Genomisk analys av specifik E. coli -stam kan hjälpa till att utveckla potentiella vacciner

Matburna patogener är mycket vanliga och vanligtvis godartade, men vissa virulenta stammar av patogener kan resultera i allvarliga sjukdomar och till och med dödsfall. Att särskilja specifika stammar av patogener kan hjälpa forskare att bättre förstå dem och utveckla biomarkörer för att upptäcka dem hos patienter, påskynda diagnos och behandling.

University at Buffalo forskare har nu slutfört den genomiska analysen av en specifik stam av Shiga-toxin E coli (STEC) som kan orsaka allvarliga sjukdomsutbrott och blir allt vanligare. Forskningen kan spela en roll för att utöka förståelsen för STEC -infektioner och, potentiellt, att utveckla vacciner mot dem.

Enligt Centers for Disease Control and Prevention, STEC beräknas orsaka mer än 265, 000 infektioner per år i USA, och är associerade med fler än 3, 600 sjukhusvistelser och cirka 30 dödsfall.

Publicerad i BMC Genomics förra månaden, papperet beskriver den genomiska analysen som slutförts på en unik STEC-stam isolerad från ett annars friskt 2 ½ år gammalt barn som bor i Davidson County, Tennessee.

Patogenen orsakade allvarlig sjukdom, inklusive hemolytiskt uremiskt syndrom, ett tillstånd som förstör röda blodkroppar, sänker trombocyter och blockerar blodkärl i njurarna, resulterar i anemi och njurskada.

Barnet överlevde men var på sjukhus i en månad och fick allvarliga komplikationer som påverkade flera organsystem, inklusive hennes lungor, hjärta, njure, hjärna, cirkulationssystemet och mag -tarmkanalen.

Ett växande folkhälsoproblem

Shiga-toxinet producerar E coli hon var infekterad med är en icke-0157 STEC. Medan patogenerna som klassificeras som 0157 STEC -infektioner i allmänhet är vanligare och leder till allvarligare sjukdom, antalet nya, icke-0157 STEC-patogener har ökat. Vissa leder till allvarlig sjukdom, skapa ett växande folkhälsoproblem, enligt UB -forskarna.

Tidningen säger att det finns mer än 400 av dessa STEC-stammar som inte är 0157, och mer än en fjärdedel rapporteras orsaka gastrointestinal sjukdom, ofta presenteras först som blodig diarré med hemolytiskt uremiskt syndrom och om det inte behandlas, i sällsynta fall, död.

Den specifika patogen barnet var infekterad med var en STEC 0145:H25. "Eftersom genomiska studier på framväxande icke-0157 STEC är begränsade, våra studier är signifikanta eftersom de avslöjar den genetiska sammansättningen av framväxande STEC 0145:H25 i jämförelse med andra STEC -stammar. "

Oscar G. Gómez-Duarte, MD, Doktorsexamen, Studera motsvarande författare och docent, Institutionen för pediatrik, Universitetet i Buffalo

Gómez-Duarte är också chef för avdelningen för pediatriska infektionssjukdomar vid Jacobs School of Medicine and Biomedical Sciences vid UB och barnläkare med UBMD Pediatrics.

"Fynden avslöjar hur denna framväxande STEC orsakar allvarlig sjukdom och att den kan vara lika virulent, eller ännu mer virulent, än vanligare STEC -stammar, som leder till allvarlig och till och med dödlig sjukdom hos mottagliga värdar, "sa han." Det ger också information om hur denna potentiellt förebyggbara infektion fortsätter att påverka utsatta individer. "

Virulensgener

En viktig upptäckt av studien, han sa, var att denna 0145:H25 -serotyp leder till särskilt svår infektion. Dessutom, förutom att bära virulensgener som finns i 0157 STEC, den har ytterligare gener och nya potentiella virulensgener jämfört med andra icke-0157-stammar som har studerats. "Dessa fynd förtjänar ytterligare analys för att förstå patogenesen för dessa framväxande STEC -infektioner, "sa Gómez-Duarte.

• Forskare identifierar kopplingen mellan störd sömn,
• Hundars åldringsmekanism och minnesprestanda kopplad till tarmmikrobiomkomposition