Stomach Health > gyomor egészség >  > Gastric Cancer > gyomorrák

PLoS One: Az interakciós hatás a pri-let-7a-1 rs10739971 a PGC és ERCC6 génpolimorfizmusok gyomorrákban és sorvadásos gyomorhurut

absztrakt katalógusa

Háttér katalógusa

A cél az volt, hogy vizsgálja meg az interakció hatását pri-let-7a-1 rs10739971 a pepszinogén C katalógusa ( PGC katalógusa) és a kimetszés javítás kereszt kiegészítve csoport 6 katalógusa ( ERCC6 katalógusa) gén polimorfizmus és kapcsolata a kockázatát gyomorrák és sorvadásos gyomorhurut. Azt reméltük, hogy azonosítsa a miRNS polimorfizmus vagy kombinációja több polimorfizmus szolgálhat biomarkerek előrejelzésére kockázatát gyomorrák és rákmegelőző betegségek. Katalógusa

Módszerek

Sequenom MassARRAY platform módszerrel kimutatására polimorfizmusok pri-let-7a-1 rs10739971 G → a, PGC katalógusa rs4711690 C → G, PGC katalógusa rs6458238 G → a, PGC katalógusa rs9471643 G → C, és ERCC6 katalógusa rs1917799 471 gyomorrákos betegek, 645 sorvadásos gyomorhurut betegek és 717 kontroll. katalógusa

Eredmények katalógusa

az interakció hatása pri-let-7a-1 rs10739971 polimorfizmus ERCC6
rs1917799 polimorfizmus volt megfigyelhető a kockázatát gyomorrák ( P katalógusa kölcsönhatás = 0,026); hatását és kölcsönhatását pri-let-7a-1 rs10739971 polimorfizmus PGC katalógusa rs6458238 polimorfizmus ( P katalógusa kölcsönhatás = 0,012) és a PGC katalógusa rs9471643 polimorfizmus ( P katalógusa kölcsönhatás = 0,039) volt megfigyelhető a kockázata sorvadásos gyomorhurut. katalógusa

Következtetés

a kombináció pri-let-7a-1 rs10739971 polimorfizmus és ERCC6 katalógusa és PGC katalógusa polimorfizmusok nyújthatna nagyobb becslés lehetséges, mint egy polimorfizmus saját. Nagyszabású tanulmányok és molekuláris mechanizmusát kutatásra van szükség, hogy erősítse meg a vizsgálat eredményeit. Katalógusa

Citation: Xu Q, Liu J-w, Ő C-y, V L-p, Gong Y h, Jing J-j, et al. (2014) az interakció hatásai pri-let-7a-1 rs10739971 a PGC katalógusa és ERCC6 katalógusa gén polimorfizmus gyomorrákban és sorvadásos gyomorhurut. PLoS ONE 9 (2): e89203. doi: 10,1371 /journal.pone.0089203 katalógusa

Szerkesztő: Xiaoping Miao, MOE legfontosabb Laboratórium Környezetvédelmi és Egészségügyi, School of Public Health, Tongji Medical College, Huazhong Egyetem Természettudományi és Technológiai, Kína katalógusa

Fogadott: november 20, 2013; Elfogadva: január 16, 2014; Megjelent: február 25, 2014 katalógusa

Copyright: © 2014 Xu et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Forrás: Ez a munka ben támogatták a Nemzeti Key Basic Research Program of China (973 Program ref sz. 2010CB529304), a Nemzeti Természettudományi Alapítvány Kína (Ref szám 31200968), valamint a Science Technology Project Liaoning tartomány (Ref szám 2011225002) . A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa

Bevezető

Magánszemélyek hasonló életvitel és nappali hasonló környezetben rendelkeznek a különböző kockázatokat a rák. Azonosítása és előrejelzése egyének nagy a kockázata a rák kialakulásának jelezheti, hogy szükség van a változó szokásokhoz. Egypontos nukleotid polimorfizmusok (SNP) döntő szerepet játszanak előrejelzésében egyének fokozott rák kockázatát. Az utóbbi években a polimorfizmusok pri-miRNS leírták, hogy biomarkerek előrejelzésére rák kockázata, mint a pri-miR-34b /c rs4938723 polimorfizmus [1], pri-miR-218 rs11134527 polimorfizmus [2] és pri-miR-938 rs2505901 polimorfizmus [3]. A vizsgálatok azt találták, hogy a számos egyetlen gén polimorfizmusok járt a kockázatát gyomorrák [4]. Azonban, a gyomorrák egy komplex többlépéses betegség sok szerepet játszó gének, és egyetlen SNP-k korlátozott képessége, hogy megjósolni gyomorrák kockázatát [5] - [7]. Számos tanulmány arról számolt be, hogy a gén-gén kölcsönhatások sokkal fontosabb, mint a fő hatása egyetlen gén komplex betegségek, mint például rák [7] - [9]. Az alapkutatás megközelítés gén-gén kölcsönhatások, hogy vizsgálja meg a két vagy több polimorfizmus kisebb vagy semmilyen hatást az előző egyetlen SNP vizsgálatok [10], [11]. Azonban a legtöbb korábbi tanulmány középpontjában a prediktív szerepét egy gén SNP és figyelmen kívül hagyta a potenciális alkalmazási gén-gén kölcsönhatások. Katalógusa

Jelenleg nyomozók középpontjában a gén SNP-SNP kölcsönhatásokat, amelyek okozhatnak protein- fehérje kölcsönhatások, és kevés tanulmány vizsgálta közötti kölcsönhatások miRNS polimorfizmusok és gén polimorfizmusok, ami okozhat fehérje-RNS interakció. miRNS leírták, hogy részt vegyen a multi-gén hálózat gyomor carcinogenesis [12]. Ugyanezt miRNS jelentették, hogy szabályozza több célpont fehérjék, és ugyanazt a fehérjék lehetne által modulált többszörös miRNS [13]. Ennek eredményeként, a hatások miRNS és a gének hálózatot alkottak. Katalógusa

A korábbi jelölt gén egyesület vizsgálatban a szövetség pepszinogén C katalógusa ( PGC katalógusa) és a kimetszés javítás kereszt kiegészítve csoport 6 katalógusa ( ERCC6 katalógusa) kialakulásának kockázatát gyomorrák, és megállapította, hogy PGC katalógusa gén rs4711690 C → G, rs6458238 G → a és G rs9471643 → C polimorfizmusok volt védő hatása ellen atrófiás gasztritisz [4]. PGC volt védő hatása van a normális gyomor- és mutatott alacsony expressziót gyomorrák, és a veszteség a védelem társult előfordulása gyomorrák [14]. ERCC6 tagja a DNS-javítás család, amely részt vesz a javítási DNS-károsodás a karcinogenezisben [15]. ERCC6 katalógusa rs1917799 T > G polimorfizmus promóter régió, amely nagyobb a gyomorrák kockázatát a kínai populációban [16]. Let-7A egy tumor szuppresszor, és a legutóbbi vizsgálatok során azt találták, hogy a funkció az érett Let-7a szorosan kapcsolódik a előfordulása és a gyomorrák kialakulásával, és csökkent expressziója let-7a társított malignus biológiai viselkedés [17], [ ,,,0],18]. Azonban hadd 7a genetikai variánsok nem vizsgálták azok társulásai és gyomorrák kockázatokat. Rs10739971 egy SNP található -559 bp upstream let-7a-1, amely lehet egy promoter régió let-7a-1. A HapMap adatbázisban, a minimális allél gyakorisága rs10739971 van ≥5% mind az európaiak és az ázsiaiak. De van-e összefüggés a rs10739971 és betegségek kockázatának közötti kölcsönhatás rs10739971 és egyéb polimorfizmusok, továbbra is ismeretlenek. Feltételeztük, hogy a fent említett változatok lehetnek optimális jelöltek, hogy vizsgálja meg a lehetséges SNP-SNP kölcsönhatások két vagy több lokusz hozzájáruló gyomorrák etiológiájában. Katalógusa

Ebben az eset-kontroll vizsgálat során, amelyben a kínai népesség, megvizsgáltuk a társulása pri-let-7a-1 rs10739971 a gyomorrák kockázatát, és a kölcsönhatás hatásait miRNS-let-7a-1 rs10739971 polimorfizmus és PGC katalógusa és ERCC6 katalógusa polimorfizmusok mintáit ugyanabba a csoportba, és megvitatják annak alkalmazása kilátások a gyomorrák és a rákmegelőző betegségek. Tudomásunk szerint ez az első tanulmány, hogy ítéletet potenciális SNP-SNP kölcsönhatások miRNS SNP-k és gén SNP két vagy több lokusz összefüggésbe a gyomorrák érzékenység. Azt remélte, hogy talál kombinációi gén-gén polimorfizmusok tudta megjósolni a kockázatot a gyomorrák és a rákmegelőző betegségek, valamint, hogy a kísérleti bizonyíték a korai diagnózist gyomorrák. Katalógusa

Módszerek katalógusa

A betegeket

Ebben a vizsgálatban, összesen 1834 egyén, köztük 471 gyomorrákos betegek, 646 sorvadásos gyomorhurut betegek és 717 kontroll, retrospektív toboroztak átesett betegek gasztroszkópia vizsgálat szűrés Zhuanghe régióban átesett betegek gasztroszkópia vizsgálat vagy gyomor műtét az első Affiliated Kórház kínai Orvostudományi Egyetem, Liaoning tartomány, Kína 2002 és 2011 között éhomi vénás vért vettünk és minden beiratkozott résztvevők diagnosztizáltak alapján gasztroszkopikus és kórszövettani vizsgálatok. A gyomorrák diagnosztizáltak alapján a WHO-kritériumok, és a sorvadásos gyomorhurut és felszínes gastritis sorolta Sydney besorolását. Támogatható ellenőrzések voltak résztvevők egy normál gyomor, vagy csak gyomorhurut szerint gasztroszkopikus és patológiai vizsgálatok és nem volt más betegségek. Katalógusa

A vizsgálat kialakítása jóváhagyta a Human Etikai Bizottság a Kínai Orvostudományi Egyetem (Shenyang, Kína ). Írásos beleegyezését adta a minden résztvevő számára. Orvosi történetét (beleértve a kor, a nem, a dohányzás és alkoholfogyasztás) kaptuk kérdőív és a nyilvántartásban számítógépes. Minden egyes részt vett a vizsgálatban írásos beleegyezését adta a járványügyi vizsgálatot. Részletes résztvevő jellemzőit foglalja össze az 1. táblázat

genomikus DNS

A genomiális DNS-t extraháltunk a korábbiakban ismertetett eljárás kismértékű módosításával [19]. Röviden, egy fagyasztott vérrög (500

Other Languages