Le microbiome pourrait aider à identifier le risque de pré-cancer chez les femmes atteintes du VPH

Une nouvelle étude publiée dans la revue en libre accès Pathogènes PLOS en mars 2020 signale l'utilisation possible de la bactérie Gardnerella trouvé dans le col de l'utérus et le vagin des femmes infectées par le virus du papillome humain (VPH), comme marqueur de changement précancéreux. Les résultats pourraient aider à trouver de nouvelles méthodes de traitement qui impliquent d'induire des changements dans le microbiome pour arrêter l'évolution de la maladie.

Diagnostic microscopique de la vaginose bactérienne. Les sécrétions vaginales contiennent des cellules épithéliales, cellules dites indices recouvertes de bactéries Gardnerella vaginalis, illustration 3D. Crédit d'image:Kateryna Kon

Infection à papillomavirus humain

L'infection au VPH fait partie des infections sexuellement transmissibles les plus courantes et provoque le cancer du col de l'utérus dans une faible proportion des cas. Cependant, on ne sait pas pourquoi seul un petit pourcentage des cas évoluent vers le cancer. La présente étude était motivée par le besoin de comprendre comment le microbiome cervico-vaginal affecte la progression de l'infection au VPH vers un état précancéreux.

Le microbiome cervico-vaginal

Certains des facteurs associés à la variation de l'issue des infections à HPV à haut risque comprennent le tabagisme, l'utilisation de contraceptifs oraux, et la parité. Cependant, la réponse immunitaire est également essentielle, ainsi que les gènes immunitaires liés à la réponse immunitaire, comme le système d'antigène leucocytaire humain (HLA).

En outre, l'environnement chimique et microbien du col de l'utérus et du vagin peut également affecter la progression de l'infection au VPH. En général, le col de l'utérus et le vagin sont caractérisés par une abondance de lactobacilles de certaines espèces ( Lactobacillus crispatus , Lactobacillus iners , Lactobacillus gasseri ou Lactobacillus jensenii ), ou de plusieurs microbes. Le premier est associé à de bons résultats pour la santé, risque plus faible d'infections sexuellement transmissibles, et les naissances prématurées.

De nombreuses études ont montré qu'une flore microbienne plus diversifiée est associée à une augmentation des anomalies du col de l'utérus ainsi qu'à une prévalence plus élevée d'infections à HPV à haut risque.

Modèle d'interactions HPV et microbiome. Crédit d'image:PLOS Pathogens

L'étude

La présente étude a une conception longitudinale, avec des échantillons de microbiome cervico-vaginal d'une cohorte prospective suivis pour détecter tout lien entre le microbiome et la progression de la lésion HPV vers des conditions précancéreuses du col de l'utérus.

Les chercheurs ont examiné 273 femmes âgées de 18 à 25 ans atteintes d'une infection au VPH à haut risque qui participaient à l'essai du vaccin contre le VPH au Costa Rica. Les échantillons cervicaux ont été testés pour obtenir une image du microbiome et de la façon dont il affecte la progression vers le précancer, persistance virale, et la clairance virale.

Les résultats

les chercheurs ont trouvé quatre types différents de communautés bactériennes, un chacun dominé par l'espèce bactérienne Lactobacillus iners dans 27%, L. crispatus dans 15% des échantillons, et Gardnerella vaginalis dans 17%. Dans environ 41 % des cas, le microbiome était extrêmement diversifié.

L'étude a montré que les infections à HPV à haut risque étaient éliminées plus rapidement et plus complètement lorsqu'il y avait une abondance de Iners de lactobacilles . D'autre part, la progression du VPH à haut risque est marquée par la prédominance de Gardnerella vaginalis bactéries. Apparemment, Gardnerella provoque une infection persistante au VPH jusqu'au précancer en induisant une diversité accrue du spectre bactérien cervico-vaginal. Cela pourrait être en induisant une immunosuppression locale, ou encore un microenvironnement avec un profil bactérien distinct. Ceci est soutenu par des études plus anciennes montrant des différences dans le microenvironnement immunitaire entre les lésions précancéreuses qui progressent et celles qui disparaissent complètement.

D'autres espèces associées à la progression sont celles qui sont isolées à partir d'échantillons prélevés sur des femmes atteintes de vaginose bactérienne, tel que Prévotella amnii et Anaerococcus prevotii . Environ 3,8 % des espèces fongiques étaient également associées à une progression vers un précancer.

Implications

Ces résultats suggèrent que la présence de Gardnerella, ainsi que la diversité résultante des espèces bactériennes cervico-vaginales, peuvent être utilisés comme biomarqueurs pour détecter celles parmi les femmes infectées par des souches de VPH à haut risque qui peuvent évoluer vers des états précancéreux. Selon l'étude, « Les chercheurs démontrent de manière prospective que la progression d'une infection persistante à HPV à haut risque vers un précancer du col de l'utérus s'explique en partie par des caractéristiques uniques du microbiote cervico-vaginal. »

Le journal poursuit en expliquant, « Nous avons identifié des biomarqueurs microbiens distincts qui protègent ou favorisent la progression d'une infection HR-HPV vers des lésions CIN2+. Ces facteurs [pourraient] agir pour supprimer (en cas de progression) ou activer (en cas de clairance) une réponse immunitaire localisée, qui à son tour influence l'histoire naturelle de l'infection HR-HPV.

De plus, si de futures études montrent que le microbiome du col de l'utérus et du vagin joue un rôle causal dans la progression de l'infection persistante à HPV vers le précancer, elle peut conduire à l'induction thérapeutique d'altérations du microbiome cervico-vaginal de manière à produire une immunité locale et à empêcher la maladie de progresser.

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