PLoS One: Funkcionális Promoter -308G > A Variant a tumor nekrózis faktor alfa gén asszociált Kockázat és progresszió a gyomorrák a kínai népesség

absztrakt katalógusa

Háttér katalógusa

A tumor nekrózis faktor-α (TNF-α) kulcsfontosságú szerepet játszik a kialakulásában és progressziójában gyomorrák. Egy funkcionális polimorfizmus, -308 G > A (rs1800629) található, amely a promoter TNFA
gén, már javasolták, hogy megváltoztassa a termelés a TNF-α és befolyása a rák kockázatát. A jelen tanulmányban igyekeztünk vizsgálni, hogy ez a polimorfizmus hatása a kockázat és progresszió a gyomorrák a kínai népesség. Katalógusa

Módszerek

genotipizált a TNFA katalógusa -308 G > a polimorfizmus a TaqMan módszer egy kétlépcsős eset-kontroll vizsgálat, amely összesen 1686 gyomorrákos betegek és 1895 daganatos alanyok. A logisztikus regressziót alkalmaztunk, hogy értékelje a genetikai egyesületek előfordulása és progressziója gyomorrák. Katalógusa

Eredmények katalógusa

találtunk szignifikáns összefüggést a variáns allél és a fokozott kockázata gyomorrák [ P katalógusa = 0.034, esélyhányados (OR) = 1,39, 95% -os megbízhatósági intervallum (CI) = 1,01-1,67, GA /AA vs. GG]. Hasonló eredményeket figyeltünk meg a nyomon követési replikációs tanulmány. Amikor együtt az adatokat a két tanulmány, találtunk egy jelentősebb egyesület ( P katalógusa = 0,001, OR = 1,34, 95% CI = 1,13-1,59), különösen az idősebb betegeknél (> 65 év). Továbbá a hordozó betegeknél a variáns allél szignifikánsan nagyobb prevalenciája T4 betegség stádiuma ( P katalógusa = 0,001, OR = 2,19, 95% CI = 1,39-3,47), és a távoli áttétek ( P
= 0,013, OR = 1,61, 95% CI = 1,10-2,35). katalógusa

Következtetések katalógusa

Eredményeink arra utalnak, hogy a funkcionális promoter -308 G > a polimorfizmus TNFA
befolyásolják a fogékonyság és progressziója gyomorrák a kínai populációban.

bevezető hivatkozás: Hong Y, Ge Z, Jing C, Shi J, Dong X, Zhou F, et al. (2013) Funkcionális Promoter -308G > A Variant a tumor nekrózis faktor alfa gén asszociált Kockázat és progresszió a gyomorrák a kínai népesség. PLoS ONE 8 (1): e50856. doi: 10,1371 /journal.pone.0050856 katalógusa

Szerkesztő: Ramon Andrade de Mello, University of Porto, katalógusa

Beérkezett: 2012. május 27., Elfogadva: október 29, 2012; Megjelent: január 10, 2013 katalógusa

Copyright: © 2013 Hong et al. Ez egy nyílt hozzáférésű cikk feltételei szerint terjeszthető a Creative Commons Nevezd meg! Licenc, amely engedélyezi a korlátlan használatát, a forgalmazás és a reprodukció bármilyen adathordozón, feltéve, hogy az eredeti szerző és a forrás jóváírásra. Katalógusa

Forrás: Ez a munka részben támogatta a "Hatok Talent Summit" Project Jiangsu tartomány (SWYY-71-028), a Nemzeti Természettudományi Alapítvány Jiangsu (BK2011194) és a Nemzeti Természettudományi Alapítvány Kína (30872084, 30972444, 81001274 és a). A finanszírozók nem volt szerepe a tanulmány tervezés, adatgyűjtés és elemzés, döntés, hogy közzéteszi, vagy a készítmény a kézirat. Katalógusa

Érdekütközés: A szerzők kijelentették, hogy nem ellentétes érdekek léteznek. Katalógusa

Bevezető

a gyomorrák a negyedik leggyakoribb daganat a második vezető oka a rák okozta halál világszerte, és különösen elterjedt bizonyos országok, köztük Kína [1], [2]. Bár a pontos etiológiája gyomor rák továbbra is azonosítani kell, felhalmozódó epidemiológiai vizsgálatok kimutatták, hogy az étrend, a dohányzás, az alkohol és különösen A Helicobacter pylori katalógusa ( H. Pylori
) fertőzés, jól ismertek okai gyomorrák [3], [4]. Ugyanakkor a magas előfordulási ezen kockázati tényezők nem mindig eredményez magas előfordulási gyomorrák, ami arra utal, hogy más fogékony tényezők, mint például a genetikai variációk és a környezeti különbségek emellett hozzájárul a gyomor kialakulásában. Nemrégiben, a feltörekvő bizonyíték azt javasolta, hogy a genetikai polimorfizmusok jelölt géneket társított érzékenységet gyomorrák [5], [6], [7].

Azt javasolták, hogy a krónikus gyulladást gyomornyálkahártya által indukált H. pylori
fertőzés egy kritikus lépés a fejlesztés a gyomorrák [8], [9]. Ebben az esetben, a genetikai változások gyulladással kapcsolatos citokin gének lehetnek potenciális hajlamosító tényező ez a betegség. Az egyik fontos citokinek társított H. pylori
fertőzés a tumor nekrózis faktor (TNF) -α által kódolt a TNFA
gén [10]. A TNF-α egy pleiotróp citokin, főként az aktivált monociták és makrofágok és fontos szerepet játszik a gyulladásos válaszban [11]. Azt javasolták, hogy több mint expressziója a TNF-α szignifikáns súlyosság-dózis-hatás, mint kockázati markerek a pre-neoplasztikus léziók gyomorrák [12].

TNFA
gén található a humán leukocita antigén class III régió 6. kromoszómán (6p21), és nagymértékben polimorf. Polimorfizmus az TNFA
gén kimutatták, hogy nagymértékben befolyásolja annak expressziós szintjének [13]. Ezért számos tanulmány megkísérelte, hogy vizsgálja meg polimorfizmusok a promóter TNFA katalógusa lehetne használni, mint feltételezett meghatározó tényezője érzékenység különböző betegségek, beleértve a gyomorrák. A sok polimorfizmusok TNFA katalógusa promoter, a TNFA katalógusa -308 G > A polimorfizmus vadul vizsgálták, és van funkcionális tanulmány arra utal, hogy a -308A allél hordozás emelkedett TNF-α termelés [14]. Ami a gyomorrák, számos vizsgálatot végeztek, hogy vizsgálja meg az összefüggést a TNFA katalógusa -308 G > A polimorfizmus és a gyomorrák különböző populációkban, azonban az eredmények képezik ezek a vizsgálatok továbbra is befogadó, [15] [16], [17], [18], [19]. Eddig két publikált metaanalízis ebben a kérdésben azt javasolták, hogy a -308 G > A polimorfizmus járt gyomorrák nyugati populációk, de nem az ázsiai populációk [20], [21]. Itt, a jelen tanulmányban, végeztünk egy viszonylag nagy kétfokozatú eset-kontroll vizsgálat, amely tartalmazza összesen 1686 gyomorrákos betegek és 1895 daganatos alanyok további értékelése a befolyása a TNFA katalógusa -308 G > a polimorfizmus gyomorrák kockázatát és progresszió a kínai népesség. katalógusa

anyagok és módszerek katalógusa

Etikai nyilatkozat katalógusa

a vizsgálat által jóváhagyott intézményi Review Board a Nanjing Orvostudományi Egyetem, Nanjing, Kína. Felvételkor, írásos beleegyezését adta a minden résztvevő részt vesz ebben a vizsgálatban. Katalógusa

Study lakosság katalógusa

Ez egy folyamatos molekuláris epidemiológiai tanulmány gyomorrák végzett az első Affiliated Kórház Nanjing Orvostudományi Egyetem , Nanjing, Kína. A design a tanulmány és a bevonási kritériumoknak az alanyok korábban leírt máshol. [22] Röviden, két független kórház-alapú eset-kontroll vizsgálatok kerültek a jelen tanulmányban. Összességében a teszt készlet tartalmaz 750 gyomor esetekben és 835 kor és nemű ellenőrzéseket felvenni a második kapcsolt kórházi Nanjing Orvosi Egyetem, a Nanjing és Rák Kórház Nantong City, Nantong, Kína március, 2006. január, 2010, és a érvényesítés készletben 936 esetben, és 1060 kontroll válogattunk be a Yixing Népi Kórház, Yixing, Kína januártól 1999. decemberig, 2006. Minden alanyok etnikai han kínai érkező különböző családok, és nem volt vér kapcsolat. Minden beteg újonnan diagnosztizált szövettanilag is megerősítették, az eset a gyomorrák és arra egymás toborzott korlátozás nélkül az életkor és a nemek. Szövettani metszetekben minden esetben megvizsgálta, két patológusok függetlenül. Azok a betegek, hogy korábban már volt rákos, áttétes rák más vagy ismeretlen eredetű, vagy az előző sugárterápia vagy kemoterápia kizárták. Az ellenőrzések verbuválódtak egészséges egyénekkel kerestek fizikális vizsgálat a járóbeteg a megfelelő kórházi és gyakoriság szerint igazítottuk az esetekben az életkor (± 5 év) és a szex. A rák-mentes kontrollok genetikailag nem rokon az esetben, és nem volt egyéni története rák. Minden beteg adományozott 5 ml vénás vért megadása után írásos beleegyezésüket adták. A válasz aránya eset és kontroll személyek is volt 85% feletti.

DNS-extrahálás és genotipizálás

A teljes genom DNS-t izoláljuk és tisztítjuk a fehérvérsejteket a perifériás vér által proteináz K-emésztéssel, majd fenol /kloroformos extrakcióval. A TNFA
-308 G > A polimorfizmus genotipizálása a TaqMan-MGB módszerrel (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA), amely felhasználja a két allél-specifikus TaqMan MGB szondák és PCR primer pár kimutatására az adott SNP célt. A szekvencia a láncindítókat és próbákat a kérésre. A reakcióelegyet 10

• PLoS One: A Novel proteomikai alapuló klinikai diagnosztika technológiája azonosítja heterogenitás aktivált jelátviteli Gyomor Cancers
• PLoS One: a magas szintű aromás aminosavak gyomornedv korai szakaszában gyomorrák Progression