Tutkijat julkaisevat mikrobiprofiilin tukemaan suolistotutkimuksen kasvavaa alaa

Mitä enemmän opimme ihmisen mikrobiomista, mitä enemmän opimme sen merkityksestä terveydellemme. Tietäen miltä terve ihmisen suoli näyttää, on kriittistä tutkimukselle, joka auttaa diagnosoimaan, kohdella, ja ehkäisemään ongelmia mikrobiomissa. "

Raja Mazumder, PhD, GW:n lääketieteen ja terveystieteiden korkeakoulun biokemian ja molekyylilääketieteen tekijä ja professori

Tämä kattava tieto terveen ihmisen suolistossa elävien mikrobien tyypeistä ja suhteista on välttämätöntä ennen minkäänlaisen prekliinisen tai kliinisen tutkimuksen suorittamista. On myös tärkeää tutkijoille, jotka haluavat löytää tapoja muuttaa mikrobiomia, hoitaa sairautta, tai parantaa hoitotulosta. GutFeelingKB voi toimia terveenä kontrollina ihmisen mikrobiomia tutkivissa tutkimuksissa.

Tietokannan kokoamiseksi tutkimusryhmä geneettisesti sekvensoi 48 ulosteenäytettä 16 terveeltä Washingtonissa rekrytoidulta osallistujalta, DC., Sen lisäksi, että käytettiin 50 ulosteen metagenominäytettä, jotka oli ladattu ihmisen mikrobiomiprojektista, myös yksilöiltä, ​​jotka seulottiin terveiksi. GutFeelingKB:ssä kuvatuista 157 organismista 20% oli Clostridia, Bacterioidia oli 19%, 17% oli bifidobakteereja, 14% oli enterobakteereja ja Firmicutes -suvusta 20% olivat Clostridioita ja 14% olivat Lactobacillales - kaikki bakteeriluokat, joita esiintyi probioottisissa elintarvikkeissa, kuten jogurtissa. Tutkimusryhmä totesi, että 84 organismia oli yhteistä kaikille näytteille, osoittaa, että tämä bakteeriryhmä voi olla ihmisen suoliston ydinlaji.

Tutkimusta tukivat National Science Foundationin apurahat, Clinical and Translational Science Awards -ohjelma National Center for Advancing Translational Sciences, McCormickin genomi- ja proteomikeskus, ja Clinical Translational Science Institute (CTSI) GW:ssä ja Children's Nationalissa Washingtonissa, DC Raw -sekvenssitiedot luotiin KamTekissa, Inc. tuetulla hinnoittelulla MiSeq Illumina -laitteilla Montgomery Collegessa Rockvillessä, Maryland.

"Tämä tutkimus osoittaa monitieteisen tiimitieteen voiman edistää translaatiotutkimusta, koska tässä tiimissä on mukana kollegoja useista instituutioista, GW:n oppiaineet ja koulut, "sanoi Keith A. Crandall, PhD, tietotekniikan yhteispäällikkö CTSI-apurahassa, tekijä, ja GW:n Milken Instituutin kansanterveyskoulun laskennallisen biologian instituutin johtaja. "GutFeelingKB tarjoaa perustavan mallin ja lähtötiedot, joiden avulla ymmärretään terveen suoliston mikrobiomin monimuotoisuus, joka on keskeinen osa tutkimusta, jossa yritetään havaita mikrobiomimuutoksiin liittyvä sairaus. "

GutFeelingKB:n luomisen lisäksi tutkimusryhmä julkaisi uuden ulosteen biomipopulaation raportin, tunnetaan nimellä FecalBiome, jolla on kliininen kyky. FecalBiome voi auttaa lääkäreitä vertaamaan potilaan mikrobiomia terveiden yksilöiden mikrobiomeihin, jotta he voivat paremmin arvioida ulosteensiirtojen ja muiden mikrobiomituotteiden tehokkuutta. Tutkimusryhmä kehitti myös prototyyppisen raportointimallin lääkäreille tietojen välittämiseksi potilaille.

"Monimutkaisen aineenvaihdunnan paljastaminen suoliston mikrobilajien ja niiden isäntien välillä vaikuttaa valtavasti monenlaisiin terveysolosuhteisiin, mahdollisesti jopa mielialamme. Voidaanko mikrobiomi "virittää" hyödyllisten bakteeripopulaatioiden lisäämiseksi? Miten ruokavalio vaikuttaa tähän viritykseen? Olemme innoissamme, että tämä tietokanta antaa meille mahdollisuuden mitata nämä muutokset ja yhdistää ne ihmisten terveyteen, "sanoi Hiroki Morizono, PhD, tietotekniikan yhteispäällikkö CTSI-apurahassa, tekijä, biolääketieteen tietotekniikan johtaja Children's Nationalissa ja genomiikan ja tarkkuuslääketieteen ja pediatrian apulaisprofessori GW:n lääketieteen ja terveystieteiden korkeakoulussa.

• Syöpäpotilaat, jotka jäävät tapaamatta, kuolevat todennäköisemmin 12 kuukauden kuluessa diagnoosista
• Yksinkertainen geneettinen testi voi lisätä vasteasteita lapsilla, joilla on eosinofiilinen ruokatorvitulehdus