Cuanto más aprendemos sobre el microbioma humano, cuanto más aprendemos de su importancia para nuestra salud. Saber cómo se ve un intestino humano sano es fundamental para la investigación que informará cómo diagnosticar, tratar, y prevenir problemas con el microbioma ".
Raja Mazumder, Doctor, coautor y profesor de bioquímica y medicina molecular en la Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud de GW
Este conocimiento integral de los tipos y proporciones de microbios que habitan el intestino humano sano es necesario antes de que se pueda realizar cualquier tipo de estudio preclínico o clínico. También es importante para los investigadores que buscan encontrar formas de alterar el microbioma, tratar una condición, o mejorar el resultado de una terapia. GutFeelingKB puede servir como un control saludable para estudios que analicen el microbioma humano.
Para compilar su base de datos, el grupo de investigación secuenció genéticamente 48 muestras fecales de 16 participantes sanos reclutados en Washington, CORRIENTE CONTINUA., además de utilizar 50 muestras metagenómicas fecales descargadas del Proyecto de Microbioma Humano de personas que también se seleccionaron como sanas. De los 157 organismos descritos en GutFeelingKB, 20% fueron clostridios, 19% fueron bacterioidios, 17% fueron Bifidobacteriales, El 14% eran Enterobacterales y del filo Firmicutes el 20% eran Clostridia y el 14% eran Lactobacillales, todas las clases de bacterias que se encuentran en alimentos probióticos como el yogur. El equipo de investigación señaló que 84 organismos eran comunes a todas las muestras, lo que indica que este grupo de bacterias puede ser una especie fundamental para el intestino humano.
La investigación fue apoyada por subvenciones de la National Science Foundation, el Programa de Premios de Ciencias Clínicas y Traslacionales del Centro Nacional para el Avance de las Ciencias Traslacionales, el Centro Genómico y Proteómico McCormick, y el Clinical Translational Science Institute (CTSI) de GW and Children's National en Washington, Los datos de secuencia sin procesar de D.C. se generaron en KamTek, Inc. con precios subsidiados utilizando instrumentos MiSeq Illumina en Montgomery College en Rockville, Maryland.
"Este estudio demuestra el poder de la ciencia en equipo multidisciplinario para avanzar en la investigación traslacional, ya que este equipo involucra a colegas de múltiples instituciones, disciplinas y escuelas dentro de GW, "dijo Keith A. Crandall, Doctor, codirector de informática en la subvención CTSI, coautor, y director del Instituto de Biología Computacional de la Escuela de Salud Pública del Instituto Milken en GW. "El GutFeelingKB proporciona un modelo fundamental y datos iniciales para comenzar a comprender la diversidad del microbioma intestinal sano, que es un componente clave de cualquier estudio que intente detectar enfermedades asociadas con cambios en el microbioma ".
Además de crear GutFeelingKB, el grupo de investigación publicó un nuevo Informe de población del bioma fecal, conocido como FecalBiome, que tiene capacidad clínica. FecalBiome puede ayudar a los médicos a comparar el microbioma de un paciente con el microbioma de individuos sanos, permitiéndoles evaluar mejor la efectividad de los trasplantes fecales y otros productos microbiológicos. El equipo de investigación también desarrolló un prototipo de plantilla de informes para que los médicos transmitieran la información a los pacientes.
"Descubrir los complejos intercambios metabólicos entre las especies microbianas intestinales y sus huéspedes humanos tiene tremendas implicaciones para una amplia variedad de condiciones de salud, posiblemente incluso nuestros estados de ánimo. ¿Se puede "ajustar" el microbioma para aumentar las poblaciones de bacterias beneficiosas? ¿Cómo afecta nuestra dieta a este ajuste? Estamos entusiasmados de que esta base de conocimientos nos permita cuantificar estos cambios y relacionarlos con la salud humana, "dijo Hiroki Morizono, Doctor, codirector de informática en la subvención CTSI, coautor, director de informática biomédica en Children's National y profesor asociado de investigación de genómica y medicina de precisión y pediatría en la Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud de GW.
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