Plos ONE: genska odpornost na CagA učinkujejo vzajemno molekul in Gene-okolje Medsebojno delovanje z fitoestrogene, dejavnik Domnevna tveganja za želodca Cancer

Povzetek

Cilji

Za oceno, ali genov, ki kodirajo CagA- interakcije molekule ( SRC
, PTPN11
, CRK
, CRKL
, CSK
, c-MET
in GRB2
) so povezani s tveganjem za nastanek raka želodca in ali je interakcija med temi geni in fitoestrogene spremeni tveganje za nastanek raka na želodcu.

Metode

v fazi odkrivanja, 137 SNP kandidatke v sedmih genov so bili analizirani v 76 incidentih želodca primerov raka in 322 ustreznimi kontrolnimi iz Korejski Multi-Center Cancer kohorte. Pet pomembnih SNP v treh genih ( SRC
, c-MET
in CRK
) so ponovno ocenili v 386 primerih in 348 kontrol v podaljšani fazi. razmerja obetov (OR) za tveganje za nastanek raka želodca ocenjenimi so bili prilagojeni za starost, kajenje, H. pylori
seropozitivnosti in CagA sev pozitivnost. Povzeti najbolj oddaljene regije v skupni populaciji študije (462 primerov in 670 nadzor) so bili predstavljeni s pomočjo pooled- in meta-analizo. so bile izmerjene koncentracije v plazmi fitoestrogene (genistein, daidzein, ekvola in enterolaktona) z delovnim časom rešiti fluoroimmunoassay.

Rezultati

SRC
rs6122566, rs6124914, c -MET
rs41739 in CRK
rs7208768 pokazala pomembne genetske učinke za raka želodca v obeh združenih in metaanalizi brez heterogenosti (združeni OR = 3,96 [95% iZ 2.05-7.65], 1,24 [95 % IZ = 1,01-1,53], 1,19 [95% IZ = 1,01-1,41], in 1,37 [95% IZ = 1,15-1,62], v tem zaporedju, meta OR = 4,59 [95% IZ 2,74-7,70], 1,36 [95% CI = 1,09-1,70], 1,20 [95% IZ = 1,00-1,44], in 1,32 [95% IZ = 1,10-1,57], v tem zaporedju). alel tveganje CRK
rs7208768 imel bistveno povečano tveganje za nastanek raka želodca pri nizkih ravneh fitoestrogenske ( p interakcija
< 0,05).

Sklepi

Naše ugotovitve kažejo, da je SRC
, c-MET
in CRK
igrajo ključno vlogo pri želodca kancerogenosti s spreminjanjem CagA signalov transductions in interakcijo med CRK
gene in fitoestrogeni spreminjanje tveganje za nastanek raka želodca

Navedba. Yang JJ, Cho LY, Ko KP, Shin, Ma SH, Choi BY, et al. (2012) genska odpornost na CagA učinkujejo vzajemno molekul in Gene-okolje Medsebojno delovanje z fitoestrogene: domnevni dejavnik tveganja za Rak želodca. PLoS ONE 7 (2): e31020. doi: 10,1371 /journal.pone.0031020

Urednik: Deodutta Roy, Florida International University, Združene države Amerike

Prejeto: 30. november 2011; Sprejeto: 29. december 2011; Objavljeno: 24. februar 2012

Copyright: © 2012 Yang et al. To je odprtega dostopa članek razširja pod pogoji Creative Commons Attribution License, ki omogoča neomejeno uporabo, distribucijo in razmnoževanje v katerem koli mediju, pod pogojem, da prvotni avtor in vir knjižijo

Financiranje:. Ta študija je podprla z nepovratnimi sredstvi iz državnega R & D programa za raka nadzor, Ministrstvo za zdravje in dobro počutje, Republiko Korejo (0520140), in programa Temeljne raziskave laboratorija (BRL) skozi National Research Foundation Koreje Ministrstvo stvarnega šolstvo, znanost in tehnologijo (2011-0001564). Med financerji imel nobene vloge pri oblikovanju študije, zbiranje in analizo podatkov, sklep, da se objavi, ali pripravi rokopisa

nasprotujočimi si interesi.. Avtorji so izjavili, da ne obstajajo konkurenčni interesi

Uvod

Helicobacter pylori
( H. pylori
), skupina I človek želodca rakotvorna snov, ki ga je Mednarodna agencija za raziskave raka (IARC) [1], je najmočnejši dejavnik tveganja za razvoj raka želodca, in vztrajno H. pylori
okužba je prvi korak k želodca rakotvornost [1] - [3]. Kljub številnih dokazov, ki H. pylori
igra ključno vlogo pri želodčnem rakotvornosti le majhen delež okuženih ljudeh razvije rak želodca. To pomeni, da drugi dejavniki, vključenih v patogeni mehanizem H. pylori
lahko spremenite individualno dovzetnost za raka želodca. Naše predhodne študije so pokazale, H. pylori
okužba sama ni bila povezana z želodčno tveganje za nastanek raka, ampak posebej CagA pozitivna H. pylori
okužba znatno poveča tveganje za raka želodca s 3,57-krat [4], [5].

-citotoksin povezan gen A (CagA), ki je imunodominanten protein z H izločajo. pylori
se zdi, da je eden izmed patogenih modifikacijskim dejavnikov [6] - [8]. Po okužil H. pylori
v epitelijskih celic želodca, CagA deluje kot velik rakotvoren in glasne komponente z zaporedno CagA signalov poti. Prvi korak se začne z interakcijo med CagA in različnih proteinov, kot so SRC, SHP2, CRK, CRKL in CSK po fosfatnem in c-met in GRB2 brez fosforilacije [9] - [12]. Tirozin fosforilirata CagA s SRC družinskih kinaze komunicira z SHP2 tirozin fosfataze (kodirani z znakom PTPN11
onkogena), CRK, CRKL in CSK in povzroča sipanja celic, disociacijo in umrljivosti, povezane z razvojem raka [8], [12] - [15]. Poleg tega, non-fosforilirata CagA komunicira z c-met in GRB2 ki spodbuja onkogenega odziv, vključno s celično proliferacijo in morfološke spremembe, kot so oblikovanje kolibrije [8], [16] - [19]. To CagA translokacije in njegov celični interakcije s temi beljakovinami lahko ključni korak začetek želodčnega rakotvornost [9] - [12].

Cellular sprememba v CagA pozitivno H. Zdi se pylori
patogeni mehanizem, da pojasni različne dovzetnosti za raka želodca med H. Pylori
okuženih oseb. Ker se celične funkcije lahko ureja njihovih genov gostitelja, lahko genetske variante v zvezi z CagA stiku molekul ključ za individualno želodčne dovzetnost za raka. Na podlagi domnevnih genetskih razlik, smo predpostavili, da se geni, ki kodirajo-CagA interakcije proteinov spremeni tveganje za raka želodca. Poleg tega smo se osredotočili na fitoestrogene kot modifikator učinek v procesu pretvorniškim CagA signala. Študije so poročali, da lahko fitoestrogene s protivnetno, antibakterijsko in antioksidant lastnosti inhibira H. pylori
aktivnost in rak želodca rast celic in proliferacijo [20] - [22]. Še posebej, genistein, eden fitoestrogene in zaviralci fosfotirozina kinaze, je poročalo, da je učinkovit blokator za CagA fosforilacijo [23].

Za ovrednotenje hipoteze, dvostopenjski genetska analiza, ki je osredotočena na gene, ki so neposredno kodirajo CagA vezavo molekul, SRC
, PTPN11
, CRK
, CRKL
, CSK
, c- MET
in GRB2
, je bila izvedena, da so bili: 1) faza odkritje, da pregledajo in identificirajo mononukleotidnih polimorfizmov (SNP), z velikim genetskim združenje za rakom želodca; 2) faza razširitev, ki ponovno analizirali najpomembnejše SNP v fazi odkrivanja. Poleg tega so v sub-analizo smo ocenili genov okolju interakcijo ugotoviti, ali raven fitoestrogenske spremeniti povezavo med polimorfizmom gena, ki neposredno kodiranje CagA veže molekule in tveganje za raka na želodcu.

Metode

Etika Izjava

študijski protokoli je odobril Institutional Review Board na National Hospital Seul University (H-0110-084-002 za študij KMCC in C-0910-049-297 za tekoče ugnezdeni primeru -nadzorovalnik študija) in revizijski odbor institucionalne univerzitetne bolnišnice Hanyang (2003-4). Še več, vsi udeleženci podpisali informirano obrazec o soglasju pred vstopom študije.

Študija prebivalstva

Two-študija faze genetska zveza je bila izvedena. Ugnezdena študija primerov in kontrol prebivalstva je bil zaposlen od korejske Multi-Center za boj proti raku kohorte (KMCC). Podrobne informacije o KMCC je opisana drugje [24]. Na kratko, so udeleženci zaposleni iz štirih mestnih in podeželskih območjih (Haman, Chungju, Uljin in Youngil) v Koreji. Podatki o posameznih značilnostih vključno s splošnim načinom življenja in izpostavljenosti okolja so bili zbrani s pomočjo standardiziranega vprašalnika, ki temelji na intervju. Vzorce krvi in ​​mesto urina so bili zbrani tudi. Vsi udeleženci so bili pasivno spremljali prek računalniških zapisov povezav v nacionalnem registru raka, nacionalno potrdilo o smrti in zdravstvenega zavarovanja zdravstvene evidence. Pasivnih nadaljnji postopki v KMCC so poročali, da so visoko učinkovite in popolne [25].

December 2002, skupno 136 želodca primerov raka je opredeljena v skladu z Mednarodne klasifikacije bolezni in sorodnih Zdravstvene težave 10. izdaje (ICD-10, C16), so bile ugotovljene v fazi odkrivanja. Med njimi je 84 primerov brez primere diagnosticirali pred zaposlitvijo (n = 36) in brez vzorcev krvi (n = 16) so bili prvotno izbrani za genotipizacijo. Štiri rak brez kontrole (n = 336) so bili povezani z vsako želodca primeru raka z vzorčenjem gostota incidence glede na starost (± 5 let), spol, stanovanjsko naselje, in vpis leto. Osem primerov in 14 kontrol so bili izključeni zaradi slabe učinkovitosti genotipizacije, in tako je bilo vključenih 76 primerov in 322 kontrol v fazi odkrivanja.

V podaljšani fazi, je bilo izbranih 388 rak želodca kompleti primera za nadzor, kot sledi : 1) 334 želodca primerov raka, vključno z 136 primerih, ki na dan 31. decembra 2002, je bilo ugotovljeno od KMCC na dan 31. decembra 2008. Razen v primerih analizirani v fazi odkrivanja (N = 84) in brez vzorcev krvi (N = 51), 199 želodca primerov raka se ujemajo 1:1 kontrol glede na starost (± 5 let), spol, in za vpis leto. 2) je bilo zaposlenih 189 novih diagnoz želodca primerov raka na University Hospital Chungnam in Hanyang University GURI bolnišnica s privolitvijo od marca 2002 do septembra je bilo 2006. Vzorci krvi, zbrane v času diagnoze ali pred operacijo raka želodca. Poleg tega je bilo 189 kontrol, ki temeljijo na skupnosti po starosti (± 5 let), spol in vpis leta (od 2001 do 2005) se ujemajo naključno izbrana iz KMCC. Od 388 raka želodca primeru nadzora dvoboj, so dva primera in 40 kontrole odpravljene zaradi slabe genotipizacijo in nezadostno vzorec in na koncu je bilo analiziranih 386 primerov in 348 kontrol v podaljšani fazi.

kandidatk genov in izbor SNP

v CagA signalov steze, CagA neposredno veže na sedem proteinov, ki vodijo do zaporednih procesov. Host geni, ki kodirajo sedem beljakovine so bile izbrane kot sledi: virus v-CRK sarkom CT10 onkogena homolog ( CRK
); v-CRK sarkom virus CT10 onkogena homolog (ptičja) -Kot ( CRKL
); c-Src tirozin kinaze ( CSK
); rastnega faktorja protein-receptor veže 2 ( GRB2
); Met proto-onkogena ( c-MET
); jedrska faktorja aktiviranih T-celic, protein tirozin fosfataza tipa nereceptorsko 11 ( PTPN11
) kodira SHP2 tirozin fosfataze in proti-Src sarkom (Schmidt-Ruppin A-2) virusnega onkogena homolog ( . SRC
)

SNP kandidatke so bili izbrani glede na tri kriterije: SNP poročali, da 1) je možno funkcionalno pomen za rakom v predhodnih študijah; 2) manjše alel frekvenca (MAF) > 0.05 v azijskih prebivalcev v javnih zbirk podatkov, kot SNP500Cancer ali mednarodnega HapMap projekt z uporabo dbSNP ID (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp); in hkrati 3) MAF > 0.05 v japonski (JET), v mednarodnem HapMap projekta. Končno, 137 SNP z rezultatom oblikovanja = 1.1 in r ^{2 > 0,8 bile genotipizacijo na zaslonu pomembne SNP za tveganje za nastanek raka želodca. 108 SNP se nahajajo v intron regiji; 24 SNP se nahajajo v promotorski regiji (robno regijo ali UTR); pet SNP se nahajajo v kodirni regiji.}

genotipizacijo

V fazi odkrivanja, 137 SNP-jev v sedmih kandidatk genov, ki kodirajo CagA interakcija beljakovine so genotip. Po merjenju koncentracije genomske DNK vseh študijskih predmetov s spektrofotometrom (NanoDrop ND-1000, NanoDrop Technologies), je bila genotipizacija izvede z uporabo GoldenGate ™ test (Illumina®, San Diego, CA, ZDA). Da bi zagotovili nadzor kakovosti in ovrednoti znotraj predmeta stopnjo konkordančno je bilo 52 dvojnikov vzorcev naključno razporejeni v genotipizacije ploščo. Konkordance stopnje za vse testov je bilo več kot 99%. Od 137 SNP je bilo 21 SNP izpadel zaradi izpada genotipizacijo (4 ang SNP), SNP stopnjo klic < 90% (7 SNP), HWE < 0,0001 (1 SNP) in MAF ≤0.05 (9 SNP). Osem primerov in 14 kontrol so bile izključene tudi zaradi genotipizacije stopnjo klic < 90%. Na koncu smo analizirali 116 SNP-jev v sedmih genov (mer genotipizacije za 99,6%), v 76 primerih in 322 kontrol

V podaljšani fazi, pet SNP s surovim p-
vrednost <.; 0.02, tag SNP ali višje rezultate projektiranja (rs6122566 in rs6124914 v SRC
; rs41739 in rs41737 v c-MET
; rs7208768 v CRK
) ugotovljene v analizi odkritje so genotipizacijo z Illumina VeraCode Test GoldenGate z BeadXpress po protokolu proizvajalca (Illumina®, ZDA) [26]. Za zagotovitev zanesljivosti metode genotipizacije v dveh fazah, je bilo 188 vzorcev dvakrat genotipizacijo na vsak način. Stopnja concordance bil > 98,4%. so bili izključeni 90% (n = 27), v dveh primerih in 40 kontrol z nezadostnim DNK (n = 15) ali stopnjo genotipizacije klic <. Na koncu smo analizirali pet SNP-jev v treh genov (stopnja genotipizacije za 99,6%), v 386 primerih in 348 kontrol.

H. pylori
okužba in CagA seropozitivnosti

H. pylori
okužba in CagA seropozitivnosti so ovrednotili s imunoblot test, Helico popivnamo 2.1 ™ (MP Biomedicals Asia Pacific, Singapur). Helico Blot 2.1 ™ kompleti so poročali, da imajo visoko občutljivost in specifičnost (za občutljivost, 99% enako v obeh, za specifičnost, 98% in 90%, v tem zaporedju). [27]

Meritve fitoestrogenske biomarkerjev

Plasma koncentracije štirih fitoestrogenske biomarkerjev, ki so 1) izoflavoni: genistein, daidzein in ekvola (daidzein metabolita) in 2) Lignan: enterolaktona so bile izmerjene z uporabo časovno ločljivo fluoroimmunoassay kompleti (Labmaster, Finska). Potem ko so bile proste fitoestrogenske biomarkerjev pridobljen iz 200 p.L plazme vzorca, v VICTOR3 ™ 1420 Multilabel boj merjeno času rešiti fluorescence (Perkin-Elmer). Podrobne metode merjenja za fitoestrogenske biomarkerjev so opisana drugje [28]. Od skupnega populaciji v študiji, so bile izmerjene koncentracije v plazmi štirih biomarkerjev v 406 primerih in 417 kontrol, z zadostno količino plazme (> 200 ul).

Statistična analiza

Za primerjavo z osnovnimi značilnostmi med primeri, v želodcu raka in kontrol, test hi-kvadrat in Študentski bile izvedene t-
preizkus. P
-values ​​za razliko v deležu za spol, starost, H. pylori
okužba, CagA in Vaca seropozitivnosti, kajenje, pitje alkohola, in zgodovina gastritis med primeri in kontrolami je bila odločena.

je bila ocenjena Hardy-Weinberg ravnovesje (HWE) v kontrolni skupini z Chi- kvadrat test in Fisherjev test, s stopnjo presečnim HWE < 0,0001. V fazi odkrivanja, minimalni globalni p
-values ​​( p
< 0,05) pri preskusu razmerje verjetnosti (LRT) s 1. stopnjo svobode (df) v modelu dodatka in LRT z 2 df v genotipov modela smo izračunali, da izberete pomembne SNP. S tremi genetske modele, dodatkov, recesivno in prevladujočih modelov, je bila analizirana povezava med izbrane SNP in tveganjem za nastanek raka želodca. Permutiran p
-values ​​so bili ocenjeni s 100.000 testov permutacija na enotnem analizo SNP. Da bi se izognili lažne zveze z lažno pozitivnih rezultatov, je popravljena ali humano p
-values ​​o stanju več SNP in lažno stopnjo odkrivanja (FDR) z uporabo Benjamini-Hochberg način smo izračunali [29]. Želodca tveganje za nastanek raka, je bila ocenjena kot razmerje obetov (OR) in 95% intervali zaupanja (CIS), ki uporabljajo brezpogojno logistični regresijski model za prilagajanje na dejavnike tveganja, ki so starost, kajenje (kdaj vs.
Nikoli), H. pylori
okužba (pozitivna vs.
negativen) in CagA seropozitivnosti (pozitivna vs.
negativno). Poleg tega je analiza haplotip izvedli genov, ki vsebujejo občutno povezanih SNP od posameznega SNP analizo s Haploview 4.1 programske opreme (www.broad.mit.edu/mpg/haploview/~~HEAD=dobj).

V podaljšani fazi, najpomembnejši SNP, opredeljene v fazi odkritja so ponovno ovrednotiti. Na podlagi dodatka ali recesivnih modelov, je tveganje za nastanek raka na želodcu ocenjena kot najbolj oddaljenih regij in 95% KI uporabo brezpogojno logistični regresijski model za prilagajanje iz istih spremenljivk zgoraj omenjenih. Če povzamemo rezultate iz odkrivanja in faze podaljškov, pooled- in meta-analize so bile izvedene. Uporaba modela fiksno učinek, povzete najbolj oddaljenih regij in 95% KI bile izračunane. Poleg tega je bila heterogenost vse študije ocenil statistiki Cochran Q [30].

Z analizo variance in kovariance (ANCOVA) s starostjo, stanje kajenje (kdaj vs.
Nikoli), H. pylori
okužba (pozitivna vs.
negativen) in CagA seropozitivnosti (pozitivna vs.
negativno) kot potencialne dejavnike tveganja za raka želodca, s pomočjo ravni fitoestrogena biomarkerjev med primerih in nadzor smo primerjali. Stratificiran analize z visokimi in nizkimi stopnjami fitoestrogenske biomarkerjev (genistein, daidzein, ekvola in enterolaktona), kjer so bile ravni presečni določi z analizo splin je bila izvedena s pomočjo brezpogojne logističnih regresijskih modelov. učinki medsebojnega delovanja med najpomembnejše SNP in fitoestrogenske biomarkerjev smo izračunali tudi najbolj oddaljenih regij in 95% KI prilagojeni za starost, status, kajenje (kdaj vs.
nikoli), H. pylori
okužba (pozitivna vs.
negativen) in CagA seropozitivnosti (pozitivna vs.
negativno).

Vse statistične analize so bile opravljene z uporabo SAS različico programske opreme 9.2 ( SAS Institute, Cary, North Carolina) in Plink različico programske opreme 1,07 (http://pngu.mgh.harvard.edu/purcell/plink) [31]. Meta-analize so bile izvedene z uporabo stata različice 10 (stata, College Station, TX).

Rezultati

Ni bilo bistvene razlike med primeri in nadzora glede na spol, H. pylori
okužba, CagA /Vaca seropozitivnosti, kajenje /stanje pitje in želodca zgodovina razjede v odkrivanja in razširitev fazah (p > 0,05). CagA /Vaca seropozitivnosti in delež trenutnih kadilcev občutno višje med primerih želodčnih raka v združenih podatkov ( p
= 0,03, p
< 0,01, p
= 0,02, v tem zaporedju) (tabela S1).

od 116 SNP v sedmih kandidatnih genih, ki kodirajo CagA vzajemno beljakovine analizirane v fazi odkrivanja, 22 SNP v treh genih, SRC
, c-MET
in CRK
, so statistično pomembno povezane z rakom želodca ( p
-LRT < 0,05). SRC
rs6122566 znatno povečano tveganje za raka želodca v recesivnih modelov (ali = 4,90, [95% CI 1,19-14,2]). Trinajst SNP, ki so bili rs41739, rs16945, rs41738, rs6566, rs10435378, rs41737, rs2023748, rs41736, rs41735, rs6951311, rs183642, rs2237717 in rs38859 v c-met
gen pokazala pomembno gen-odmerkih vpliva na linearno testi gibanj ( p
< 0,05). CRK
rs7208768 imeli malo pomemben gen odmerkih učinek. 100.000 permutaciji testi na enotnem analizo SNP pokazala SRC
rs6122566, c-met
rs41739 in CRK
rs7208768 z najpomembnejšo permutiran p
- vrednost vsakega gena ( p
_{permutacija = 0,00284, p
permutacija = 0,00989, p
permutacija = 0,01392, oziroma). Marginalni pomen popravljene ali humano p
-vrednost je bila ugotovljena za SRC
rs6122566 ( p
= 0,0918), vendar je vse FDR p
-values v vseh genetskih modelov niso bile statistično značilne ( p
> 0,2). (tabela S2)}

haplotip bloki so označene z LD ploskve (slika S1). Največji blok je bil zgrajen z najbolj pomembnimi SNP vključno rs41739, rs6566, in rs41738, vendar omnibus p
-vrednost ni bila pomembna ( p
> 0,05). Štirje bloki so opredeljeni v SRC
in en blok opredeljena s CRK
ni pokazala statistične pomembnosti v testu omnibus. Rezultati analize haplotip se ni prisotna informacije presega posamezne SNP rezultatov (podatki niso prikazani).

V podaljšani fazi, dva SNP, rs6122566 in rs6124914, v SRC
gena in rs7208768 v CRK
ostala bistveno povezana s povečanim tveganjem za raka želodca (OR = 4,01 [95% IZ: 1,62-9,96], OR = 1,30 [95% IZ: 1,00-1,70], OR = 1,33, [95% IZ: 1,08-1,64], v tem zaporedju). Združenja med SNP v c-met
gena (rs41739 in rs41737) in tveganje za nastanek raka želodca, je bilo oslabljena. V skupni analizi, ki je vključevala tudi iskanje in podaljšanje faze, oceno tveganja SRC
rs6122566 v recesivno modelu je pomembno povezana z rakom želodca v obeh združenih in meta-analiz (OR = 3,96, [95% CI: 2,05-7,65], OR = 4,59 [95% IZ: 2,74-7,70], v tem zaporedju). Poleg tega, SRC
rs6124914, c-MET
rs41739 in CRK
rs7208768 pokazala pomembne učinke gensko odmerkov za raka želodca v obeh analiz. Ni bilo heterogenost po analizah (test Cochran Q, p
> 0,05). (Tabela S3)

Med skupno 823 oseb (406 primerov in 417 kontrol), ki je bilo izmerjenih plazemske koncentracije štirih fitoestrogenske biomarkerjev, so bile splošne koncentracije genistein, daidzein in enterolaktona v primerih bistveno nižje od kontrol (genistein 167,6 nmol /L v primerih, vs.
200.2 nmol /L pri nadzoru p
= 0,0004; daidzein 91,4 nmol /L v primerih, vs
131,6 nmol /L v okviru nadzora, p
. < 0,0001; enterolaktona 51,0 nmol /L primeri vs
77,7 nmol /L v okviru nadzora, p
. < 0,0001). Splošni plazemske koncentracije ekvola, ki daidzein metabolita, so bile nižje v primerih, vendar niso statistično značilne (50,3 nmol /L za primere, vs
62,2 nmol /L za nadzor;. p
= 0,0977) . V razslojeni analizo po fitoestrogenske biomarkerjev, so opazili bistveno gen interakcije z okoljem, v CRK
. alel tveganje CRK
rs7208768 imel bistveno povečano tveganje za nastanek raka želodca pri nizkih ravneh fitoestrogenske. Natančneje, A alel za rs7208768 povezana z večjim tveganjem za nastanek raka želodca pri nizki genistein, daidzein, ekvola in enterolaktona in statistično značilna (OR = 1,91 [95% IZ: 1,44-2,52] pri nizkih genistein ali = 2,09, [95% IZ: 1,46-3,01] pri nizkih daidzein, OR = 1,87 [95% IZ: 1,26-2,78] pri nizkih ekvola, OR = 1,77 [95% IZ: 1,10-2,85] pri nizki enterolaktona). p
-interaction bilo veliko ( p
= 0,0001, p
= 0,0013, p
= 0,0147, p
= 0,0404, v tem zaporedju) (tabela S4).

Čeprav so bile izvedene tudi dodatne stratifikacije analize za odkrivanje interakcijo med CagA seropozitivnosti in vsako genov učinkom za tveganje za nastanek raka želodca, interakcije niso bile pomembne v nobeni od treh genov, SRC
, c-MET
in CRK
(podatki niso prikazani).

Pogovor

CagA izločajo H. Zdi se, da igrajo pomembno vlogo v želodcu rakotvornost preko zaporedno CagA signalov poti pylori
okužbe. CagA najprej veže na sedmih beljakovinskih komponent za aktiviranje nenormalnih celične odzive, ki so osnova za razvoj raka želodca. Ker se funkcija proteina lahko ureja njihovih genov gostitelja, lahko geni, ki kodirajo CagA interakcija molekule lahko spremeni tveganje za raka želodca. Oceniti to hipotezo, smo genotipizacijo 137 SNP sedem kandidatnih genih in dokazali, da genetske variante SRC
(rs6122566 in rs6124914), c-met
(rs41739) in CRK
(rs7208768) so bistveno povezana s tveganjem za nastanek raka želodca. Poleg tega, interaktivni učinek so bili analizirani CRK
genetski polimorfizem, rs7208768 in štiri fitoestrogenske biomarkerjev, genistein, daidzein, ekvola in enterolaktona na tveganje za nastanek raka želodca.

SRC, protein ne-receptor tirozin kinaze (TK), se zdi, da je bistvenega pomena želodca rakotvornost. Po injiciranju v epitelijskih celic želodca, CagA opravi tirozin fosforilacijo s SRC družinskih kinaz [8], [12] [18]. Tirozin fosforilacijo CagA je sestavni korak pri določanju zaporedno celični mehanizem signaliziranja. Ker nekateri CagA interakcijo molekule, kot SHP-2 CRK in CSK lahko odzovejo s fosforiliranim CagA samo, lahko SRC bolj pomembna pri vplivanju na celične funkcije drugemu in induciranje razvoj raka želodca. Poleg tega, SRC, so poročali, da igrajo ključno vlogo pri napredovanju tumorjev in posredovanje razvoj in metastaze [32] raka. Zdi se Cellular dejavnost SRC je treba spremeniti z genom gostiteljice in naši rezultati kažejo, da je SRC
rs6122566 in rs6124914 lahko vplivajo na tveganje v želodca rakotvornost. SRC
genetske variacije, ki vplivajo na celično zmogljivosti v epitelijskih celic želodca so povezane s tveganjem za nastanek raka želodca.

Kljub oslabljenega pomena pri analizi podaljška, c-MET
ki je sinonim za HGFR
(hepatocitov receptorja rastnega faktorja) je lahko samostojna gen tveganje za raka želodca. Številne prejšnje študije poročajo, da je c-MET, eden od TKS receptorja, spodbuja invazivno rast tumorja, celično invazijo, in umrljivosti ter ojačanja in /ali čezmerno c-MET je bila povezana z različnimi človeškega raka, vključno z rakom želodca [17], [ ,,,0],33] - [36]. V zvezi z c-MET celični mehanizem, CagA igra pomembno vlogo kot adapter beljakovin, Gab, da posreduje receptor TK signalizacijo, ki ga nadzoruje skupino nadaljnjih komponent na aktivnem receptor kot Grb2, PLCγ in SHP-2 [37], [38]. Z funkcionalno posnemanjem adapter protein Gab, CagA bi spodbudili nenormalno širjenje in umrljivosti zaradi želodčnih epitherial celic [39]. V tej študiji je polimorfizem na c-met
gen (rs41739) je bila značilno povezana z želodčno tveganjem raka in morebitne genetske občutljivem dejavnik za rakom želodca. V skladu z mobilnega pomen in funkcijo, zdi, c-met
gen za spremembo tveganje za želodčne kancerogenosti s CagA signalov poti.

CRK adapter protein, ki ima Spajanje izo, CRK-I ( SH2-SH3) in CRK-II (SH2-SH3-SH3), veže na družbo TKS in nadzoruje prepisu in citoskeletnim reorganizacijo modulacijo celične dejavnosti [40]. Prav ta adapter protein združuje različne celične signale in njegova disregulacijo je povezan s človeško karcinoma [41]. Interakcija med CRK in fosforiliranega CagA so poročali, da je biološki pogoj, ki vodi do morfološke spremembe, celice sipanja in deregulacijo adhezijo celic, celic v želodčni epitela [14]. Številne študije so pokazale, da je čezmernim CRK povezana z različnimi vrstami človeških raka, vključno pljuč, želodca in raka na debelem črevesu [42], [43]. Naše ugotovitve podpirajo tudi genetski potencial CRK
rs7208768 na razvoj raka želodca in tako genske in celične velikosti CRK.

Še bolj zanimivo, pomembne interakcije med CRK
genetski polimorfizem in štiri fitoestrogenske biomarkerjev, genistein, daidzein, ekvola in enterolaktona, spremenjeno tveganje za nastanek raka na želodcu. Študije so pokazale varovalne učinke fitoestrogene na raka želodca [20], [28] in zlasti genistein zaviral ERK signalov kaskado je z H inducirano. pylori
okužbe igrajo vlogo kot inhibitor tirozin kinaze [44]. Glede na to, CRK je glavni gorvodno molekula aktivacije ERK so tvegane genske variante CRK
za aktiviranje ERK signalizacija lahko blokira fitoestrogene, in posredujejo razvoj raka želodca.

SRC, c-MET in CRK so vključeni tudi v proteinski družba TKS, ki je raznolika multigene družina, ki upravlja z mobilnim signalov pot posredniško vrsto nadaljnjih celičnih procesov in igra pomembne vloge pri razvoju različnih kliničnih bolezni [45], [46]. TKs so znani tudi kot onkogeni, ki sodelujejo v človeških malignih bolezni. SRC pripada TK brez receptorja in c-MET je TK receptorja, medtem CRK je adapter protein, ki se veže na TK-fosforilirane proteine ​​in krepi glavne proteine ​​v signalov poti [41]. Te tri molekule, kodirane z SRC
, c-MET
in CRK
geni lahko neodvisno povzroči celično diferenciacijo, oprijem, smrt in morfološke spremembe, ki jih predajanje celic signale, povezane z njihove TK dejavnosti glede interakcije z CagA. Futhermore se zdi, gene, povezane z ukrepom TK, da igrajo ključno vlogo kot dovzetne dejavnik želodčnega raka upoštevamo genistein, ki je inhibitor tirozin kinaze lahko zmanjša želodčne tveganje za nastanek raka [28]. To kaže, da so genetske dovzetnosti SRC
, c-MET
in CRK
in želodca rakotvornosti je treba obravnavati kot neodvisne dejavnike tveganja, ki spreminjajo celični prenos signala v TK vzdrževani manire ker neokuženih osebah z CagA izločajo H. Pylori
lahko pojavi tveganje za raka želodca, odvisno od posameznih genetskih variant treh genov.

Čeprav PTPN11
, CRKL
, CSK
in GRB2
ni pokazala pomembnega povezave z rakom želodca v tej študiji, ne smemo spregledati njihove genetske učinke. Na celičnem nivoju, so te molekule znatno povezano z odklonska učinkov, ki so osnova želodčni karcinogenezo [12]. Kot eden izmed človeških proto-onkogeni, PTPN11
kodira citoplazemske tirozin fosfataze z SHP2 in lahko povzročijo zmotne hiperaktivacijo signalizacijo ERK [47]. Študija je tudi poročala, da je PTPN11
genetska varianta je povečalo tveganje za želodčne atrofije in raka pri CagA pozitivno H. pylori
okužene osebe [48]. V CagA signalov poti, CRKL deluje precej podobno kot CRK; CSK otežuje aktivnostjo SRC družinskega kinaze in CagA-SHP2 signalizacijo; in GRB2 deluje kot sprožilec za aktiviranje RAS /MEK /ERK poti [14] [18] [49]. Nadaljnje raziskave z večjim številom primerov želodčnega raka in širšo pokritost genetskih polimorfizmov v teh genov so utemeljene.

želodca karcinogeneza jih povzroča CagA pozitivno H. Pylori
okužba lahko infered od naših študijskih rezultatov in pregled celičnih mehanizmov [16] [18] [47] (Slika S2). Ko je CagA vbrizga v želodčnih ephithelial celicah, SRC sproži CagA fosforilacijo, ki sodeluje z CRK adapter beljakovin in SHP2 za spodbujanje aktivacije ERK. Non-fosforiliranih CagA posnema Gab adapter beljakovinski okrepi znotrajcelično signalizacijo c-MET-HGF in spodbujanje signale c-met, ki aktivira tudi plaz v ERK signala.

• Plos ONE: Identifikacija Serum MicroRNAs kot Novel neinvazivna bioloških označevalcev za zgodnje odkrivanje želodčnega raka
• Plos ONE: Aktiviranje Transcription Factor 4 daje rezistenco fenotip do želodca raka celice skozi transaktivacije od SIRT1 izražanja