Все началось с того, что образцы со всего запада США поступили в лабораторию биолога-эволюциониста Кристал Хепп. который работает со Школой информатики, Вычисления, и Cyber Systems (SICCS) и Институт патогенов и микробиома (PMI) в Университете Северной Аризоны. Она сотрудничает с десятком различных департаментов общественного здравоохранения на Западе. Они отправляют ей образцы Западного Нила (WNV), найденные в их районах, и ее команда секвенируют вирусные геномы и анализируют данные, чтобы восстановить генеалогическое древо каждого образца, что позволяет ей определить, как вирус распространяется с течением времени и по региону.
В этом случае, Департамент здравоохранения округа Коконино прислал ей два образца:один найден в комарах на озере Мэри и один в районе Чешира, как в конце августа. Hepp секвенировал геномы штаммов вируса, сравнила их со штаммами вирусов, которые она секвенировала из других областей, и обнаружили, что два штамма вируса не являются результатом местной циркуляции вируса, это означает, что они не передавались среди птиц и комаров в округе. Штамм Cheshire тесно связан со штаммами, циркулирующими в округе Марикопа, в то время как штамм Lake Mary наиболее тесно связан со штаммом, выделенным ее командой из Монтаны в 2018 году, хотя штамм Lake Mary показал несколько различных мутаций от штамма Montana.
Это было неожиданно, - сказал Хепп. Это также, вероятно, хорошо для округа Коконино.
<цитата>Мы часто думаем, что самый простой ответ - это наиболее вероятный ответ. Было бы разумно, если бы эти два штамма разделены всего 10 милями, произошли из-за того же события импорта. С точки зрения общественного здравоохранения, обнаружение того, что эти два штамма происходят из двух разных мест, - хорошая новость. Если бы они были в близком родстве, это означало бы, что WNV, вероятно, проходил через птиц и комаров в 10 милях от округа Коконино. Мы надеемся, что эти два отдельных введения только что ездили на велосипеде в очень локализованных географических местах, где они были обнаружены, а не через 10 миль, и что они просто исчезают ".
Кристалл Хепп, эволюционный биолог, НАУ
Лаборатория Хеппа является лидером в усилиях по лучшему пониманию того, как вирус Западного Нила циркулирует на юго-западе Америки. Ее партнеры по общественному здравоохранению ставят первоначальный диагноз, затем отправьте ей штаммы, чтобы определить, возник ли вирус. Знание и отображение этих данных может помочь правительствам лучше предсказать и подготовиться к возможности возникновения Западного Нила в их районах. Эти партнеры включают:
Это исследование включает студентов бакалавриата Дарин Эриксон, Бризи Брок, Сэмюэл Пойдмор, и величество Грир-Гипсон, специалист-исследователь Джилл Кокинг, аспирант Чейз Риденур Кристал Шеридан и Хейди О'Нил из ядра секвенирования PMI, а также Даррин Леммер, Майк Валентайн и Дэйв Энгельталер из Исследовательского института трансляционной геномики.
"Мы очень заинтересованы в понимании взаимосвязи между штаммами, циркулирующими на Юго-Западе, "Сказал Хепп." Это позволяет нам определить, Например, ситуация с WNV в округе Марикопа относится к другим юго-западным местам. WNV из округа Марикопа также распространился на округ Вашингтон, Юта; Округ Риверсайд, Калифорния; и округ Юма, Аризона в прошлом, и мы хотели бы продвинуться вперед с прогностической моделью, которая могла бы информировать округа о рисках на основе исторических закономерностей и данных об окружающей среде ».
С 2010 года в округе Коконино не было зарегистрировано ни одного случая заболевания людей из Западного Нила.
Западный Нил - самая распространенная в штате болезнь, переносимая комарами. хотя его масштабы трудно измерить, потому что только около 20 процентов инфицированных людей даже осознают, что они больны. Большинство из тех, кто испытывает симптомы, чувствуют себя больными гриппом, но примерно у одного из 150 инфицированных людей развивается серьезное заболевание, такое как энцефалит или менингит, что может быть фатальным.
В 2018 г. Хепп получил грант от Центра биомедицинских исследований Аризоны на исследование циркуляции и источников происхождения в Западном Ниле в штате.
Сильный микробиом в раннем возрасте связан с меньшим количеством респираторных инфекций
Исследование показывает противовирусные эффекты куркумина
Правильно ли указаны уровни микробов на этикетках коммерческих кефирных продуктов?
Исследование с участием близнецов показывает, что симптомы COVID-19 имеют генетический вклад
Микробиом влагалища может влиять на эффективность профилактической терапии ВИЧ.
Новый инструмент для расшифровки микробиома кишечника
Пробиотики могут иметь терапевтические преимущества для пациентов с биополярным расстройством.
Исследование системы здравоохранения Шеппарда Пратта в Балтиморе показало, что пробиотики могут служить потенциальным терапевтическим подходом к биполярному расстройству и другим психическим заболеван
Вперед, продолжать,
Ешьте камеру - капсульная эндоскопия Всякий раз, когда ловят большую белую акулу и думают, что она стоит за нападением, у рыбы разрезают живот. Из желудка обычно выходит всякая ерунда, включая кучу ц
Смесь на основе козьего молока полезна для здоровья кишечника младенцев
Исследователи из лаборатории RMIT проанализировали смесь козьего молока и изучили присутствующие в ней олигосахариды. Было обнаружено, что эти простые сахара и пребиотики, присутствующие в детской сме