turėti įtakos Difuzinis skrandžio kancerogenezės.
Šiame tyrime mes genotipą visus žinomus variantus, esančius konservatyvių sekų iš CDH1
intronui 2 ir nustatė jų alelių dažnius grupių Italijos atsitiktinis DGC atvejais ir sveikų asmenų išpainioti galimų asociacijų su liga.
metodų
pacientų
DNR mėginiai buvo paimti iš 134 DGC pacientų, kurie vietiniai iš Pesaro-Urbino apskritis, Marche regionas, Centrinės Italijoje. Po operacijos, The DGC diagnozė buvo nepriklausomai patvirtinta dviejų patologai. Pacientai buvo kliniškai ištirti vietos medicinos onkologijos skyriui (ligoninė Kaulo Urbino), kur jie taip pat baigė demografinį lapą, įskaitant jų asmeninio ir šeimine vėžio istorijos. Duomenys buvo patikrinti per interviu su jų onkologijos gydytojams ir jų šeimos istorija buvo atsekti už ≥3 kartų ir į šonus 2 -asis ir 3 RD eilės giminaičių. Remiantis šiuo vertinimu, nė vienas iš pacientų atitiko klinikinius kriterijus žinomų paveldimų onkologinių sindromų. Įtraukimo kriterijai gali pacientų buvo: Kaukazo tautybės, kilęs iš tirtų geografinės vietovės ir šeimos istorijos vėžio trūkumo. buvo priimti tie patys kriterijai plius asmeninės istorijos vėžio trūksta kontrolės. Valdymo DNR mėginiai buvo gauti iš 55 sveikų giminaičių, kurie buvo arba nepaveiktos tėvai (n = 15), broliai ir seserys (22) ar vaikams (18) tirtų DGC pacientams. Kaip sveiki artimieji nebuvo prieinama kiekvienam DGC paciento DNR mėginiai iš nesusijusių sveikų asmenų (n = 45), atrinktų remiantis buvusių ir dabartinių kraujo donorų iš ligoninės Kaulo Urbino baseinas grupės buvo įtrauktos gaunant 100 kontrolę iš viso. Nesusiję kontrolė buvo atsitiktinai parinktos dažniai atitikimo tais atvejais, pagal amžių ir lytį. Amžiaus vidurkis DGC pacientams be giminaičių buvo 54,6 m ± 11.41SD, o kad jų įvykdymo kontrolė buvo 52,2 m ± 10.21SD. Visi tiriamieji buvo apklausti apie jų rūkymo ir alkoholio vartojimo įpročius. H. pylori
statusas lėmė patologinių tyrimų skrandžio mėginius atvejais ir kraujo ar kvėpavimo testai kontrolės. Etiniai reikalavimai buvo patikrinti ir vidaus etikos komiteto (ligoninė Kaulo Urbino) ir visų tyrimo dalyvių patvirtino davė rašytinį informuoto sutikimo.
CDH1 INTRON 2 užkonservuotas ir polimorfizmas
užkonservuotas CDH1
intronui 2 (GenBank NC_000016) buvo identifikuoti pagal ieškančiai atitinkančius žmogaus, šimpanzės, žiurkėms ir pelės sekas iš NCBI duomenų bazės (NCBI, Entrez nukleotidų), po to derinti naudojant ncbi serverio (ncbi, pagrindinių vietos Sureguliavimas paieškos įrankis) ir Invitrogen Vektorius KOVOS Advance ™ 9.0 programinė įranga (ACCELRYS programinė įranga Inc ", San Diegas, JAV). Užkonservuotas buvo apibrėžta kaip turintys mažiau nei 5% sekos variantus tarp skirtingų rūšių. Į užkonservuotas buvo PGR sustiprina į sutampa fragmentų apie 200 bp dydžio. Atitinkami gruntai (1 lentelėje sekų ir sąlygomis) buvo sukurta naudojant GeneFisher internetinis įrankis [15] ir pagaminti Sigma-Proligo (Sigma-Aldrich Corporation, St Louis, JAV). buvo naudojami FastStart Taq DNR polimerazė (Roche, Bazelis, Šveicarija) ir "PTC-200 PGR mašinos (MJ tyrimų, Waltham, JAV). Šie polimorfizmas yra (ansamblis GenomeBrowser [16]) per stiprintuvu regionuose: 163 + 14184ΔAGGG (rs10673765, įsikūręs PGR fragmentas C2F1), 163 + 14384C > T (rs9932686, C2F2), 163 + 37235G > A (rs1125557, C3F2 ), 163 + 37276T > A (rs9282650, C3F2), ir 163 + 49526C > G (rs9931853, C4F1). TESS internetinis įrankis [17] buvo ieškoti spėjamas transkripcijos privalomas veiksnių svetainių, kurios gali būti paveiktos aukščiau variants.Table 1 PCR pradmenys ir sąlygos

Persiųsti grunto pervežimas pervežimas Grįžtamieji grunto pervežimas pervežimas Ta * pervežimas pervežimas Mg ++ † pervežimas pervežimas DMSO ‡ pervežimas pervežimas C1F1
ccgccttaaagaaactcttg
accggtggcaaatactag
65 ° C temperatūroje
1,5 -
C1F2
tagaagggttgaacctgttc
tcttagtccacgagaagaag
65 ° C temperatūroje
1,5 UAB -
C1F3
taggagagcttgtaacaagc
cactcggttctaccgaag
65 ° C temperatūroje
1,5 -
C2F1
tgtattagccacagagaag
ctaaaactagaccacgaag
65 ° C temperatūroje
1.5 UAB -
C2F2
gtcacaaaacagcttg
ccttccttgagcaaggc
65 ° C temperatūroje
1,5 -
C3F1
ttgcctaaggccccctttttgttc
gaatctgcgaagtctacatc
65 ° C temperatūroje
1,5
- CR.LT C3F2
acactagccacacatgggactcaag
tgctggtgtggattcaaatgtg
65 ° C temperatūroje
1,5 -
C4F1
acctccgcctcctgggttcaagc
ttcctcccgcttagtg
60 ° C temperatūroje
1.5 -
C4F2
tggccaggcctgtcttaaactc
ttcttaggtccgtgggtttttacg
65 ° C temperatūroje
1,5 -
C4F3
aaagtgctgggattacaggtgtgag
tcgataatcccgagaactc
55 ° C temperatūroje
1,0
+
C4F4
gaaccataggactttgactgatgg
actgatggttatccgggttcccttg
65 ° C
1,5 -
C4F5
agctgttgagctgtcatcacaatcc
gaatttcctacccgtctatggtagg
65 ° C temperatūroje
1,5 -
C5F1
tagtggggagtggggtcttagcttc
tcgttcaccctcctttcttcttacc
58 ° C temperatūroje
1,5 -
C5F2
gggcatgttgaaatatacccagtc
tctgagtaatagaggggtacgttgg
65 ° C,
1,5 -
C5F3
cttgccagcgtgacagtg
cgaaaccccgtggagtag
65 ° C temperatūroje
1,5 -
C5F4
caggttggggctcctcgtcatactg
cttccgacgtgacttaaggaaagag
65 ° C temperatūroje
1,5 -
C5F5
gcttgtctcaactttcactgtc
gaatttcctacccgtctatggtagg
65 ° C temperatūroje
1,5 -
C6F1
tggtattcaggaggatgcag
acctacgatcgtaaaaagt
65 ° C temperatūroje
1,5 -
C6F2
cccatcaatgcttatttgttctt
gcctgggagacggagact
65 ° C temperatūroje
1,5 -
C6F3
tgggctgtttgagttttgttc
cggtgtaaaaggttcgtgac
65 ° C temperatūroje
1.5 -
* Ta atkaitinimo temperatūra; † Mg ++ - koncentracija yra duota mm; ‡ DMSO buvo įtraukta 5% fc
Vieno kryptis raumeningumo polimorfizmo
Vieno kryptis raumeningumo polimorfizmas (SSCP) buvo naudojamas nuskaityti konservatyvius intronui 2 regionas 19 Italijos DGC pacientų už papildomą dažnos, bet buvimas population- specialūs polimorfizmas. SSCP buvo vykdomi, kaip aprašyta [18], išskyrus tai, kad ULS ™ 495 fluoroforas (Kreatech biotechnologijos, Amsterdamas, Nyderlandai) buvo naudojamas vietoj radioaktyvumo ženklinti fragmentus. Trumpai tariant, 1 mikrol PGR produktas buvo inkubuojami su 0,2 iL dažų 20 iL reakcija. . Geliai buvo nuskaitomi naudojant FX molekulinė vizoriai (BioRad, Hercules, JAV) esant 488 nm bangos ilgiui
genotipo
Šie restrikcijos fermentų buvo naudojamas DNR genotipas variantai: 0,06 U /mikrol BsaXI už 163 + 14184ΔAGGG 1 V /mikrol BanII
už 163 + 14384C > T 0,2 V /mikrol MaeIII
už 163 + 37276T > A, ir 0,4 V /mikrol HpaII
už 163 + 49526C > g. Visi fermentai buvo iš Naujosios Anglijos Biolabs (Ipswich, JAV) su MaeIII
išskyrus iš Roche (Bazelis, Šveicarija). Reakcijos buvo inkubuojami per naktį ir fragmentai buvo atskirtas nuo 4% (w /v) agarozės gelius
polimorfizmas 163 + 37235G > a. Ir 163 + 37276T > A buvo nustatytas genotipas ant ABI PRISM 7900 (Applied Biosystems Foster City, Jungtinės Valstijos) naudojant realaus laiko PGR pagrįstas alelių diskriminacijos tyrimus, atliekamus iš Applied Biosystems pagal pateiktus nurodymus.
sekos
Aptikti variantai buvo tikrinamas tiesioginio sekvenavimo naudojant USB thermosequencing komplektas (USB, Klyvlendas, JAV) ir licor 4000L DNR sekos nustatymo (licor, Linkolnas, Nebraska JAV).
Statistinė analizė
skirtumas paskirstymo tarp atvejų ir kontrolės buvo vertinami pagal χ 2-testas (su df = 2 už genotipų ir df = 1 alelių) , Rizika buvo apskaičiuota pagal vieną požymį analizės ir kelių logistinę regresiją (Stata programinė įranga, StataCorp LP, College Station, JAV). Χ 2-testas (df = 2) taip pat buvo nagrinėjama nukrypimus nuo Hardy-Weinberg pusiausvyros. Amžius skirtumai tarp pacientų, vežančių skirtingus genotipus buvo apskaičiuotos naudojant 2-tailed t-testą.
Haplotipas dažniai buvo rekonstruotas iš unphased genotipų ir susiejimas pusiausvyros pažeidimo (LD) tarp VNP-ai buvo įvertintas naudojant SHEsis programinės įrangos platformą [19, 20]. Tik haplotipų su santykiniu dažniu > 0,03, bet kuriuo atvejais ar kontrolės buvo įtraukti į tyrimą. Pasaulinis asociacija haplotipų su liga buvo apskaičiuojamas pagal χ 2-testas (df = 7). 163 + 14184ΔAGGG ir 163 + 14384C > T variantai nebuvo įtraukti į galutinę analizę, nes jie nebuvo informatyvus. Atskirų haplotipų, sergantiems ligomis asociacija buvo grindžiamas 2 × 2 nenumatytų lentelių, palyginus su A A-C haplotipas. LD buvo išreikštas r 2, su R 2 = 1, tai rodo visišką LD, r 2 = 0 nebuvimą LD ir R 2 "< 0,33 rodo minimalų ld.
Rezultatai
Šeši užkonservuotas, kurių bendras dydis 3.2 KBP buvo identifikuojamos per CDH1
intronas 2. Be penkių žinomų polimorfizmas (CDH1
163 + 14184ΔAGGG (rs10673765) 163 + 14384C > T (rs9932686), 163 + 37235G > A (rs1125557), 163 + 37276T > A (rs9282650), ir 163 + 49526C > G (rs9931853)), konkretūs Italijos gyventojų pagal studijų jokių papildomų bendri polimorfizmas buvo atrado SSCP į šešiuose regionuose.
Naudojant apribojimas fragmentas ilgio polimorfizmo ir alelių diskriminacijos tyrimus, atliekamus, santykiniai dažniai genotipų, atsirandančių iš penkių variantų buvo nustatyti per DGC atvejais ir kontrolės. Sekos Atsitiktinių pavyzdžių patvirtino atitinkamus genotipus. Visi polimorfizmas buvo Hardy-Weinberg pusiausvyros abiem atvejais ir kontrolės (p > 0,19). 2 lentelėje apibendrinama genotipas paskirstymą ir jų skirtumus atvejais ir controls.Table 2 CDH1
intronui 2 genotipas pasiskirstymas tarp DGC atvejais ir kontrolės
+ 14184ΔAGGG atvejų (n = 134)
+ 14184ΔAGGG valdikliai (n = 100)
χ2 testas
ARBA (95% PI) *, †
ARBA (95% PI) *, †
+ /+
+ /Δ Δ
/Δ
+ /+
+ /Δ Δ
/Δ
psl
Δ /Δ vs + /+
+ /Δ vs + /+
128
4
2
96
3
1
0,947
1.50 (0,13-16,78)
1,00 (0,21-4,57)
95,5%
3%
1,5%
97%
1,5%
1,5%
14,2% pervežimas 2,5%
+ 14384C > T atvejų (n = 134)
+ 14384C > T valdikliai (n = 100)
χ 2 -test
arba (95% PI)
arba (95% PI)
CK
KT
TT
CK
KT
TT
p
TT vs BK pervežimas CT vs BK
130
2
2
98
1
1
0,895
1.51 (0,13-16,87) 1.51 (0,13-16,87)
97,0%
1,5%
1,5%
98,0%
1,0%
1,0%
12,3%
12,3%
+ 37235G > A atvejai (N = 134)
+ 37235G > A valdikliai (n = 100)
χ 2 -test
arba (95% PI)
arba (95% PI)
vS
GA
A.
vS
GA
A.
psl
A. vs vS
GA vs vS
30
56
48
37
50
13
0,0003
4,55 (2,09-9,93)
1.38 (0.75-2.55)
22,4%
41,8%
35,8%
37,0%
50,0%
13,0%
100%
40,6%
+ 37276T > A atvejai (N = 134)
+ 37276T > A valdikliai (n = 100)
χ 2 -test
arba (95% PI)
arba (95% PI)
TT
TA
A.
TT
TA
A.
p
A. vs TT pervežimas TA vs TT
65
65
4
46
51
3
0,929
0,94 (0,20-4,42 )
0,90 (0,53-1,53)
48,5%
48,5%
3,0%
46,0%
51,0%
3,0%
1,9%
1,6%
49526C > G atvejų (n = 134)
+ 49526C > G valdikliai (n = 100)
χ 2 -test
arba (95% PI)
arba (95% PI)
CK
CV
vS
CK
CV
vS
psl
vS vs BK pervežimas CG vs vS
34
82
18 58
30
12
0,727
1,32 (0.55-3.19) pervežimas 1,25 (0.69-2.26) pervežimas 25,4% pervežimas 61,2% pervežimas 13,4 %
30,0%
58,0%
12,0%
32,2%
22,5%
* ARBA vertės nekoreguoti.
† toliau AR verčių procentais įvertina asociacijų galia bent atitinkamas ARBA lygio ir darant prielaidą, reikšmingumo lygis 5%
tirtų variantų kiekvieno varianto, tik 163 + 37235G >. SNP buvo reikšmingai susijęs su liga, kurią A-alelio per didelę tarp DGC atvejai (56,7% vs 38% kontrolės, χ 2 = 16,1, p < 0,0001; 2 lentelė). 163 + 37235AA genotipas buvo 2,8 karto dažnesni tais atvejais, lyginant su kontroline grupe. Atitinkami Kursai Santykis (ARBA) pasiūlė žymiai padidėjusi rizika susirgti DGC AA vežėjų, palyginti su GG vežėjų (arba = 4.55, 95% PI = 2.09-9.93, p = 0,0002, galios asociacijos 100%; 2 lentelė). Nėra gerokai padidėjo rizika užsiimti GA-genotipą aišku (arba = 1.38, 95% PI = 0,75-2,55, p = 0,3, galia asociacijos 41%; 2 lentelė). DGC rizika AA vežėjų išliko reikšmingas, kai AR buvo pritaikytos pagal amžių, lytį, alkoholio vartojimo ir H. pylori
infekcija (3 lentelė). Rūkančiųjų, tačiau susijusi rizika buvo tik paribio reikšmės (p = 0,089, 3 lentelė). Susijusios su kitais variantais mokėsi rizika išliko nereikšmingas po patikslinimo (duomenys neparodyti). Nėra asociacija buvo pastebėtas tarp 163 + 37235G > SNP ir amžių, diagnostika (p > 0,16) .table 3 Adjusted PVA, susijusios su CDH1
intronui 2 163 + 37235G > variantas pervežimas Variable

163+37235

Cases

Controls

OR (95% PI)



N
%
N
%

Amžius
≤ mediana
VS
17
20
20 GA
34
1 pervežimas 37
45
30
52
1,45 (0.65-3.25)
A.
29
35
8
14
4.26 (1.55-11.77 )
> Mediana
VS
13
25
17
40
1
GA
19
37
20
48
1,24 ( 0,48-3,24)
A.
19 37
5
12
4,97 (1,47-16,86)
Sex
Moteris
VS
13
20
20
34
1
GA
28
44
30
51
1.44 (0.60-3.42)
A.
23
36
9
15
3.93 (1,39-11,12)
Vyras
VS
17
24
17
41
1
GA
28
40
20
49
1.40 (0.58-3.39)
AA
25
36
4
10
6.25 (1,79-21,84)
Rūkymas
Niekada
VS
17 24 25
42
1
GA
30
42
30
50
1,47 (0,66-3,26)
A.
25 35
5
8
7.35 (2.34-23.01)
kada nors
VS
13
21
12
30
1
GA
26
42
20
50
1.20 (0,45-3,19)
A.
23
37
8 pervežimas 20
2,65 (0.86-8.16)) pervežimas Alkoholio
≤ 20 g /dieną
VS
24
26
26
40
1
GA
35
38
31
48
1.22 (0,59-2,55 )
A.
34 37
8
12
4.60 (1.78-11.90)
> 20 g /dienai
VS
6
15
11
31
1
GA
21
51
19
54
2,01 (0,63-6,55)
A.
14
34
5
15
5.13 (1,23-21,36)
H. pylori pervežimas Neigiama pervežimas GG
2
11
16
37
1
GA
22
48
22
51
3,2 (1.00-10.26)
A.
19
41
5
12
12.16 (2,98-49,64)
Teigiamas
VS
25
28
21
37
1
GA
34
39
28
49
1,02 (0.472 -. 19)
A.
29
33
8
14
3,045 (1,15-8,07)
nustatyti, ar CDH1
163 + 37235A-alelis suteikia DGC riziką savarankiškai ar kartu su kitais intronas 2 variantai, haplotipas todėl iš penki polimorfizmas buvo rekonstruotas ir jų dažniai buvo įvertintas atvejais ir kontrolės. Dvi ir 5'-variantai nebuvo informatyvus, todėl buvo atmesti. Introno 2 haplotipas parodė pasaulinę asociacijos liga (df = 7, χ 2 = 24.09, p < 0,002). Apskritai, haplotipas, kurių sudėtyje yra 163 + 37235A-alelių buvo dažnesni tais atvejais, lyginant su kontrole, o trys iš keturių haplotipų su G-alelis buvo dažnesni tarp kontrolės (4 lentelė). Stipriausias ryšys su ligos buvo pastebėtas už AAG ir ATC haplotipų (163 + 37235A 1 padėtyje). Priešingai, GAG ir GTC haplotipas parodė stipriausią apsaugą. Ryšys pusiausvyros sutrikimo analizė parodė, beveik nėra LD tarp tirtų variantų (r 2 "< 0,03; 5 lentelė), o tai rodo, kad CDH1
163 + 37235G > SNP gali suteikti didesnį jautrumą į DGC nepriklausomai nuo kitų variantų investigated.Table 4 CDH1
intronui 2 haplotipas dažniai tarp DGA atvejais ir kontrolės

byloje (Freq) †

kontrolė (dažn) †
Fišerio p
Pearson psl
ARBA (95% PI)
AAC *
16.04 (0,060)
5,31 (0,027)
0,088
0,088
2,33 (0.86-6.34)
ARG
17.49 (0,065)
5,34 (0,027 )
0,056
0,056
2,55 (0.95-6.83)
, ATC
73.09 (0.273)
35.43 (0.177)
0,015
0,015
1.74 (1.11 -2,74)
ATG
45.38 (0,169)
29.91 (0,150)
0,565
0,565
1.16 (0.70-1.92)
GAA
21.73 (0,081)
24.18 (0,121)
0,152
0,152
0,64 (0.35-1.18)
GAG
17.75 (0,066) pervežimas 22.17 (0,111) pervežimas 0.087
0.087
0,57 (0,30-1,09)
GTC
39.15 (0,146)
53.07 (0,265)
0,001
0,001
0,47 (0,30-0,75)
GTG
37.37 (0,139)
24.85 (0,123)
0,602
0,602
1,16 (0,67-1,99)
* haplotipas tvarka: 163 + 37235G > A 163 + 37276T > A 163 + 49526C > g. Dvi ir 5'-variantai nebuvo įtraukti, nes jie nebuvo labiau suskaidytas į haplotipų.
† skaičiai reiškia rekonstruotų haplotipas skaičių tarp bylų (257) ir kontrolės (192), su kiekvieno individo, turinčiame du chromosomas. Santykiniai dažniai yra suteiktas procentais. Ne visi genotipas duomenys buvo įtraukti į analizę, kaip buvo atsisakyta žemo dažnio haplotipas.
5 lentelė jungtimi disbalansui tarp CDH1
intronui 2 polimorfizmas
r2 ryšys pusiausvyros sutrikimo

163 + 14384C > T
163 + 37235G >
163 + 37276T >
163 + 49526C > G
163 + 14184ΔAGGG
0,001
0,000
0,001
0,001
163 + 14384C > T -
0,002
0,000
0.000
163 + 37235G > UAB -
- 0,028
0,000
163 + 37276T >, A -
- -
0,003 <

• Kraujagyslių endotelio augimo faktoriaus geno polimorfizmas ir klinikinės baigties išplitusiu skrandžio vėžiu sergančių pacientų, gydytų FOLFOX santykiai: VEGF polimorfizmas skrandžio cance…
• Ikioperacinė chemoradioterapija lokaliai išplitusio skrandžio cancer