Det startet med prøver fra hele det vestlige USA som ankom laboratoriet til evolusjonsbiologen Crystal Hepp, som jobber med både School of Informatics, Databehandling, og Cyber Systems (SICCS) og Pathogen and Microbiome Institute (PMI) ved Northern Arizona University. Hun samarbeider med et titalls forskjellige offentlige helseavdelinger i hele Vesten. De sender henne prøver fra West Nile (WNV) funnet i områdene deres, og teamet hennes sekvenserer de virale genomene og analyserer dataene for å rekonstruere slektstreet til hver prøve, som lar henne bestemme hvordan viruset beveger seg over tid og i hele regionen.
I dette tilfellet, Coconino County Health Department sendte henne de to prøvene, en funnet i mygg ved Lake Mary og en i Cheshire -området, begge i slutten av august. Hepp sekvenserte genomene til virusstammene, sammenlignet dem med virusstammene hun hadde sekvensert fra andre områder, og fant ut at de to virusstammene ikke skyldes lokal sirkulasjon av viruset, noe som betyr at de ikke ble overført blant fugler og mygg i fylket. Cheshire -stammen er nært beslektet med stammer som sirkulerer i Maricopa County, mens Lake Mary -stammen er nærmest beslektet med en belastning teamet hennes sekventerte fra Montana i 2018, selv om Lake Mary -stammen viste flere forskjellige mutasjoner fra Montana -stammen.
Dette var uventet, Sa Hepp. Det er også sannsynligvis en god ting for Coconino County.
Vi tror ofte at det enkleste svaret er det mest sannsynlige svaret. Det hadde vært fornuftig hvis disse to stammene, skilt med bare 10 miles, skyldtes den samme importhendelsen. Fra et folkehelseperspektiv, å finne ut at disse to stammene er fra to forskjellige steder er gode nyheter. Hvis de var nært beslektet, det ville bety at WNV sannsynligvis hadde blitt syklet gjennom fugler og mygg over 10 miles av Coconino County. Vi håper at de to separate introduksjonene nettopp har syklet på de veldig lokaliserte geografiske stedene de ble funnet, i stedet for over 10 miles, og at de bare blekner. "
Crystal Hepp, evolusjonsbiolog, NAU
Hepps laboratorium er en leder i arbeidet med å bedre forstå hvordan West Nile -viruset sirkulerer i det amerikanske sørvest. Hennes helsepartnere stiller den første diagnosen, send deretter hennes stammer for å finne ut om viruset oppsto. Å kjenne og kartlegge disse dataene kan hjelpe regjeringer til bedre å forutsi og forberede muligheten for West Nile i sine områder. Disse partnerne inkluderer:
Denne forskningen inkluderer studenter Daryn Erickson, Breezy Brock, Samuel Poidmore, og Majestet Greer-Gipson, forskningsspesialist Jill Cocking, doktorgradsstudent Chase Ridenour, Krystal Sheridan og Heidie O'Neill fra PMI -sekvenseringskjernen, så vel som Darrin Lemmer, Mike Valentine og Dave Engelthaler fra Translational Genomics Research Institute.
"Vi er veldig interessert i å forstå sammenhengen mellom stammer som sirkulerer i sørvest, "Hepp sa." Dette gjør at vi kan bestemme, for eksempel, WNV -situasjonen i Maricopa County er for andre sørvestlige steder. WNV fra Maricopa County har i tillegg spilt over til Washington County, Utah; Riverside County, California; og Yuma County, Arizona tidligere, og vi vil gjerne gå videre med en prediktiv modell som kan informere fylker om risiko basert på historiske mønstre og miljødata. "
Ingen menneskelige tilfeller av West Nile har blitt rapportert i Coconino County siden 2010.
West Nile er den vanligste myggbårne sykdommen i staten, selv om omfanget er vanskelig å måle fordi bare omtrent 20 prosent av de smittede selv innser at de er syke. De fleste som opplever symptomer, føler at de har influensa, men omtrent en av 150 smittede utvikler en alvorlig sykdom som encefalitt eller meningitt, som kan være dødelig.
I 2018, Hepp mottok et tilskudd fra Arizona Biomedical Research Center for å undersøke sirkulasjonen og kildeplasseringene til West Nile i staten.
Tiltak for å forhindre SARS-CoV-2 overføring gjennom avløpsvann i fattige regioner
Tilstedeværelse av visse tarmbakterier hos mødre kan beskytte babyer mot matallergi
Transplantasjon av vaginal væske kan hjelpe til med å behandle tilbakevendende bakteriell vaginose
Blodprøve for mikrobielt DNA kan advare om kreft
Migrasjon påvirker tarmmikrobiota som igjen påvirker helsefunnforskere
Ny forskning identifiserer en kobling mellom tarmmikrobiomet og slag
Detaljert kart over mikrobiom for menneskelig tunge
En ny studie publisert i tidsskriftet Cellerapporter i mars 2020 rapporterer bruk av avanserte og raske spektrale avbildningsteknikker for å utvikle et detaljert kart over mikrobielle samfunn på men
Parkinsons sykdom kan forebygges av tarmmikrober
En vanlig tarmorganisme som hjelper oss med å fordøye maten bedre, kan også være et kraftig instrument for å forhindre eller reversere symptomene på Parkinsons sykdom (PD), ifølge en fersk studie. End
Er C-seksjon bra for barndoms helse?
En nylig studie publisert av VATT Institute for Economic Research antyder at en ikke -planlagt CS utført for en indikasjon som kanskje kunne vært unngått, har bare et årsak-virkning-forhold til astma