Objavljeni rezultati so objavljeni v znanstveni reviji mBio .
Fakulteta na Translational Genomics Research Institute (TGen), podružnica City of Hope, Univerza v Severni Arizoni (NAU), Univerza v Arizoni (UArizona), in Državna univerza Arizona (ASU) sta aprila začeli ACGU z izrecnim namenom slediti povzročitelju COVID-19, SARS-CoV-2:kako se razvija in kako se širi, znotraj in zunaj Arizone.
ACGU je sekvenciral genome SARS-CoV-2 v čim več virusih pozitivnih vzorcih bolnikov v Arizoni, in sodelovanje z uradniki javnega zdravja v Arizoni, rezultate uporabil za prizadevanja po vsej državi za testiranje in sledenje bolnikom, kot tudi zagotoviti smernice za oblikovalce javne politike v Arizoni.
Hitro ukrepanje uradnikov javnega zdravstva ASU in okrožja Maricopa, Znanstveniki ACGU se strinjajo, verjetno je v Arizoni obdržal prvega identificiranega bolnika s COVID-19-študenta, ki se je pravkar vrnil iz Hubeija, kitajska provinca, kjer je bolezen izvirala - zaradi vžiga izbruha, in Arizoni preprečila, da bi postala zgodnji epicenter okužbe.
"To je odličen primer, kako je lahko hiter in temeljit odziv javnega zdravja uspešen pri preprečevanju širjenja te bolezni, "je dejal direktor ACGU dr. Paul Keim, Regentov profesor bioloških znanosti in Cowden, darovan katedra za mikrobiologijo na NAU in izvršni direktor Inštituta za patogene in mikrobiome NAU.
"Podobne korake bi lahko naredili pri oblikovanju prihodnjih prizadevanj za ponovno odprtje podjetij in šol, čeprav virus še naprej kroži in ljudje ostajajo dovzetni, "je dodal Keim, ki je tudi ugledni profesor in so-direktor oddelka za patogene in mikrobiome TGen.
Dr. Michael Worobey, soustanovitelj ACGU in vodja Oddelka za ekologijo in evolucijsko biologijo Univerze v Arizoni, se strinja.
"To je kombinacija pacienta, ki dela prave stvari, da se izolira in se zaveda, da je morda imel to bolezen, in uradniki javnega zdravja delajo vse pravilno. Ustavitev vdora COVID-19 je bila zmaga zvezne države Arizona, "Je rekel dr. Worobey.
To je Arizoni prineslo dragocen čas za pripravljenost. Prvi prijavljeni primer prenosa "v skupnosti" se je zgodil v Arizoni v začetku marca zaradi izbruha zvezne države Washington, ki so ga odkrili februarja.
Več kot 80% genomskih sekvenc SARS-CoV-2 iz primerov COVID-19 v Arizoni izvira iz najmanj 11 ločenih linij, ki so sprva krožile po Evropi, in potovanja od takrat prevladujejo v izbruhu po ZDA. Noben od opaženih prenosnih grozdov ni epidemiološko povezan s prvotnim primerom, povezanim s potovanji v Arizoni, kar kaže na uspešno zgodnjo izolacijo in karanteno.
ACGU uporablja najsodobnejše sekvence, potek računalniške analize po meri, in superračunalniki za določitev zaporedja genoma RNA virusa, kar je nekaj manj kot 30, Dolžine 000 baz. V nasprotju, v človeškem genomu je skoraj 3 milijarde baz, ki določajo tako preproste lastnosti, kot sta barva oči in las, in tako zapletena kot nagnjenost posameznika k raku in drugim boleznim.
TGen je doslej sekvenciral genome SARS-CoV-2 od skoraj 3, 000 pozitivnih vzorcev COVID-19 za ACGU, dodatno zaporedje pa je bilo izvedeno v ASU in UArizoni, med več kot 200, 000 pozitivnih primerov v Arizoni, zaradi česar je to eno najmočnejših tovrstnih prizadevanj v državi. ACGU prejme vzorce Arizone, ki jih zbere država, okrožje, plemenskih in zasebnih zdravstvenih sistemov.
Znanstveniki ACGU izkoriščajo majhne spremembe ali mutacije v genomu virusa, ki se naravno pojavljajo skozi čas, ko se virus razmnožuje, za spremljanje širjenja virusa. Če primerjamo mutacije, opažene v Arizoni, s tistimi, ki so prisotne v sevih, ki krožijo po vsem svetu, lahko ugotovijo, kdaj in od kod je bil virus vnesen v Arizono.
Z uporabo analiz molekularne ure, raziskovalci so ugotovili, da večino zaporedij v Arizoni predstavljata dve vrsti-in več podvrsti-večina od njih je bila verjetno uvedena z domačimi potovanji, vendar z nekaterimi dokazi za mednarodni uvoz.
"Skozi ACGU, izkoriščamo strokovno znanje na področju virusologije, genomika, evolucijo in bioinformatiko iz vse Arizone, da bi te genomske podatke hitro destilirali v dejanske vpoglede, ki lahko dopolnijo odziv države na področju javnega zdravja, "Dr. Keim je dejal." Ti rezultati dokazujejo moč sledenja stikov in samoizolacije v javnem zdravju po pozitivnem testu za preprečevanje napredovanja okužbe. "
David Engelthaler, dr. Direktor podjetja TGen North v Flagstaffu, ki vključuje vejo nalezljivih bolezni inštituta, je dejal, da prve ugotovitve ACGU kažejo, kako vsaka skupnost, vsaka država piše svojo zgodbo o dogajanju v pandemiji COVID-19.
"Moramo razumeti vse te zaplete, ki so pripeljali do tega, kjer smo zdaj, "je dejal dr. Engelthaler, še eden od soustanoviteljev ACGU. "Ko so 26. januarja v Arizoni odkrili to bolezen, javno zdravje je takoj priskočilo na pomoč, da bi zagotovili identifikacijo vseh stikov, odvzeli smo vzorce in bolnika v naslednjih nekaj tednih pozorno opazovali, da se prepričamo, da ni več primerov. "
V prihodnjih mesecih rekel je, treba bo slediti izbruhom COVID-19 in okoli vsakega primera zgraditi epidemiološke zidove, zlasti za najbolj ogrožene:osebe, starejše od 65 let, tisti v ustanovah za dolgotrajno oskrbo, zapori, in tisti z že obstoječimi zdravstvenimi težavami.
"Ko na to nimaš oči, če nimate sledenja stikov, potem se lahko resnično enostavno premakne od osebe do osebe, "Je dejal dr. Engelthaler." Za oblikovalce javne politike je zelo koristno, da sprejemajo odločitve na lokalni ravni. "
Dr. Efrem Lim, virolog, ki vodi ekipo ASU, je dejal, da lahko podatki o zaporedju genoma SARS-CoV-2 dajo izvajalcem zdravstvenih storitev in oblikovalcem javne politike prednost v boju proti pandemiji.
Sledenje prenosu virusa in njegovih mutacij zagotavlja, da so terapije in cepiva, ki se razvijajo, na pravi poti. Zdaj imamo vedeti, kako izgleda virus SARS-CoV-2 v naših skupnostih na ravni zaporedja. "
Dr. Efrem Lim, Virolog in docent, Inštitut za biodizajn, Državna univerza Arizona
Peptid pajkovega strupa bi lahko pomagal ustaviti bolečine pri sindromu razdražljivega črevesja
Običajne glive na koži lahko povzročijo vnetne črevesne bolezni
Črevesne bakterije, povezane z močnejšimi mišicami pri starejših
Študija ugotavlja, da hrana selektivno vpliva na črevesne mikrobe
Dodatek kratkih verig maščobnih kislin izboljša okrevanje po možganski kapi,
Človeški mikrobiom obrezuje glikane sluznice,
Znanstveniki spremenijo kri tipa A v univerzalni tip O,
potencialno podvoji zaloge transfuzije krvi Raziskovalci na Univerzi v Britanski Kolumbiji so odkrili potencialni način za pretvorbo krvi tipa A v univerzalno kri tipa O, razvoj, ki bi lahko močno po
Malo dokazov za trombocitopenijo, povezano s cepivom mRNA COVID-19,
predlaga novo študijo FDA Kljub temu, da je bilo za boj proti pandemiji koronavirusa 2019 (COVID-19) uvedenih veliko cepiv, poročali so o nekaterih resnih škodljivih učinkih, v obliki trombocitopenije
Mikroplastika je bila prvič ugotovljena v človeških odpadkih
Analiza vzorcev človeškega blata, odvzetih od udeležencev v osmih državah, je pokazala, da je vsak preskusni vzorec vseboval mikroplastiko in da je bilo prisotnih do devet različnih plastičnih mas.