Pesquisadores publicam perfil microbiano para apoiar o crescente campo da pesquisa intestinal

Existem 157 organismos que formam o bioma básico de um intestino humano saudável, de acordo com pesquisa publicada na revista PLOS ONE por investigadores da George Washington University (GW). O perfil microbiano da linha de base, chamado GutFeelingKB, pode ser expandido para 863 organismos se proteomas intimamente relacionados forem considerados. Esta informação servirá como uma lista de referência para médicos, pacientes, e pesquisadores, dando-lhes uma ideia de como é um microbioma humano "normal".

p Quanto mais aprendemos sobre o microbioma humano, quanto mais aprendemos sobre sua importância para nossa saúde. Saber a aparência de um intestino humano saudável é fundamental para a pesquisa que informará como diagnosticar, tratar, e evitar problemas com o microbioma. "

Raja Mazumder, PhD, co-autor e professor de bioquímica e medicina molecular na Escola de Medicina e Ciências da Saúde GW

p Este conhecimento abrangente dos tipos e proporções de micróbios que habitam o intestino humano saudável é necessário antes que qualquer tipo de estudo pré-clínico ou clínico possa ser realizado. Também é importante para os pesquisadores que procuram encontrar maneiras de alterar o microbioma, tratar uma condição, ou melhorar o resultado da terapia. O GutFeelingKB pode servir como um controle saudável para estudos que examinam o microbioma humano.

p Para compilar seu banco de dados, o grupo de pesquisa sequenciou geneticamente 48 amostras fecais de 16 participantes saudáveis ​​recrutados em Washington, D.C., além de usar 50 amostras metagenômicas fecais baixadas do Projeto Microbioma Humano de indivíduos também selecionados como saudáveis. Dos 157 organismos descritos em GutFeelingKB, 20% eram clostrídios, 19% eram Bacterioidia, 17% eram Bifidobacteriales, 14% eram Enterobacterales e do filo Firmicutes 20% eram Clostridia e 14% eram Lactobacillales - todas as classes de bactérias encontradas em alimentos probióticos como o iogurte. A equipe de pesquisa observou que 84 organismos eram comuns a todas as amostras, indicando que este grupo de bactérias pode ser uma espécie essencial para o intestino humano.

p A pesquisa foi apoiada por doações da National Science Foundation, o Programa de Prêmios de Ciência Clínica e Translacional no National Center for Advancing Translational Sciences, o McCormick Genomic and Proteomic Center, e o Clinical Translational Science Institute (CTSI) da GW and Children's National em Washington, Dados de sequência bruta de D.C. foram gerados em KamTek, Inc. com preços subsidiados usando instrumentos MiSeq Illumina no Montgomery College em Rockville, Maryland.

p "Este estudo demonstra o poder da ciência da equipe multidisciplinar para o avanço da pesquisa translacional, pois esta equipe envolve colegas de várias instituições, disciplinas e escolas dentro da GW, "disse Keith A. Crandall, PhD, informática co-lidera a bolsa CTSI, co-autor, e diretor do Instituto de Biologia Computacional da Escola de Saúde Pública do Milken Institute da GW. "O GutFeelingKB fornece um modelo básico e dados iniciais para começar a entender a diversidade do microbioma intestinal saudável, que é um componente-chave de qualquer estudo que tente detectar doenças associadas a alterações no microbioma. "

p Além de criar GutFeelingKB, o grupo de pesquisa publicou um novo Relatório da População do Bioma Fecal, conhecido como FecalBiome, que tem capacidade clínica. FecalBiome pode ajudar os médicos a comparar o microbioma de um paciente com os microbiomas de indivíduos saudáveis, permitindo-lhes avaliar melhor a eficácia dos transplantes fecais e outros produtos do microbioma. A equipe de pesquisa também desenvolveu um modelo de relatório de protótipo para os médicos transmitirem as informações aos pacientes.

p "Descobrir as complexas trocas metabólicas entre as espécies microbianas intestinais e seus hospedeiros humanos tem implicações tremendas para uma ampla variedade de condições de saúde, possivelmente até mesmo nosso humor. O microbioma pode ser 'ajustado' para aumentar as populações de bactérias benéficas? Como nossa dieta afeta esse ajuste? Estamos entusiasmados com esta base de conhecimento nos permitirá quantificar essas mudanças e relacioná-las à saúde humana, "disse Hiroki Morizono, PhD, informática co-lidera a bolsa CTSI, co-autor, diretor de informática biomédica do Children's National e professor associado de pesquisa de genômica e medicina de precisão e pediatria da Escola de Medicina e Ciências da Saúde GW.

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