PLoS ONE: Vidiniai navikinės heterogeniškumas HER2, FGFR2, cMet ir ATM skrandžio vėžiu: Optimizavimas Asmeninės Healthcare per Inovatyvios Patologinės ir statistinė analizė

Anotacija

Dabartinės vaistų kūrimo pastangos skrandžio vėžiu yra nukreipti prieš keletą molekulinius taikinius vairavimo Naviko augimo. Tačiau viduje navikinės biologinis heterogeniškumas, dažniausiai pastebėtas skrandžio vėžio, gali sukelti tendencingai atrinktais pacientais. RER, Bankomatas, FGFR2 ir HER2 buvo profiliuoti skrandžio vėžio biopsijos mėginių. Naujoviškas patologinis vertinimas buvo atliktas per balais atskirų biopsijos prieš visą biopsijų iš vieno paciento, kad heterogeniškumo įvertinimas. Po to buvo apskaičiuotas klaidingai neigiamų rizika kiekvieno biologinis žymuo silico
. 166 skrandžio vėžio atvejų su keliais biopsijų iš pavienių pacientų buvo renkami iš Šanchajaus Renji ligoninėje. Po iš anksto nustatytus kriterijus, 56 ~ 78% atvejų parodė, mažas, 15 ~ 35% parodė vidutinio ir 0 ~ 11% parodė aukštą heterogeniškumas per nustatytą biologinių žymenų profiliuotų. Jei 3 biopsijos buvo paimti iš vieno paciento, klaidingas neigiamas rizikos aptikti iš biologinių žymenų buvo beveik 5% (išimtis FGFR2: 12.2%). Kai 6 biopsijos buvo surinkti, klaidingas neigiamas rizikos kreipėsi 0%. Mūsų tyrimas rodo, daugialypės biopsijos mėginių ėmimo naudos svarstant asmeninį sveikatos biologinio žymiklio strategiją ir teikia pavyzdį spręsti viduje auglio žymenų heterogeniškumo iššūkis naudojant alternatyvų patologinę vertinimą ir statistinius metodus

nurodomoji dalis:. Jūs P Zhang M, ventiliatorius S, Zhang, T, Fu yra H, S X, ir kt. (2015) Vidiniai navikinės heterogeniškumas HER2, FGFR2, cMet ir ATM skrandžio vėžiu: Optimizavimas Asmeninės Healthcare per Inovatyvios Patologinės ir statistinė analizė. PLoS ONE 10 (11): e0143207. Doi: 10,1371 /journal.pone.0143207

redaktorius: Daniele Generali Instituti Ospitalieri di Cremona, Italija

Įstojo: Liepos 30, 2015; Priėmė: Lapkričio 2, 2015 m Paskelbta lapkričio 20 d, 2015

Visos teisės saugomos: © 2015 Jūs et al., Tai atviros prieigos straipsnis platinama pagal Creative Commons Attribution licencija, kuri leidžia nevaržomai naudotis, paskirstymo ir dauginimąsi bet kokioje laikmenoje sąlygomis, su sąlyga, kad pirmasis autorius ir šaltinis įskaitomos

Duomenų Prieinamumas: Visi susiję duomenys yra per popieriaus

finansavimas:. AstraZeneca "rėmė šį tyrimą. Finansuotojas, jeigu paramą atlyginimų forma autoriams [py, MZ, SF, TZ, HF, XS, PG ir xy] ir numatyta galimybe ir išteklių užbaigti šį tyrimą. Konkretūs vaidmenys šių autorių yra aiškiai nurodyta skyriuje "Autorius įmokos"

konkuruojančių interesų. Autoriai priklausančios AstraZeneca yra dieninio darbuotojai ir /arba dalininkai AstraZeneca. Šis tyrimas parėmė AstraZeneca. Tai nekeičia autorių laikymąsi PLoS ONE politiką dalijimosi duomenimis ir medžiagų. Autoriai deklaruoja, kad jie neturi jokių kitų konkuruojančių interesų.

Įvadas

Skrandžio vėžys (GC) yra vienas iš labiausiai paplitusių vėžio formų pasaulyje, su maždaug pusę visų atvejų, įvykusių Rytų Azijoje (daugiausia Kinija), ir yra trečioji pagrindinė priežastis, dėl vėžio susijusių mirties visame pasaulyje [1]. Nors sergamumas mažėja, dauguma GC atvejai diagnozuojama vėlyvos stadijos ir prognozė ligos išlieka prasta [2]. Išgyvenamumo mediana metastazavusio GC yra trumpesnis nei vieneri metai, o bendras 5 metų išgyvenamumas yra mažesnis nei 7% [3].

Vidiniai navikinės heterogeniškumas yra dažniausiai stebimas GC. 1980-aisiais, DE Aretxabala ir kt
įvertino 222 mėginius iš 37 GC atvejais ir rado diploidinių ir aneuploidija pavyzdžius ar skirtingų aneuploidija stemlines toje pačioje byloje (taip vadinamas DNR turinio heterogeniškumas) mišinys 33% pirminės navikai [4]. Panašus tyrimas Yonemura ir kt pervežimas parodė 69% DNR turinio heterogeniškumas 65 rezekcijos GC mėginių [5]. Neseniai Yang , et al
įvertino GC mėginiai iš 148 pacientų ir nustatė heterogeniškumas norma 79,3% į žmogiškąjį epitelio augimo faktoriaus receptoriaus 2 (HER2) baltymų raiška ir 44% HER2
geno amplifikacijos [6]. Taigi, didelis viduje navikinės heterogeniškumas pastebėtas GC gali prisidėti prie pasipriešinimo gydymo ir prastesn pacientų prognozei [7, 8], ir, galiausiai, nemažas neliesti problema, su kuria susiduria gydytojai, patologai, ir mokslininkai.

keli molekuliniai taikiniai metu funkcija arba patvirtintų vaistams ar perspektyviausių terapijos, dalyvaujantiems klinikiniuose plėtrą GC. HER2 vaidina svarbų vaidmenį krūties vėžio, kiaušidžių vėžio ir skrandžio vėžio [9] ir trastuzumabo, monokloninio antikūno prieš HER2 tumorigenezei, buvo patvirtinta, kad GC [10] gydymui. Mezenchiminių-epitelio perėjimas faktorius (RER) genas koduoja baltymą, kuris yra vienintelis žinomas receptorius hepatocitų augimo faktoriaus (HGF) ligando [11]. MET
geno amplifikacija ir baltymų raiška buvo įrodyta, kad sukelti nuolat aktyvavimo RER signalinio kelio, kuris prisideda prie naviko augimas, angiogenezę ir metastazių [12]. Keli MET inhibitoriai šiuo metu vyksta GC klinikiniai tyrimai, įskaitant Savolitinib (1 etapas (NCT02252913) [13]) ir AMG337 (2 fazė (NCT02016534)). Be to, fibroblastų augimo faktoriaus receptoriaus 2 (FGFR2) taip pat susijęs ląstelių proliferacijos, diferenciacijos ir judrumas, ir papildytas FGFR2
genas vaidina svarbų vaidmenį GC Tumorigenesis, taip pabrėždamas savo potraukį kaip vaistų kūrimo tikslinė [14-16]. Ataksija telangiectasia mutavo (OEV) yra baltymų kinazės priklausanti fosfatidil 3 "kinazės (PI3K) šeimos, ir normaliomis sąlygomis yra aktyvuota reaguojant į DNR dvigubos krypties pertraukas [17]. Bankomatų trūkumas yra susijęs su aukšto dažnio audinių piktybinių navikų [18-20] ir ATM trūkumas navikų ląstelės yra jautrios poli (ADP ribozės) polimerazės-1 (PARP) slopinimo, potencialiu taikiniu, kurios buvo pasiūlyta gydymo GC keliuose ankstesniuose tyrimuose [21-24]. Lynparza, pirmasis JAV ir Europos patvirtintų PARP inhibitorius orientacija BRCA1 /2 mutantas kiaušidžių vėžiu, šiuo metu vyksta III fazės klinikinį tyrimą, GC (NCT01924533) ir dirba paciento pasirinkimas biologinio žymiklio požiūrį naudotis bankomatais išraišką IHC (paskelbimo spaudoje) .

dabartinę epochą molekules tikslingai vaistų kūrimo, biologiniai žymenys tikimasi tiksliai prognozuoti klinikinį atsaką [25]. Aukštos navikas heterogeniškumas, tačiau gali sukelti biologinis aptikimo paklaidos, jei mėginiai gaunami iš mažo naviko regione, o ne visai naviko audinyje (pvz chirurginiu rezekcijos mėginiai paprastai tik 2 cm x 2cm). Priešingai, biopsijos mėginiai paprastai gaunamos iš skirtingų regionų visą naviką ir greičiausiai bus daugiau atstovas pacientų bendras biologinis ekspresijos būklė, teigdamas, jų potencialą sumažinti vidaus auglio heterogeniškumo dėl pacientų atrankos šališkumo poveikį.

mūsų tyrimo, siekiant geriau įvertinti vidaus navikinės heterogeniškumas, mes dirbantys chirurginio biopsiją, kaip mūsų navikas mėginių ėmimo strategiją. Be to, mes atliko novatorišką patologinę vertinimą per balais atskirų biopsijos prieš visą biopsijų iš pavienių pacientų. Čia mes taip pat dirba statistinius metodus įvertinti klaidingus neigiamus aptikimo riziką, analizuojant baigtinių skaičių biopsijų, siekiant suprasti tarp biopsijos skaičiaus ir pasirinkdami klaidingą teigiamą pacientą dėl konkrečios gydymo ar įtraukimo į klinikinį tyrimą rizikos santykį .

medžiagos ir metodai

paciento informavimo

Archyvas GC biopsijos mėginiai buvo imami iš 166 pacientų, kuriems buvo gastroskopija egzaminą su keliais biopsijų iš įvairių vėžinių srityse kiekvienam pacientui tarp 2007 ir 2014 metu Renji ligoninėje, Šanchajus, Kinija. Išankstinis raštiškas sutikimas buvo gautas iš visų pacientų, o tyrimas protokolas buvo patvirtintas Renji ligoninės Institucinis ekspertizės valdyba. Visi mėginiai

imunohistocheminis (IHC)

Formalin fiksuoto ir parafino įterptųjų (FFPE) bandiniai buvo peržiūrėtas du apmokyti patologai GC diagnozę ir keturiasdešimt mėginių buvo atmesti tyrimo dėl prastos audinių kokybę. buvo suskirstyta ne 4μm storio. RER dažymo, triušis monokloninis anti-viso RER antikūnas (cMet SP44, Ventana Medical Systems, Arizonos valstija, JAV) buvo naudojamas ir tyrimas buvo atliktas automatinis STAINER ( "Discovery XT, Ventana Medical Systems, Arizonos valstija, JAV). Bankomatų dažymo atlikta naudojant triušio monokloninis anti-bankomatų antikūnas (ab32420, Abcam, MA, JAV) ant autostainer (Thermo Scientific, MA, JAV). HER2 dažymo atlikta naudojant HercepTest komplektas (DaKo, Danija) pagal gamintojo nurodymus ant automatinio STAINER ( "Discovery XT Ventana Medical Systems, Arizonos valstija, JAV).

chromosomų dažymas (žuvis)

dvejopo spalva ŽUVYS tyrimas buvo atliktas kaip aprašyta anksčiau [26]. HER2 /CEP17
zondai buvo įsigytas iš Vysis (IL, JAV; kat.-171060). MET parsisiųsti ir FGFR2
zondai buvo parengta ženklinimo BAC (BTD-2270N20 ir RP11-62L18, atitinkamai) DNR su raudonų dUTP (Enzo Biochem, NY, JAV; kat.N;23- 050), CEP10
-Spectrum Žalia ir CEP7
-Spectrum Green zondai buvo įsigytos iš Vysis (Kat. -112.010 ir -132007, atitinkamai) ir naudojami kaip vidaus kontrolės procedūrų FGFR2 parsisiųsti ir , susitiko
zondai

patologija vertinimas biopsijų

remiantis H &. El dažymo, kiekvienas biopsija su tinkamų vėžinių ląstelių (daugiau nei 50 naviko ląstelės) visų pirma buvo pažymėta patologas. Tada biologinis statusas įskaitant IHC ir žuvų dažymo RER, Bankomatas, FGFR2 ir HER2 buvo vertinami kiekvieno biopsija. Individualūs balai už kiekvieną biologinis žymuo buvo suteikta kiekvienam biopsija (1 pav)

Pasak MetMab teisiamas GC (NCT01662869), RER IHC dažymo, biopsija rodo IHC 3+ yra apibrėžiamas kaip teigiamas.; RER žuvis, biopsija rodo MET
genas vidutiniškai kopija skaičius ≥ 5 apibrėžiamas kaip teigiamas. Nuo vykstančio teismo kitam RER inhibitoriumi AZD6094 (NCT02449551), naudojimas, MET
genas vidutiniškai kopija skaičius ≥ 4, kaip išjungti vienam agentas gydymo ranką ant GC pacientams, mes toliau skirstomi RER FISH neigiamą grupę į dvi dalis pogrupiai ( MET
genas vidutiniškai kopija skaičius ≥ 4 ir < 5 ir MET
genas vidutiniškai kopija skaičius < 4). ATM IHC dažymo, biopsija rodo IHC 0 apibrėžiama kaip neigiamas pagal Olaparib teismą (NCT01063517). Dėl FGFR2 žuvis, biopsija rodo, FGFR2
geno amplifikacija (vidutinis kopija skaičius ≥ 6) yra apibrėžiamas kaip teigiamas atsižvelgiant į tyrimų AZD4547 (NCT01457846) ir dovitinib (NCT01719549). Dėl HER2, biopsija rodo HER2 IHC 3+ ar HER2 IHC 2+ plius, HER2
genų amplifikacija yra apibrėžiamas kaip teigiama pagal TOGA teismą (NCT01041404).

MET IHC, susitiko žuvis, FGFR2 Žuvis ir HER2, atvejai, nors iš biopsijos rodančių teigiamą
yra apibrėžiamas kaip teigiamų atvejų. ATM IHC dažymo, bylos su visais biopsijų, rodančių neigiamą yra apibrėžiama kaip neigiamas atvejais

įvairiapusiškumo laipsnį vertinimas

Po patologas peržiūros, iš žymenų heterogeniškumo laipsnis buvo nustatomas pagal šiuos kriterijus:.

Aukšto heterogeniškumas: < 25% biopsijos su RER IHC 3+ MET
geno amplifikacija, bankomatas IHC 0 FGFR2
geno amplifikacija, ar navikas HER2 teigiamas

Vidutinio heterogeniškumas. 25% ~ 50% biopsijos su RER IHC 3+ MET
geno amplifikacija, bankomatas IHC 0 FGFR2
geno amplifikacija, ar navikas HER2 teigiamas

Mažų heterogeniškumas. ≥50% biopsijos su RER IHC 3+ MET
geno amplifikacija, bankomatas IHC 0 FGFR2
geno amplifikacija, ar navikas HER2 teigiamas.

MET IHC, RER žuvis, FGFR2 ŽUVYS ir ar navikas HER2 teigiamas, buvo apskaičiuoti vidutiniai procentai teigiamų biopsijų konkrečiu atveju tarp teigiamų atvejų. Dėl buvo apskaičiuojamas bankomatų IHC, vidutinis procentas bankomatų IHC neigiamų biopsijų konkrečiu atveju tarp atvejais, kai bent vienas ATM neigiamas biopsija. 95% pasikliovimo intervalai virš vidutinės vertės buvo vertinamos saviranka.

klaidingų neigiamų aptikimo rizikos vertinimas

kiekvienas biologinis ir iš anksto numeris biopsijų N
(0 < N < maksimalus skaičius biopsijų iš mėginio), visi galimi scenarijai renkantis N
biopsijos iš kiekvieno mėginio ir padaryti iš žymenų statuso nustatymu mėginio remiantis N
pasirinkta biopsijos buvo sukurtas skaičiavimais.

remiantis scenarijus aukščiau išvardintų, buvo įvertintas klaidingai neigiamų aptikimo rizika. RER IHC, susitiko žuvis, FGFR2 žuvis, ir ar navikas HER2 teigiamas, klaidingai neigiamų aptikti su N
biopsijų iš kiekvieno mėginio rizika buvo apibrėžiama kaip laukiamo skaičiaus tarp teigiamų mėginių, kurie yra neigiamas, santykio aptikimo rezultatai su N
biopsijos ir viso teigiamų mėginių. ATM IHC, klaidingai neigiamų aptikimo rizika su N
biopsijos iš kiekvieno mėginio buvo apibrėžiama kaip laukiamo vertės tarp ne neigiamų mėginių skaičius su visais neigiamais biopsijos su N
santykis biopsijos iš kiekvieno mėginio, ir viso OEV ne neigiamų mėginių.

Visi skaičiavimai buvo tikslūs, išskyrus ATM IHC su vienu biopsijos iš kiekvieno mėginio, nes labai daug galimų scenarijų. ATM IHC su vienu biopsijos iš kiekvieno mėginio, klaidingai neigiamų aptikimo rizika buvo apskaičiuota atsižvelgiant atsitiktinis pogrupį 30 ne neigiamų mėginių be pakeitimo metu, kompiuterija klaidingų neigiamų aptikimo rizika, kad pogrupyje, kartoja procesą 22000 kartų ir imant klaidingų neigiamų aptikimo riziką vidutiniškai iš 22000 atsitiktinių pogrupiuose. Be to, buvo pranešta 95% pasikliautinasis intervalas šio apskaičiuoto rizikos.

Rezultatai

Apžvalga GC biopsijos skaičių klinikiniuose mėginiuose

Šiame kohortos, kad biopsijos skaičių mėginiai iš vienam pacientui svyravo nuo 1 iki 9, su tiek bendra tiek ir teigiamų biopsijos (su naviko ląstelių) mediana ne 4. teigiami biopsijos numeriai buvo šiek tiek mažesnė nei visas biopsijos numerius. Atvejai su 3 ~ 4 ir 5 ~ 6 teigiami biopsijų sudarė 47% ir 25% atitinkamai visų surinktų mėginių (2 pav).

heterogeniškumas laipsnis ir klaidingai neigiamų vertinimas

18 RER IHC teigiami atvejai (pav 3A), 61% atvejų parodė mažą įvairiapusiškumą, o 33% pacientų vidutinės trukmės ir 5,5% pacientų aukštą įvairiapusiškumą. Vidutinis procentas RER teigiamų biopsijų konkrečiu atveju tarp tų 18 teigiamų atvejų buvo 65,78% (95% PI: 52,14% -79,60%). RER klaidingai neigiamų aptikimo lygis buvo apytikriai 3,39% 4 biopsijos ir kreipėsi 0% imant 6 biopsijos (pav 4a).

13 RER ŽUVŲ teigiamų atvejų (pav 3b), 77% iš atvejai parodė, žemos heterogeniškumą, o 15% parodė, vidutinės ir 8% parodė aukštą įvairiapusiškumą. Vidutinis procentas RER ŽUVŲ teigiamų biopsijų konkrečiu atveju tarp tų 13 teigiamų atvejų buvo 74,05% (95% PI: 57,53% -89,10%). RER ŽUVYS klaidingai neigiamų aptikimo lygis buvo apytikriai 3,30% 4 biopsijos ir kreipėsi 0% imant 7 biopsijos (pav 4b). Be to, reikšminga koreliacija buvo nustatyta tarp RER IHC rezultatą ir susitiko ŽUVŲ rezultatus (p < 0,01, κ = 0,62, Fišerio tikslusis testas) pervežimas

58 atvejais, kurių bent vienas ATM neigiamas biopsija (pav 3C) , 62% atvejų parodė, žemos heterogeniškumą, o 35% parodė, vidutinės ir 3,6% parodė aukštą įvairiapusiškumą. Vidutinė procentinė dalis bankomatų IHC neigiamų biopsijų konkrečiu atveju tarp tų 58 atvejų buvo 63,07% (95% PI: 54,93% -71,39%). ATM IHC klaidingai neigiamų aptikimo lygis siekė maždaug 0,19% 4 biopsijos, ir kreipėsi 0% su 5 biopsijų (pav 4c).

9 FGFR2 ŽUVŲ teigiamų atvejų, 56% atvejų parodė, mažas heterogeniškumas, o 33% parodė, vidutinės ir 11% parodė aukštą heterogeniškumą (pav 3D). Vidutinis procentas FGFR2 ŽUVŲ teigiamų biopsijų konkrečiu atveju tarp tų 9 teigiamų atvejų buvo 56,30% (95% PI: 36,85% -76,85%). FGFR2 ŽUVYS klaidingai neigiamų aptikimo lygis buvo apytikriai 3,70% 4 biopsijos ir kreipėsi 0% 6 biopsijos (pav 4d).

32 HER2 teigiamą atvejais, 78% atvejų parodė mažą heterogeniškumas, o 22% parodė, vidutiniškai heterogeniškumą ir nė vienas iš atvejais parodė aukštą heterogeniškumą (pav 3E). Vidutinis procentinis HER2 teigiamą biopsijų konkrečiu atveju tarp tų 32 teigiamų atvejų buvo 75,16% (95% PI: 65,88% -85,11%). HER2 klaidingai neigiamų aptikimo lygis buvo apytikriai 0,21% 4 biopsijos ir kreipėsi 0% su 5 biopsijų (pav 4e).

Diskusijos

Vidiniai navikinės biologinis heterogeniškumas jau seniai klausimas pacientų klinikinių tyrimų, ir todėl atranką, suprasti naviko nevienalytiškumas itin svarbus siekiant sėkmingai diegti asmeninį sveikatos žymenų (PHB) strategiją. Tačiau keli tyrimai iki šiol spręsti šią problemą ir nėra standartizuotas strategija matavimo naviko heterogeniškumo laipsnį. Šiame tyrime mes priėmėme naujas požiūris balais kiekvieną atskirą biopsiją ir skaičiuojant heterogeniškumo lygį per kiekvienu atveju. Mūsų rezultatai parodė, kad didelis nevienalytiškumas buvo rasta tik 0 ~ 11% teigiamas (arba neigiamas ATM) atvejų, tuo tarpu dauguma teigiamų atvejų (56% ~ 78%) parodė mažą heterogeniškumas, nurodant lygis yra santykinai žemas heterogeniškumo už Mūsų atrinkti biologiniai žymenys šioje GC atvejais kohortos.

Be to, mes taip pat atliko klaidingus neigiamus vertinimus kiekvienai biologinis žymuo galėtų įvertinti klaidingus neigiamus normas, susijusias su išieškojimu įvairių skaičių biopsijos. Rezultatai parodė, kad kai 3 ar daugiau biopsijos buvo surinkti, ir klaidingai neigiamų rizika buvo beveik 5% visų tirtų biologinių žymenų (7.14%, 5.16%, 0,86% ir 1,41% atitinkamai RER IHC, susitiko žuvis, ATM IHC ir HER2 ). Šis skaičius (3-4 biopsijos) yra maždaug lygus vidutiniam surinktų klinikinėje praktikoje šios kohortos biopsijos ir kaip toks, rodo santykinai mažą klaidingą neigiamą riziką, susijusią su šių biologinių žymenų mūsų kohortos. Viena išimtis, kad FGFR2 ŽUVYS parodė didesnę klaidingą neigiamą palūkanų norma (12,2% klaidingai neigiamų norma 3 biopsijos), gali būti dėl to, kad ribota FGFR2 teigiamas Imties dydis (9 teigiami mėginiai). Kai 6 biopsijos iš viso buvo surinkta iš vieno paciento, klaidingas neigiamas rizikos RER, Bankomatas, FGFR2 ir HER2 kreipėsi 0% šio kohortos. Šie rezultatai pateikti kaip padidinti biopsijos numerius gali būti naudojamas atkreipti dėmesį į žymenų heterogeniškumo iššūkį diegti klinikinių pacientų atrankos metodus pavyzdys.

Atsižvelgiant į tiksliai pacientų atrankos klinikinių tyrimų svarbą, mes tvirtai tikime, kad tinkamai spręsti biologinis heterogeniškumas yra lemiamas sėkmės veiksnys. Pavyzdžiui, MetMab parodė reikšmingą pagerėjimą tiek be ligos progresavimo (2,9 vs 1,5 mėn) ir bendrasis išgyvenamumas (12,6 vs 3,8 mėnesių) [27] 2 fazės tyrimo (NCT01590719), tačiau šis pagerėjimas nebuvo sėkmingai perduoti į 3 fazės nustatymo (NCT01662869). Pažymėtina, kad RER baltymų raišką (IHC) buvo pasirinktas kaip pacientas atrankos kriterijus [28]. Nors vis dar diskusijų klausimas, tai yra įmanoma, kad MetMab pažadas 2 etape, tačiau jo gedimas 3 etape buvo bent iš dalies yra naviko heterogeniškumo pasekmė, ir paciento atrankos strategijos nesugebėjimas (IHC) ryžtingai spręsti iššūkis viduje auglio heterogeniškumo GC.

Galiausiai, mes taip pat palygino pozityvumo normos (ar negatyvumo rodiklį ATM) aptiktų šioje biopsijos mėginių kohortos su chirurginių pavyzdžių iš mūsų ankstesnių tyrimų biologinių žymenų ( 1 lentelė). Su ATM, išskyrus tiek biopsija ir chirurginiai mėginiai buvo imami iš tos pačios vietos ligoninę. Rezultatai parodė, kad nors pozityvumo tarifai yra didesni (ATM, negatyvumo lygis yra mažesnis) biopsija pavyzdžių, bendri rezultatai biopsijos mėginių buvo panašus į chirurginės pavyzdžius. Tai teigiamos normos (ar sumažėjimo negatyvumo norma ATM) padidėjimas greičiausiai paaiškinamas teigiamų atvejų aptikimo naudojant kelis biopsijos, kurios buvo praleistus naudojant ankstesnius atrankos strategijas (ty chirurginės rezekcijų.).

Kartu tai tyrimas skirtas naviko heterogeniškumo iššūkį iš novatoriškos kampu naudojant biopsijos kaip naviko atrankos metodą ir teikiant individualius biologinis balus kiekvienai biopsija. Mūsų rezultatai rodo gana žemą lygį heterogeniškumo visoje analizuotų šios kohortos biologinius žymenis. Nepaisant to, heterogeniškumo laipsnis per kitų pacientų kohortos gali skirtis ir turėtų būti nagrinėjamas kiekvienu atveju atskirai, atveju. Be to, mūsų rezultatai parodė neteisingų neigiamų aptikti atitinkamą su in biopsijos skaičiaus visų tirtų čia biologinių žymenų padidėjimo norma sumažėjo, rodo daugialypės biopsijos mėginių ėmimo naudos ir tarnauja kaip spręsti vidaus navikinės heterogeniškumas naudojant statistinius metodus, pavyzdžiui.

Padėka

Mes dėkojame AstraZeneca už rėmimas šį tyrimą.

• PLoS ONE: Aukštas įvairovė Vaca CagA Helicobacter pylori genotipų Pacientai su ir be Skrandžio Cancer
• PLoS ONE: In vitro apibūdinimas Rapid citotoksiškumo priešvėžinis Polipeptidas HPRP-A2 per membraninį naikinimo ir Intraląstelinė mechanizmo prieš Skrandžio vėžio ląstelių Lines