Det startet med prøver fra hele det vestlige USA som ankom laboratoriet til evolusjonsbiologen Crystal Hepp, som jobber med både School of Informatics, Databehandling, og Cyber Systems (SICCS) og Pathogen and Microbiome Institute (PMI) ved Northern Arizona University. Hun samarbeider med et titalls forskjellige offentlige helseavdelinger i hele Vesten. De sender henne prøver fra West Nile (WNV) funnet i områdene deres, og teamet hennes sekvenserer de virale genomene og analyserer dataene for å rekonstruere slektstreet til hver prøve, som lar henne bestemme hvordan viruset beveger seg over tid og i hele regionen.
I dette tilfellet, Coconino County Health Department sendte henne de to prøvene, en funnet i mygg ved Lake Mary og en i Cheshire -området, begge i slutten av august. Hepp sekvenserte genomene til virusstammene, sammenlignet dem med virusstammene hun hadde sekvensert fra andre områder, og fant ut at de to virusstammene ikke skyldes lokal sirkulasjon av viruset, noe som betyr at de ikke ble overført blant fugler og mygg i fylket. Cheshire -stammen er nært beslektet med stammer som sirkulerer i Maricopa County, mens Lake Mary -stammen er nærmest beslektet med en belastning teamet hennes sekventerte fra Montana i 2018, selv om Lake Mary -stammen viste flere forskjellige mutasjoner fra Montana -stammen.
Dette var uventet, Sa Hepp. Det er også sannsynligvis en god ting for Coconino County.
Vi tror ofte at det enkleste svaret er det mest sannsynlige svaret. Det hadde vært fornuftig hvis disse to stammene, skilt med bare 10 miles, skyldtes den samme importhendelsen. Fra et folkehelseperspektiv, å finne ut at disse to stammene er fra to forskjellige steder er gode nyheter. Hvis de var nært beslektet, det ville bety at WNV sannsynligvis hadde blitt syklet gjennom fugler og mygg over 10 miles av Coconino County. Vi håper at de to separate introduksjonene nettopp har syklet på de veldig lokaliserte geografiske stedene de ble funnet, i stedet for over 10 miles, og at de bare blekner. "
Crystal Hepp, evolusjonsbiolog, NAU
Hepps laboratorium er en leder i arbeidet med å bedre forstå hvordan West Nile -viruset sirkulerer i det amerikanske sørvest. Hennes helsepartnere stiller den første diagnosen, send deretter hennes stammer for å finne ut om viruset oppsto. Å kjenne og kartlegge disse dataene kan hjelpe regjeringer til bedre å forutsi og forberede muligheten for West Nile i sine områder. Disse partnerne inkluderer:
Denne forskningen inkluderer studenter Daryn Erickson, Breezy Brock, Samuel Poidmore, og Majestet Greer-Gipson, forskningsspesialist Jill Cocking, doktorgradsstudent Chase Ridenour, Krystal Sheridan og Heidie O'Neill fra PMI -sekvenseringskjernen, så vel som Darrin Lemmer, Mike Valentine og Dave Engelthaler fra Translational Genomics Research Institute.
"Vi er veldig interessert i å forstå sammenhengen mellom stammer som sirkulerer i sørvest, "Hepp sa." Dette gjør at vi kan bestemme, for eksempel, WNV -situasjonen i Maricopa County er for andre sørvestlige steder. WNV fra Maricopa County har i tillegg spilt over til Washington County, Utah; Riverside County, California; og Yuma County, Arizona tidligere, og vi vil gjerne gå videre med en prediktiv modell som kan informere fylker om risiko basert på historiske mønstre og miljødata. "
Ingen menneskelige tilfeller av West Nile har blitt rapportert i Coconino County siden 2010.
West Nile er den vanligste myggbårne sykdommen i staten, selv om omfanget er vanskelig å måle fordi bare omtrent 20 prosent av de smittede selv innser at de er syke. De fleste som opplever symptomer, føler at de har influensa, men omtrent en av 150 smittede utvikler en alvorlig sykdom som encefalitt eller meningitt, som kan være dødelig.
I 2018, Hepp mottok et tilskudd fra Arizona Biomedical Research Center for å undersøke sirkulasjonen og kildeplasseringene til West Nile i staten.
Hvordan gjøre SCD-lovlige gulrøtter raskere og mer næringsrike på samme tid!
Hvordan disse helseheltene overvinner fordøyelsesproblemene sine
Cøliaki 101 – En nybegynnerveiledning til helbredelse
Å kjenne symptomene på ulcerøs kolitt
Fordøyelsessykdommer:Hva du bør vite om bendelorm
Kan gallestein forsvinne av seg selv?
Mennesker kontra virus - Kan vi unngå utryddelse i nær fremtid?
Ekspert argumenterer for at menneskeskapte endringer i miljøet kan føre til fremvekst av patogener, ikke bare utenfra, men også fra vårt eget mikrobiom, som kan bane vei for storstilt ødeleggelse av m
Kokain- og crackavhengighet
Fakta om kokain og crackmisbruk Når en person trekker seg tilbake fra effekten av kokain, kan reduksjonen i nevrotransmittere resultere i et plutselig fall i blodtrykket eller puls, alvorlig depres
Hvilken type lege er en proktolog?
Proktologer jobber tett med gastrointestinale (GI) spesialister, også kjent som gastroenterolog, som gir fullstendig omsorg for lidelser som påvirker lidelser fordøyelsessystemet. En proktolog er e