Comenzó con muestras de todo el oeste de los Estados Unidos que llegaron al laboratorio del biólogo evolutivo Crystal Hepp. que trabaja tanto con la Facultad de Informática, Informática, and Cyber Systems (SICCS) y el Pathogen and Microbiome Institute (PMI) de la Northern Arizona University. Colabora con una docena de departamentos de salud pública diferentes en todo el oeste. Le envían muestras del West Nile (WNV) que se encuentran en sus áreas, y su equipo secuencia los genomas virales y analiza los datos para reconstruir el árbol genealógico de cada muestra, lo que le permite determinar cómo se está moviendo el virus a lo largo del tiempo y en toda la región.
En este caso, El Departamento de Salud del Condado de Coconino le envió las dos muestras, uno encontrado en mosquitos en Lake Mary y otro en el área de Cheshire, ambos a finales de agosto. Hepp secuenció los genomas de las cepas del virus, los comparó con las cepas de virus que había secuenciado de otras áreas, y encontró que las dos cepas de virus no eran el resultado de la circulación local del virus, lo que significa que no se transmitieron entre aves y mosquitos en el condado. La cepa de Cheshire está estrechamente relacionada con las cepas que circulan en el condado de Maricopa, mientras que la cepa Lake Mary está más estrechamente relacionada con una cepa que su equipo secuenció de Montana en 2018, aunque la cepa Lake Mary mostró varias mutaciones diferentes de la cepa Montana.
Esto fue inesperado Dijo Hepp. También es probable que sea algo bueno para el condado de Coconino.
A menudo pensamos que la respuesta más simple es la respuesta más probable. Habría tenido sentido si estas dos cepas, separados por solo 10 millas, se debieron al mismo evento de importación. Desde una perspectiva de salud pública, encontrar que estas dos cepas son de dos lugares diferentes es una buena noticia. Si estuvieran estrechamente relacionados, Significaría que el VNO probablemente se había desplazado a través de aves y mosquitos a lo largo de 10 millas del condado de Coconino. Esperamos que las dos presentaciones separadas hayan estado en bicicleta en las ubicaciones geográficas muy localizadas en las que se encontraron, en lugar de a lo largo de 10 millas, y que simplemente se desvanecen ".
Crystal Hepp, biólogo evolutivo, NAU
El laboratorio de Hepp es líder en el esfuerzo por comprender mejor cómo circula el virus del Nilo Occidental en el suroeste de Estados Unidos. Sus socios de salud pública hacen el diagnóstico inicial, luego envíe sus cepas para determinar si el virus se originó. Conocer y mapear esos datos puede ayudar a los gobiernos a predecir y prepararse mejor para la posibilidad del Nilo Occidental en sus áreas. Esos socios incluyen:
Esta investigación incluye estudiantes de pregrado Daryn Erickson, Brock ventoso, Samuel Poidmore, y Majestad Greer-Gipson, especialista en investigación Jill Cocking, estudiante de posgrado Chase Ridenour, Krystal Sheridan y Heidie O'Neill del núcleo de secuenciación de PMI, así como Darrin Lemmer, Mike Valentine y Dave Engelthaler del Instituto de Investigación de Genómica Traslacional.
"Estamos muy interesados en comprender la conectividad entre las cepas que circulan en el suroeste, ", Dijo Hepp." Esto nos permite determinar, por ejemplo, la situación del VNO en el condado de Maricopa es para otras ubicaciones del suroeste. El VNO del condado de Maricopa también se ha extendido al condado de Washington, Utah; Condado de Riverside, California; y el condado de Yuma, Arizona en el pasado y nos gustaría avanzar con un modelo predictivo que pudiera informar a los condados sobre el riesgo en base a patrones históricos y datos ambientales ".
No se han reportado casos humanos de West Nile en el condado de Coconino desde 2010.
West Nile es la enfermedad transmitida por mosquitos más común en el estado, aunque su alcance es difícil de medir porque solo alrededor del 20 por ciento de las personas infectadas se dan cuenta de que están enfermas. La mayoría de los que experimentan síntomas sienten que tienen gripe, pero aproximadamente una de cada 150 personas infectadas desarrolla una enfermedad grave como encefalitis o meningitis, que puede ser fatal.
En 2018, Hepp recibió una subvención del Centro de Investigación Biomédica de Arizona para investigar la circulación y las ubicaciones de origen del Nilo Occidental en el estado.
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