Se alkoi näytteillä kaikkialta Yhdysvalloista, jotka saapuivat evoluutiobiologin Crystal Heppin laboratorioon. joka työskentelee sekä tietotekniikan korkeakoulun kanssa, Tietokoneet, ja Cyber Systems (SICCS) ja Pathogen and Microbiome Institute (PMI) Pohjois -Arizonan yliopistossa. Hän tekee yhteistyötä tusinan eri kansanterveysosaston kanssa lännessä. He lähettävät hänelle Länsi -Niililtä (WNV) näytteitä, jotka löytyvät alueiltansa, ja hänen tiiminsä sekvensoi virusgenomit ja analysoi tiedot kunkin näytteen sukupuun rekonstruoimiseksi, jonka avulla hän voi määrittää, miten virus liikkuu ajan mittaan ja koko alueella.
Tässä tapauksessa, Coconinon läänin terveysministeriö lähetti hänelle kaksi näytettä, yksi löydetty hyttysistä Mary -järvellä ja toinen Cheshiren alueelta, molemmat elokuun lopussa. Hepp sekvensoi viruskantojen genomit, verrattiin niitä viruskantoihin, jotka hän oli sekvensoinut muilta alueilta, ja havaitsi, että nämä kaksi viruskantaa eivät olleet peräisin viruksen paikallisesta liikkeestä, eli niitä ei levitetty läänin lintujen ja hyttysten välillä. Cheshire -kanta liittyy läheisesti Maricopan piirikunnassa kiertäviin kantoihin, kun taas Lake Mary -kanta liittyy läheisimmin kantaan, jonka hänen tiiminsä sekvensoi Montanasta vuonna 2018, vaikka Lake Mary -kanta osoitti useita erilaisia mutaatioita Montana -kannasta.
Tämä oli odottamatonta, Hepp sanoi. Se on todennäköisesti hyvä asia myös Coconinon piirikunnalle.
Usein ajattelemme, että yksinkertaisin vastaus on todennäköisin vastaus. Olisi ollut järkevää, jos nämä kaksi kantaa vain 10 mailin päässä toisistaan, johtuivat samasta tuontitapahtumasta. Kansanterveyden kannalta havaita, että nämä kaksi kantaa ovat kahdesta eri paikasta, on hyvä uutinen. Jos he olivat läheisesti yhteydessä toisiinsa, se tarkoittaisi, että WNV oli todennäköisesti pyöräillyt lintujen ja hyttysten läpi 10 mailin päässä Coconinon piirikunnasta. Toivomme, että kaksi erillistä esittelyä ovat juuri pyöräille niillä paikallisilla maantieteellisillä paikoilla, joista ne löytyivät, pikemminkin kuin 10 mailia, ja että ne vain haalistuvat. "
Crystal Hepp, evoluutiobiologi, NAU
Heppin laboratorio on johtaja pyrkimyksissä ymmärtää paremmin, miten Länsi -Niilin virus kiertää Amerikan lounaisosassa. Hänen kansanterveyskumppaninsa tekevät ensimmäisen diagnoosin, sitten lähettää hänelle kantoja selvittääkseen, onko virus peräisin. Tietojen tunteminen ja kartoittaminen voi auttaa hallituksia paremmin ennustamaan ja valmistautumaan Länsi -Niilin mahdollisuuteen omilla alueillaan. Näitä kumppaneita ovat:
Tämä tutkimus sisältää perustutkinto -opiskelijat Daryn Erickson, Breezy Brock, Samuel Poidmore, ja majesteetti Greer-Gipson, tutkimusasiantuntija Jill Cocking, jatko -opiskelija Chase Ridenour, Krystal Sheridan ja Heidie O'Neill PMI -sekvensointiytimestä sekä Darrin Lemmer, Mike Valentine ja Dave Engelthaler Translational Genomics Research Instituteista.
"Olemme erittäin kiinnostuneita ymmärtämään Lounais -alueella kiertävien kantojen väliset yhteydet, "Hepp sanoi." Tämän avulla voimme päättää, esimerkiksi, WNV -tilanne Maricopan piirikunnassa koskee muita lounaisalueita. WNV Maricopan piirikunnasta on lisäksi levinnyt Washingtonin piirikuntaan, Utah; Riversiden lääni, Kalifornia; ja Yuman piirikunta, Arizona menneisyydessä, ja haluaisimme siirtyä eteenpäin ennustemallilla, joka voisi tiedottaa maakunnille riskeistä historiallisten mallien ja ympäristötietojen perusteella. "
Coconinon piirikunnassa ei ole raportoitu yhtään ihmisen tapausta Länsi -Niilistä vuoden 2010 jälkeen.
Länsi-Niili on osavaltion yleisin hyttysten välittämä sairaus, vaikka sen laajuutta on vaikea mitata, koska vain noin 20 prosenttia tartunnan saaneista ihmisistä edes ymmärtää olevansa sairaita. Useimmat oireista kärsivät tuntevat olevansa flunssassa, mutta noin joka 150 tartunnan saaneesta sairastaa vakavan sairauden, kuten aivotulehduksen tai aivokalvontulehduksen, joka voi olla kohtalokasta.
Vuonna 2018 Hepp sai apurahan Arizonan biolääketieteelliseltä tutkimuskeskukselta tutkiakseen Länsi -Niilin kiertoa ja lähdepaikkoja osavaltiossa.
Ruokavalio ja ravitsemus vaikuttavat paksusuolen limakalvon mikrobiomiin
Syntymäkanavan bakteerit liittyvät pienempään munasarjasyövän riskiin
Tuo Pepto ei todennäköisesti auta haavaasi
Ilmoittavatko kaupallisten kefirituotteiden etiketit mikrobitasot oikein?
Toimenpiteet SARS-CoV-2:n leviämisen estämiseksi jäteveden kautta köyhillä alueilla
Tutkimus sanoo SARS-CoV-2-koiran infektiosta
Mikrobit voivat ennustaa kuolemaan johtavia seurauksia hengitetyissä COVID-19-potilaissa
Läsnäolo Mycoplasma salivarium hengitettynä COVID-19-infektion sairastavien potilaiden alemmissa hengitysteissä liittyy lisääntynyt todennäköisyys kuolla. Tulos oli osa molekyylitutkimusta, jossa ta
Maaseudun ja kaupunkien mikrobiota eroaa nuoresta iästä,
löytää uuden tutkimuksen Uusi tutkimus on osoittanut, että ihmisen suoliston mikrobiomissa erot Nigerian maaseutu- ja kaupunkialueilla asuvien ihmisten välillä alkavat hyvin nuorena. Kuva
Rotaviruksella on rooli tyypin 1 diabeteksen kehittymisessä
Uusi artikkeli julkaistiin PLOS Pathogens -lehdessä 10. lokakuuta, 2019, väittää, että tavallinen rotavirus voi olla vastuussa joistakin tyypin 1 diabeteksen esiintymisistä, diabeteksen muoto, joka es